logo

Genes within 1Mb (chr1:78303560:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 8.08e-04 0.615 0.181 0.051 B L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 3.61e-01 -0.123 0.134 0.051 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 2.96e-01 -0.163 0.155 0.051 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 4.11e-02 -0.289 0.141 0.051 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 7.41e-01 0.044 0.133 0.051 B L1
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0568 0.178 0.051 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.50e-01 0.141 0.186 0.051 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 6.15e-02 -0.298 0.158 0.051 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 3.63e-01 -0.127 0.139 0.051 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 2.23e-03 0.506 0.164 0.051 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 3.07e-01 -0.109 0.106 0.051 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 3.77e-01 -0.128 0.144 0.051 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 9.50e-02 -0.23 0.137 0.051 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 2.73e-01 0.11 0.1 0.051 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 2.76e-01 0.133 0.121 0.051 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 9.13e-01 0.0137 0.126 0.051 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 2.86e-03 0.461 0.153 0.051 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 3.77e-01 -0.131 0.148 0.051 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.57e-01 -0.11 0.147 0.051 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 3.02e-01 -0.149 0.144 0.051 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0667 0.12 0.051 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 9.54e-02 -0.272 0.163 0.051 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0556 0.165 0.051 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 2.52e-01 -0.185 0.161 0.051 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 7.51e-04 0.627 0.183 0.051 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 1.28e-01 0.168 0.11 0.051 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 3.19e-01 0.109 0.109 0.051 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 6.12e-01 0.0571 0.112 0.051 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 4.52e-01 -0.115 0.153 0.051 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 6.14e-01 0.0627 0.124 0.051 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.42e-01 0.13 0.169 0.051 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.17e-01 -0.171 0.171 0.051 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0711 0.176 0.051 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 2.50e-02 0.439 0.194 0.052 NK L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.96e-01 -0.105 0.155 0.052 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00636 0.127 0.052 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.82e-01 0.0197 0.133 0.052 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00401 0.128 0.052 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 1.76e-01 -0.238 0.176 0.052 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 5.34e-01 0.106 0.17 0.052 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.36e-02 0.462 0.186 0.051 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0782 0.15 0.051 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 6.05e-01 0.0837 0.161 0.051 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 5.87e-01 0.0895 0.165 0.051 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 1.22e-01 -0.202 0.131 0.051 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 9.58e-01 0.0107 0.2 0.051 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 2.78e-01 -0.211 0.194 0.051 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 4.89e-01 0.123 0.178 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 4.87e-01 0.155 0.222 0.051 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.34e-01 -0.105 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0911 0.182 0.051 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 2.04e-01 -0.234 0.183 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0155 0.213 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 4.11e-01 -0.142 0.173 0.051 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 3.06e-01 0.211 0.206 0.051 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 6.99e-04 -0.743 0.215 0.051 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 9.86e-01 0.00342 0.198 0.051 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 3.64e-03 0.565 0.192 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.03e-01 -0.148 0.176 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0638 0.168 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.90e-01 -0.222 0.169 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 5.65e-01 0.0967 0.168 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 5.38e-01 0.116 0.188 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0542 0.198 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.69e-01 0.167 0.186 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 3.02e-01 -0.165 0.16 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.78e-02 0.45 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0715 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0847 0.146 0.052 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 2.57e-01 -0.165 0.145 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0648 0.189 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 7.51e-01 0.0588 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 7.33e-01 0.0655 0.192 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 1.25e-01 0.294 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 4.37e-01 0.127 0.163 0.052 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 4.39e-03 0.552 0.192 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.82e-01 -0.116 0.164 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0994 0.148 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.75e-01 -0.209 0.154 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0447 0.152 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 7.80e-01 0.0511 0.183 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.42e-01 0.122 0.199 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 8.11e-02 -0.335 0.191 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0571 0.15 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.31e-01 0.304 0.2 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 9.69e-01 0.00695 0.182 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 1.88e-01 -0.197 0.149 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 3.72e-01 -0.147 