Genes within 1Mb (chr1:77483602:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0488 0.153 0.073 B L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 2.17e-01 -0.136 0.11 0.073 B L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.73e-01 0.0343 0.118 0.073 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.27e-01 -0.108 0.11 0.073 B L1
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 8.33e-01 0.031 0.146 0.073 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 2.75e-01 -0.167 0.153 0.073 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 9.47e-02 0.219 0.131 0.073 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.69e-01 0.158 0.115 0.073 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.55e-02 -0.254 0.137 0.073 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.73e-02 -0.174 0.0875 0.073 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0592 0.119 0.073 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 2.90e-01 -0.096 0.0905 0.073 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0632 0.0833 0.073 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.30e-03 -0.273 0.0989 0.073 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.05e-01 0.168 0.103 0.073 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0933 0.129 0.073 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.91e-02 -0.202 0.122 0.073 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.131 0.073 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.96e-01 -0.105 0.0806 0.073 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0949 0.0988 0.073 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 2.56e-01 -0.153 0.135 0.073 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.54e-01 0.126 0.136 0.073 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0392 0.133 0.073 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 1.14e-01 -0.234 0.148 0.074 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 8.93e-01 0.018 0.134 0.074 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 5.74e-02 -0.297 0.155 0.074 DC L1
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.91e-01 -0.166 0.126 0.074 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.06e-01 -0.151 0.147 0.074 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 6.24e-01 0.0694 0.141 0.074 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 4.73e-01 0.11 0.153 0.074 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.54e-01 0.153 0.165 0.074 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.04e-01 0.0393 0.158 0.074 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.35e-01 0.0744 0.157 0.073 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 7.53e-01 0.029 0.0923 0.073 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.34e-01 -0.033 0.157 0.073 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0382 0.127 0.073 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0269 0.103 0.073 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 2.93e-01 -0.148 0.14 0.073 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.62e-01 0.13 0.142 0.073 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 4.07e-01 -0.121 0.146 0.073 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.87e-01 0.0649 0.161 0.073 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 1.54e-02 -0.304 0.125 0.073 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.75e-03 -0.44 0.145 0.073 NK L1
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 2.27e-02 -0.356 0.155 0.073 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.59e-01 0.0613 0.105 0.073 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0451 0.144 0.073 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.74e-01 0.188 0.138 0.073 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 7.56e-01 0.0494 0.159 0.073 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.35e-01 0.0986 0.126 0.073 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0224 0.126 0.073 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0248 0.159 0.073 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.36e-01 0.0685 0.111 0.073 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.89e-01 0.0676 0.169 0.073 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.00e-01 -0.111 0.163 0.073 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.23e-01 0.0336 0.15 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 2.52e-01 -0.197 0.172 0.082 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00938 0.17 0.082 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0208 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.81e-01 0.144 0.164 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 9.55e-01 0.00757 0.134 0.082 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.00e+00 2.22e-05 0.16 0.082 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.86e-01 -0.094 0.172 0.082 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.37e-01 0.228 0.153 0.082 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 2.74e-01 -0.182 0.165 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.30e-01 0.0131 0.15 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.68e-01 0.0289 0.173 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 1.15e-01 -0.223 0.141 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 6.13e-02 -0.297 0.158 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0872 0.167 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.13e-01 0.159 0.157 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 7.24e-01 0.0478 0.136 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 5.90e-01 -0.088 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.30e-02 -0.305 0.157 0.073 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 5.47e-01 0.105 0.175 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0885 0.162 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 6.52e-01 0.0714 0.158 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.86e-01 0.217 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.54e-01 -0.233 0.163 0.073 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.96e-01 0.18 0.139 0.073 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0661 0.159 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 7.40e-01 0.0444 0.134 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.82e-01 0.0454 0.164 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 2.46e-02 0.333 0.147 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.48e-01 -0.234 0.161 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 8.64e-01 0.0268 0.157 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.88e-01 0.161 0.122 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0989 0.165 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0807 0.149 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 3.62e-01 0.156 0.17 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 1.18e-01 -0.222 0.141 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 8.95e-01 0.0192 0.145 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 5.22e-01 -0.108 0.169 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0384 0.142 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 2.69e-01 0.198 0.179 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 3.57e-01 -0.156 0.17 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0328 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.44e-01 0.225 0.153 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 2.01e-01 -0.216 0.168 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 7.91e-01 0.0441 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0339 0.173 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 1.53e-01 -0.208 0.145 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 1.65e-01 -0.15 0.108 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.76e-01 0.0352 0.123 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 2.57e-01 -0.12 0.106 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000964 0.0927 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.77e-02 -0.233 0.0976 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.11e-02 0.244 0.112 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 3.24e-01 -0.151 0.153 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 3.16e-02 -0.246 0.113 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.93e-01 -0.173 0.164 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 8.86e-01 0.0154 0.107 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 1.05e-01 -0.185 0.114 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 4.25e-02 -0.289 0.142 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.84e-01 0.131 0.15 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.42e-01 -0.115 0.149 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 1.67e-01 -0.213 0.153 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0677 0.163 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0049 0.154 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.93e-02 -0.244 0.138 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 4.86e-01 -0.113 0.162 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0815 0.167 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.72e-01 -0.115 0.16 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.93e-02 -0.277 0.14 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 4.62e-01 0.116 0.157 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0339 0.149 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.37e-01 0.0435 0.129 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.32e-01 -0.073 0.152 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 7.77e-01 0.04 0.141 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 4.46e-01 -0.11 0.145 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 1.35e-01 -0.226 0.151 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 1.13e-01 -0.224 0.141 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0854 0.144 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0543 0.11 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 1.13e-01 -0.19 0.12 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.01e-01 -0.237 0.144 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 9.50e-02 0.243 0.145 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.26e-01 0.0311 0.142 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0445 0.171 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 7.47e-01 0.0555 0.171 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 3.85e-02 -0.381 0.183 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0859 0.168 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 2.46e-01 -0.181 0.156 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 9.12e-01 0.019 0.171 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0951 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.83e-01 0.204 0.153 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 3.69e-01 0.16 0.178 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0949 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.77e-01 0.185 0.169 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 5.03e-02 0.235 0.119 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0625 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 2.92e-01 0.175 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 2.49e-01 0.203 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 4.66e-01 -0.105 0.143 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.20e-01 0.0818 0.165 0.074 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.50e-01 0.00908 0.145 0.074 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.18e-01 0.0379 0.164 0.074 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 6.94e-01 0.0506 0.129 0.074 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.25e-01 0.155 0.157 0.074 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 7.57e-01 0.0499 0.161 0.074 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 6.55e-01 0.0717 0.16 0.074 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.84e-01 0.0215 0.147 0.074 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 5.42e-01 -0.102 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.72e-02 -0.329 0.165 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.95e-01 0.0228 0.172 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0689 0.148 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.44e-01 -0.145 0.153 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.04e-01 0.164 0.159 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 7.41e-03 0.41 0.151 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 1.77e-01 0.224 0.165 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 8.35e-02 -0.238 0.137 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.25e-04 -0.52 0.151 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 8.60e-03 -0.414 0.156 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 9.57e-01 0.00671 0.126 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.67e-01 -0.145 0.161 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.52e-01 0.217 0.151 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0527 0.18 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0877 0.177 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 5.22e-01 0.118 0.184 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.11e-02 -0.421 0.164 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0996 0.168 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0256 0.164 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.64e-01 -0.099 0.171 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0172 0.164 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0994 0.147 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 1.69e-01 -0.212 0.154 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.25e-01 -0.241 0.157 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.60e-01 0.0425 0.139 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 5.84e-01 -0.08 0.146 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 4.55e-01 0.119 0.159 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0146 0.226 0.078 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.38e-02 -0.397 0.195 0.078 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 3.49e-01 -0.106 0.113 0.078 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 6.87e-01 0.0755 0.187 0.078 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 4.91e-01 0.118 0.17 0.078 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.56e-01 0.0829 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.21e-01 -0.138 0.215 0.078 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 2.61e-01 0.212 0.188 0.078 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0982 0.173 0.074 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 3.48e-01 0.15 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.42e-01 -0.157 0.134 0.074 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 2.86e-01 -0.148 0.138 0.074 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0356 0.146 0.074 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.93e-01 0.0659 0.167 0.074 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 9.37e-02 -0.272 0.161 0.074 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 6.90e-01 0.0505 0.126 0.074 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 7.87e-03 -0.43 0.16 0.073 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 2.33e-01 -0.175 0.146 0.073 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0502 0.161 0.073 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 5.78e-01 0.0556 0.0998 0.073 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 2.45e-01 -0.164 0.14 0.073 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 2.62e-01 -0.175 0.156 0.073 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.71e-01 -0.219 0.159 0.073 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0415 0.175 0.076 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 7.16e-01 0.0545 0.15 0.076 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.10e-03 -0.429 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 7.27e-01 -0.046 0.132 0.076 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.24e-01 0.0994 0.156 0.076 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 5.50e-01 0.0758 0.127 0.076 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 4.29e-01 0.125 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 6.19e-02 0.323 0.172 0.076 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.19e-01 -0.248 0.158 0.076 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0343 0.16 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0576 0.101 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 6.73e-01 0.0679 0.161 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.81e-01 0.129 0.147 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 1.84e-01 -0.157 0.118 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0717 0.15 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.27e-01 0.103 0.163 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.82e-02 -0.351 0.148 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 2.27e-01 0.205 0.17 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00512 0.123 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 1.83e-01 -0.207 0.155 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.88e-02 -0.28 0.147 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0109 0.127 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.17e-01 -0.161 0.161 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 2.83e-02 0.36 0.163 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 9.54e-02 0.267 0.159 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.73e-01 -0.156 0.216 0.061 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 6.07e-01 -0.105 0.204 0.061 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0732 0.218 0.061 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 7.28e-01 -0.057 0.163 0.061 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0152 0.21 0.061 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0318 0.201 0.061 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 9.03e-01 0.0261 0.213 0.061 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 7.97e-01 0.0477 0.185 0.061 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0886 0.186 0.076 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 4.77e-01 0.11 0.155 0.076 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0239 0.165 0.076 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0424 0.17 0.076 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 7.99e-01 0.0336 0.132 0.076 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 6.91e-02 0.287 0.157 0.076 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.38e-01 -0.258 0.173 0.076 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0399 0.168 0.076 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 3.50e-01 0.163 0.174 0.075 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 6.22e-01 0.0653 0.132 0.075 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 3.95e-01 0.136 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 4.93e-02 -0.322 0.163 0.075 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 6.92e-01 0.0555 0.14 0.075 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.71e-01 -0.143 0.159 0.075 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0583 0.172 0.075 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 8.97e-02 0.273 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 3.27e-02 -0.362 0.168 0.065 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 6.25e-01 0.0854 0.174 0.065 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.81e-01 -0.199 0.184 0.065 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 1.44e-01 -0.176 0.12 0.065 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 3.27e-01 -0.166 0.169 0.065 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 9.14e-01 0.018 0.165 0.065 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 4.85e-01 0.12 0.171 0.065 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 5.67e-01 -0.11 0.192 0.065 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 3.87e-02 0.35 0.168 0.065 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 2.47e-01 -0.186 0.16 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 1.95e-01 -0.166 0.128 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 4.32e-01 0.132 0.168 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 2.09e-01 -0.175 0.139 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 1.21e-01 -0.247 0.159 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 7.54e-01 0.052 0.166 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 4.66e-01 0.111 0.153 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 1.42e-01 0.187 0.127 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.57e-01 -0.116 0.156 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 7.25e-01 -0.044 0.125 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 3.30e-01 0.158 0.162 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0732 0.117 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 1.29e-01 0.227 0.149 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.10e-01 -0.167 0.164 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 3.85e-01 0.132 0.152 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 2.37e-01 0.139 0.117 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 6.80e-01 0.0662 0.16 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 9.59e-01 -0.005 0.0976 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0654 0.155 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0359 0.129 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0726 0.115 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 3.62e-01 -0.135 0.147 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 1.18e-01 0.238 0.151 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 2.36e-01 -0.176 0.148 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 8.14e-01 0.0399 0.169 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 2.09e-01 0.141 0.112 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00931 0.162 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 1.20e-01 -0.241 0.155 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -404911 sc-eQTL 6.45e-01 0.0595 0.129 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0459 0.155 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 7.08e-02 -0.29 0.16 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -520952 sc-eQTL 3.58e-01 0.152 0.165 0.073 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -199817 sc-eQTL 4.22e-01 0.131 0.163 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -276250 sc-eQTL 5.05e-02 -0.25 0.127 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 264172 sc-eQTL 2.90e-03 -0.428 0.142 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 201583 sc-eQTL 2.59e-02 -0.349 0.156 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -495508 sc-eQTL 6.51e-01 0.0495 0.109 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -495573 sc-eQTL 1.23e-01 -0.211 0.137 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -296022 sc-eQTL 4.46e-01 0.111 0.145 0.073 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 264172 eQTL 3.65e-06 -0.158 0.0339 0.0 0.0 0.0785
ENSG00000154027 AK5 201583 eQTL 0.014 -0.0862 0.035 0.0 0.0 0.0785
ENSG00000162614 NEXN -404911 eQTL 0.0348 0.0596 0.0282 0.0016 0.0 0.0785


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 264172 1.32e-06 9.83e-07 2.65e-07 1.14e-06 3.48e-07 6.02e-07 1.61e-06 3.82e-07 1.46e-06 5.06e-07 1.87e-06 7.32e-07 2.23e-06 2.63e-07 5.17e-07 9.19e-07 8.89e-07 7e-07 8.35e-07 6.4e-07 7.72e-07 1.6e-06 8.31e-07 5.77e-07 2.19e-06 5.53e-07 9.41e-07 7.24e-07 1.38e-06 1.25e-06 6.96e-07 2.38e-07 2.02e-07 6.86e-07 5.2e-07 4.62e-07 6.19e-07 2.4e-07 4.12e-07 2.76e-07 2.59e-07 1.63e-06 8.31e-08 1.14e-07 2.1e-07 1.38e-07 2.22e-07 4.82e-08 1.68e-07
ENSG00000162614 NEXN -404911 8.63e-07 6.65e-07 1.22e-07 4.43e-07 1.12e-07 2.67e-07 5.82e-07 1.62e-07 4.74e-07 2.72e-07 8.15e-07 4.21e-07 9.1e-07 1.6e-07 2.44e-07 2.89e-07 4.29e-07 4.24e-07 2.65e-07 1.69e-07 2.48e-07 4.14e-07 3.84e-07 2.22e-07 9.26e-07 2.71e-07 3.16e-07 2.73e-07 4.22e-07 6.81e-07 3.38e-07 5.88e-08 5.63e-08 1.77e-07 3.34e-07 1.58e-07 1.05e-07 1.02e-07 7.45e-08 1.57e-08 8.61e-08 6.49e-07 4.18e-08 1.22e-08 1.45e-07 1.46e-08 1.3e-07 3.01e-08 5.94e-08