Genes within 1Mb (chr1:77462115:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.16e-05 0.461 0.11 0.16 B L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0711 0.0826 0.16 B L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.06e-01 0.143 0.0881 0.16 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0656 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 1.86e-02 -0.256 0.108 0.16 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.18e-01 -0.141 0.114 0.16 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.55e-01 0.044 0.0984 0.16 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 5.91e-01 0.0463 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 7.28e-09 0.582 0.0965 0.16 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00203 0.0666 0.16 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0892 0.16 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.88e-03 0.211 0.0669 0.16 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 4.29e-01 0.0498 0.0628 0.16 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0101 0.076 0.16 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 7.01e-01 0.0302 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 7.55e-06 0.442 0.0962 0.16 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0592 0.096 0.16 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 5.12e-01 0.0672 0.102 0.16 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 2.18e-02 0.145 0.0625 0.16 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0463 0.0774 0.16 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0318 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 3.53e-01 0.0992 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.08e-03 0.365 0.11 0.167 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00896 0.102 0.167 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 9.55e-01 0.00667 0.119 0.167 DC L1
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0289 0.0962 0.167 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0368 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0554 0.107 0.167 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.02e-01 -0.098 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.78e-01 0.0524 0.126 0.167 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 6.64e-01 0.0523 0.12 0.167 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 6.27e-05 0.469 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0699 0.16 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.27e-02 0.297 0.118 0.16 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.39e-01 -0.114 0.0966 0.16 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 6.87e-01 0.0318 0.0788 0.16 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.27e-01 0.0852 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0662 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.16e-06 0.578 0.115 0.159 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 5.13e-01 0.0628 0.0959 0.159 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 6.09e-04 0.381 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 4.48e-25 1.09 0.0925 0.159 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 4.13e-02 -0.162 0.0788 0.159 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0515 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.159 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 3.92e-04 0.421 0.117 0.16 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0417 0.0957 0.16 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.41e-01 0.14 0.0948 0.16 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.51e-08 0.659 0.112 0.16 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0188 0.0838 0.16 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00486 0.128 0.16 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 5.30e-01 -0.078 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.29e-01 0.137 0.113 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 8.32e-01 0.0292 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0993 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 1.23e-01 -0.205 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 6.16e-01 0.0543 0.108 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 1.97e-01 0.167 0.129 0.153 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.67e-03 -0.414 0.136 0.153 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0448 0.124 0.153 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.48e-03 0.366 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0442 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.89e-01 0.11 0.128 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.14e-01 -0.13 0.104 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 5.41e-02 -0.225 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.55e-02 -0.274 0.122 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.115 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0378 0.0998 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.07e-03 0.37 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.78e-01 0.174 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.12 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 3.07e-01 -0.12 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.73e-01 0.0195 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 1.43e-01 -0.151 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.51e-04 0.451 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0921 0.102 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.68e-01 0.112 0.124 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 1.10e-01 -0.15 0.0937 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0579 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 6.00e-01 0.0648 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 7.59e-01 0.0366 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 5.99e-01 0.0489 0.0928 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 5.34e-01 0.0797 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 2.87e-01 -0.123 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0482 0.132 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0235 0.112 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.131 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00209 0.13 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 6.19e-01 0.0549 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0999 0.136 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 1.47e-01 -0.187 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.61e-01 -0.119 0.13 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.97e-04 0.429 0.113 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.38e-01 -0.152 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0134 0.126 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.83e-01 0.141 0.131 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.24e-07 0.55 0.103 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.0818 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 6.14e-02 0.174 0.0923 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 2.00e-03 0.245 0.0782 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 8.17e-01 0.0162 0.0698 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0442 0.0745 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00663 0.0856 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.53e-08 0.611 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 5.67e-01 0.0496 0.0867 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.68e-01 0.0367 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 3.44e-03 0.236 0.0797 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.15e-01 0.107 0.0863 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0271 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.53e-01 0.158 0.11 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0294 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.02e-01 0.198 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 7.87e-03 0.301 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0179 0.103 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.85e-01 0.0844 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.99e-01 -0.048 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 7.63e-02 0.224 0.126 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0458 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 9.89e-01 0.00173 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.33e-11 0.755 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0514 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 3.94e-01 -0.103 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 1.51e-01 0.164 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.11e-07 0.584 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0535 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 5.58e-01 0.0634 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 3.74e-01 0.0736 0.0825 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0293 0.0902 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.77e-01 0.0771 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0218 0.11 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 3.40e-01 0.117 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0549 0.133 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 4.98e-01 0.0764 0.113 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0883 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 4.76e-01 0.09 0.126 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 9.93e-01 0.000922 0.111 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.38e-01 0.206 0.138 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 2.38e-01 -0.165 0.139 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 5.93e-01 0.071 0.133 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 3.31e-01 0.0915 0.0939 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 9.46e-01 0.00865 0.128 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000943 0.129 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.73e-01 0.15 0.137 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 3.20e-01 0.111 0.112 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.88e-02 0.295 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 3.20e-01 -0.11 0.11 0.158 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.20e-01 0.045 0.125 0.158 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.098 0.158 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.15e-01 0.0439 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.19e-01 -0.061 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.113 0.158 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.44e-01 0.0598 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 2.94e-01 0.14 0.133 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 9.58e-06 0.498 0.11 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.42e-01 -0.139 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 1.30e-01 -0.181 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 7.58e-04 0.414 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 7.84e-01 0.0284 0.103 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 5.12e-04 0.401 0.113 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 2.76e-24 1.08 0.0928 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0939 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.80e-01 0.0183 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 7.85e-01 0.0309 0.114 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.17e-03 0.418 0.127 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0749 0.128 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 6.47e-01 0.0612 0.133 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.30e-23 1.07 0.0935 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0974 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.67e-02 -0.227 0.123 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.30e-05 0.52 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 5.23e-01 0.0698 0.109 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.69e-02 0.238 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.24e-24 1.06 0.0909 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0395 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.85e-01 -0.126 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 3.46e-01 0.167 0.176 0.17 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.155 0.17 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.05e-01 0.0912 0.0885 0.17 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 6.15e-01 0.074 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 1.12e-01 -0.212 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 1.14e-01 -0.229 0.144 0.17 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.15e-01 -0.085 0.169 0.17 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 1.32e-01 -0.223 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.22e-02 0.258 0.126 0.163 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 3.63e-01 -0.107 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.11e-01 0.1 0.099 0.163 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 9.81e-06 0.443 0.0977 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00782 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0196 0.123 0.163 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.96e-02 0.202 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.23e-03 0.389 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0509 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 3.49e-03 0.216 0.073 0.16 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0397 0.105 0.16 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.63e-01 0.0201 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 1.11e-03 0.385 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.79e-01 0.181 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 7.78e-02 -0.204 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.39e-01 0.0415 0.124 0.161 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.161 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.01e-01 0.0464 0.12 0.161 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0968 0.161 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 6.97e-01 0.0477 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 5.57e-01 0.0789 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 1.37e-01 0.183 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 6.66e-05 0.477 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0761 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.12e-02 0.262 0.121 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 6.26e-02 -0.207 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.0896 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 7.99e-01 0.0291 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0687 0.124 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.70e-01 0.125 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.54e-02 0.311 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0726 0.0933 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.29e-01 0.136 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 9.32e-01 0.00827 0.0968 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 5.41e-02 0.235 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 4.85e-01 0.0874 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 4.70e-01 0.088 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.11e-01 0.186 0.148 0.164 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 9.65e-01 0.00627 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 4.11e-01 0.124 0.15 0.164 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 1.77e-06 0.519 0.104 0.164 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 9.17e-02 0.243 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.13e-01 0.0329 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 4.74e-01 0.105 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 5.96e-01 0.0678 0.128 0.164 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.67e-03 0.424 0.133 0.158 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.69e-01 0.0484 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0478 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0195 0.124 0.158 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0959 0.158 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 5.92e-02 0.218 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 2.19e-01 0.157 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 5.46e-01 -0.074 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.89e-01 0.0879 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 6.83e-01 0.0393 0.0963 0.158 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.19e-01 -0.147 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 8.82e-01 0.0152 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 5.40e-01 0.0711 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0301 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 6.72e-01 0.0497 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 6.61e-02 0.232 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 2.76e-01 0.141 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0315 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 6.69e-01 0.0383 0.0894 0.164 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 1.67e-01 -0.174 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0333 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0243 0.128 0.164 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.72e-01 -0.023 0.142 0.164 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 6.51e-01 0.0573 0.126 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 8.04e-04 0.394 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.0949 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.82e-02 0.219 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0365 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 1.10e-02 -0.298 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 4.77e-02 -0.242 0.122 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 8.16e-01 0.0264 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0785 0.0943 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 4.92e-04 0.41 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 1.69e-01 -0.131 0.0949 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.48e-01 0.0399 0.124 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0835 0.0895 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 8.35e-01 -0.024 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 3.00e-01 0.13 0.125 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 6.93e-01 0.0458 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 3.17e-01 0.0901 0.0899 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 1.99e-04 0.446 0.118 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 1.17e-01 -0.116 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.35e-03 0.315 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0981 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0286 0.0872 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 2.44e-01 0.131 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0415 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.06e-04 0.461 0.122 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0322 0.0837 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 3.34e-01 -0.112 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -426398 sc-eQTL 3.55e-02 0.202 0.0953 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.88e-01 0.0164 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 7.20e-01 0.0431 0.12 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -542439 sc-eQTL 6.75e-01 0.0516 0.123 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 sc-eQTL 2.22e-06 0.571 0.117 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -297737 sc-eQTL 4.38e-01 0.0754 0.097 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 242685 sc-eQTL 7.32e-04 0.367 0.107 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 180096 sc-eQTL 8.99e-25 1.09 0.0927 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -516995 sc-eQTL 1.44e-01 -0.121 0.0825 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -317509 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0831 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 eQTL 3.53e-05 0.0621 0.0149 0.0 0.0 0.148
ENSG00000077254 USP33 -297737 eQTL 0.00858 -0.0382 0.0145 0.0 0.0 0.148
ENSG00000137960 GIPC2 -517427 pQTL 2.4e-05 0.122 0.0289 0.0 0.0 0.149
ENSG00000142892 PIGK 242685 eQTL 2.45e-05 0.108 0.0254 0.0 0.0 0.148
ENSG00000154027 AK5 180096 eQTL 3.27e-47 0.359 0.0235 0.0 0.0 0.148
ENSG00000162616 DNAJB4 -517060 eQTL 0.0272 -0.0625 0.0282 0.0 0.0 0.148


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -221304 1.28e-06 1.24e-06 2.83e-07 1.26e-06 3.92e-07 5.98e-07 1.49e-06 4.54e-07 1.78e-06 6.2e-07 2.04e-06 8.44e-07 2.5e-06 2.95e-07 4.96e-07 9.62e-07 9.41e-07 1.09e-06 6.6e-07 4.74e-07 7.49e-07 1.89e-06 1.09e-06 6.29e-07 2.42e-06 7.75e-07 1.04e-06 8.48e-07 1.62e-06 1.28e-06 8.17e-07 2.61e-07 3e-07 5.6e-07 5.64e-07 5.06e-07 6.93e-07 2.97e-07 4.58e-07 2.42e-07 3.57e-07 1.77e-06 1.28e-07 1.32e-07 3.65e-07 2.31e-07 2.28e-07 1.16e-07 2.46e-07
ENSG00000142892 PIGK 242685 1.29e-06 1e-06 2.54e-07 1.04e-06 3.91e-07 5.26e-07 1.6e-06 3.81e-07 1.41e-06 5.63e-07 1.87e-06 7.37e-07 2.23e-06 3.03e-07 5.65e-07 9.19e-07 8.94e-07 7.83e-07 8.83e-07 5.97e-07 7.95e-07 1.72e-06 8.89e-07 5.48e-07 2.24e-06 6.68e-07 9.18e-07 8.64e-07 1.48e-06 1.25e-06 6.73e-07 2.42e-07 2.85e-07 6.58e-07 5.69e-07 5e-07 6.17e-07 2.47e-07 4.52e-07 2.64e-07 2.58e-07 1.62e-06 9.48e-08 1.06e-07 3e-07 1.23e-07 2.21e-07 3.77e-08 1.82e-07
ENSG00000154027 AK5 180096 1.88e-06 2.24e-06 2.77e-07 1.44e-06 4.62e-07 6.43e-07 1.29e-06 5.6e-07 1.72e-06 7.24e-07 1.86e-06 1.45e-06 2.94e-06 7.47e-07 4.61e-07 1.15e-06 1.03e-06 1.55e-06 6.59e-07 1.05e-06 7.78e-07 2.15e-06 1.81e-06 1.02e-06 2.62e-06 1.22e-06 1.1e-06 1.35e-06 1.76e-06 1.64e-06 8.36e-07 2.65e-07 4.45e-07 1.12e-06 9.62e-07 8.86e-07 7.27e-07 3.94e-07 7.04e-07 3.28e-07 1.52e-07 2.79e-06 4.23e-07 1.99e-07 2.81e-07 2.97e-07 4.63e-07 2.65e-07 2.32e-07