logo

Genes within 1Mb (chr1:78433768:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.82e-01 0.149 0.112 0.16 B L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0122 0.0808 0.16 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.88e-01 0.0652 0.0938 0.16 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0314 0.0857 0.16 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 5.67e-01 0.046 0.0803 0.16 B L1
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00836 0.107 0.16 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.56e-01 0.0204 0.112 0.16 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.57e-01 -0.136 0.0958 0.16 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0216 0.0841 0.16 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 2.21e-01 0.124 0.101 0.16 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0751 0.0647 0.16 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 8.35e-01 0.0184 0.0881 0.16 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0347 0.0841 0.16 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0549 0.0612 0.16 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 5.15e-01 0.0483 0.074 0.16 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 2.65e-02 0.169 0.0757 0.16 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.26e-01 0.145 0.0944 0.16 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 6.60e-02 -0.166 0.0896 0.16 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0288 0.0895 0.16 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0563 0.0876 0.16 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.58e-01 0.0131 0.0729 0.16 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0992 0.16 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.75e-01 0.136 0.0999 0.16 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 7.95e-02 -0.172 0.0974 0.16 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 7.49e-01 0.0345 0.108 0.16 DC L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.14e-01 0.0228 0.0972 0.16 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.35e-01 0.0278 0.0819 0.16 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.12e-01 0.00895 0.0805 0.16 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 7.22e-01 0.038 0.107 0.16 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 1.59e-01 -0.144 0.102 0.16 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0321 0.111 0.16 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.92e-01 0.103 0.12 0.16 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 8.30e-01 0.0246 0.115 0.16 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 8.74e-02 0.192 0.112 0.16 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.40e-01 0.0134 0.0664 0.16 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0088 0.0654 0.16 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.31e-01 0.0058 0.0673 0.16 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 3.30e-01 0.0893 0.0915 0.16 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 6.80e-01 0.0307 0.0745 0.16 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.72e-01 0.0163 0.101 0.16 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 6.41e-01 0.0479 0.103 0.16 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 7.13e-01 0.0388 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.33e-01 0.174 0.116 0.159 NK L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0954 0.0912 0.159 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0172 0.0747 0.159 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00953 0.0785 0.159 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 7.61e-01 0.0231 0.0758 0.159 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 2.93e-01 -0.11 0.104 0.159 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 8.73e-01 0.0161 0.1 0.159 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 4.71e-01 0.0829 0.115 0.16 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0447 0.0915 0.16 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 5.30e-01 0.062 0.0985 0.16 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.76e-01 0.0563 0.1 0.16 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0665 0.08 0.16 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00187 0.122 0.16 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 8.45e-01 0.0232 0.119 0.16 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.51e-01 0.00664 0.108 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0496 0.13 0.166 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0719 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0421 0.106 0.166 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 1.10e-01 -0.171 0.107 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 2.00e-01 0.159 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0717 0.101 0.166 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 2.14e-01 0.15 0.12 0.166 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.13e-02 -0.326 0.128 0.166 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.97e-01 0.000368 0.116 0.166 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.76e-01 0.0505 0.121 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.39e-01 -0.128 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 1.27e-01 0.158 0.103 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0836 0.105 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0408 0.104 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 4.31e-01 0.0913 0.116 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0328 0.122 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.92e-01 0.0982 0.115 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 8.73e-01 0.0158 0.0988 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.66e-02 0.246 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0518 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.91e-01 0.0621 0.0901 0.159 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0966 0.0899 0.159 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0823 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 3.72e-01 -0.102 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 9.02e-01 0.0147 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0934 0.119 0.159 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 6.37e-01 0.0477 0.101 0.159 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 4.75e-01 0.0827 0.115 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 7.61e-01 0.0297 0.0973 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 6.73e-01 0.0372 0.0878 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 4.17e-01 0.0741 0.0912 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.81e-01 0.0135 0.0901 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 7.26e-01 0.0379 0.108 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0261 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00346 0.0888 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.57e-01 0.111 0.121 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.60e-01 0.0192 0.109 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 5.62e-01 0.0523 0.0901 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0478 0.0987 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.42e-01 0.0484 0.104 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 4.27e-01 0.0983 0.123 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00753 0.122 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00897 0.104 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0643 0.136 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 9.72e-01 0.00452 0.129 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.98e-01 0.0259 0.101 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0493 0.116 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0939 0.128 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0285 0.126 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0282 0.132 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 4.26e-01 0.0841 0.106 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0746 0.0787 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 5.93e-01 0.0496 0.0929 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0312 0.0942 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0119 0.0674 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.80e-01 0.0201 0.0719 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.03e-02 0.14 0.082 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.34e-02 0.277 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 1.55e-01 -0.12 0.084 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 9.49e-01 0.00548 0.0861 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0287 0.0901 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 2.70e-01 -0.093 0.084 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.44e-01 0.0207 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0621 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.31e-01 0.0522 0.109 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0254 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.67e-01 0.0757 0.104 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 1.54e-01 -0.149 0.104 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0685 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 1.67e-02 -0.281 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0531 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.72e-01 0.0491 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.67e-02 -0.213 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0296 0.0882 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.24e-01 0.063 0.0989 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.78e-02 -0.159 0.0929 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 3.84e-01 0.0961 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 5.42e-01 0.0624 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0087 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 4.45e-01 0.0855 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0982 0.104 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 6.59e-01 0.0416 0.0942 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0545 0.0968 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 9.96e-01 0.00039 0.0887 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.36e-01 -0.036 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 5.17e-02 0.209 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 2.99e-01 -0.109 0.104 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.59e-01 0.11 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 1.73e-01 -0.164 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 2.68e-01 0.128 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 6.62e-01 0.0457 0.104 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 9.89e-02 0.18 0.109 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 9.63e-01 0.00552 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.05e-01 0.0146 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 1.38e-01 0.159 0.107 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 5.42e-01 0.0834 0.136 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 4.02e-02 -0.28 0.136 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.13e-01 0.0828 0.101 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 3.66e-01 0.0948 0.105 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.23e-01 0.101 0.126 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0384 0.127 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.35e-01 0.0111 0.135 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 7.47e-01 0.0356 0.11 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 4.10e-01 0.0993 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0905 0.106 0.158 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 5.80e-01 -0.054 0.0974 0.158 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 7.64e-01 0.0326 0.108 0.158 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.96e-01 0.015 0.115 0.158 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 1.89e-01 -0.155 0.117 0.158 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0503 0.117 0.158 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0972 0.107 0.158 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 2.23e-01 0.15 0.123 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 7.25e-01 0.0433 0.123 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.68e-01 0.0657 0.0904 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 1.37e-01 0.158 0.106 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0525 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 5.86e-01 0.0641 0.118 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.73e-01 0.155 0.113 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 9.94e-02 0.195 0.118 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.0982 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00345 0.0768 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.35e-01 0.00668 0.082 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.80e-01 0.0136 0.0898 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0522 0.115 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0416 0.108 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.00e+00 -7.36e-05 0.122 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.48e-01 -0.139 0.12 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 9.70e-01 0.00357 0.0935 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0223 0.105 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0476 0.114 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.70e-02 -0.191 0.111 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 4.40e-01 0.09 0.116 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.14e-01 0.187 0.118 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00593 0.106 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0338 0.0748 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 2.01e-01 -0.102 0.0792 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.85e-01 0.0698 0.0999 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0484 0.105 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.65e-01 0.159 0.114 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 8.10e-01 0.0388 0.161 0.181 PB L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 7.61e-02 -0.25 0.14 0.181 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.73e-01 0.0356 0.123 0.181 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0416 0.11 0.181 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 1.85e-01 0.177 0.133 0.181 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0235 0.122 0.181 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 5.13e-02 -0.256 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0836 0.154 0.181 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0454 0.135 0.181 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.98e-02 0.227 0.125 0.161 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 8.52e-01 0.0217 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 2.74e-02 -0.196 0.0882 0.161 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.67e-01 0.00399 0.097 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.31e-01 0.0512 0.106 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0204 0.121 0.161 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 2.30e-02 -0.267 0.117 0.161 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0914 0.161 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0638 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0334 0.107 0.16 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0166 0.0838 0.16 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 6.19e-01 0.0431 0.0866 0.16 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 2.97e-02 -0.222 0.102 0.16 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.13e-01 