logo

Genes within 1Mb (chr1:78311013:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.23e-01 -0.146 0.119 0.12 B L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0298 0.0863 0.12 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.83e-01 0.0875 0.1 0.12 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.93e-01 0.0627 0.0914 0.12 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 6.39e-01 0.0403 0.0858 0.12 B L1
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 2.97e-01 0.119 0.114 0.12 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.37e-01 -0.142 0.119 0.12 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 7.03e-01 0.0392 0.103 0.12 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 5.57e-01 0.0529 0.0898 0.12 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.109 0.12 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0918 0.0695 0.12 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.87e-01 0.0819 0.0945 0.12 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 2.41e-01 0.106 0.0901 0.12 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0738 0.0657 0.12 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 5.81e-03 -0.218 0.0781 0.12 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.27e-01 0.0994 0.082 0.12 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.29e-01 0.0091 0.102 0.12 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0257 0.0974 0.12 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0966 0.12 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.00e-01 0.0364 0.0946 0.12 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.74e-01 0.0442 0.0785 0.12 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0516 0.107 0.12 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 1.62e-01 0.151 0.108 0.12 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 8.93e-02 0.179 0.105 0.12 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.40e-02 0.224 0.12 0.117 DC L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.14e-01 0.0258 0.109 0.117 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0151 0.0922 0.117 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.65e-01 0.0271 0.0905 0.117 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00428 0.12 0.117 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0839 0.115 0.117 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0661 0.125 0.117 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.04e-01 0.172 0.135 0.117 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 2.65e-01 -0.144 0.128 0.117 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.32e-01 -0.12 0.123 0.12 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0941 0.0725 0.12 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00669 0.0716 0.12 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0177 0.0738 0.12 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000195 0.1 0.12 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 6.22e-01 0.0403 0.0816 0.12 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 8.35e-01 0.0231 0.111 0.12 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.12 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 9.04e-01 0.0139 0.115 0.12 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.98e-01 0.107 0.126 0.118 NK L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0645 0.0992 0.118 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.40e-01 0.0627 0.0811 0.118 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.59e-01 0.0632 0.0852 0.118 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0256 0.0823 0.118 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 1.30e-01 -0.171 0.113 0.118 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 4.94e-01 0.0745 0.109 0.118 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 1.59e-01 -0.178 0.126 0.12 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 3.90e-01 0.0866 0.101 0.12 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.108 0.12 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0315 0.111 0.12 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.30e-01 0.00778 0.0883 0.12 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.52e-01 0.154 0.134 0.12 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 8.35e-01 0.0272 0.131 0.12 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 9.56e-01 0.00662 0.119 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0176 0.141 0.128 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0114 0.139 0.128 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.25e-01 -0.114 0.115 0.128 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0524 0.116 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 2.93e-01 0.142 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 9.87e-01 0.00177 0.109 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 8.54e-02 0.224 0.13 0.128 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 5.74e-01 0.0793 0.141 0.128 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0871 0.125 0.128 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 1.43e-01 -0.19 0.129 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0207 0.117 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 1.21e-01 0.172 0.11 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0611 0.112 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.24e-02 -0.186 0.11 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 2.06e-01 -0.157 0.124 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 1.98e-02 -0.303 0.129 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 4.29e-01 0.0973 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 4.28e-01 0.084 0.106 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.59e-01 0.0571 0.129 0.119 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 4.03e-01 -0.105 0.125 0.119 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.13e-01 0.05 0.0986 0.119 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0637 0.0986 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 2.44e-01 0.149 0.128 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 7.18e-01 0.0453 0.125 0.119 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0202 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.13 0.119 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0192 0.11 0.119 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.16e-02 -0.233 0.124 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000272 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.095 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 6.31e-01 0.0475 0.0987 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.02e-01 0.0654 0.0974 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 2.23e-01 0.143 0.117 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.21e-01 -0.156 0.127 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 8.36e-01 0.0255 0.123 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 7.70e-01 -0.028 0.096 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.21e-01 -0.129 0.13 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0348 0.118 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 1.33e-01 0.146 0.0967 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0264 0.107 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 3.72e-01 -0.1 0.112 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 4.33e-02 0.231 0.113 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.39e-01 0.157 0.133 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0827 0.112 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0627 0.145 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0852 0.137 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0675 0.108 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 6.59e-02 0.227 0.123 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 1.64e-01 -0.19 0.136 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0444 0.134 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.84e-01 0.122 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.94e-01 0.0451 0.114 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 1.59e-01 -0.12 0.0851 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.43e-01 0.0955 0.1 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 5.32e-01 0.0639 0.102 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0997 