Genes within 1Mb (chr1:78295863:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.116 0.15 B L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.40e-01 -0.017 0.0838 0.15 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0204 0.0974 0.15 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00991 0.0889 0.15 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.65e-01 0.0929 0.0831 0.15 B L1
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 6.54e-01 0.0498 0.111 0.15 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.80e-02 -0.273 0.115 0.15 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0995 0.15 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 4.51e-01 0.0658 0.0872 0.15 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0895 0.106 0.15 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0225 0.0677 0.15 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0243 0.0919 0.15 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 6.31e-01 0.0422 0.0877 0.15 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0201 0.064 0.15 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.95e-03 -0.237 0.0755 0.15 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.78e-01 0.0867 0.0797 0.15 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0353 0.0989 0.15 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.58e-01 0.0168 0.0942 0.15 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 5.28e-01 -0.059 0.0933 0.15 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0442 0.0914 0.15 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.85e-01 0.0531 0.0759 0.15 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0252 0.104 0.15 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 6.42e-01 0.0487 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 3.58e-02 0.214 0.101 0.15 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 1.14e-01 0.18 0.113 0.149 DC L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 3.06e-01 0.105 0.103 0.149 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0764 0.0865 0.149 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0441 0.0851 0.149 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.22e-01 0.0402 0.113 0.149 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 1.26e-01 -0.166 0.108 0.149 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0854 0.118 0.149 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 3.00e-01 0.132 0.127 0.149 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.98e-01 -0.156 0.121 0.149 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.12 0.15 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 2.08e-01 -0.089 0.0705 0.15 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0787 0.0694 0.15 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.52e-02 -0.127 0.0712 0.15 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 9.59e-01 0.00497 0.0976 0.15 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0231 0.0793 0.15 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.94e-01 0.0145 0.108 0.15 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.96e-01 -0.114 0.109 0.15 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 4.38e-01 0.087 0.112 0.15 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.62e-01 0.111 0.122 0.148 NK L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0173 0.0961 0.148 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0664 0.0784 0.148 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.73e-01 0.0465 0.0825 0.148 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.04e-01 0.0819 0.0795 0.148 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 2.55e-01 -0.125 0.109 0.148 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 8.81e-01 0.0158 0.105 0.148 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 5.88e-02 -0.234 0.123 0.15 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00339 0.0987 0.15 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.34e-01 0.0224 0.106 0.15 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 2.53e-01 -0.124 0.108 0.15 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0235 0.0864 0.15 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 6.50e-02 0.243 0.131 0.15 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 4.30e-01 -0.101 0.128 0.15 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 6.67e-01 0.0504 0.117 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0615 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.48e-01 0.0429 0.134 0.161 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.161 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0369 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 5.84e-01 0.0708 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00791 0.105 0.161 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.88e-01 0.165 0.125 0.161 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 9.21e-01 0.0134 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 1.25e-01 -0.192 0.125 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 4.70e-01 0.0818 0.113 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 6.88e-01 0.0432 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 3.16e-01 -0.109 0.109 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.01e-01 -0.176 0.107 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 3.04e-01 -0.124 0.12 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 2.73e-03 -0.376 0.124 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.17e-01 0.147 0.119 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 7.09e-01 0.0383 0.103 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 4.02e-01 0.105 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0618 0.121 0.149 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 7.87e-01 0.0259 0.0957 0.149 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 1.88e-01 -0.126 0.0953 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.09e-01 0.127 0.124 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0199 0.121 0.149 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.64e-01 0.0216 0.126 0.149 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.01e-01 -0.206 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0646 0.107 0.149 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.78e-02 -0.25 0.12 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0204 0.102 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0393 0.0919 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00503 0.0955 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.60e-01 0.0864 0.0941 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 4.04e-01 0.0944 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 7.63e-02 -0.218 0.123 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.72e-01 0.163 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 8.89e-01 0.013 0.0929 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0715 0.113 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.59e-01 0.0165 0.0931 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0305 0.102 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 6.09e-01 -0.055 0.107 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 2.39e-01 0.129 0.109 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0347 0.128 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 3.11e-01 0.128 0.126 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 3.75e-01 0.0955 0.107 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 7.20e-01 0.0502 0.14 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0904 0.133 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0835 0.104 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 4.27e-02 0.242 0.118 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.27e-01 -0.159 0.132 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0762 0.13 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 5.69e-02 0.257 0.134 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0137 0.111 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0906 0.0825 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0304 0.0975 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0658 0.0988 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0682 0.0705 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 7.12e-03 -0.202 0.0742 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.0862 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.04e-01 0.0222 0.0891 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0564 0.0909 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 4.01e-01 0.08 0.095 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.48e-01 0.129 0.0886 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.83e-01 -0.148 0.111 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 8.62e-01 0.0204 0.117 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 2.44e-01 -0.133 0.114 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.03e-01 0.0449 0.118 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.59e-01 0.123 0.109 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 3.64e-01 -0.1 0.11 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 9.84e-01 0.00213 0.106 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0212 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0734 0.128 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0996 0.125 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0797 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 3.98e-01 0.0806 0.0951 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 3.07e-01 0.109 0.107 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0555 0.101 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0898 0.119 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0228 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.80e-01 0.152 0.113 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 6.44e-01 -0.054 0.117 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.57e-01 0.0338 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.94e-01 -0.103 0.098 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 8.10e-01 0.0243 0.101 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.19e-01 0.144 0.092 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 3.75e-01 0.0987 0.111 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 7.52e-01 0.0356 0.112 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.31e-01 0.165 0.108 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 4.98e-01 0.0858 0.126 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.79e-01 0.0193 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.71e-01 0.134 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.53e-01 0.0348 0.111 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.14e-02 0.265 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 5.38e-01 0.0782 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.25e-01 0.198 0.129 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 3.59e-01 0.104 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 5.48e-01 0.0818 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 4.20e-01 -0.11 0.136 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 9.87e-01 0.00167 0.101 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0543 0.104 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.94e-01 -0.086 0.126 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0472 0.126 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 6.18e-01 0.0671 0.134 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 2.50e-01 0.126 0.109 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.37e-01 -0.12 0.125 0.147 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 3.16e-01 -0.11 0.11 0.147 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.34e-01 0.0212 0.101 0.147 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 8.35e-01 0.0235 0.112 0.147 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.97e-01 0.0812 0.119 0.147 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.05e-01 0.0301 0.122 0.147 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0604 0.122 0.147 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.77e-01 -0.15 0.111 0.147 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.45e-01 0.122 0.129 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0707 0.129 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.30e-01 -0.114 0.0944 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.52e-01 0.0663 0.111 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0048 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.12e-01 0.195 0.122 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.38e-01 0.176 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 4.15e-01 0.102 0.125 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0401 0.104 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0547 0.0811 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 8.98e-01 0.0112 0.0868 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 6.09e-01 0.0487 0.0949 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0836 0.122 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 9.77e-01 0.00327 0.115 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 6.35e-01 0.0634 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 6.79e-02 -0.239 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.65e-01 0.114 0.102 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 8.80e-02 0.196 0.114 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.56e-01 0.142 0.124 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.48e-02 -0.209 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 8.29e-02 -0.219 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0353 0.124 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 3.30e-01 0.108 0.111 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0311 0.0785 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00285 0.0834 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.104 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.30e-02 -0.272 0.109 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 4.46e-01 0.0918 0.12 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.17e-01 -0.17 0.169 0.17 PB L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0481 0.149 0.17 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0337 0.13 0.17 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0431 0.116 0.17 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.93e-01 0.037 0.141 0.17 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 2.75e-01 -0.14 0.128 0.17 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0938 0.139 0.17 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 3.96e-01 0.138 0.161 0.17 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.142 0.17 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.89e-01 0.115 0.133 0.15 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 1.39e-01 0.183 0.123 0.15 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.52e-01 -0.109 0.0947 0.15 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0638 0.103 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.65e-01 0.126 0.113 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.36e-01 0.192 0.128 0.15 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.99e-01 -0.131 0.125 0.15 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.06e-01 0.158 0.0972 0.15 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 1.25e-02 -0.317 0.126 0.15 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 3.25e-01 0.113 0.115 0.15 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0731 0.0901 0.15 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 8.42e-02 0.161 0.0926 0.15 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.56e-02 -0.196 0.11 0.15 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00176 0.123 0.15 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.62e-02 0.3 0.124 0.15 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0264 0.136 0.149 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 3.97e-01 0.0989 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.02e-02 -0.154 0.0873 0.149 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 1.76e-01 -0.12 0.0886 0.149 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.07e-01 0.101 0.121 0.149 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 1.79e-03 -0.305 0.0962 0.149 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.34e-01 0.184 0.122 0.149 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 1.98e-02 0.314 0.134 0.149 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0999 0.124 0.149 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.26e-01 -0.12 0.122 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 1.24e-02 -0.191 0.0757 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 4.48e-01 -0.057 0.0749 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.92e-03 -0.207 0.0772 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.43e-01 0.0368 0.112 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 2.00e-01 -0.115 0.0896 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 4.00e-01 0.0963 0.114 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.53e-02 -0.276 0.123 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 7.99e-01 0.029 0.114 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0266 0.13 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 9.48e-01 0.00609 0.0939 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 4.12e-02 -0.157 0.0764 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0485 0.0758 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.17e-01 0.092 0.113 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0971 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 6.67e-01 0.053 0.123 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 3.99e-01 0.106 0.126 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 7.18e-02 -0.3 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0569 0.158 0.121 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.53e-01 -0.165 0.144 0.121 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 1.44e-01 -0.215 0.146 0.121 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 2.02e-01 -0.207 0.161 0.121 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00496 0.156 0.121 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.72e-02 0.361 0.162 0.121 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 7.86e-02 0.251 0.142 0.121 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.79e-02 0.289 0.138 0.149 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 1.45e-01 0.169 0.115 0.149 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0501 0.0846 0.149 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0809 0.0824 0.149 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0375 0.127 0.149 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0563 0.0984 0.149 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.83e-02 0.202 0.118 0.149 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0518 0.13 0.149 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 3.27e-01 -0.123 0.125 0.149 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0809 0.134 0.147 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0562 0.102 0.147 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0905 0.0799 0.147 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 5.86e-02 -0.159 0.0837 0.147 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.91e-01 -0.165 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0735 0.107 0.147 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 8.06e-01 0.0302 0.123 0.147 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.93e-01 0.139 0.132 0.147 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 6.10e-01 0.0632 0.124 0.147 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.49e-02 0.282 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 6.77e-01 0.0574 0.137 0.147 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0365 0.105 0.147 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 7.69e-01 0.0313 0.106 0.147 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 6.43e-01 -0.062 0.133 0.147 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0924 0.13 0.147 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 2.31e-01 -0.162 0.135 0.147 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 4.18e-01 -0.122 0.151 0.147 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 1.27e-01 -0.204 0.133 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0461 0.122 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0436 0.0976 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0252 0.103 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0502 0.107 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0117 0.106 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 4.50e-01 -0.092 0.121 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 5.48e-02 -0.242 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 8.21e-01 0.0263 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 8.29e-01 0.021 0.0972 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 9.80e-02 -0.196 0.118 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0554 0.0949 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00703 0.0938 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 9.83e-01 0.00213 0.0976 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 1.93e-01 0.116 0.089 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 1.82e-01 0.153 0.114 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.44e-01 -0.183 0.125 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.08e-01 0.145 0.115 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 4.31e-01 0.0707 0.0896 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 3.07e-01 -0.125 0.122 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 1.12e-01 -0.118 0.074 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 1.33e-01 -0.111 0.0733 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 3.29e-02 -0.161 0.0751 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 4.48e-01 0.0749 0.0984 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0923 0.0871 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 4.71e-01 0.0811 0.112 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 2.40e-01 -0.136 0.116 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 3.42e-01 0.108 0.113 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 2.31e-01 0.157 0.131 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 6.80e-01 0.0359 0.0869 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0928 0.0813 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 1.18e-01 -0.121 0.077 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.57e-01 -0.111 0.12 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 407350 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0425 0.0999 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 5.18e-01 0.0779 0.12 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 5.29e-01 0.0785 0.124 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 291309 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0418 0.128 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 612444 sc-eQTL 4.82e-01 0.0869 0.123 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 536011 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0137 0.0969 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -324059 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0487 0.0781 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -353933 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00237 0.082 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 316753 sc-eQTL 3.53e-01 0.0769 0.0826 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 sc-eQTL 1.83e-02 -0.244 0.102 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 516239 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0334 0.11 0.149 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162613 FUBP1 316753 eQTL 0.0157 0.0502 0.0207 0.0 0.0 0.133
ENSG00000162616 DNAJB4 316688 eQTL 0.0182 -0.0697 0.0295 0.0 0.0 0.133
ENSG00000219201 AC138392.1 484082 eQTL 0.0328 0.117 0.0546 0.00133 0.0 0.133
ENSG00000235927 NEXN-AS1 406324 eQTL 0.011 -0.0803 0.0315 0.0 0.0 0.133


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina