logo

Genes within 1Mb (chr1:78285521:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 8.08e-01 0.0343 0.141 0.09 B L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0568 0.102 0.09 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.33e-01 0.025 0.118 0.09 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.44e-01 0.0656 0.108 0.09 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.73e-01 0.138 0.101 0.09 B L1
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 9.07e-02 0.228 0.134 0.09 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0373 0.141 0.09 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0253 0.121 0.09 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 3.56e-01 0.0979 0.106 0.09 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.34e-03 -0.372 0.125 0.09 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.78e-01 0.0579 0.0815 0.09 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 6.67e-01 0.0477 0.111 0.09 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.106 0.09 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0988 0.0768 0.09 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0778 0.0929 0.09 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0502 0.0961 0.09 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.01e-02 -0.246 0.119 0.09 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.82e-01 0.123 0.114 0.09 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.24e-01 0.0253 0.113 0.09 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0452 0.111 0.09 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0813 0.0922 0.09 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.68e-01 -0.14 0.126 0.09 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 3.93e-01 0.109 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0576 0.124 0.09 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.27e-01 -0.214 0.14 0.092 DC L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.19e-01 0.156 0.126 0.092 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.09e-01 0.109 0.107 0.092 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 9.39e-01 0.00808 0.105 0.092 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 2.32e-01 -0.166 0.139 0.092 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 4.03e-01 0.112 0.133 0.092 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 1.12e-01 0.23 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.53e-01 0.179 0.156 0.092 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0877 0.149 0.092 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 2.11e-01 -0.183 0.146 0.09 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 1.76e-02 0.203 0.0849 0.09 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0247 0.0846 0.09 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0902 0.087 0.09 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 2.20e-01 -0.146 0.118 0.09 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.32e-01 0.145 0.096 0.09 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.25e-01 -0.105 0.131 0.09 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.24e-01 0.204 0.132 0.09 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 3.09e-01 -0.139 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.68e-01 -0.215 0.155 0.09 NK L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.47e-01 0.0738 0.122 0.09 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0779 0.0999 0.09 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.70e-01 -0.144 0.105 0.09 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.101 0.09 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0435 0.14 0.09 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 8.87e-01 0.019 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 6.10e-01 0.0747 0.146 0.09 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0942 0.116 0.09 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.26e-01 0.1 0.125 0.09 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 4.07e-01 0.106 0.128 0.09 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 6.41e-01 0.0477 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0336 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.19e-01 -0.185 0.15 0.09 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0491 0.138 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 5.07e-01 -0.112 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.09e-01 0.138 0.167 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.32e-01 0.0295 0.138 0.087 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.36e-01 0.208 0.139 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.07e-01 0.26 0.16 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 4.13e-01 -0.108 0.131 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 7.90e-01 0.0419 0.157 0.087 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0646 0.169 0.087 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 6.89e-01 0.0604 0.151 0.087 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 6.50e-01 0.0695 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.54e-01 -0.103 0.138 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 1.98e-01 0.168 0.131 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 2.75e-01 0.145 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.73e-01 0.178 0.13 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 2.71e-02 0.322 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.53e-01 0.0285 0.154 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.79e-01 0.157 0.145 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.03e-01 0.203 0.124 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.66e-01 -0.136 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.84e-01 -0.156 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 6.78e-01 0.0478 0.115 0.091 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.97e-01 0.148 0.115 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0264 0.15 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 9.74e-02 0.241 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.46e-01 0.0293 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.76e-01 0.0432 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 3.67e-01 0.116 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.54e-01 0.138 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0718 0.125 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0115 0.113 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 4.20e-01 0.0946 0.117 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.97e-01 0.0982 0.116 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 3.63e-01 -0.127 0.139 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.00e-01 -0.128 0.152 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.57e-01 -0.207 0.146 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.73e-01 0.125 0.114 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0346 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.49e-01 0.131 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.12e-01 0.117 0.115 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.83e-01 0.169 0.126 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0351 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 9.68e-01 0.00553 0.136 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.64e-01 -0.177 0.158 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.56e-01 0.223 0.156 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 4.95e-01 0.0912 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.26e-02 -0.336 0.165 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.94e-01 0.135 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.21e-01 -0.028 0.124 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0186 0.142 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 5.52e-01 0.0934 0.157 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.36e-01 -0.12 0.154 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 4.30e-01 -0.127 0.161 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.04e-02 -0.288 0.132 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 7.99e-01 0.0254 0.0997 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.72e-01 0.105 0.117 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 8.11e-01 0.0286 0.119 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.29e-01 0.0184 0.0852 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0866 0.0908 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 6.88e-01 -0.042 0.104 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.21e-04 -0.545 0.139 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 6.52e-01 0.0488 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 6.66e-01 0.0477 0.11 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 6.68e-01 0.0496 0.115 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.34e-01 -0.162 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 9.25e-01 0.0126 0.135 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.41e-01 -0.047 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.17e-01 -0.113 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0332 0.143 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0646 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 9.53e-01 0.00799 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 4.02e-02 -0.265 0.128 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.46e-01 0.0295 0.151 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0279 0.156 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.47e-01 -0.217 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 9.61e-01 0.00654 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.00e-01 -0.118 0.114 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 6.28e-01 0.062 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.12 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 1.76e-01 -0.193 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.18e-01 0.206 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.59e-01 -0.19 0.135 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 7.12e-02 -0.257 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0887 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.79e-01 0.106 0.12 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.11e-01 -0.126 0.124 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 7.05e-01 -0.043 0.113 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 3.59e-01 0.125 0.136 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 6.10e-01 0.0704 0.138 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 4.07e-01 -0.111 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.38e-02 -0.387 0.156 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.61e-01 0.0925 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0252 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0259 0.138 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0517 0.145 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 9.85e-01 0.00292 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0173 0.162 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.86e-01 -0.188 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.78e-01 -0.123 0.174 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.75e-02 0.345 0.173 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.128 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 4.33e-01 -0.105 0.133 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0203 0.161 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0378 0.162 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 5.93e-01 0.092 0.172 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 3.37e-01 -0.135 0.14 0.084 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 6.58e-01 0.0681 0.153 0.089 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.43e-01 -0.082 0.135 0.089 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0344 0.124 0.089 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0835 0.138 0.089 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.07e-02 -0.255 0.145 0.089 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0235 0.15 0.089 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0414 0.149 0.089 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 6.17e-01 0.0686 0.137 0.089 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0313 0.164 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 7.64e-01 0.049 0.163 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.31e-01 0.0887 0.141 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 5.71e-01 -0.085 0.15 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.26e-01 0.125 0.156 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.89e-01 0.0405 0.151 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.93e-01 -0.137 0.161 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.64e-01 0.149 0.133 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 2.45e-01 -0.121 0.104 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.66e-01 -0.101 0.111 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0597 0.122 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0228 0.156 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.146 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.01e-01 -0.145 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.78e-01 -0.15 0.17 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 6.48e-01 0.0604 0.132 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0542 0.149 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.162 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 5.78e-01 0.088 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.79e-01 -0.178 0.164 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.55e-01 -0.232 0.162 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.78e-01 -0.104 0.146 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.43e-01 0.0791 0.103 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 9.61e-02 -0.182 0.109 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0208 0.138 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.47e-01 0.167 0.144 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.64e-01 0.22 0.157 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.14e-03 0.643 0.213 0.089 PB L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.92e-01 -0.205 0.194 0.089 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 2.38e-01 0.2 0.168 0.089 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.24e-01 0.0969 0.152 0.089 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.71e-01 -0.03 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 9.09e-01 0.0192 0.168 0.089 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.17e-01 0.224 0.181 0.089 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 3.94e-01 0.18 0.211 0.089 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.59e-01 -0.209 0.185 0.089 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 5.34e-01 -0.102 0.163 0.089 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.53e-01 -0.141 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.115 0.089 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.25e-02 0.269 0.125 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.46e-03 0.363 0.136 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0817 0.158 0.089 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 7.96e-01 0.0399 0.154 0.089 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.83e-01 -0.159 0.119 0.089 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0206 0.155 0.09 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 1.85e-01 -0.185 0.14 0.09 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.72e-01 0.098 0.11 0.09 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.07e-01 0.0752 0.113 0.09 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 9.19e-01 0.0137 0.134 0.09 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 4.06e-01 -0.124 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 5.12e-01 -0.1 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.47e-01 -0.13 0.17 0.08 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 6.77e-01 0.061 0.146 0.08 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.28e-01 0.108 0.11 0.08 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0171 0.112 0.08 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 2.20e-02 -0.347 0.15 0.08 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.123 0.08 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.01e-01 0.197 0.154 0.08 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 3.07e-01 0.173 0.169 0.08 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.60e-01 -0.175 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 1.03e-01 -0.245 0.149 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.13e-02 0.192 0.0936 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 9.63e-01 0.00427 0.0923 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0963 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0657 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 7.37e-01 0.0373 0.111 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000465 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.68e-01 0.21 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.67e-01 -0.193 0.14 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 6.60e-01 0.071 0.161 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 4.37e-01 0.0904 0.116 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 9.83e-01 0.00209 0.0956 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.99e-01 0.0793 0.0938 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.77e-01 -0.124 0.14 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0657 0.153 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 1.56e-01 0.221 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0662 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.80e-01 0.143 0.202 0.082 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 2.51e-01 0.22 0.191 0.082 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 5.24e-01 0.112 0.175 0.082 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 7.97e-01 -0.046 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 1.14e-01 0.31 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 2.89e-01 0.2 0.188 0.082 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.20e-01 -0.244 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 1.61e-01 -0.242 0.172 0.082 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 5.13e-01 -0.114 0.173 0.091 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 5.08e-02 0.28 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 2.36e-01 -0.125 0.105 0.091 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 2.39e-02 -0.231 0.101 0.091 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0477 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.82e-01 0.163 0.122 0.091 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 6.25e-01 0.072 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 6.25e-01 0.0793 0.162 0.091 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.22e-01 0.19 0.155 0.091 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.86e-01 -0.108 0.155 0.09 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 8.72e-01 -0.019 0.118 0.09 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0245 0.0924 0.09 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0971 0.09 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 2.15e-01 -0.181 0.145 0.09 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.26e-01 0.19 0.123 0.09 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0877 0.142 0.09 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0891 0.153 0.09 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 3.49e-01 0.134 0.143 0.09 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0112 0.16 0.088 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.70e-01 0.146 0.163 0.088 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 8.29e-01 0.0269 0.124 0.088 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00352 0.127 0.088 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0283 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 7.94e-01 0.0405 0.155 0.088 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 1.03e-01 0.262 0.159 0.088 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 4.38e-01 -0.139 0.179 0.088 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 4.66e-01 -0.116 0.159 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0527 0.148 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.33e-01 -0.114 0.118 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.62e-01 0.0913 0.124 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 3.45e-01 0.122 0.129 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 2.45e-01 0.149 0.128 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 3.27e-02 0.312 0.145 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 8.21e-01 0.0345 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 2.93e-01 0.148 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.81e-02 0.256 0.116 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 6.19e-01 0.0727 0.146 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00223 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 4.67e-01 0.0839 0.115 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.90e-01 0.157 0.119 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 4.77e-01 0.0781 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0368 0.141 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 1.48e-01 -0.222 0.153 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0692 0.142 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 4.04e-01 0.0921 0.11 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 4.58e-01 -0.112 0.151 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 7.25e-02 0.165 0.0913 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 9.61e-01 0.00446 0.0912 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0539 0.0938 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.90e-01 -0.105 0.122 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 1.80e-01 0.145 0.108 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0432 0.139 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 5.06e-02 0.279 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.18e-01 -0.173 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 3.78e-01 -0.135 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 3.59e-01 0.0931 0.101 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0956 0.0949 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 1.20e-01 -0.14 0.0899 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 3.90e-01 -0.121 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 397008 sc-eQTL 2.58e-01 0.132 0.116 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 9.57e-01 0.00765 0.14 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0294 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 280967 sc-eQTL 2.96e-01 0.156 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 602102 sc-eQTL 7.77e-02 -0.278 0.157 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 525669 sc-eQTL 7.63e-01 0.0375 0.124 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -334401 sc-eQTL 2.01e-01 -0.128 0.0998 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -364275 sc-eQTL 8.70e-02 -0.18 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 306411 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0853 0.106 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 306346 sc-eQTL 5.31e-01 0.0834 0.133 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 505897 sc-eQTL 8.41e-01 0.0283 0.141 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 305979 pQTL 0.047 -0.0689 0.0347 0.0 0.0 0.095

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina