logo

Genes within 1Mb (chr1:78271109:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 8.31e-01 0.0199 0.0931 0.263 B L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0163 0.0672 0.263 B L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0577 0.0779 0.263 B L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0284 0.0712 0.263 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 1.02e-01 0.109 0.0664 0.263 B L1
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 9.76e-02 0.147 0.0884 0.263 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 4.11e-02 -0.19 0.0922 0.263 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.08e-01 0.0662 0.0799 0.263 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 4.38e-01 0.0543 0.0698 0.263 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.81e-01 -0.113 0.0839 0.263 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 6.89e-01 0.0215 0.0538 0.263 CD4T L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0116 0.0729 0.263 CD4T L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.00e-01 0.00879 0.0696 0.263 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 7.69e-02 -0.0975 0.0549 0.263 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0276 0.0508 0.263 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.56e-02 -0.128 0.0607 0.263 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.71e-01 0.0457 0.0633 0.263 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0413 0.0789 0.263 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.66e-01 0.068 0.075 0.263 CD8T L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0148 0.0745 0.263 CD8T L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0363 0.0729 0.263 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.09e-01 -0.0793 0.0493 0.263 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00782 0.0606 0.263 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0332 0.0828 0.263 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.97e-01 0.087 0.0833 0.263 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 2.22e-01 0.0997 0.0813 0.263 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 3.43e-01 0.0869 0.0915 0.266 DC L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 1.75e-01 0.112 0.0824 0.266 DC L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0238 0.0698 0.266 DC L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0394 0.0684 0.266 DC L1
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 6.90e-01 0.0312 0.0781 0.266 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0756 0.0907 0.266 DC L1
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0544 0.0871 0.266 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0107 0.0948 0.266 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 1.19e-01 0.159 0.102 0.266 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 1.63e-01 -0.136 0.0971 0.266 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0564 0.0965 0.263 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.68e-01 0.0413 0.0568 0.263 Mono L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0593 0.0558 0.263 Mono L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.44e-02 -0.14 0.0568 0.263 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.51e-01 -0.09 0.0782 0.263 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 2.67e-01 0.0707 0.0636 0.263 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 8.20e-01 0.0198 0.0867 0.263 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 9.91e-01 0.00102 0.0877 0.263 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 9.26e-01 0.00834 0.0901 0.263 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 3.81e-01 0.0871 0.0992 0.262 NK L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.13e-01 0.0789 0.078 0.262 NK L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0946 0.0636 0.262 NK L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0355 0.0671 0.262 NK L1
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 6.26e-01 0.0474 0.0972 0.262 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0233 0.0648 0.262 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0694 0.089 0.262 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 7.93e-01 0.0226 0.0857 0.262 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0398 0.0968 0.263 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.87e-01 -0.011 0.0771 0.263 Other_T L1
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00477 0.0831 0.263 Other_T L1
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.92e-01 -0.11 0.0843 0.263 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0471 0.0972 0.263 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 8.06e-01 0.0166 0.0675 0.263 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.47e-01 0.0969 0.103 0.263 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.24e-01 -0.121 0.0995 0.263 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 6.63e-01 0.0398 0.0913 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0664 0.109 0.276 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.93e-01 0.092 0.107 0.276 B_Activated L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.43e-01 -0.13 0.0886 0.276 B_Activated L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.84e-01 0.00177 0.0899 0.276 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 1.86e-01 0.137 0.103 0.276 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0448 0.0844 0.276 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 4.41e-01 0.0778 0.101 0.276 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 3.10e-01 -0.11 0.108 0.276 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0736 0.0967 0.276 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.101 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.85e-01 0.0638 0.0912 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 4.68e-01 0.063 0.0867 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0577 0.0877 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0254 0.0866 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 6.49e-01 0.0442 0.097 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 7.28e-03 -0.272 0.1 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 7.98e-02 0.168 0.0953 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 3.63e-01 0.0752 0.0825 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 7.71e-01 0.0292 0.1 0.263 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 2.19e-01 -0.119 0.0967 0.263 B_Memory L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.90e-01 0.0106 0.0766 0.263 B_Memory L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0358 0.0765 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 5.31e-01 0.0625 0.0995 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 4.15e-01 0.0792 0.097 0.263 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 5.43e-01 0.0613 0.101 0.263 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.27e-01 -0.122 0.101 0.263 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 8.44e-01 0.0169 0.0857 0.263 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0394 0.0969 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00635 0.0816 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0735 0.0735 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.17e-01 -0.008 0.0766 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.18e-01 0.093 0.0753 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 8.58e-01 0.0163 0.0908 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 7.70e-02 -0.175 0.0983 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 7.15e-01 0.0349 0.0956 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 6.70e-01 0.0318 0.0745 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 5.84e-01 0.0558 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 7.76e-01 0.0261 0.0918 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 7.51e-01 0.0241 0.0758 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 4.56e-01 0.062 0.083 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 3.55e-01 -0.081 0.0874 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 1.56e-01 0.127 0.089 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 8.58e-02 -0.178 0.103 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 8.65e-02 0.176 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 9.25e-02 0.147 0.0871 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.88e-01 -0.143 0.108 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.92e-01 -0.014 0.103 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.97e-01 -0.104 0.0803 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 2.99e-01 0.0964 0.0926 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 2.77e-01 -0.102 0.0933 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0487 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.1 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.38e-01 0.124 