logo

Genes within 1Mb (chr1:78438046:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.98e-01 0.0903 0.171 0.06 B L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 9.50e-01 0.00782 0.124 0.06 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.66e-01 0.199 0.143 0.06 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.32e-01 0.197 0.13 0.06 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.10e-01 0.196 0.122 0.06 B L1
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0174 0.164 0.06 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 9.57e-01 0.00921 0.171 0.06 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.13e-01 0.0348 0.147 0.06 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 8.89e-02 0.218 0.128 0.06 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.05e-01 -0.25 0.153 0.06 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.44e-01 0.0932 0.0983 0.06 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.61e-01 0.0985 0.133 0.06 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 7.83e-01 0.0351 0.128 0.06 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0132 0.0931 0.06 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 9.97e-01 0.000419 0.112 0.06 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.06 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 3.53e-01 -0.135 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.68e-01 0.125 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.89e-01 0.118 0.137 0.06 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00511 0.135 0.06 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.44e-01 -0.068 0.112 0.06 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.52e-01 -0.142 0.153 0.06 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 4.56e-01 0.115 0.154 0.06 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00521 0.151 0.06 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.45e-01 -0.105 0.173 0.061 DC L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.57e-01 0.0283 0.157 0.061 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 6.02e-01 0.0689 0.132 0.061 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 8.81e-01 0.0195 0.13 0.061 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00921 0.172 0.061 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0098 0.165 0.061 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0178 0.179 0.061 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 3.24e-01 0.191 0.193 0.061 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 6.53e-01 -0.083 0.184 0.061 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0954 0.175 0.06 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.76e-02 0.175 0.102 0.06 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0795 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0815 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.99e-01 -0.182 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 5.95e-01 0.0613 0.115 0.06 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 6.00e-01 0.0825 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 2.47e-02 0.355 0.157 0.06 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.06e-01 -0.136 0.163 0.06 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0545 0.187 0.06 NK L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 5.71e-01 0.0832 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 5.01e-01 0.0808 0.12 0.06 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 4.07e-01 -0.105 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0258 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 4.43e-01 -0.128 0.167 0.06 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 3.09e-01 0.164 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 2.13e-01 0.219 0.176 0.06 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 4.88e-01 0.0975 0.14 0.06 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.70e-02 0.314 0.15 0.06 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 3.90e-01 0.133 0.154 0.06 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.00e-01 0.0829 0.123 0.06 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0718 0.188 0.06 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.72e-02 -0.321 0.181 0.06 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 9.92e-01 0.00173 0.166 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.59e-01 -0.29 0.205 0.056 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 9.54e-01 0.0118 0.204 0.056 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.09e-01 0.14 0.169 0.056 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.51e-01 0.244 0.169 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.15e-01 0.128 0.197 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 1.86e-01 -0.211 0.159 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.73e-01 -0.26 0.19 0.056 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.81e-01 -0.031 0.206 0.056 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0444 0.184 0.056 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 3.55e-01 0.17 0.183 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 2.48e-01 -0.191 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.47e-02 0.315 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.01e-02 0.299 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.14e-01 0.248 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 1.16e-01 0.276 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 2.69e-01 0.205 0.185 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.95e-01 0.226 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 2.31e-02 0.339 0.148 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.55e-02 -0.434 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.68e-01 0.157 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.33e-01 0.207 0.137 0.06 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.81e-02 0.26 0.136 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0994 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0227 0.175 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.05e-01 0.186 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0501 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 6.24e-01 0.0755 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.39e-01 0.267 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 4.40e-01 -0.117 0.152 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.14e-01 0.112 0.137 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 7.14e-02 0.257 0.142 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.14e-02 0.274 0.14 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 3.69e-01 -0.152 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.02e-01 -0.301 0.183 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0998 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 1.40e-01 0.205 0.138 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 8.00e-01 0.0486 0.191 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 1.41e-01 0.253 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.75e-01 0.193 0.142 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 2.23e-01 0.19 0.156 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 3.99e-01 -0.139 0.164 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 2.26e-02 -0.381 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.96e-01 -0.252 0.195 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.03e-01 -0.074 0.193 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 9.65e-01 0.00716 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 4.95e-02 -0.387 0.196 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.18e-01 0.187 0.187 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 2.87e-01 0.156 0.146 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0732 0.169 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.93e-01 0.0251 0.186 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0968 0.183 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0766 0.191 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 3.32e-01 -0.157 0.161 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 5.64e-01 0.0697 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.28e-01 0.139 0.142 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.71e-01 0.0613 0.144 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 6.22e-01 0.0509 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 7.87e-01 0.0298 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0368 0.126 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 4.96e-03 -0.481 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 4.44e-01 0.0992 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.72e-01 0.0949 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0141 0.138 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.45e-01 -0.188 0.129 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 9.49e-01 0.0104 0.161 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.88e-01 -0.224 0.169 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.45e-01 -0.1 0.165 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0616 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0303 0.158 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.33e-01 0.0765 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0325 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.39e-02 0.38 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 9.64e-01 0.00841 0.185 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.87e-01 -0.236 0.178 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0495 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 2.17e-01 0.168 0.136 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.66e-01 0.211 0.152 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 4.86e-01 -0.101 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 5.58e-01 -0.1 0.17 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.93e-01 0.0212 0.158 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 1.93e-01 -0.211 0.161 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 2.81e-01 -0.184 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0479 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.64e-01 0.131 0.144 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0984 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 2.08e-01 -0.171 0.135 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 6.77e-01 0.068 0.163 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 2.66e-01 0.184 0.165 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0718 0.16 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 2.32e-02 -0.421 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0218 0.188 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 6.01e-01 0.0943 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 4.14e-01 0.133 0.163 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.95e-01 0.00101 0.171 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 2.71e-01 -0.206 0.187 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 9.37e-01 -0.015 0.191 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.79e-01 -0.119 0.168 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0325 0.197 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.69e-01 0.178 0.198 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.48e-01 0.21 0.145 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0542 0.151 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00346 0.182 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0696 0.183 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.90e-01 0.0519 0.195 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 8.15e-01 0.0372 0.159 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 3.01e-01 0.19 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 2.15e-01 0.2 0.161 0.061 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.28e-01 0.226 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0998 0.165 0.061 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.48e-01 -0.106 0.176 0.061 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 6.18e-01 0.0897 0.18 0.061 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 3.89e-01 -0.154 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.26e-01 0.131 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 6.00e-01 -0.103 0.195 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 6.38e-02 0.36 0.193 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.41e-01 0.211 0.143 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 9.80e-01 0.00432 0.169 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.41e-01 0.0358 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 4.75e-01 -0.133 0.186 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.38e-01 0.267 0.179 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0675 0.192 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00663 0.159 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 8.10e-01 0.0298 0.124 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0157 0.133 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00567 0.145 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.14e-01 -0.188 0.186 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 5.21e-01 -0.113 0.175 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.44e-01 0.122 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0597 0.198 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.05e-01 0.249 0.153 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.08e-01 0.0891 0.173 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0614 0.188 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 6.94e-01 0.0722 0.183 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0286 0.191 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.53e-01 -0.273 0.191 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0936 0.171 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.56e-01 0.172 0.121 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0602 0.129 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0288 0.162 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.15e-01 0.267 0.169 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 5.39e-01 0.114 0.186 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.54e-03 0.828 0.255 0.063 PB L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.31e-01 0.0502 0.234 0.063 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.77e-01 0.18 0.203 0.063 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0575 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 6.29e-01 -0.107 0.221 0.063 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 9.13e-02 -0.339 0.199 0.063 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.16e-02 0.547 0.213 0.063 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0453 0.254 0.063 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.94e-01 -0.153 0.223 0.063 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0368 0.195 0.059 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0863 0.181 0.059 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 6.68e-02 0.254 0.138 0.059 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.28e-02 0.28 0.15 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 7.04e-01 0.063 0.166 0.059 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.54e-01 -0.269 0.188 0.059 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 5.66e-01 0.106 0.184 0.059 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 1.14e-01 -0.225 0.142 0.059 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0122 0.186 0.06 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0261 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 4.89e-01 0.0908 0.131 0.06 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.29e-01 0.205 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00356 0.161 0.06 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.02e-01 -0.184 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0918 0.182 0.06 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0986 0.213 0.051 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.59e-01 0.0326 0.183 0.051 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 6.38e-01 0.0649 0.138 0.051 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 6.99e-01 0.0539 0.139 0.051 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 4.51e-01 -0.144 0.19 0.051 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0582 0.155 0.051 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 1.73e-01 0.262 0.192 0.051 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 2.31e-01 0.254 0.212 0.051 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.27e-01 -0.155 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 2.38e-01 -0.209 0.177 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 3.29e-02 0.237 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0149 0.109 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 8.64e-01 0.0195 0.114 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 5.03e-02 -0.318 0.161 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0348 0.131 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 6.22e-01 -0.082 0.166 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.21e-01 0.279 0.179 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 2.05e-01 -0.209 0.165 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 7.88e-01 0.0512 0.19 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.68e-01 0.0229 0.137 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0671 0.113 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0613 0.111 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0275 0.166 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 2.36e-01 0.169 0.142 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 4.48e-01 0.137 0.18 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 2.85e-01 0.197 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 5.48e-01 -0.108 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.52e-01 0.338 0.235 0.058 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 2.37e-01 0.264 0.222 0.058 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.08e-01 0.328 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.93e-01 0.111 0.208 0.058 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.15e-02 0.573 0.224 0.058 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 8.02e-01 0.0552 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 4.84e-02 -0.456 0.229 0.058 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0747 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0872 0.196 0.062 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0153 0.163 0.062 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 2.81e-01 -0.128 0.119 0.062 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.062 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0567 0.179 0.062 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 7.00e-01 0.0533 0.138 0.062 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.12e-01 0.168 0.166 0.062 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.95e-01 0.237 0.182 0.062 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 2.51e-01 0.202 0.176 0.062 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 3.73e-01 0.169 0.189 0.059 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.08e-01 0.0539 0.144 0.059 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0664 0.113 0.059 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.47e-01 -0.172 0.118 0.059 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00924 0.178 0.059 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 9.67e-02 0.252 0.151 0.059 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 3.13e-01 0.175 0.173 0.059 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0891 0.187 0.059 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0317 0.175 0.059 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0177 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 2.76e-01 0.216 0.197 0.056 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 8.47e-01 0.0292 0.151 0.056 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 8.39e-01 0.0313 0.154 0.056 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 7.14e-01 0.0706 0.193 0.056 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 3.49e-01 -0.176 0.187 0.056 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 9.97e-01 0.000815 0.195 0.056 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 4.79e-01 -0.154 0.217 0.056 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 5.46e-01 0.117 0.193 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0985 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0397 0.143 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.07e-01 0.243 0.15 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 1.13e-01 0.25 0.157 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 3.48e-01 0.146 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 5.26e-01 0.113 0.178 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 2.22e-01 0.226 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 1.37e-01 0.254 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 1.05e-02 0.362 0.14 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 1.46e-01 0.259 0.177 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 8.53e-01 0.0265 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 1.18e-01 0.22 0.14 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 5.55e-02 0.28 0.145 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.28e-01 0.204 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 3.19e-01 -0.171 0.171 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 4.44e-02 -0.377 0.186 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.174 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 2.04e-01 0.171 0.134 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0906 0.178 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 1.12e-01 0.172 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0245 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0308 0.111 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 1.21e-01 -0.223 0.143 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 3.97e-01 0.108 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0208 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 2.65e-02 0.374 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 2.85e-01 -0.177 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.93e-01 0.0978 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 5.85e-01 0.0664 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 3.58e-01 -0.105 0.114 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 2.03e-01 -0.138 0.108 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0728 0.168 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 549533 sc-eQTL 4.92e-01 0.096 0.139 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 2.32e-01 0.2 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 8.88e-01 0.0245 0.174 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 433492 sc-eQTL 4.57e-01 0.133 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 754627 sc-eQTL 5.81e-01 -0.104 0.189 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 678194 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0389 0.148 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -181876 sc-eQTL 7.12e-01 0.0442 0.12 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -211750 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0896 0.125 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 458936 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0542 0.127 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 458871 sc-eQTL 7.92e-01 0.0419 0.159 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 658422 sc-eQTL 7.03e-01 0.064 0.168 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 458504 pQTL 0.0157 -0.101 0.0416 0.0 0.0 0.0629

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000219201 \N 626265 3.14e-07 1.76e-07 5.35e-08 2.53e-07 9.24e-08 8.89e-08 2.24e-07 5.43e-08 1.44e-07 6.4e-08 1.76e-07 1.2e-07 2.38e-07 8.44e-08 5.69e-08 7.97e-08 4.18e-08 1.56e-07 7.39e-08 5.33e-08 1.25e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.22e-08 2.37e-07 1.26e-07 1.18e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.58e-07 1.14e-07 4.58e-08 3.65e-08 9.3e-08 6.35e-08 2.79e-08 3.7e-08 9.3e-08 6.76e-08 6.55e-08 4.68e-08 1.79e-07 5.21e-08 1.77e-08 2.82e-08 1.77e-08 1.11e-07 2.2e-09 4.85e-08