0.0271 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 5.58e-02 0.223 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.40e-01 0.124 0.13 0.161 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.39e-01 0.107 0.111 0.161 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 8.99e-01 0.0107 0.084 0.161 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.02e-01 0.0571 0.0849 0.161 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 1.36e-01 0.173 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00494 0.0944 0.161 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 5.82e-01 0.0648 0.117 0.161 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 2.01e-01 0.165 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 8.68e-01 0.0198 0.119 0.161 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.70e-01 0.104 0.115 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 5.76e-01 0.0406 0.0725 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00106 0.0709 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0597 0.0741 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.41e-02 0.183 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0182 0.085 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0207 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0242 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 6.23e-01 0.053 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 2.02e-01 0.157 0.123 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.40e-01 0.105 0.0888 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0569 0.0731 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0437 0.0719 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 5.98e-01 0.0567 0.107 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 3.66e-01 0.0835 0.0922 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 4.04e-01 0.0976 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.97e-01 0.000515 0.119 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 1.83e-01 0.155 0.116 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.50e-01 0.0683 0.15 0.142 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00454 0.142 0.142 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0484 0.13 0.142 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.02e-01 0.0887 0.132 0.142 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 5.08e-01 0.0964 0.145 0.142 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 4.04e-01 -0.117 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.30e-01 0.223 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 3.96e-02 0.263 0.127 0.142 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.08e-01 0.207 0.129 0.162 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 9.97e-01 0.000379 0.108 0.162 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00113 0.0786 0.162 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 4.54e-01 0.0574 0.0765 0.162 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 3.88e-01 0.102 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0944 0.0912 0.162 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 2.45e-01 0.128 0.11 0.162 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.37e-01 0.116 0.121 0.162 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 3.64e-01 -0.106 0.116 0.162 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0637 0.121 0.163 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0927 0.0919 0.163 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 3.00e-01 -0.075 0.0722 0.163 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.83e-01 0.00163 0.0762 0.163 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 2.62e-01 -0.128 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 2.02e-01 -0.124 0.0967 0.163 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.111 0.163 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 1.71e-01 0.164 0.119 0.163 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0209 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0504 0.119 0.158 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 4.10e-01 -0.101 0.122 0.158 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0817 0.0928 0.158 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0725 0.0945 0.158 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0935 0.119 0.158 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.158 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0554 0.12 0.158 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.12e-01 -0.136 0.134 0.158 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 6.90e-01 0.0477 0.119 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 1.81e-01 -0.125 0.0929 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 3.78e-01 0.0865 0.0979 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0478 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0924 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 6.40e-01 0.0565 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0871 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00267 0.0928 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 5.96e-01 0.0482 0.0908 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 5.66e-01 0.0515 0.0897 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00061 0.0933 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 4.70e-01 0.0617 0.0853 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 6.44e-01 0.0506 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 4.69e-01 0.0868 0.12 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00285 0.0858 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 1.39e-01 0.171 0.115 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 2.32e-01 0.084 0.0701 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0225 0.0697 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.97e-01 -0.038 0.0718 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.18e-02 0.162 0.0925 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 4.55e-01 0.0617 0.0825 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00323 0.106 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0184 0.11 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 2.75e-01 0.117 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 2.76e-01 0.13 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0752 0.0789 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 4.10e-01 -0.061 0.074 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 8.96e-01 0.00918 0.0704 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0685 0.109 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 545255 sc-eQTL 3.05e-02 -0.196 0.0898 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 7.92e-01 0.0289 0.109 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 3.74e-02 0.235 0.112 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 429214 sc-eQTL 2.17e-01 -0.143 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 750349 sc-eQTL 7.20e-02 0.21 0.116 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 673916 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0933 0.0918 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -186154 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0274 0.0742 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -216028 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0462 0.0778 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 454658 sc-eQTL 8.95e-01 0.0104 0.0785 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 sc-eQTL 2.53e-01 -0.113 0.0983 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 654144 sc-eQTL 9.38e-01 0.00805 0.104 0.157 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 454226 pQTL 0.0253 0.0624 0.0279 0.0 0.0 0.159
ENSG00000162616 DNAJB4 454593 eQTL 0.00385 -0.0792 0.0273 0.0 0.0 0.151
ENSG00000180488 MIGA1 654144 eQTL 5.37e-02 -0.0375 0.0194 0.00107 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina