logo

Genes within 1Mb (chr1:77463180:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.33e-01 -0.124 0.158 0.071 B L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 3.34e-01 0.111 0.114 0.071 B L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 3.14e-01 0.124 0.122 0.071 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000842 0.114 0.071 B L1
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0375 0.152 0.071 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.96e-01 -0.205 0.158 0.071 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0359 0.136 0.071 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 7.59e-02 0.211 0.118 0.071 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0958 0.145 0.071 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.97e-01 0.000308 0.0927 0.071 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0563 0.125 0.071 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 7.97e-02 0.166 0.0945 0.071 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.07e-01 0.0895 0.0873 0.071 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.47e-01 0.153 0.105 0.071 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.109 0.071 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 9.12e-01 0.0148 0.134 0.071 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.68e-01 0.141 0.127 0.071 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.84e-01 0.181 0.135 0.071 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 4.68e-01 0.061 0.084 0.071 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.94e-01 -0.027 0.103 0.071 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 2.91e-01 -0.148 0.14 0.071 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.53e-01 0.202 0.141 0.071 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 1.00e-01 0.227 0.138 0.071 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0971 0.167 0.068 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.36e-01 0.179 0.15 0.068 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0255 0.176 0.068 DC L1
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 4.24e-01 -0.114 0.142 0.068 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 2.36e-01 0.196 0.165 0.068 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0924 0.159 0.068 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 9.86e-02 -0.285 0.172 0.068 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.81e-01 -0.103 0.186 0.068 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 3.26e-01 0.175 0.178 0.068 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 3.53e-01 -0.151 0.162 0.071 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.98e-01 -0.123 0.0951 0.071 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0568 0.163 0.071 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.53e-01 0.0989 0.132 0.071 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 5.17e-01 0.0695 0.107 0.071 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.071 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 7.87e-01 0.0399 0.147 0.071 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 6.16e-01 0.076 0.151 0.071 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.37e-02 -0.289 0.166 0.071 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0213 0.132 0.071 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0826 0.154 0.071 NK L1
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 5.29e-02 -0.316 0.162 0.071 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.77e-01 0.031 0.109 0.071 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 5.41e-01 -0.092 0.15 0.071 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 3.09e-01 0.147 0.144 0.071 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0792 0.162 0.071 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0132 0.129 0.071 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0787 0.128 0.071 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00755 0.163 0.071 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0336 0.113 0.071 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.63e-01 0.0297 0.173 0.071 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.75e-01 0.0263 0.167 0.071 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 9.05e-02 0.259 0.152 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 3.30e-01 -0.193 0.198 0.069 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 6.58e-02 0.36 0.194 0.069 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00269 0.187 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0849 0.189 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 8.23e-01 0.0345 0.154 0.069 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 7.28e-01 -0.064 0.184 0.069 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 4.09e-01 0.164 0.198 0.069 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 4.98e-01 -0.12 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.95e-02 -0.292 0.171 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00404 0.155 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.68e-01 0.2 0.18 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0506 0.147 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0808 0.165 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 5.86e-01 0.0947 0.174 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 2.86e-01 -0.175 0.163 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.14 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0789 0.169 0.071 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0284 0.163 0.071 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 8.20e-01 0.0412 0.181 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.31e-01 -0.163 0.167 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 4.11e-01 0.134 0.163 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 5.37e-01 0.105 0.169 0.071 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 6.11e-01 0.0864 0.17 0.071 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 8.88e-01 0.0204 0.144 0.071 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 2.56e-01 -0.188 0.165 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 5.71e-01 0.0789 0.139 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.78e-01 0.00463 0.171 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 1.38e-01 0.191 0.128 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00214 0.155 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 9.47e-02 -0.281 0.168 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.07e-01 -0.108 0.163 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 2.47e-02 0.284 0.125 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.17e-01 0.142 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.77e-01 0.00446 0.158 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0622 0.18 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 9.88e-01 0.00225 0.15 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 3.64e-01 -0.139 0.153 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.13e-01 -0.283 0.177 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.34e-01 0.11 0.177 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 7.46e-01 0.0488 0.15 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.25e-01 -0.143 0.179 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 5.86e-01 0.0929 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.12e-01 0.272 0.17 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 4.51e-01 -0.117 0.154 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.04e-01 -0.141 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 4.17e-01 0.135 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.86e-01 0.0248 0.173 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0369 0.152 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.11e-01 0.0271 0.113 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 3.91e-01 -0.111 0.129 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 5.46e-02 0.212 0.11 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 1.91e-01 0.127 0.0964 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 4.72e-02 0.204 0.102 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 2.51e-01 0.136 0.118 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0748 0.16 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.12 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0174 0.173 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 5.45e-01 0.0683 0.113 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 5.60e-01 0.0701 0.12 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 7.87e-01 0.0407 0.15 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.90e-01 0.0851 0.158 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.17e-01 -0.125 0.154 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.85e-01 -0.211 0.158 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.08e-01 -0.212 0.168 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 5.51e-01 0.0947 0.159 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 2.91e-01 0.152 0.143 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 4.20e-01 -0.135 0.168 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0403 0.173 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 3.56e-01 -0.154 0.166 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.58e-01 0.0262 0.147 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 6.22e-01 0.0807 0.164 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 6.64e-01 0.0671 0.154 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0493 0.134 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.99e-02 -0.268 0.157 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.89e-01 0.192 0.146 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 2.15e-01 0.186 0.15 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.63e-01 0.0275 0.159 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 3.91e-01 0.127 0.148 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.27e-01 0.183 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 8.32e-01 0.0245 0.115 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.57e-01 0.116 0.126 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0242 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.90e-01 0.2 0.152 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 3.73e-01 0.132 0.148 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 3.21e-01 0.168 0.168 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.01e-01 0.278 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 5.14e-01 -0.12 0.183 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 3.27e-01 0.163 0.166 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.14e-01 -0.126 0.154 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0383 0.169 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0307 0.173 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 8.09e-03 0.399 0.149 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.52e-01 -0.111 0.185 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 5.89e-01 0.101 0.186 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.47e-02 0.43 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 4.02e-01 -0.105 0.125 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 9.27e-01 0.0157 0.172 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0394 0.173 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 2.80e-01 -0.198 0.183 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 9.40e-02 0.25 0.148 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0436 0.169 0.071 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 4.92e-01 -0.102 0.149 0.071 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0402 0.168 0.071 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.071 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.69e-01 -0.145 0.161 0.071 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0725 0.165 0.071 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.68e-01 0.227 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 2.68e-02 0.333 0.149 0.071 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 1.18e-01 -0.275 0.175 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 6.74e-01 0.0738 0.175 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0156 0.181 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 3.75e-01 -0.139 0.156 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 1.89e-01 -0.211 0.16 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 3.99e-01 -0.142 0.168 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.65e-01 0.0935 0.162 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.11e-02 -0.336 0.171 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 5.83e-01 0.0788 0.143 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0613 0.162 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 3.66e-02 -0.344 0.163 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 7.22e-01 0.0466 0.131 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 5.82e-01 0.0924 0.168 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.29e-01 0.0341 0.158 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0586 0.183 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.30e-02 -0.406 0.177 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.06e-01 0.236 0.186 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 3.97e-01 -0.144 0.169 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.80e-01 0.121 0.171 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 3.45e-01 0.157 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00434 0.174 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0278 0.171 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00993 0.153 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.66e-01 -0.179 0.16 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 8.06e-02 -0.286 0.163 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.54e-01 -0.108 0.145 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.70e-01 0.025 0.152 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 6.08e-01 0.0852 0.166 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0668 0.239 0.074 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.98e-01 0.219 0.209 0.074 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 7.62e-01 0.0363 0.12 0.074 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.69e-01 0.178 0.198 0.074 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 5.49e-01 -0.108 0.181 0.074 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.94e-01 0.255 0.195 0.074 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.97e-01 0.0297 0.228 0.074 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 4.57e-01 -0.149 0.2 0.074 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 1.03e-01 -0.285 0.174 0.072 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 3.74e-01 -0.144 0.162 0.072 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 7.42e-01 -0.045 0.136 0.072 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 8.65e-01 -0.024 0.141 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.76e-01 0.132 0.148 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 4.01e-01 0.142 0.169 0.072 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00866 0.165 0.072 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0287 0.128 0.072 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.42e-01 0.135 0.175 0.071 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000598 0.157 0.071 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.22e-01 0.211 0.173 0.071 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0641 0.107 0.071 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.92e-01 0.13 0.151 0.071 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.15e-01 0.264 0.167 0.071 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.01e-01 0.116 0.172 0.071 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.37e-01 -0.159 0.203 0.063 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 7.14e-01 0.0641 0.175 0.063 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 5.15e-01 -0.122 0.187 0.063 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 4.00e-01 -0.13 0.154 0.063 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 1.61e-02 0.435 0.179 0.063 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0808 0.148 0.063 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 2.01e-01 -0.235 0.183 0.063 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0127 0.203 0.063 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 9.15e-02 0.313 0.184 0.063 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 8.30e-01 -0.038 0.176 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0175 0.111 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0173 0.177 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.96e-01 0.137 0.161 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 1.99e-01 0.167 0.129 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.61e-01 -0.231 0.164 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.45e-01 0.035 0.179 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 3.79e-01 0.144 0.164 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.09e-01 -0.158 0.19 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.90e-01 -0.146 0.137 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0193 0.175 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.58e-01 0.124 0.166 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 5.11e-01 0.0939 0.143 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 1.47e-01 -0.262 0.18 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 5.38e-01 0.114 0.184 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 6.49e-01 0.0818 0.18 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.14e-01 -0.136 0.207 0.073 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.81e-02 0.46 0.192 0.073 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.26e-01 -0.32 0.207 0.073 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 3.63e-01 0.142 0.156 0.073 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 2.49e-01 -0.231 0.2 0.073 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 3.47e-01 -0.181 0.192 0.073 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 1.84e-01 -0.271 0.202 0.073 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 4.20e-01 -0.143 0.177 0.073 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 4.39e-01 -0.151 0.194 0.069 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.46e-01 0.187 0.161 0.069 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.70e-01 -0.236 0.171 0.069 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 1.39e-01 0.262 0.176 0.069 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 2.17e-01 0.169 0.137 0.069 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 6.89e-02 0.299 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 3.49e-01 -0.17 0.181 0.069 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 2.81e-01 0.188 0.174 0.069 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.27e-01 -0.112 0.177 0.068 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 8.84e-01 0.0197 0.135 0.068 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.86e-01 0.215 0.162 0.068 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0401 0.167 0.068 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 3.90e-01 0.122 0.142 0.068 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 6.61e-02 0.297 0.161 0.068 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 8.20e-01 -0.04 0.175 0.068 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 4.69e-02 0.324 0.162 0.068 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 7.89e-01 0.0532 0.199 0.062 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.34e-01 0.242 0.202 0.062 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 2.64e-01 0.24 0.215 0.062 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0298 0.14 0.062 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.50e-01 -0.149 0.197 0.062 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 3.85e-01 -0.168 0.192 0.062 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0534 0.2 0.062 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0901 0.223 0.062 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0524 0.198 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 1.33e-01 -0.252 0.167 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 3.89e-01 0.115 0.134 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 1.45e-01 0.256 0.175 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 4.08e-01 -0.12 0.145 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 8.07e-01 0.0407 0.167 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 8.25e-01 0.0384 0.173 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0198 0.159 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 7.66e-01 0.0397 0.133 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0913 0.163 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 5.97e-01 0.0691 0.13 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0225 0.17 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 3.23e-01 0.121 0.123 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 2.98e-01 -0.164 0.157 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 3.83e-02 -0.355 0.17 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0531 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 3.28e-02 0.262 0.122 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 2.74e-01 -0.187 0.17 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 1.71e-01 -0.142 0.104 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.43e-01 -0.012 0.166 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 2.02e-01 0.176 0.137 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 4.94e-01 0.0836 0.122 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 2.47e-02 -0.352 0.156 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 4.21e-01 0.13 0.162 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 7.52e-01 0.05 0.158 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 5.08e-01 -0.112 0.169 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 2.49e-01 0.129 0.112 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 9.28e-01 0.0147 0.162 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 5.25e-01 0.0988 0.155 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -425333 sc-eQTL 3.69e-01 0.116 0.129 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 5.17e-02 0.301 0.154 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 6.49e-02 -0.296 0.159 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 sc-eQTL 2.68e-02 0.364 0.163 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -220239 sc-eQTL 1.41e-01 -0.25 0.169 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -296672 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0383 0.133 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 243750 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0911 0.151 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 181161 sc-eQTL 6.77e-02 -0.299 0.163 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -515930 sc-eQTL 6.57e-01 0.0506 0.114 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -515995 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00825 0.143 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -316444 sc-eQTL 7.03e-01 0.0576 0.151 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000273338 AC103591.3 -541374 eQTL 4.00e-02 0.0875 0.0426 0.0 0.0 0.0564

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162613 \N -515930 9.14e-07 6.42e-07 1.23e-07 4.27e-07 9.33e-08 2.67e-07 5.8e-07 1.42e-07 4.74e-07 2.62e-07 8.08e-07 4.31e-07 9.37e-07 1.6e-07 2.26e-07 2.84e-07 3.75e-07 4.22e-07 2.51e-07 1.69e-07 2.3e-07 4.31e-07 4.12e-07 2.17e-07 9.71e-07 2.68e-07 3.1e-07 2.98e-07 4.13e-07 7.06e-07 3.38e-07 6.84e-08 5.55e-08 1.77e-07 3.52e-07 1.66e-07 1.1e-07 1.06e-07 7.45e-08 1.58e-08 1.16e-07 6.19e-07 2.47e-08 5.74e-09 1.33e-07 1.42e-08 1.32e-07 3.13e-08 6.06e-08