logo

Genes within 1Mb (chr1:78285889:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 8.08e-01 0.0343 0.141 0.09 B L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0568 0.102 0.09 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.33e-01 0.025 0.118 0.09 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.44e-01 0.0656 0.108 0.09 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.73e-01 0.138 0.101 0.09 B L1
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 9.07e-02 0.228 0.134 0.09 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0373 0.141 0.09 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.121 0.09 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 3.56e-01 0.0979 0.106 0.09 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.34e-03 -0.372 0.125 0.09 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.78e-01 0.0579 0.0815 0.09 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 6.67e-01 0.0477 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.106 0.09 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0988 0.0768 0.09 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0778 0.0929 0.09 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0502 0.0961 0.09 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.01e-02 -0.246 0.119 0.09 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.24e-01 0.0253 0.113 0.09 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0452 0.111 0.09 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0813 0.0922 0.09 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.68e-01 -0.14 0.126 0.09 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 3.93e-01 0.109 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0576 0.124 0.09 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.27e-01 -0.214 0.14 0.092 DC L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.19e-01 0.156 0.126 0.092 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.09e-01 0.109 0.107 0.092 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 9.39e-01 0.00808 0.105 0.092 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 2.32e-01 -0.166 0.139 0.092 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 4.03e-01 0.112 0.133 0.092 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 1.12e-01 0.23 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.53e-01 0.179 0.156 0.092 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0877 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 2.11e-01 -0.183 0.146 0.09 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 1.76e-02 0.203 0.0849 0.09 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0247 0.0846 0.09 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0902 0.087 0.09 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 2.20e-01 -0.146 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.32e-01 0.145 0.096 0.09 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.25e-01 -0.105 0.131 0.09 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.24e-01 0.204 0.132 0.09 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 3.09e-01 -0.139 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.68e-01 -0.215 0.155 0.09 NK L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.47e-01 0.0738 0.122 0.09 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0779 0.0999 0.09 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.70e-01 -0.144 0.105 0.09 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.101 0.09 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0435 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 8.87e-01 0.019 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 6.10e-01 0.0747 0.146 0.09 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0942 0.116 0.09 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.26e-01 0.1 0.125 0.09 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 4.07e-01 0.106 0.128 0.09 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 6.41e-01 0.0477 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0336 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.19e-01 -0.185 0.15 0.09 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0491 0.138 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 5.07e-01 -0.112 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.09e-01 0.138 0.167 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.32e-01 0.0295 0.138 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.36e-01 0.208 0.139 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.07e-01 0.26 0.16 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 4.13e-01 -0.108 0.131 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 7.90e-01 0.0419 0.157 0.087 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0646 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 6.89e-01 0.0604 0.151 0.087 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 6.50e-01 0.0695 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.54e-01 -0.103 0.138 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.131 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 2.75e-01 0.145 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.73e-01 0.178 0.13 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 2.71e-02 0.322 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.53e-01 0.0285 0.154 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.79e-01 0.157 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.03e-01 0.203 0.124 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.66e-01 -0.136 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.84e-01 -0.156 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 6.78e-01 0.0478 0.115 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.97e-01 0.148 0.115 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0264 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 9.74e-02 0.241 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.46e-01 0.0293 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.76e-01 0.0432 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 3.67e-01 0.116 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.54e-01 0.138 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0718 0.125 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0115 0.113 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 4.20e-01 0.0946 0.117 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.97e-01 0.0982 0.116 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 3.63e-01 -0.127 0.139 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.00e-01 -0.128 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.57e-01 -0.207 0.146 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.73e-01 0.125 0.114 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0346 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.49e-01 0.131 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.12e-01 0.117 0.115 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.83e-01 0.169 0.126 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0351 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 9.68e-01 0.00553 0.136 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.64e-01 -0.177 0.158 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.56e-01 0.223 0.156 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 4.95e-01 0.0912 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.26e-02 -0.336 0.165 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.94e-01 0.135 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.21e-01 -0.028 0.124 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0186 0.142 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 5.52e-01 0.0934 0.157 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.36e-01 -0.12 0.154 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 4.30e-01 -0.127 0.161 