logo

Genes within 1Mb (chr1:78286685:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 4.59e-01 0.0761 0.103 0.199 B L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.99e-01 -0.039 0.0741 0.199 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0472 0.0861 0.199 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0845 0.0784 0.199 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 2.34e-01 0.0878 0.0735 0.199 B L1
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 6.83e-01 0.0401 0.0982 0.199 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 9.56e-02 -0.171 0.102 0.199 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.84e-01 0.00173 0.0883 0.199 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 9.71e-01 0.00284 0.0772 0.199 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 3.74e-01 0.0823 0.0925 0.199 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0525 0.059 0.199 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0421 0.0801 0.199 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0266 0.0765 0.199 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 8.32e-01 0.0119 0.0558 0.199 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.26e-02 -0.143 0.0667 0.199 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 3.04e-01 0.0716 0.0695 0.199 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 1.73e-01 0.118 0.0866 0.199 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0289 0.0828 0.199 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0523 0.082 0.199 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0685 0.0803 0.199 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.45e-01 0.0217 0.0668 0.199 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 2.68e-01 -0.101 0.091 0.199 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 8.63e-01 0.0159 0.0919 0.199 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.64e-01 0.1 0.0896 0.199 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.84e-02 0.173 0.0978 0.198 DC L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.30e-01 0.0429 0.0889 0.198 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0687 0.0749 0.198 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0471 0.0736 0.198 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.62e-01 0.0296 0.0977 0.198 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 1.23e-01 -0.144 0.0932 0.198 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0774 0.102 0.198 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.23e-01 0.169 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0873 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 3.67e-01 0.0949 0.105 0.199 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0153 0.0619 0.199 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0299 0.0609 0.199 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0832 0.0625 0.199 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0115 0.0854 0.199 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00354 0.0694 0.199 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 7.07e-01 0.0356 0.0944 0.199 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.19e-01 -0.149 0.095 0.199 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 5.46e-01 0.0592 0.0981 0.199 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 4.57e-02 0.215 0.107 0.197 NK L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0466 0.0847 0.197 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0489 0.0692 0.197 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.26e-01 0.0462 0.0728 0.197 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.87e-01 0.0608 0.0702 0.197 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 9.12e-02 -0.163 0.096 0.197 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 6.80e-01 0.0383 0.093 0.197 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0229 0.106 0.199 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0193 0.0843 0.199 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.58e-01 0.0533 0.0908 0.199 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0424 0.0926 0.199 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0725 0.0737 0.199 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 1.15e-01 0.178 0.112 0.199 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.44e-01 -0.159 0.109 0.199 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 3.84e-01 0.087 0.0998 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00255 0.12 0.209 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00152 0.118 0.209 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0972 0.209 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0858 0.0986 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.78e-01 0.0475 0.114 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0426 0.0928 0.209 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 6.73e-02 0.202 0.11 0.209 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.18e-01 -0.186 0.119 0.209 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.07e-01 -0.134 0.106 0.209 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 6.89e-01 0.0442 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.85e-01 0.0144 0.0994 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 7.41e-01 0.0313 0.0945 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.39e-01 -0.141 0.0952 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 1.77e-01 -0.127 0.094 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0537 0.106 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 8.24e-03 -0.292 0.109 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.15e-01 0.165 0.104 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0347 0.0901 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 5.88e-02 0.205 0.108 0.198 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0705 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 8.86e-01 0.0119 0.0829 0.198 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.93e-02 -0.15 0.0823 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.71e-01 0.0966 0.108 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 8.47e-01 0.0203 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 6.00e-01 0.0572 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0437 0.109 0.198 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0255 0.0927 0.198 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0344 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0407 0.0896 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0461 0.0809 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0563 0.0841 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 4.82e-01 0.0584 0.083 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 3.03e-01 0.103 0.0995 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 1.93e-01 -0.142 0.108 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 7.93e-01 0.0277 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00603 0.0818 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 4.89e-01 0.0757 0.109 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0334 0.0985 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0235 0.0814 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0572 0.0891 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 9.16e-01 0.00987 0.0939 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 2.70e-01 0.106 0.0956 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0182 0.112 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.84e-01 0.0605 0.11 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 3.26e-01 0.0923 0.0938 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 9.22e-01 -0.012 0.123 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0622 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00548 0.0913 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.93e-01 0.0899 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 4.04e-01 -0.097 0.116 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 9.02e-01 -0.014 0.114 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.46e-02 0.228 0.118 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 3.45e-01 0.0916 0.0967 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.072 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0352 0.0852 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.96e-01 -0.112 0.0861 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 8.62e-01 0.0108 0.0618 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 6.78e-02 -0.12 0.0654 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 4.81e-01 0.0533 0.0756 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 9.28e-02 0.174 0.103 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0776 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0668 0.0791 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00695 0.0829 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 4.03e-01 0.0649 0.0774 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0786 0.0966 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0343 0.102 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.23e-01 0.0352 0.0993 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00994 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.44e-01 0.0577 0.0949 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.45e-01 -0.14 0.0954 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0155 0.0925 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 2.83e-01 -0.116 0.108 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.49e-01 0.00714 0.111 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0237 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 7.47e-02 -0.17 0.0949 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00483 0.0825 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.86e-01 0.0802 0.0924 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 9.95e-02 -0.144 0.0869 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 4.68e-01 -0.075 0.103 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0541 0.0955 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.52e-01 0.112 0.0978 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 2.66e-01 0.114 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0174 0.0958 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0987 0.0861 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0415 0.0887 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 2.17e-01 0.1 0.081 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 5.18e-01 0.0632 0.0976 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 7.71e-01 0.0288 0.0988 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.97e-01 0.1 0.0956 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 9.61e-02 0.187 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0505 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.108 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00269 0.0982 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.47e-03 0.298 0.101 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0398 0.113 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 2.83e-01 0.123 0.115 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 6.63e-01 0.0441 0.101 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 1.63e-01 0.167 0.12 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 3.92e-01 -0.103 0.121 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 3.96e-01 0.0755 0.0887 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00627 0.0923 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 2.66e-01 -0.123 0.111 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0624 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.95e-01 0.000679 0.119 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 4.77e-01 0.0689 0.0968 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 6.92e-01 0.0438 0.111 0.197 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0933 0.097 0.197 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0135 0.0895 0.197 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 9.53e-01 0.00589 0.0994 0.197 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.54e-01 0.0475 0.106 0.197 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 8.39e-01 -0.022 0.108 0.197 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 2.48e-01 -0.124 0.107 0.197 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0983 0.0985 0.197 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 8.64e-02 0.199 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.30e-01 -0.025 0.116 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0421 0.0856 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.05e-01 0.0521 0.101 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.73e-01 0.0308 0.107 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 7.49e-01 0.0356 0.111 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 6.07e-02 0.201 0.107 0.196 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 5.27e-02 0.213 0.109 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0488 0.0916 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0405 0.0714 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 8.11e-01 0.0183 0.0763 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 5.70e-01 0.0475 0.0835 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0892 0.107 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.49e-01 0.00646 0.101 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 6.14e-01 0.058 0.115 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 9.50e-02 -0.188 0.112 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 7.25e-01 0.0309 0.0878 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 8.69e-02 0.169 0.0983 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.62e-01 0.047 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 8.79e-03 -0.273 0.103 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 2.73e-01 -0.12 0.109 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 3.76e-01 0.0964 0.109 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 4.74e-01 0.0698 0.0973 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0495 0.0688 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.03e-01 -0.038 0.0731 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.95e-01 0.0783 0.0919 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 8.75e-02 -0.165 0.096 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 3.34e-01 0.102 0.105 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 4.70e-01 -0.105 0.145 0.226 PB L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 2.54e-01 -0.146 0.127 0.226 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 3.55e-01 -0.103 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.59e-01 -0.044 0.0997 0.226 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.37e-01 0.0407 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0613 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.82e-01 -0.105 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.78e-01 0.0038 0.139 0.226 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 4.09e-01 0.101 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 4.24e-01 0.0923 0.115 0.2 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 4.00e-01 0.0899 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 2.30e-02 -0.185 0.0809 0.2 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0669 0.0889 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 2.14e-01 0.121 0.0974 0.2 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 2.80e-01 0.12 0.111 0.2 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 8.49e-02 -0.186 0.108 0.2 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 1.35e-02 0.207 0.0831 0.2 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 2.51e-01 -0.126 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.16e-01 0.0645 0.0992 0.199 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 1.45e-01 -0.113 0.0773 0.199 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 4.69e-01 0.0583 0.0802 0.199 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.06e-02 -0.178 0.0945 0.199 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0355 0.106 0.199 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 8.03e-04 0.358 0.105 0.199 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.38e-01 0.0396 0.118 0.198 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 9.74e-01 0.00326 0.102 0.198 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 9.95e-02 -0.126 0.0759 0.198 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0801 0.0772 0.198 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 1.28e-01 0.16 0.105 0.198 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 6.77e-03 -0.231 0.0842 0.198 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.86e-01 0.0928 0.107 0.198 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 1.72e-02 0.279 0.116 0.198 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 3.51e-01 -0.101 0.108 0.198 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.52e-01 0.0337 0.107 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0723 0.0668 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0127 0.0655 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 3.05e-02 -0.148 0.0678 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00904 0.0979 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0962 0.0782 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 2.90e-01 0.106 0.0996 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.48e-03 -0.298 0.106 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 6.02e-01 0.0519 0.0993 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 5.42e-01 0.0694 0.114 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.92e-01 0.0441 0.0821 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 1.50e-01 -0.097 0.0672 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0349 0.0663 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 3.98e-01 0.0839 0.099 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0291 0.0852 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.85e-01 0.0938 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.14e-01 0.0718 0.11 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 1.93e-01 0.139 0.107 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 9.49e-01 0.00893 0.141 0.173 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0356 0.133 0.173 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.06e-01 -0.101 0.121 0.173 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.123 0.173 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0465 0.136 0.173 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0515 0.131 0.173 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 7.15e-02 0.248 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 1.24e-01 0.185 0.119 0.173 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 1.64e-02 0.285 0.118 0.2 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 1.41e-01 0.146 0.0986 0.2 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.00e-01 -0.038 0.0724 0.2 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0583 0.0705 0.2 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0429 0.109 0.2 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 4.77e-01 -0.06 0.0841 0.2 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 7.06e-02 0.183 0.101 0.2 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 7.86e-01 0.0302 0.111 0.2 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 1.54e-01 -0.153 0.107 0.2 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0147 0.114 0.197 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0407 0.0868 0.197 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 3.51e-02 -0.143 0.0675 0.197 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.11e-02 -0.181 0.0708 0.197 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 2.19e-01 -0.132 0.107 0.197 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0297 0.0916 0.197 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00903 0.105 0.197 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.197 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 8.43e-01 0.0209 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 1.07e-01 0.182 0.112 0.195 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.41e-01 0.0539 0.116 0.195 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0727 0.0879 0.195 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0392 0.0896 0.195 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0544 0.112 0.195 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0326 0.11 0.195 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.50e-01 -0.106 0.113 0.195 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00532 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0271 0.113 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 1.33e-01 0.162 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0709 0.0857 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0395 0.0902 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 1.73e-01 -0.129 0.0941 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0244 0.0933 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0873 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 1.53e-01 -0.158 0.11 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 6.16e-01 0.0514 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0333 0.0854 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 8.88e-01 0.0147 0.104 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0447 0.0835 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0245 0.0826 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0572 0.0858 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 1.79e-01 0.106 0.0783 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 3.61e-01 -0.101 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.47e-01 0.00674 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 5.19e-01 0.0509 0.0789 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 6.71e-01 0.0454 0.107 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0211 0.065 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0522 0.0643 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 8.93e-02 -0.112 0.0659 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 6.06e-01 0.0445 0.086 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0547 0.0762 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 2.76e-01 0.107 0.0981 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 5.90e-02 -0.191 0.1 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.69e-01 0.109 0.0986 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 2.05e-02 0.256 0.11 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 8.30e-01 0.0158 0.0738 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 9.84e-02 -0.114 0.0687 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 8.06e-02 -0.115 0.0652 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0714 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 398172 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0475 0.0847 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 9.93e-01 0.000834 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 4.36e-01 0.0823 0.106 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 282131 sc-eQTL 2.79e-01 -0.117 0.108 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 sc-eQTL 7.32e-02 0.194 0.108 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526833 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0414 0.0852 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -333237 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0519 0.0687 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363111 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00476 0.0721 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 307575 sc-eQTL 5.59e-01 0.0426 0.0727 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 sc-eQTL 1.05e-02 -0.232 0.09 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 507061 sc-eQTL 9.86e-01 0.00171 0.0965 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 603266 eQTL 0.0191 0.0309 0.0132 0.0 0.0 0.194
ENSG00000077254 USP33 526833 eQTL 0.00098 -0.042 0.0127 0.0 0.0 0.194
ENSG00000162613 FUBP1 307575 eQTL 0.0279 0.0384 0.0174 0.0 0.0 0.194
ENSG00000162616 DNAJB4 307510 eQTL 0.0176 -0.0588 0.0248 0.0 0.0 0.194
ENSG00000219201 AC138392.1 474904 eQTL 0.0429 0.0931 0.0459 0.00115 0.0 0.194

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000077254 USP33 526833 2.6e-06 2.63e-06 2.17e-07 1.17e-06 3.23e-07 8.89e-07 1.32e-06 3.95e-07 1.75e-06 7.1e-07 3.76e-06 1.29e-06 4.58e-06 1.42e-06 1.47e-06 1.04e-06 9.41e-07 2.24e-06 8.2e-07 6.9e-07 8.12e-07 3.44e-06 2.67e-06 6.27e-07 2.61e-06 6.57e-07 9.48e-07 7.16e-07 1.81e-06 1.47e-06 1.96e-06 7.12e-08 1.95e-07 5.78e-07 5.82e-07 6.66e-07 2.59e-07 1.14e-07 1.23e-07 8.15e-09 4.72e-08 2.52e-05 2.46e-07 1.3e-08 1.91e-07 1.02e-07 1.9e-07 2.35e-08 8.28e-08
ENSG00000162613 FUBP1 307575 5.28e-06 6.19e-06 7.57e-07 1.97e-06 4.72e-07 1.81e-06 5.6e-06 9.02e-07 4.99e-06 2.01e-06 9.14e-06 3.28e-06 1.06e-05 1.65e-06 2.02e-06 3.81e-06 1.79e-06 3.95e-06 1.57e-06 1.33e-06 2.79e-06 7.65e-06 5.02e-06 1.6e-06 6.39e-06 1.26e-06 1.58e-06 1.77e-06 4.46e-06 3.75e-06 4.77e-06 2.38e-07 5.85e-07 9.63e-07 1.95e-06 9.61e-07 7.58e-07 3.15e-07 5.35e-07 2.43e-07 1.3e-07 6.87e-05 4.8e-07 2e-08 3.45e-07 3.21e-07 8.29e-07 8.19e-08 2.3e-07