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 3.90e-01 0.149 0.173 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 9.28e-01 0.0159 0.177 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 8.81e-01 0.0308 0.206 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 5.36e-01 -0.126 0.204 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 3.63e-01 0.158 0.173 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 6.50e-02 0.321 0.173 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.07e-01 -0.108 0.13 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0874 0.153 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.39e-01 -0.23 0.155 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 5.31e-02 0.214 0.11 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 3.71e-01 0.106 0.119 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.34e-01 -0.132 0.136 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 9.19e-07 0.89 0.176 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.14 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.09e-01 -0.118 0.142 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.09e-02 -0.26 0.148 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0867 0.139 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.01e-01 0.117 0.174 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.93e-01 -0.157 0.183 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.24e-02 0.445 0.176 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 5.15e-01 -0.12 0.185 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 3.50e-01 -0.16 0.171 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 2.19e-01 -0.213 0.172 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0554 0.167 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 1.62e-01 -0.272 0.194 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.10e-01 0.204 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 4.38e-01 0.149 0.192 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.96e-02 -0.331 0.168 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 8.84e-02 -0.248 0.145 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0383 0.164 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 5.53e-02 -0.296 0.153 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0378 0.183 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0968 0.169 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 9.58e-01 0.00914 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 7.43e-03 0.497 0.184 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 3.21e-01 -0.174 0.175 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.05e-01 -0.131 0.158 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.50e-01 -0.233 0.161 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0637 0.148 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 9.46e-01 0.0122 0.178 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 9.57e-01 0.00977 0.18 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 7.49e-01 -0.056 0.175 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 9.96e-02 0.334 0.202 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 2.03e-01 -0.26 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00299 0.196 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0647 0.178 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 2.04e-01 0.236 0.185 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 9.29e-02 -0.342 0.202 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0405 0.208 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0689 0.183 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.84e-02 0.471 0.198 0.052 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0702 0.176 0.052 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.59e-01 -0.12 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 5.55e-01 -0.106 0.18 0.052 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0899 0.192 0.052 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.93e-01 -0.134 0.196 0.052 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 2.74e-01 -0.214 0.195 0.052 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 8.77e-01 0.0278 0.179 0.052 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 7.45e-01 0.0663 0.203 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0102 0.2 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 2.52e-01 -0.178 0.155 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.44e-01 0.0346 0.175 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 3.22e-01 -0.188 0.19 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.48e-02 -0.371 0.184 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 4.01e-01 0.163 0.193 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 7.98e-01 0.071 0.277 0.056 PB L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 9.98e-02 -0.398 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 1.81e-01 -0.282 0.21 0.056 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0447 0.19 0.056 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 8.32e-01 0.0488 0.229 0.056 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 4.73e-01 0.15 0.209 0.056 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.72e-01 -0.129 0.227 0.056 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 1.82e-01 -0.352 0.262 0.056 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 8.11e-01 0.0557 0.232 0.056 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0391 0.201 0.052 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.46e-01 -0.142 0.186 0.052 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 1.54e-02 -0.344 0.141 0.052 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0603 0.155 0.052 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 6.75e-01 0.0714 0.17 0.052 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0751 0.194 0.052 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 1.67e-01 -0.261 0.188 0.052 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 7.32e-02 0.263 0.146 0.052 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 5.27e-02 0.381 0.195 0.051 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0693 0.178 0.051 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 1.17e-01 -0.218 0.138 0.051 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.08e-01 -0.231 0.143 0.051 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0686 0.17 0.051 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0651 0.189 0.051 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 3.76e-02 0.401 0.192 0.051 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 3.39e-02 0.411 0.193 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 4.84e-02 0.241 0.121 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.07e-01 0.0993 0.119 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 8.26e-01 0.0275 0.125 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 4.64e-01 -0.131 0.179 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0361 0.143 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.09e-01 0.121 0.182 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 1.37e-01 -0.294 0.197 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 6.31e-01 0.0873 0.182 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 1.51e-01 0.297 0.206 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 2.83e-01 0.161 0.15 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 5.68e-01 0.0705 0.123 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 9.61e-01 0.00596 0.121 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0197 0.181 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 2.72e-01 0.171 0.155 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 2.68e-01 0.218 0.196 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0329 0.201 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 8.57e-01 0.0351 0.195 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 8.62e-03 0.61 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.95e-01 0.0872 0.222 0.055 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 6.66e-01 0.0875 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 7.22e-01 0.0734 0.206 0.055 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 2.79e-01 0.246 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 6.23e-01 -0.108 0.218 0.055 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 9.70e-01 0.00857 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 9.25e-01 0.019 0.201 0.055 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 2.74e-01 0.232 0.211 0.051 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.90e-01 0.0703 0.176 0.051 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00436 0.128 0.051 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 9.83e-01 0.00262 0.125 0.051 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0487 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 6.93e-01 -0.059 0.149 0.051 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.37e-01 0.111 0.18 0.051 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 2.79e-01 0.214 0.197 0.051 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 3.00e-01 -0.197 0.19 0.051 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 3.71e-01 0.178 0.199 0.052 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0737 0.151 0.052 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 6.23e-02 -0.221 0.118 0.052 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.14e-01 -0.198 0.125 0.052 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 9.69e-01 0.00735 0.188 0.052 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 7.94e-01 0.0419 0.16 0.052 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0999 0.182 0.052 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 9.95e-01 0.00123 0.197 0.052 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 5.23e-01 -0.117 0.184 0.052 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 9.89e-04 0.622 0.186 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 5.01e-01 -0.103 0.152 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 5.12e-01 -0.105 0.16 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 6.28e-02 -0.311 0.166 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0246 0.166 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0854 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 9.52e-01 0.0119 0.197 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 6.71e-01 0.0771 0.182 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 4.45e-01 -0.116 0.151 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 2.26e-03 0.58 0.188 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0663 0.153 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 4.18e-01 -0.123 0.151 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 1.33e-01 -0.236 0.157 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 8.83e-01 0.0213 0.144 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 7.76e-01 0.0527 0.185 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.15e-01 0.165 0.202 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 5.40e-02 -0.359 0.185 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 9.63e-01 0.0067 0.145 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 7.98e-03 0.513 0.192 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 1.26e-02 0.295 0.117 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 3.24e-01 0.116 0.117 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 7.06e-01 0.0458 0.121 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0687 0.157 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 5.68e-01 0.0796 0.139 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 4.15e-01 0.146 0.179 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 1.05e-01 -0.3 0.184 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 5.82e-01 0.0995 0.181 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 sc-eQTL 3.18e-02 0.417 0.193 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 543708 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0594 0.129 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -316362 sc-eQTL 1.70e-01 -0.167 0.121 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -346236 sc-eQTL 3.24e-01 -0.114 0.115 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 324450 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0305 0.179 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 415047 sc-eQTL 4.09e-01 -0.123 0.149 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 324385 sc-eQTL 3.33e-01 -0.173 0.179 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 523936 sc-eQTL 5.39e-01 0.114 0.185 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 299006 sc-eQTL 5.71e-02 -0.361 0.189 0.052 CD16_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 eQTL 0.000137 0.0824 0.0215 0.00118 0.0 0.0618
ENSG00000077254 USP33 543708 eQTL 0.0037 -0.0607 0.0209 0.0 0.0 0.0618
ENSG00000137960 GIPC2 324018 pQTL 0.00692 0.113 0.0419 0.0 0.0 0.0636
ENSG00000162614 NEXN 415047 eQTL 0.0112 0.0769 0.0303 0.00217 0.0 0.0618

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 620141 1.64e-06 2.37e-06 4.93e-07 1.21e-06 4.68e-07 7.92e-07 1.31e-06 2.7e-07 1.72e-06 6.44e-07 2.41e-06 1.47e-06 2.68e-06 9.24e-07 8.93e-07 1.65e-06 1.12e-06 2.16e-06 6.7e-07 6.44e-07 7e-07 3.35e-06 1.34e-06 5.17e-07 2.86e-06 7.37e-07 1.17e-06 9.31e-07 1.79e-06 1.5e-06 1.06e-06 5.71e-08 2.29e-07 6e-07 4.66e-07 4.32e-07 5.61e-07 2.97e-07 1.23e-07 2.17e-07 1.44e-07 6.09e-06 4.01e-07 1.67e-07 1.55e-07 1.19e-07 2.15e-07 7.25e-09 5.39e-08