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.04e-02 -0.288 0.132 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 7.99e-01 0.0254 0.0997 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.72e-01 0.105 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 8.11e-01 0.0286 0.119 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.29e-01 0.0184 0.0852 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0866 0.0908 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 6.88e-01 -0.042 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.21e-04 -0.545 0.139 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 6.52e-01 0.0488 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 6.66e-01 0.0477 0.11 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 6.68e-01 0.0496 0.115 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.34e-01 -0.162 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 9.25e-01 0.0126 0.135 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.41e-01 -0.047 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.17e-01 -0.113 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0332 0.143 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0646 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 9.53e-01 0.00799 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 4.02e-02 -0.265 0.128 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.46e-01 0.0295 0.151 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0279 0.156 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.47e-01 -0.217 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 9.61e-01 0.00654 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.00e-01 -0.118 0.114 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 6.28e-01 0.062 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.12 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 1.76e-01 -0.193 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.18e-01 0.206 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.59e-01 -0.19 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 7.12e-02 -0.257 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0887 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.79e-01 0.106 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.11e-01 -0.126 0.124 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 7.05e-01 -0.043 0.113 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 3.59e-01 0.125 0.136 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 6.10e-01 0.0704 0.138 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 4.07e-01 -0.111 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.38e-02 -0.387 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.61e-01 0.0925 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0252 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0259 0.138 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0517 0.145 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 9.85e-01 0.00292 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0173 0.162 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.86e-01 -0.188 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.78e-01 -0.123 0.174 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.75e-02 0.345 0.173 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.128 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 4.33e-01 -0.105 0.133 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0203 0.161 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0378 0.162 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 5.93e-01 0.092 0.172 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 3.37e-01 -0.135 0.14 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 6.58e-01 0.0681 0.153 0.089 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.43e-01 -0.082 0.135 0.089 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0344 0.124 0.089 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0835 0.138 0.089 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.07e-02 -0.255 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0235 0.15 0.089 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0414 0.149 0.089 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 6.17e-01 0.0686 0.137 0.089 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0313 0.164 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 7.64e-01 0.049 0.163 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.31e-01 0.0887 0.141 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 5.71e-01 -0.085 0.15 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.26e-01 0.125 0.156 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.89e-01 0.0405 0.151 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.93e-01 -0.137 0.161 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.64e-01 0.149 0.133 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 2.45e-01 -0.121 0.104 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.66e-01 -0.101 0.111 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0597 0.122 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0228 0.156 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.146 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.01e-01 -0.145 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.78e-01 -0.15 0.17 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 6.48e-01 0.0604 0.132 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0542 0.149 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.162 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 5.78e-01 0.088 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.79e-01 -0.178 0.164 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.55e-01 -0.232 0.162 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.78e-01 -0.104 0.146 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.43e-01 0.0791 0.103 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 9.61e-02 -0.182 0.109 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.138 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.47e-01 0.167 0.144 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.64e-01 0.22 0.157 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.14e-03 0.643 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.92e-01 -0.205 0.194 0.089 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 2.38e-01 0.2 0.168 0.089 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.24e-01 0.0969 0.152 0.089 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.71e-01 -0.03 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 9.09e-01 0.0192 0.168 0.089 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.17e-01 0.224 0.181 0.089 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 3.94e-01 0.18 0.211 0.089 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.59e-01 -0.209 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 5.34e-01 -0.102 0.163 0.089 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.53e-01 -0.141 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.115 0.089 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.25e-02 0.269 0.125 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.46e-03 0.363 0.136 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0817 0.158 0.089 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 7.96e-01 0.0399 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.83e-01 -0.159 0.119 0.089 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0206 0.155 0.09 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 1.85e-01 -0.185 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.72e-01 0.098 0.11 0.09 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.07e-01 0.0752 0.113 0.09 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 9.19e-01 0.0137 0.134 0.09 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 4.06e-01 -0.124 