logo

Genes within 1Mb (chr1:77587357:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 1.16e-01 -0.217 0.138 0.098 B L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 2.14e-01 -0.124 0.0996 0.098 B L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00662 0.107 0.098 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.05e-01 0.0246 0.0994 0.098 B L1
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 6.87e-05 -0.518 0.128 0.098 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 3.10e-02 -0.298 0.137 0.098 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.86e-02 0.202 0.118 0.098 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 8.81e-02 0.177 0.103 0.098 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0362 0.127 0.098 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0751 0.0809 0.098 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 2.97e-01 -0.114 0.109 0.098 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 5.40e-01 0.0511 0.0832 0.098 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0047 0.0765 0.098 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 1.17e-02 -0.231 0.091 0.098 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 3.93e-01 0.0816 0.0954 0.098 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 1.67e-01 -0.164 0.118 0.098 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 3.65e-01 -0.102 0.113 0.098 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0345 0.12 0.098 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 3.27e-01 0.0731 0.0743 0.098 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 3.26e-01 0.0896 0.091 0.098 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.45e-01 -0.145 0.124 0.098 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.37e-01 0.0776 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 4.21e-01 0.0987 0.123 0.098 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 1.77e-01 0.182 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.82e-01 0.0028 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.71e-01 -0.195 0.142 0.101 DC L1
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 7.62e-01 0.0348 0.115 0.101 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 5.77e-01 0.0746 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.13e-01 -0.203 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.90e-02 -0.273 0.138 0.101 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00322 0.15 0.101 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 2.38e-01 0.169 0.143 0.101 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.46e-01 -0.11 0.144 0.098 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 5.77e-02 -0.161 0.0844 0.098 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.28e-01 0.0132 0.145 0.098 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 1.81e-01 0.157 0.117 0.098 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.04e-01 -0.155 0.0949 0.098 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.84e-01 -0.091 0.13 0.098 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00662 0.131 0.098 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 4.32e-01 0.106 0.135 0.098 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0713 0.146 0.097 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00792 0.115 0.097 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.64e-01 -0.188 0.134 0.097 NK L1
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 6.58e-03 0.386 0.141 0.097 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 1.86e-01 -0.126 0.095 0.097 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 1.61e-01 -0.184 0.131 0.097 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0163 0.126 0.097 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.97e-01 -0.1 0.147 0.098 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 8.43e-01 0.0232 0.117 0.098 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0187 0.117 0.098 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.04e-01 0.24 0.147 0.098 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.11e-01 -0.038 0.102 0.098 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 8.04e-01 -0.039 0.157 0.098 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.13e-01 0.036 0.152 0.098 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 8.84e-01 0.0204 0.139 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.28e-01 0.133 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 5.06e-01 0.11 0.166 0.102 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.46e-01 -0.12 0.158 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 5.26e-01 0.102 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0748 0.13 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.89e-01 0.108 0.156 0.102 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.11e-01 -0.111 0.168 0.102 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.84e-01 -0.13 0.149 0.102 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 1.62e-01 -0.209 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0448 0.135 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.74e-01 0.212 0.156 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 4.18e-01 -0.104 0.128 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.42e-02 -0.349 0.141 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.90e-02 -0.328 0.149 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.01e-01 0.0358 0.142 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 6.07e-01 0.0629 0.122 0.097 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.18e-01 0.12 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 7.64e-01 0.0428 0.143 0.099 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.79e-01 0.00414 0.158 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 3.36e-01 0.141 0.146 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0825 0.143 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0425 0.148 0.099 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.45e-01 0.0102 0.148 0.099 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.12e-01 -0.127 0.126 0.099 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 1.62e-01 -0.202 0.144 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0907 0.121 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0724 0.149 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.86e-01 0.00194 0.112 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 3.02e-02 -0.291 0.133 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.15e-01 -0.182 0.147 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 7.24e-02 0.255 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 5.68e-01 0.0634 0.111 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.51e-01 -0.142 0.152 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 2.54e-01 -0.156 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0418 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 4.29e-01 -0.103 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 5.85e-02 -0.251 0.132 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0698 0.155 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 4.58e-01 0.114 0.153 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 2.18e-01 0.161 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 2.82e-01 -0.179 0.166 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.74e-01 -0.215 0.157 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.57e-02 -0.383 0.157 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.27e-03 0.457 0.14 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0503 0.157 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0718 0.154 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 2.31e-01 0.193 0.161 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 7.83e-01 0.0367 0.133 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0945 0.0989 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0408 0.113 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 4.26e-01 0.0771 0.0968 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0118 0.0846 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 5.93e-03 -0.247 0.0888 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.00e-01 0.0263 0.104 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 5.32e-01 0.0882 0.141 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0433 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.57e-01 -0.047 0.152 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.25e-01 0.152 0.0986 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0105 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.18e-01 -0.163 0.131 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.90e-01 0.0555 0.139 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.46e-01 -0.127 0.135 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00329 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0124 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.38e-02 0.312 0.137 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0209 0.126 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.03e-01 -0.123 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 2.01e-01 -0.193 0.151 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 2.78e-02 -0.33 0.149 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.78e-02 -0.313 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.148 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.60e-02 0.31 0.138 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.63e-01 -0.021 0.122 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 8.73e-01 0.0229 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 1.49e-01 -0.192 0.132 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 5.98e-01 0.0719 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0179 0.138 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.16e-01 0.0136 0.129 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0307 0.132 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 5.86e-01 0.0548 0.1 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 1.20e-01 0.17 0.109 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 3.68e-01 -0.119 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.16e-01 0.0668 0.133 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.31e-01 0.126 0.129 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0733 0.151 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00726 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.51e-02 -0.396 0.161 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.19e-01 0.231 0.148 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 3.59e-02 0.289 0.137 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0427 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.01e-01 0.0194 0.155 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 2.13e-01 0.169 0.135 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0726 0.17 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 8.73e-02 -0.291 0.169 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.83e-01 -0.216 0.161 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.04e-01 0.187 0.114 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.67e-01 0.0466 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 7.37e-01 0.0532 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 4.92e-01 -0.115 0.168 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0147 0.137 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.94e-01 -0.103 0.151 0.097 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00207 0.133 0.097 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.73e-01 0.108 0.15 0.097 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.15e-01 0.146 0.118 0.097 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.94e-01 0.0193 0.144 0.097 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.07e-02 -0.34 0.146 0.097 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0562 0.147 0.097 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 1.62e-01 -0.189 0.134 0.097 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.16e-01 -0.157 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 4.86e-01 -0.109 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0437 0.161 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 7.84e-01 0.0381 0.139 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 1.25e-01 -0.219 0.142 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 6.43e-01 0.0694 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.81e-01 0.0594 0.144 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.06e-01 0.0775 0.15 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 7.36e-01 0.0421 0.124 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.56e-01 -0.105 0.141 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.05e-02 0.364 0.141 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 2.97e-01 -0.118 0.113 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 6.45e-02 -0.268 0.144 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 4.60e-01 0.101 0.137 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0651 0.174 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.171 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.36e-01 0.0144 0.178 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 7.32e-04 0.537 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00482 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 3.41e-03 -0.46 0.155 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.97e-03 -0.442 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0423 0.149 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 8.40e-01 0.0269 0.133 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 3.86e-01 -0.121 0.139 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.78e-02 0.313 0.141 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.32e-01 0.0267 0.126 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.15e-01 -0.108 0.132 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0709 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.17e-01 -0.165 0.203 0.122 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.35e-01 -0.266 0.177 0.122 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 2.69e-01 0.113 0.101 0.122 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 2.80e-01 0.182 0.168 0.122 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.34e-01 -0.23 0.152 0.122 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.37e-01 -0.13 0.166 0.122 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.56e-01 0.114 0.194 0.122 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 5.21e-01 0.109 0.17 0.122 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 4.13e-01 0.13 0.158 0.1 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0151 0.147 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.39e-01 0.00943 0.123 0.1 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.53e-01 0.145 0.127 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00605 0.134 0.1 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 1.94e-01 0.199 0.153 0.1 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.04e-01 0.0774 0.149 0.1 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.76e-02 0.24 0.115 0.1 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 2.66e-01 -0.169 0.151 0.098 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0982 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.22e-01 0.144 0.0924 0.098 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.52e-01 0.0244 0.131 0.098 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 9.32e-01 0.0124 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.80e-02 0.282 0.148 0.098 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.77e-01 0.144 0.162 0.095 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 8.58e-01 -0.025 0.139 0.095 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0283 0.15 0.095 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 3.52e-01 0.114 0.123 0.095 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 3.15e-01 0.146 0.145 0.095 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.45e-01 -0.172 0.117 0.095 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0218 0.147 0.095 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 3.72e-01 0.145 0.161 0.095 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.57e-01 0.137 0.148 0.095 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0696 0.147 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.90e-02 -0.216 0.0915 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0927 0.148 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 5.00e-01 0.0913 0.135 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 9.54e-03 -0.28 0.107 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0304 0.138 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0153 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 7.15e-01 0.0502 0.137 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0129 0.154 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0098 0.111 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.93e-01 0.0969 0.141 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 2.66e-02 0.297 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0831 0.115 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0253 0.146 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.08e-01 0.0988 0.149 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 4.30e-01 0.115 0.145 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 8.58e-01 0.0345 0.193 0.079 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.28e-01 -0.277 0.181 0.079 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0755 0.195 0.079 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.079 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0634 0.187 0.079 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 4.10e-01 0.148 0.179 0.079 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 1.77e-01 0.256 0.189 0.079 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 4.15e-01 0.135 0.165 0.079 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.36e-01 0.156 0.162 0.1 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.16e-02 0.337 0.133 0.1 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 2.71e-01 -0.158 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0505 0.148 0.1 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 5.38e-01 0.0705 0.114 0.1 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 5.41e-02 0.264 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 8.59e-01 0.027 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 9.82e-01 0.00338 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.63e-01 0.141 0.154 0.095 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 2.32e-01 -0.14 0.117 0.095 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0175 0.142 0.095 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0999 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0914 0.124 0.095 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00577 0.141 0.095 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0103 0.153 0.095 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 7.48e-02 0.254 0.142 0.095 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 6.28e-01 0.0822 0.169 0.082 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 7.47e-01 0.0559 0.173 0.082 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 2.96e-02 -0.397 0.181 0.082 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 1.44e-01 -0.174 0.119 0.082 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 4.37e-01 -0.131 0.168 0.082 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 2.26e-01 -0.199 0.163 0.082 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 3.56e-01 -0.157 0.17 0.082 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 1.56e-02 -0.457 0.187 0.082 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 2.31e-01 0.202 0.168 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 5.09e-01 -0.096 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0157 0.116 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.55e-01 0.216 0.152 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 9.84e-01 0.00251 0.126 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 7.79e-03 -0.381 0.142 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 5.97e-02 -0.281 0.149 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 9.79e-01 0.00361 0.138 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 7.68e-01 0.034 0.115 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 8.14e-02 -0.247 0.141 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 1.94e-01 -0.148 0.113 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 4.23e-01 -0.119 0.148 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0258 0.107 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 1.54e-02 -0.33 0.135 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 3.27e-01 -0.147 0.15 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 4.68e-02 0.275 0.137 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 3.99e-01 0.0908 0.107 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.09e-01 -0.149 0.146 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 7.27e-02 -0.159 0.0884 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 7.37e-01 0.0476 0.142 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 7.65e-02 0.208 0.117 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 6.77e-02 -0.191 0.104 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0732 0.135 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 7.20e-01 0.0498 0.139 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 4.81e-01 0.0955 0.135 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 3.21e-02 0.323 0.15 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00943 0.101 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.80e-01 -0.194 0.144 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0963 0.139 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -301156 sc-eQTL 5.95e-01 0.0615 0.116 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 9.03e-01 0.0169 0.139 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 5.79e-01 -0.08 0.144 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 sc-eQTL 1.79e-01 0.199 0.147 0.097 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -96062 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0172 0.148 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -172495 sc-eQTL 6.87e-01 0.047 0.117 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 367927 sc-eQTL 1.56e-01 -0.187 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 305338 sc-eQTL 7.87e-03 0.378 0.141 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -391753 sc-eQTL 2.67e-01 -0.11 0.0993 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 sc-eQTL 2.51e-02 -0.278 0.123 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -192267 sc-eQTL 6.17e-01 -0.066 0.132 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000154027 AK5 305338 eQTL 0.00298 0.101 0.0338 0.00316 0.0 0.079
ENSG00000162616 DNAJB4 -391818 eQTL 2.81e-07 -0.187 0.0362 0.0 0.0 0.079
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -302182 eQTL 3.81e-06 -0.18 0.0388 0.0 0.0 0.079
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 eQTL 3.61e-01 -0.0329 0.0359 0.00168 0.0 0.079

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154027 AK5 305338 1.29e-06 9.23e-07 2.81e-07 6.49e-07 2.46e-07 4.63e-07 1.13e-06 3.45e-07 1.11e-06 3.77e-07 1.37e-06 5.93e-07 1.63e-06 2.67e-07 4.38e-07 5.87e-07 7.73e-07 5.72e-07 4.82e-07 6.7e-07 3.61e-07 1.01e-06 7.79e-07 5.1e-07 1.92e-06 2.99e-07 6.88e-07 6.89e-07 9.65e-07 1.03e-06 5.48e-07 1.55e-07 2.29e-07 4.29e-07 4.05e-07 3.38e-07 4.77e-07 1.66e-07 2.18e-07 1.3e-07 2.67e-07 1.3e-06 5.62e-08 4.2e-08 2.01e-07 1.28e-07 1.87e-07 8.37e-08 8.38e-08
ENSG00000162614 \N -301156 1.34e-06 9.1e-07 2.7e-07 6.97e-07 2.58e-07 4.46e-07 1.16e-06 3.33e-07 1.14e-06 3.78e-07 1.41e-06 5.64e-07 1.67e-06 2.59e-07 4.31e-07 6.36e-07 7.77e-07 5.54e-07 5.07e-07 6.76e-07 3.87e-07 1.08e-06 8.03e-07 5.76e-07 1.92e-06 3.06e-07 6.91e-07 7.19e-07 1.01e-06 1.08e-06 5.2e-07 1.58e-07 2.33e-07 4.57e-07 4.25e-07 3.36e-07 4.61e-07 1.68e-07 2.32e-07 1.92e-07 2.83e-07 1.4e-06 6.65e-08 4.23e-08 1.72e-07 1.22e-07 2.09e-07 7.81e-08 9.23e-08
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -302182 1.34e-06 9.15e-07 2.7e-07 6.94e-07 2.58e-07 4.46e-07 1.18e-06 3.45e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.38e-06 5.64e-07 1.62e-06 2.59e-07 4.19e-07 6.22e-07 7.77e-07 5.48e-07 5.07e-07 6.61e-07 3.91e-07 1.05e-06 8.03e-07 5.4e-07 1.92e-06 2.89e-07 6.91e-07 7.19e-07 9.81e-07 1.06e-06 5.3e-07 1.57e-07 2.43e-07 4.57e-07 4.22e-07 3.16e-07 4.92e-07 1.68e-07 2.32e-07 1.67e-07 2.82e-07 1.4e-06 6.65e-08 4.23e-08 1.88e-07 1.3e-07 2.08e-07 7.75e-08 9.13e-08
ENSG00000273338 AC103591.3 -417197 8.63e-07 5.74e-07 1.03e-07 4.26e-07 9.16e-08 2.24e-07 5.65e-07 1.11e-07 4.26e-07 2.37e-07 6.88e-07 3.91e-07 7.36e-07 1.41e-07 2.35e-07 2.05e-07 2.77e-07 3.73e-07 2.12e-07 1.76e-07 2.01e-07 3.71e-07 3.3e-07 1.61e-07 7.42e-07 2.4e-07 2.94e-07 2.69e-07 3.83e-07 5.28e-07 2.73e-07 5.93e-08 5.63e-08 1.4e-07 3.3e-07 7.98e-08 8.6e-08 1.06e-07 6.33e-08 2.2e-08 1.43e-07 4.82e-07 4.47e-08 5.74e-09 1.67e-07 2.64e-08 1.24e-07 2.28e-08 4.97e-08