0.0727 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 6.45e-03 -0.211 0.0766 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.46e-01 0.104 0.0892 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0432 0.122 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 2.54e-01 -0.105 0.0914 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.45e-01 0.0883 0.0934 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 1.45e-01 0.143 0.0974 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 8.00e-01 0.0232 0.0916 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 1.01e-01 -0.187 0.114 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 8.86e-01 0.0173 0.12 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.26e-01 -0.143 0.118 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0256 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 7.12e-02 0.204 0.112 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0774 0.114 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 1.94e-01 -0.143 0.11 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.68e-01 -0.143 0.128 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0188 0.133 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0648 0.127 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.11e-02 -0.194 0.111 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.54e-01 0.0893 0.0961 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 1.75e-01 0.146 0.108 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 4.81e-01 -0.072 0.102 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0675 0.12 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 9.20e-01 0.0112 0.112 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 2.26e-01 0.139 0.114 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0253 0.12 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.10e-01 0.0418 0.112 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.81e-01 0.0416 0.101 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 3.90e-01 0.0892 0.104 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.62e-01 0.0552 0.095 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 6.03e-01 0.0595 0.114 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 1.89e-01 0.152 0.115 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 1.64e-01 0.156 0.112 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.95e-01 0.137 0.13 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.87e-01 0.0186 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.52e-02 0.264 0.125 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.35e-01 0.0891 0.114 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 3.47e-01 0.123 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 6.53e-02 0.246 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 3.92e-01 0.101 0.117 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.78e-01 0.122 0.138 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 2.92e-01 -0.146 0.138 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0107 0.102 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0766 0.106 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0467 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.05e-01 0.0488 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.21e-01 0.167 0.136 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 6.19e-01 0.0555 0.111 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0634 0.129 0.119 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 4.98e-01 -0.077 0.114 0.119 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.76e-01 0.0928 0.105 0.119 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.90e-01 0.0803 0.116 0.119 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 4.47e-01 0.0941 0.123 0.119 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00333 0.126 0.119 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 7.79e-01 0.0354 0.126 0.119 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 3.10e-01 -0.117 0.115 0.119 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 1.37e-01 0.201 0.134 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0372 0.135 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0025 0.0993 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 2.82e-01 0.126 0.116 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0963 0.124 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.54e-01 0.147 0.129 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 1.11e-01 0.198 0.124 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.52e-01 0.121 0.13 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0892 0.108 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0841 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 8.94e-01 0.012 0.0899 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.83e-01 -0.054 0.0984 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.87e-01 -0.134 0.126 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.58e-01 0.109 0.118 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000911 0.139 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 1.53e-01 -0.196 0.136 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.51e-02 0.213 0.105 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.86e-02 0.211 0.119 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.85e-01 0.0712 0.13 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 9.89e-02 -0.209 0.126 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.02e-01 -0.137 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0544 0.13 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 5.10e-01 0.0769 0.116 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.58e-01 0.0365 0.0823 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.70e-01 0.0256 0.0875 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 7.25e-01 0.0387 0.11 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.71e-02 -0.254 0.114 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 4.20e-01 0.102 0.126 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00255 0.179 0.133 PB L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 2.50e-01 -0.181 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.53e-01 0.0616 0.137 0.133 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 5.96e-01 0.0651 0.123 0.133 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 7.70e-01 0.0434 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 9.35e-01 0.011 0.135 0.133 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 3.91e-01 -0.126 0.147 0.133 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 5.11e-01 0.112 0.17 0.133 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 6.40e-01 0.0702 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 4.67e-01 0.102 0.14 0.122 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 2.28e-01 0.157 0.13 0.122 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0852 0.0997 0.122 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 6.87e-01 0.0438 0.109 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 3.17e-01 0.119 0.119 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 4.69e-01 0.0984 0.136 0.122 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 7.33e-02 -0.236 0.131 0.122 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 1.75e-01 0.139 0.102 0.122 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.75e-02 -0.273 0.13 0.12 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0223 0.119 0.12 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.34e-01 0.0726 0.0927 0.12 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 1.02e-02 0.245 0.0945 0.12 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 2.64e-02 -0.251 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 6.30e-01 0.061 0.126 0.12 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 1.23e-01 0.199 0.129 0.12 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.85e-01 0.155 0.145 0.122 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 5.55e-01 0.0737 0.124 0.122 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0866 0.0936 0.122 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0293 0.0949 0.122 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 6.85e-01 0.0527 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 1.58e-01 -0.149 0.105 0.122 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 1.80e-01 0.176 0.131 0.122 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.44e-02 0.324 0.143 0.122 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 3.72e-01 -0.118 0.132 0.122 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.56e-01 -0.143 0.126 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.32e-02 -0.137 0.0788 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 8.16e-01 0.0181 0.0775 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 1.49e-01 -0.117 0.0807 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 4.68e-01 0.0842 0.116 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0762 0.0928 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 9.09e-01 0.0135 0.118 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 4.51e-02 -0.256 0.127 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0744 0.118 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.73e-01 0.00448 0.135 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 3.75e-01 0.0863 0.097 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0551 0.0798 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 8.13e-01 0.0186 0.0785 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 6.06e-01 0.0606 0.117 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0422 0.101 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.19e-01 0.0459 0.128 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 4.16e-01 0.106 0.13 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 3.91e-01 0.109 0.126 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 1.35e-01 -0.257 0.171 0.091 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 7.78e-01 0.0461 0.163 0.091 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 2.60e-01 -0.168 0.149 0.091 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 2.65e-01 -0.169 0.151 0.091 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 3.11e-02 -0.359 0.165 0.091 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0623 0.161 0.091 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.96e-02 0.367 0.167 0.091 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 1.21e-01 0.229 0.147 0.091 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 2.72e-01 0.164 0.149 0.122 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 3.27e-01 0.121 0.123 0.122 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 7.17e-01 0.0327 0.0903 0.122 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 6.31e-01 0.0423 0.0881 0.122 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0747 0.136 0.122 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 7.52e-01 0.0333 0.105 0.122 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.58e-02 0.281 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0663 0.139 0.122 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 2.05e-01 -0.17 0.133 0.122 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 3.36e-01 -0.135 0.14 0.12 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 8.18e-02 -0.185 0.105 0.12 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.72e-01 0.0601 0.0834 0.12 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 8.36e-01 0.0182 0.088 0.12 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.60e-02 -0.219 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 7.58e-01 0.0346 0.112 0.12 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.128 0.12 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.86e-01 0.12 0.138 0.12 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 7.97e-01 0.0332 0.129 0.12 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 9.78e-02 0.234 0.141 0.116 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00314 0.145 0.116 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0574 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.112 0.116 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 4.27e-01 -0.112 0.141 0.116 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00787 0.138 0.116 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0514 0.143 0.116 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 2.42e-01 -0.187 0.159 0.116 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0848 0.141 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0493 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.101 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.37e-01 0.102 0.106 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.65e-01 0.0332 0.111 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 9.80e-01 0.00281 0.11 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 3.45e-01 -0.119 0.125 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.15e-01 -0.162 0.13 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 7.50e-01 0.0383 0.12 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 5.24e-01 0.064 0.1 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 4.79e-02 -0.242 0.121 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00787 0.0981 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.34e-01 0.0936 0.0967 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 5.75e-01 0.0565 0.101 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.38e-01 0.0568 0.0922 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 6.51e-02 0.217 0.117 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0478 0.129 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 6.28e-01 0.0579 0.119 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00543 0.0927 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 4.14e-01 -0.103 0.126 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0618 0.0766 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0313 0.076 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0658 0.0781 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 3.74e-01 0.0903 0.101 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00531 0.0901 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 7.95e-01 0.0302 0.116 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 3.37e-01 -0.115 0.119 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 8.55e-01 0.0213 0.117 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 7.86e-01 0.0376 0.138 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0772 0.0915 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 3.91e-01 0.0738 0.0858 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 4.85e-01 0.057 0.0815 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 1.37e-01 -0.188 0.126 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 422500 sc-eQTL 5.41e-01 0.0645 0.105 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.126 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 8.18e-01 0.0303 0.131 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 306459 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0396 0.135 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 627594 sc-eQTL 5.87e-01 0.0695 0.128 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 551161 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0564 0.1 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -308909 sc-eQTL 4.53e-01 0.0608 0.0809 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -338783 sc-eQTL 7.09e-01 0.0318 0.0849 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 331903 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0457 0.0857 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 sc-eQTL 1.51e-02 -0.26 0.106 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 531389 sc-eQTL 7.84e-01 0.0311 0.114 0.119 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162613 FUBP1 331903 eQTL 0.00308 0.0704 0.0237 0.00184 0.0 0.0967
ENSG00000162616 DNAJB4 331838 eQTL 0.00259 -0.102 0.0337 0.0 0.0 0.0967
ENSG00000180488 MIGA1 531389 eQTL 4.91e-02 -0.0471 0.0239 0.00109 0.0 0.0967
ENSG00000235927 NEXN-AS1 421474 eQTL 0.00278 -0.108 0.036 0.0 0.0 0.0967

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162613 FUBP1 331903 1.27e-06 9.48e-07 2.79e-07 3.89e-07 2.76e-07 4.35e-07 1.08e-06 3.46e-07 1.16e-06 3.82e-07 1.35e-06 5.97e-07 1.62e-06 2.61e-07 4.31e-07 7.17e-07 7.77e-07 5.63e-07 5.07e-07 6.25e-07 3.87e-07 1.11e-06 7.79e-07 5.6e-07 1.92e-06 3.59e-07 6.88e-07 6.46e-07 1.01e-06 1.06e-06 5.3e-07 7.24e-08 2.27e-07 5.28e-07 3.98e-07 3.94e-07 3.67e-07 1.47e-07 2.44e-07 1.04e-07 2.8e-07 1.29e-06 7.53e-08 1.95e-08 1.82e-07 7.91e-08 1.97e-07 8.74e-08 8.44e-08