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 5.12e-01 -0.1 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.47e-01 -0.13 0.17 0.08 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 6.77e-01 0.061 0.146 0.08 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.28e-01 0.108 0.11 0.08 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.08 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 2.20e-02 -0.347 0.15 0.08 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.123 0.08 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.01e-01 0.197 0.154 0.08 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 3.07e-01 0.173 0.169 0.08 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.60e-01 -0.175 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 1.03e-01 -0.245 0.149 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.13e-02 0.192 0.0936 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 9.63e-01 0.00427 0.0923 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0963 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0657 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 7.37e-01 0.0373 0.111 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000465 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.68e-01 0.21 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.67e-01 -0.193 0.14 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 6.60e-01 0.071 0.161 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 4.37e-01 0.0904 0.116 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 9.83e-01 0.00209 0.0956 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.99e-01 0.0793 0.0938 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.77e-01 -0.124 0.14 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0657 0.153 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 1.56e-01 0.221 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0662 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.80e-01 0.143 0.202 0.082 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 2.51e-01 0.22 0.191 0.082 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 5.24e-01 0.112 0.175 0.082 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 7.97e-01 -0.046 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 1.14e-01 0.31 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 2.89e-01 0.2 0.188 0.082 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.20e-01 -0.244 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 1.61e-01 -0.242 0.172 0.082 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 5.13e-01 -0.114 0.173 0.091 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 5.08e-02 0.28 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 2.36e-01 -0.125 0.105 0.091 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 2.39e-02 -0.231 0.101 0.091 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0477 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.82e-01 0.163 0.122 0.091 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 6.25e-01 0.072 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 6.25e-01 0.0793 0.162 0.091 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.22e-01 0.19 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.86e-01 -0.108 0.155 0.09 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 8.72e-01 -0.019 0.118 0.09 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0245 0.0924 0.09 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0971 0.09 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 2.15e-01 -0.181 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.26e-01 0.19 0.123 0.09 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0877 0.142 0.09 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0891 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 3.49e-01 0.134 0.143 0.09 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0112 0.16 0.088 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.70e-01 0.146 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 8.29e-01 0.0269 0.124 0.088 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00352 0.127 0.088 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0283 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 7.94e-01 0.0405 0.155 0.088 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 1.03e-01 0.262 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 4.38e-01 -0.139 0.179 0.088 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 4.66e-01 -0.116 0.159 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0527 0.148 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.118 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.62e-01 0.0913 0.124 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 3.45e-01 0.122 0.129 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 2.45e-01 0.149 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 3.27e-02 0.312 0.145 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 8.21e-01 0.0345 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 2.93e-01 0.148 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.81e-02 0.256 0.116 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 6.19e-01 0.0727 0.146 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00223 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 4.67e-01 0.0839 0.115 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.90e-01 0.157 0.119 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 4.77e-01 0.0781 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0368 0.141 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 1.48e-01 -0.222 0.153 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0692 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 4.04e-01 0.0921 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 4.58e-01 -0.112 0.151 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 7.25e-02 0.165 0.0913 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 9.61e-01 0.00446 0.0912 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0539 0.0938 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.90e-01 -0.105 0.122 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 1.80e-01 0.145 0.108 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0432 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 5.06e-02 0.279 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.18e-01 -0.173 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 3.78e-01 -0.135 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 3.59e-01 0.0931 0.101 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0956 0.0949 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 1.20e-01 -0.14 0.0899 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 3.90e-01 -0.121 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397376 sc-eQTL 2.58e-01 0.132 0.116 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 9.57e-01 0.00765 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0294 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 281335 sc-eQTL 2.96e-01 0.156 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602470 sc-eQTL 7.77e-02 -0.278 0.157 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 526037 sc-eQTL 7.63e-01 0.0375 0.124 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334033 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.0998 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -363907 sc-eQTL 8.70e-02 -0.18 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306779 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0853 0.106 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306714 sc-eQTL 5.31e-01 0.0834 0.133 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 506265 sc-eQTL 8.41e-01 0.0283 0.141 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 306347 pQTL 0.047 -0.0689 0.0347 0.0 0.0 0.095

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina