logo

Genes within 1Mb (chr1:78312622:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.27e-01 0.0123 0.134 0.09 B L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 9.45e-01 0.00664 0.0968 0.09 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 3.37e-01 -0.108 0.112 0.09 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 1.05e-01 -0.166 0.102 0.09 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.83e-01 0.084 0.0961 0.09 B L1
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 5.62e-01 0.0743 0.128 0.09 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.27e-01 0.085 0.134 0.09 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.47e-01 -0.133 0.115 0.09 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 4.16e-01 0.082 0.101 0.09 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 7.80e-01 0.0342 0.122 0.09 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0409 0.0781 0.09 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 7.06e-02 -0.191 0.105 0.09 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0761 0.101 0.09 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 4.85e-03 0.206 0.0724 0.09 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 8.13e-01 0.021 0.0891 0.09 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 7.24e-01 0.0325 0.0921 0.09 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00183 0.115 0.09 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0489 0.109 0.09 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 8.07e-02 -0.189 0.108 0.09 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.18e-01 0.0245 0.106 0.09 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 4.89e-01 0.061 0.0881 0.09 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.16e-01 0.0783 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0312 0.121 0.09 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 1.87e-01 0.156 0.118 0.09 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.36e-01 0.192 0.128 0.095 DC L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.77e-01 0.103 0.116 0.095 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0642 0.0979 0.095 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00902 0.0962 0.095 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0485 0.128 0.095 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 8.75e-01 0.0193 0.122 0.095 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0822 0.133 0.095 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 4.86e-03 -0.401 0.141 0.095 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0628 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0338 0.138 0.09 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0711 0.0813 0.09 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0291 0.0801 0.09 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.48e-01 0.0158 0.0825 0.09 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 7.76e-01 0.032 0.112 0.09 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 2.67e-01 0.101 0.091 0.09 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.93e-01 0.0665 0.124 0.09 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 1.34e-01 0.188 0.125 0.09 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 1.89e-01 0.17 0.129 0.09 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 2.16e-01 -0.174 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0367 0.111 0.09 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.40e-01 -0.133 0.0899 0.09 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0639 0.0949 0.09 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0524 0.0916 0.09 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 7.72e-01 0.0366 0.126 0.09 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 9.16e-01 0.0128 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 2.87e-01 -0.147 0.138 0.09 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.09e-01 0.112 0.11 0.09 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 3.32e-01 0.115 0.118 0.09 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0796 0.121 0.09 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 6.37e-01 0.0455 0.0963 0.09 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 3.60e-01 -0.135 0.147 0.09 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.38e-01 0.0879 0.142 0.09 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 7.14e-01 0.0479 0.13 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 3.54e-01 -0.144 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 2.45e-01 0.179 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.64e-01 0.0735 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.93e-01 -0.11 0.128 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.76e-01 0.0231 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 9.79e-01 0.00313 0.121 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0655 0.144 0.102 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 4.88e-01 0.108 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 8.95e-01 0.0183 0.138 0.102 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00391 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.97e-01 0.111 0.131 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 3.39e-01 -0.119 0.124 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.11e-02 -0.271 0.125 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.60e-01 -0.022 0.124 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 5.78e-01 0.0776 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0653 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 4.18e-01 -0.112 0.138 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 3.58e-01 0.109 0.119 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.36e-01 -0.213 0.142 0.091 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.01e-01 -0.143 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0732 0.109 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.64e-01 0.0187 0.109 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 4.66e-01 -0.103 0.142 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 1.24e-01 -0.213 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 2.31e-01 0.172 0.143 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0247 0.144 0.091 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.122 0.091 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 7.26e-01 0.0492 0.14 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.60e-01 -0.036 0.118 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0327 0.106 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 9.61e-02 -0.184 0.11 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 7.07e-01 0.041 0.109 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 2.59e-01 0.148 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 3.66e-01 0.129 0.143 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 3.36e-01 -0.133 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 6.41e-01 0.0502 0.107 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0859 0.146 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0457 0.132 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.108 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 7.36e-01 0.0402 0.119 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.76e-01 -0.111 0.125 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 7.53e-01 0.0404 0.128 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 9.31e-01 0.0129 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.61e-01 -0.166 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 9.58e-01 0.0067 0.126 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.55e-01 0.219 0.153 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 4.74e-02 -0.288 0.145 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.47e-01 0.165 0.114 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 2.84e-01 0.141 0.131 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.28e-01 0.221 0.144 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 1.85e-01 0.189 0.142 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 6.88e-01 0.0598 0.149 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0164 0.129 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0366 0.0961 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.96e-02 -0.263 0.112 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0979 0.115 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.02e-02 0.21 0.0809 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 2.20e-01 -0.108 0.0874 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00894 0.101 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0443 0.136 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 2.27e-01 0.123 0.101 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 9.29e-02 -0.174 0.103 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0461 0.109 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.71e-01 0.091 0.101 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 4.63e-01 0.0932 0.127 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.28e-01 0.161 0.133 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 7.42e-01 0.0435 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0458 0.136 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0967 0.126 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 2.00e-01 -0.163 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 2.57e-01 -0.139 0.123 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 1.36e-01 0.214 0.143 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.74e-01 0.0833 0.148 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 7.24e-01 0.0523 0.148 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 2.95e-01 -0.137 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0959 0.112 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0846 0.126 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.22e-01 0.118 0.119 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 7.98e-01 0.0361 0.14 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 4.11e-02 0.272 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 4.12e-01 0.111 0.135 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 9.61e-01 0.00618 0.126 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 2.51e-01 -0.131 0.114 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.42e-01 0.0233 0.117 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.43e-01 0.157 0.107 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00308 0.129 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 3.03e-01 -0.134 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.33e-01 0.151 0.126 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 3.42e-01 0.14 0.147 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 1.93e-01 0.193 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 9.10e-01 -0.016 0.142 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 4.31e-01 -0.101 0.129 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 2.74e-01 -0.148 0.135 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 4.59e-01 0.11 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0938 0.151 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 3.38e-01 -0.127 0.132 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 4.93e-02 -0.315 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 1.54e-02 0.389 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.96e-02 -0.224 0.118 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.93e-01 0.106 0.123 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0273 0.149 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 8.43e-01 0.0296 0.15 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.26e-01 0.101 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 8.59e-02 0.222 0.129 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 3.58e-01 -0.134 0.146 0.091 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 1.89e-01 0.168 0.128 0.091 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.56e-01 0.167 0.118 0.091 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0669 0.131 0.091 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.69e-01 0.125 0.139 0.091 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 9.98e-01 0.000417 0.143 0.091 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.34e-02 0.321 0.14 0.091 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00889 0.13 0.091 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 2.51e-01 -0.17 0.148 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.66e-01 0.134 0.147 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000676 0.109 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.59e-01 0.0748 0.128 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 9.15e-01 0.0146 0.136 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 8.51e-01 0.0266 0.141 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.35e-01 -0.162 0.136 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 8.18e-02 -0.254 0.145 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0557 0.121 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.03e-02 -0.241 0.0929 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.83e-02 -0.19 0.1 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0412 0.11 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0448 0.142 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.41e-01 0.0815 0.133 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.49e-01 -0.226 0.156 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.58e-01 -0.142 0.154 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0566 0.12 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 7.84e-02 0.238 0.134 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.35e-01 0.219 0.146 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 3.81e-02 0.296 0.142 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 4.35e-01 -0.117 0.149 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0984 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.58e-01 -0.118 0.128 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 3.53e-01 -0.084 0.0902 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0905 0.0958 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 2.01e-01 -0.154 0.12 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0282 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.09e-01 0.025 0.217 0.081 PB L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 4.91e-01 0.131 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 9.07e-01 0.0194 0.166 0.081 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.89e-01 0.128 0.148 0.081 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 2.75e-01 0.196 0.179 0.081 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 2.95e-01 0.172 0.163 0.081 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.59e-01 0.0788 0.178 0.081 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 4.08e-01 -0.172 0.206 0.081 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000886 0.182 0.081 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 5.26e-02 -0.291 0.149 0.091 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 8.98e-01 0.0179 0.139 0.091 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 4.30e-01 0.0846 0.107 0.091 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0257 0.116 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.94e-01 0.017 0.128 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 3.98e-01 -0.123 0.145 0.091 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 3.80e-01 0.124 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.36e-01 0.131 0.11 0.091 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 2.95e-01 0.153 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0909 0.132 0.09 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.09 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.73e-01 0.0603 0.107 0.09 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.19e-01 0.197 0.126 0.09 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.61e-03 0.379 0.138 0.09 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.54e-01 -0.164 0.143 0.09 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.09e-01 0.244 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 3.08e-01 0.134 0.131 0.095 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.85e-01 -0.054 0.0987 0.095 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 9.67e-01 0.00408 0.1 0.095 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 3.96e-01 -0.116 0.136 0.095 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 9.78e-01 0.00311 0.111 0.095 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0624 0.138 0.095 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0895 0.152 0.095 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0889 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0195 0.142 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 1.47e-01 -0.129 0.0889 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0204 0.0873 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 6.22e-01 0.0451 0.0913 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 7.54e-01 -0.041 0.13 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 3.22e-01 0.104 0.104 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 2.58e-01 0.151 0.133 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.42e-01 0.169 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 7.58e-01 0.0409 0.132 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 5.96e-01 0.081 0.153 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.62e-02 -0.195 0.11 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0125 0.0907 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.24e-01 0.0198 0.0892 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 5.03e-01 0.0893 0.133 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 2.78e-01 0.124 0.114 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.20e-01 0.0718 0.145 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 1.29e-01 0.224 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.47e-01 0.166 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.72e-01 0.00592 0.17 0.097 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0814 0.16 0.097 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0745 0.146 0.097 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 7.79e-01 0.0419 0.149 0.097 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0646 0.164 0.097 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0858 0.157 0.097 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.77e-02 -0.364 0.164 0.097 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.47e-02 -0.324 0.143 0.097 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 3.31e-01 -0.152 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 6.73e-01 0.0546 0.129 0.091 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 1.38e-01 -0.14 0.0939 0.091 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0676 0.092 0.091 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 1.87e-01 0.187 0.141 0.091 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0843 0.11 0.091 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 1.17e-01 0.207 0.131 0.091 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.43e-01 -0.17 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.66e-02 0.309 0.138 0.091 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 9.38e-01 0.0116 0.148 0.093 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 9.26e-01 0.0105 0.112 0.093 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 2.01e-01 -0.113 0.0878 0.093 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 2.26e-02 -0.211 0.0917 0.093 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0569 0.139 0.093 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 3.38e-02 -0.25 0.117 0.093 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 4.34e-01 -0.106 0.135 0.093 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 7.14e-01 0.0536 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 8.49e-01 -0.026 0.136 0.093 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 6.05e-01 0.079 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0271 0.156 0.096 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 9.39e-01 0.00916 0.119 0.096 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 7.22e-01 -0.043 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 9.07e-01 0.0177 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0396 0.148 0.096 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.35e-01 0.0729 0.153 0.096 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.58e-02 -0.38 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 4.08e-01 -0.126 0.152 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 3.85e-01 -0.122 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 8.28e-01 0.0244 0.112 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0654 0.118 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 8.48e-02 -0.212 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 9.19e-01 0.0124 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0208 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.68e-01 0.0827 0.145 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 9.78e-01 0.00365 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.39e-01 0.131 0.111 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 4.56e-01 0.103 0.138 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0361 0.111 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0656 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 3.78e-01 -0.1 0.113 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.93e-01 0.014 0.104 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.133 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 5.09e-01 0.0964 0.146 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 2.19e-01 -0.165 0.134 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 8.87e-01 0.0148 0.104 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 8.39e-01 0.0291 0.143 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 7.20e-02 -0.156 0.0863 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0191 0.0862 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 5.37e-01 0.0548 0.0886 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.63e-01 0.0199 0.115 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 1.38e-01 0.151 0.102 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 3.99e-01 0.111 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 3.60e-02 0.283 0.134 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 2.96e-01 0.138 0.132 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 2.41e-01 -0.171 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 5.51e-01 0.0578 0.0966 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 2.03e-01 -0.115 0.0903 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0987 0.0859 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 8.83e-01 0.0198 0.134 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 424109 sc-eQTL 2.91e-01 -0.117 0.111 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 6.92e-01 0.0531 0.134 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0487 0.138 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 308068 sc-eQTL 1.52e-01 0.203 0.141 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 629203 sc-eQTL 1.52e-01 -0.204 0.142 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 552770 sc-eQTL 4.26e-01 -0.089 0.112 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -307300 sc-eQTL 7.94e-02 -0.158 0.0895 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -337174 sc-eQTL 1.60e-01 -0.133 0.0941 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 333512 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0555 0.0954 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 333447 sc-eQTL 7.68e-01 0.0353 0.12 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 532998 sc-eQTL 6.44e-01 0.0585 0.126 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 \N 629203 3.27e-07 1.56e-07 5.93e-08 2.24e-07 1.03e-07 8.37e-08 2.16e-07 5.82e-08 1.71e-07 9.35e-08 1.76e-07 1.22e-07 2.38e-07 8.13e-08 5.69e-08 8.71e-08 4.35e-08 1.8e-07 6.92e-08 5.33e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.64e-07 3.42e-08 2.28e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 1.32e-07 1.1e-07 1.26e-07 3.72e-08 3.21e-08 9.81e-08 3.97e-08 2.79e-08 4.41e-08 9.17e-08 6.41e-08 4.24e-08 5.81e-08 1.59e-07 5.22e-08 1.43e-08 3.32e-08 1.68e-08 8.74e-08 1.96e-09 4.81e-08