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0294 0.0879 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0305 0.0656 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00595 0.0773 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0491 0.0783 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0897 0.0639 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0348 0.056 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.32e-02 -0.127 0.0592 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 3.33e-01 0.0665 0.0685 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.44e-02 -0.23 0.0933 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.52e-01 0.0533 0.0709 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0211 0.0724 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 4.54e-01 0.0568 0.0757 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0733 0.0663 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.07e-01 0.0588 0.0708 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0374 0.0884 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0156 0.0931 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0888 0.0917 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0238 0.0948 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 5.02e-01 0.0591 0.0878 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 2.06e-01 -0.112 0.0884 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.03e-01 -0.154 0.094 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0824 0.0854 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 9.88e-01 0.00155 0.1 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0542 0.103 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0486 0.0986 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0174 0.087 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0339 0.075 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.85e-01 0.0731 0.084 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 4.95e-01 0.0624 0.0914 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 3.39e-01 -0.076 0.0793 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.59e-01 -0.106 0.0935 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 1.75e-01 0.118 0.0865 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0451 0.0891 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0554 0.0928 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0868 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00531 0.0783 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00806 0.0804 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 3.67e-02 -0.141 0.0669 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.35e-01 0.0575 0.0736 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0883 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 9.05e-01 0.0107 0.0895 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 3.14e-01 0.0875 0.0867 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0318 0.101 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.24e-01 0.00967 0.102 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.23e-01 0.0219 0.0977 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0138 0.0885 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 4.14e-01 0.0815 0.0995 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.54e-01 0.106 0.0924 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.94e-01 0.107 0.101 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.09e-01 0.0857 0.104 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0229 0.0911 0.266 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.13e-01 0.0553 0.109 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.28e-01 0.107 0.11 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 3.15e-01 0.0813 0.0807 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0774 0.0838 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.83e-01 0.0986 0.0738 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.10e-01 -0.127 0.101 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0455 0.102 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.108 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 5.82e-01 0.0486 0.0881 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0148 0.101 0.26 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 2.05e-01 -0.112 0.0882 0.26 MAIT L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0106 0.0815 0.26 MAIT L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0796 0.0904 0.26 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 5.94e-01 0.042 0.0786 0.26 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0565 0.0961 0.26 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 8.48e-01 0.0189 0.0984 0.26 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0476 0.098 0.26 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0604 0.0898 0.26 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.80e-01 0.141 0.105 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00539 0.105 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0924 0.0769 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.28e-01 0.0887 0.0905 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.75e-01 0.127 0.093 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0579 0.0961 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.39e-02 0.212 0.0992 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.90e-01 0.103 0.0967 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.90e-01 0.041 0.102 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.56e-01 0.0784 0.0848 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 6.99e-02 -0.12 0.0657 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0573 0.0707 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 8.87e-01 0.014 0.0978 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 9.14e-01 0.00835 0.0775 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0173 0.0994 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 6.22e-01 -0.046 0.0934 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 7.81e-01 0.0304 0.109 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.52e-02 -0.178 0.106 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 5.22e-01 0.0533 0.0832 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.12e-01 0.149 0.0933 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 7.09e-01 0.0378 0.101 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 6.41e-01 0.0476 0.102 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0613 0.0993 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.48e-02 -0.231 0.102 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 9.01e-01 0.0126 0.102 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.38e-01 0.0872 0.0908 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0146 0.0643 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0934 0.0681 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 5.24e-01 0.0622 0.0973 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 6.39e-01 0.0404 0.086 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 1.63e-01 -0.126 0.0899 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 9.35e-02 0.165 0.098 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.87e-01 0.185 0.139 0.289 PB L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0759 0.123 0.289 PB L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 7.88e-01 0.0288 0.107 0.289 PB L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.28e-01 0.00865 0.096 0.289 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 8.50e-01 0.022 0.116 0.289 PB L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0556 0.106 0.289 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 5.88e-01 0.0625 0.115 0.289 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.33e-01 0.159 0.133 0.289 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00767 0.117 0.289 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 2.77e-01 0.114 0.105 0.263 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.29e-01 0.077 0.0971 0.263 Pro_T L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0443 0.0746 0.263 Pro_T L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 9.89e-01 0.00113 0.0811 0.263 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0144 0.0843 0.263 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 1.27e-02 0.221 0.0878 0.263 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 8.60e-01 0.0179 0.101 0.263 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.94e-01 -0.104 0.0986 0.263 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 4.17e-01 0.0624 0.0767 0.263 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 3.76e-02 -0.213 0.102 0.263 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0063 0.0928 0.263 Treg L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.39e-01 0.00561 0.0727 0.263 Treg L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.46e-01 0.109 0.0747 0.263 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 5.98e-01 0.0333 0.0631 0.263 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0715 0.0889 0.263 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00921 0.0989 0.263 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 8.23e-02 0.175 0.1 0.263 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0157 0.111 0.256 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.33e-01 0.0926 0.0953 0.256 cDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0707 0.0718 0.256 cDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.62e-01 -0.102 0.0724 0.256 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 3.58e-02 0.176 0.0831 0.256 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 1.85e-01 -0.132 0.0989 0.256 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 8.56e-02 -0.139 0.0802 0.256 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 1.01e-01 0.165 0.0999 0.256 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.77e-02 0.219 0.11 0.256 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 2.10e-01 -0.127 0.101 0.256 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 1.53e-01 -0.141 0.0983 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0315 0.0621 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 6.22e-01 -0.03 0.0607 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.17e-03 -0.186 0.0622 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0139 0.0907 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 6.90e-01 -0.029 0.0728 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.95e-01 0.0788 0.0924 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.1 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0425 0.0921 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 2.45e-01 0.122 0.105 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.85e-01 0.0659 0.0757 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0857 0.0621 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0276 0.0613 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 9.73e-01 0.00308 0.0916 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 7.40e-01 0.0261 0.0786 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 4.20e-01 0.0803 0.0994 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 7.21e-02 0.182 0.101 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 5.19e-01 0.0638 0.0988 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 3.68e-01 -0.113 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 7.35e-01 0.0404 0.119 0.221 gdT L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0625 0.109 0.221 gdT L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.92e-01 -0.144 0.11 0.221 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 9.33e-02 -0.159 0.0942 0.221 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 7.22e-01 0.0434 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 4.82e-01 0.0824 0.117 0.221 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 1.92e-01 0.161 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 3.71e-01 0.0965 0.108 0.221 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.03e-02 0.21 0.111 0.264 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 2.48e-02 0.208 0.0919 0.264 intMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.11e-01 -0.108 0.0676 0.264 intMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.56e-02 -0.139 0.0656 0.264 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 3.68e-01 -0.092 0.102 0.264 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 6.36e-01 0.0375 0.079 0.264 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0947 0.264 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 6.29e-01 0.0507 0.105 0.264 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 7.03e-01 0.0384 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 2.77e-01 -0.114 0.104 0.26 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0665 0.0793 0.26 ncMono L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0832 0.0621 0.26 ncMono L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.24e-02 -0.163 0.0647 0.26 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.79e-02 -0.215 0.0972 0.26 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 4.58e-01 0.0621 0.0836 0.26 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 9.49e-01 0.00615 0.0956 0.26 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.63e-01 0.0758 0.103 0.26 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 2.43e-01 0.112 0.0961 0.26 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 5.64e-02 0.202 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 6.85e-01 0.044 0.108 0.26 pDC L2
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0324 0.0826 0.26 pDC L2
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0358 0.0841 0.26 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 1.19e-01 -0.117 0.0743 0.26 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 8.28e-01 -0.023 0.106 0.26 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 2.75e-01 -0.112 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0411 0.107 0.26 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.92e-01 -0.126 0.119 0.26 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 7.61e-02 -0.187 0.105 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 9.68e-01 0.00399 0.0988 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0623 0.0786 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00859 0.0828 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0569 0.0866 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.93e-01 0.0587 0.0855 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 5.41e-01 0.06 0.098 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 1.09e-01 -0.163 0.101 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 6.68e-01 0.0403 0.0938 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 3.11e-01 0.0793 0.0782 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00877 0.0953 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00379 0.0762 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0284 0.0753 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 6.68e-01 0.0336 0.0783 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 2.12e-01 0.0895 0.0714 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.0915 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.37e-02 -0.226 0.0993 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 4.27e-01 0.0738 0.0927 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 2.71e-01 0.0793 0.0718 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0483 0.0991 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 9.09e-01 0.00695 0.0605 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0595 0.0598 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 1.60e-02 -0.148 0.0609 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00983 0.0801 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 7.97e-01 0.0183 0.071 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.10e-01 0.0929 0.0913 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 9.55e-01 0.00528 0.0942 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000597 0.092 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 4.11e-01 0.0846 0.103 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 5.02e-01 0.0458 0.0682 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 6.20e-02 -0.119 0.0635 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 3.39e-02 -0.128 0.0602 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 4.04e-02 -0.193 0.0936 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN 382596 sc-eQTL 2.76e-01 0.0855 0.0783 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 3.76e-01 0.0836 0.0943 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 2.60e-01 0.11 0.0975 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 266555 sc-eQTL 4.36e-01 0.0783 0.1 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 587690 sc-eQTL 7.64e-01 0.0303 0.101 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 511257 sc-eQTL 3.82e-01 0.0691 0.079 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137959 IFI44L -348813 sc-eQTL 9.15e-02 -0.107 0.0634 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137965 IFI44 -378687 sc-eQTL 2.14e-01 -0.083 0.0667 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 989090 sc-eQTL 6.62e-01 0.0426 0.0972 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 291999 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0174 0.0675 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 291934 sc-eQTL 2.16e-01 -0.105 0.0845 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 491485 sc-eQTL 9.84e-01 0.00183 0.0895 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137959 IFI44L -348813 eQTL 0.067 -0.0276 0.015 0.00108 0.0 0.25

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina