logo

Genes within 1Mb (chr1:77455610:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.16e-05 0.461 0.11 0.16 B L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0711 0.0826 0.16 B L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.06e-01 0.143 0.0881 0.16 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0656 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 1.86e-02 -0.256 0.108 0.16 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.18e-01 -0.141 0.114 0.16 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.55e-01 0.044 0.0984 0.16 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 5.91e-01 0.0463 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 7.28e-09 0.582 0.0965 0.16 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00203 0.0666 0.16 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0892 0.16 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.88e-03 0.211 0.0669 0.16 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 4.29e-01 0.0498 0.0628 0.16 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0101 0.076 0.16 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 7.01e-01 0.0302 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 7.55e-06 0.442 0.0962 0.16 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0592 0.096 0.16 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 5.12e-01 0.0672 0.102 0.16 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 2.18e-02 0.145 0.0625 0.16 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0463 0.0774 0.16 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0318 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 3.53e-01 0.0992 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.08e-03 0.365 0.11 0.167 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00896 0.102 0.167 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 9.55e-01 0.00667 0.119 0.167 DC L1
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0289 0.0962 0.167 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0368 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0554 0.107 0.167 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.02e-01 -0.098 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.78e-01 0.0524 0.126 0.167 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 6.64e-01 0.0523 0.12 0.167 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 6.27e-05 0.469 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0699 0.16 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.27e-02 0.297 0.118 0.16 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.39e-01 -0.114 0.0966 0.16 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 6.87e-01 0.0318 0.0788 0.16 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.27e-01 0.0852 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0662 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.16e-06 0.578 0.115 0.159 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 5.13e-01 0.0628 0.0959 0.159 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 6.09e-04 0.381 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 4.48e-25 1.09 0.0925 0.159 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 4.13e-02 -0.162 0.0788 0.159 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0515 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.159 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 3.92e-04 0.421 0.117 0.16 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0417 0.0957 0.16 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.41e-01 0.14 0.0948 0.16 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.51e-08 0.659 0.112 0.16 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0188 0.0838 0.16 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00486 0.128 0.16 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 5.30e-01 -0.078 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.29e-01 0.137 0.113 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 8.32e-01 0.0292 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0993 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 1.23e-01 -0.205 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 6.16e-01 0.0543 0.108 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 1.97e-01 0.167 0.129 0.153 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.67e-03 -0.414 0.136 0.153 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0448 0.124 0.153 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.48e-03 0.366 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0442 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.89e-01 0.11 0.128 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.14e-01 -0.13 0.104 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 5.41e-02 -0.225 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.55e-02 -0.274 0.122 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.115 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0378 0.0998 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.07e-03 0.37 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.78e-01 0.174 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.12 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 3.07e-01 -0.12 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.73e-01 0.0195 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 1.43e-01 -0.151 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.51e-04 0.451 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0921 0.102 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.68e-01 0.112 0.124 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 1.10e-01 -0.15 0.0937 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0579 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 6.00e-01 0.0648 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 7.59e-01 0.0366 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 5.99e-01 0.0489 0.0928 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 5.34e-01 0.0797 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 2.87e-01 -0.123 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0482 0.132 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0235 0.112 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.131 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00209 0.13 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 6.19e-01 0.0549 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0999 0.136 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 1.47e-01 -0.187 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.61e-01 -0.119 0.13 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.97e-04 0.429 0.113 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.38e-01 -0.152 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0134 0.126 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.83e-01 0.141 0.131 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.24e-07 0.55 0.103 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.0818 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 6.14e-02 0.174 0.0923 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 2.00e-03 0.245 0.0782 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 8.17e-01 0.0162 0.0698 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0442 0.0745 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00663 0.0856 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.53e-08 0.611 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 5.67e-01 0.0496 0.0867 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.68e-01 0.0367 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 3.44e-03 0.236 0.0797 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.15e-01 0.107 0.0863 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0271 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.53e-01 0.158 0.11 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0294 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.02e-01 0.198 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 7.87e-03 0.301 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0179 0.103 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.85e-01 0.0844 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.99e-01 -0.048 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 7.63e-02 0.224 0.126 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0458 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 9.89e-01 0.00173 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.33e-11 0.755 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0514 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 3.94e-01 -0.103 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 1.51e-01 0.164 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.11e-07 0.584 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0535 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 5.58e-01 0.0634 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 3.74e-01 0.0736 0.0825 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0293 0.0902 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.77e-01 0.0771 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0218 0.11 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 3.40e-01 0.117 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0549 0.133 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 4.98e-01 0.0764 0.113 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0883 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 4.76e-01 0.09 0.126 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 9.93e-01 0.000922 0.111 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.38e-01 0.206 0.138 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 2.38e-01 -0.165 0.139 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 5.93e-01 0.071 0.133 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 3.31e-01 0.0915 0.0939 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 9.46e-01 0.00865 0.128 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000943 0.129 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.73e-01 0.15 0.137 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 3.20e-01 0.111 0.112 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.88e-02 0.295 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 3.20e-01 -0.11 0.11 0.158 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.20e-01 0.045 0.125 0.158 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.098 0.158 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.15e-01 0.0439 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.19e-01 -0.061 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.113 0.158 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.44e-01 0.0598 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 2.94e-01 0.14 0.133 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 9.58e-06 0.498 0.11 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.42e-01 -0.139 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 1.30e-01 -0.181 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 7.58e-04 0.414 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 7.84e-01 0.0284 0.103 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 5.12e-04 0.401 0.113 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 2.76e-24 1.08 0.0928 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0939 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.80e-01 0.0183 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 7.85e-01 0.0309 0.114 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.17e-03 0.418 0.127 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0749 0.128 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 6.47e-01 0.0612 0.133 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.30e-23 1.07 0.0935 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0974 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.67e-02 -0.227 0.123 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.30e-05 0.52 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 5.23e-01 0.0698 0.109 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.69e-02 0.238 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.24e-24 1.06 0.0909 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0395 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.85e-01 -0.126 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 3.46e-01 0.167 0.176 0.17 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.155 0.17 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.05e-01 0.0912 0.0885 0.17 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 6.15e-01 0.074 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 1.12e-01 -0.212 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 1.14e-01 -0.229 0.144 0.17 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.15e-01 -0.085 0.169 0.17 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 1.32e-01 -0.223 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.22e-02 0.258 0.126 0.163 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 3.63e-01 -0.107 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.11e-01 0.1 0.099 0.163 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 9.81e-06 0.443 0.0977 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00782 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0196 0.123 0.163 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.96e-02 0.202 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.23e-03 0.389 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0509 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 3.49e-03 0.216 0.073 0.16 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0397 0.105 0.16 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.63e-01 0.0201 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 1.11e-03 0.385 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.79e-01 0.181 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 7.78e-02 -0.204 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.39e-01 0.0415 0.124 0.161 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.161 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.01e-01 0.0464 0.12 0.161 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0968 0.161 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 6.97e-01 0.0477 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 5.57e-01 0.0789 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 1.37e-01 0.183 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 6.66e-05 0.477 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0761 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.12e-02 0.262 0.121 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 6.26e-02 -0.207 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.0896 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 7.99e-01 0.0291 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0687 0.124 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.70e-01 0.125 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.54e-02 0.311 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0726 0.0933 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.29e-01 0.136 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 9.32e-01 0.00827 0.0968 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 5.41e-02 0.235 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 4.85e-01 0.0874 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 4.70e-01 0.088 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.11e-01 0.186 0.148 0.164 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 9.65e-01 0.00627 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 4.11e-01 0.124 0.15 0.164 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 1.77e-06 0.519 0.104 0.164 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 9.17e-02 0.243 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.13e-01 0.0329 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 4.74e-01 0.105 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 5.96e-01 0.0678 0.128 0.164 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.67e-03 0.424 0.133 0.158 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.69e-01 0.0484 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0478 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0195 0.124 0.158 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0959 0.158 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 5.92e-02 0.218 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 2.19e-01 0.157 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 5.46e-01 -0.074 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.89e-01 0.0879 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 6.83e-01 0.0393 0.0963 0.158 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.19e-01 -0.147 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 8.82e-01 0.0152 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 5.40e-01 0.0711 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0301 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 6.72e-01 0.0497 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 6.61e-02 0.232 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 2.76e-01 0.141 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0315 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 6.69e-01 0.0383 0.0894 0.164 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 1.67e-01 -0.174 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0333 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0243 0.128 0.164 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.72e-01 -0.023 0.142 0.164 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 6.51e-01 0.0573 0.126 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 8.04e-04 0.394 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.0949 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.82e-02 0.219 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0365 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 1.10e-02 -0.298 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 4.77e-02 -0.242 0.122 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 8.16e-01 0.0264 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0785 0.0943 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 4.92e-04 0.41 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 1.69e-01 -0.131 0.0949 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.48e-01 0.0399 0.124 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0835 0.0895 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 8.35e-01 -0.024 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 3.00e-01 0.13 0.125 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 6.93e-01 0.0458 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 3.17e-01 0.0901 0.0899 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 1.99e-04 0.446 0.118 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 1.17e-01 -0.116 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.35e-03 0.315 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0981 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0286 0.0872 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 2.44e-01 0.131 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0415 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.06e-04 0.461 0.122 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0322 0.0837 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 3.34e-01 -0.112 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -432903 sc-eQTL 3.55e-02 0.202 0.0953 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.88e-01 0.0164 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 7.20e-01 0.0431 0.12 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -548944 sc-eQTL 6.75e-01 0.0516 0.123 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 sc-eQTL 2.22e-06 0.571 0.117 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304242 sc-eQTL 4.38e-01 0.0754 0.097 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 236180 sc-eQTL 7.32e-04 0.367 0.107 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 173591 sc-eQTL 8.99e-25 1.09 0.0927 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -523500 sc-eQTL 1.44e-01 -0.121 0.0825 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324014 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0831 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 eQTL 4.65e-05 0.0613 0.015 0.0 0.0 0.147
ENSG00000077254 USP33 -304242 eQTL 0.00927 -0.0379 0.0146 0.0 0.0 0.147
ENSG00000137960 GIPC2 -523932 pQTL 2.92e-05 0.122 0.029 0.0 0.0 0.148
ENSG00000142892 PIGK 236180 eQTL 2.68e-05 0.107 0.0254 0.0 0.0 0.147
ENSG00000154027 AK5 173591 eQTL 8.06e-48 0.362 0.0235 0.0 0.0 0.147
ENSG00000162616 DNAJB4 -523565 eQTL 0.0266 -0.0629 0.0283 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -227809 1.91e-06 2.09e-06 2.19e-07 1.3e-06 4.18e-07 6.4e-07 1.27e-06 3.98e-07 1.72e-06 7.14e-07 1.84e-06 1.25e-06 2.75e-06 6.86e-07 3.66e-07 1.07e-06 1.04e-06 1.27e-06 5.65e-07 6.02e-07 6.15e-07 1.96e-06 1.63e-06 6.61e-07 2.5e-06 8.38e-07 1.02e-06 1.04e-06 1.72e-06 1.36e-06 7.53e-07 2.49e-07 3.19e-07 5.83e-07 8.29e-07 6.66e-07 7.14e-07 3.18e-07 4.69e-07 1.86e-07 3.04e-07 2.82e-06 2.33e-07 8.1e-08 2.88e-07 3.22e-07 2.87e-07 1.7e-07 2.05e-07
ENSG00000142892 PIGK 236180 1.86e-06 1.95e-06 2.53e-07 1.25e-06 3.55e-07 6.42e-07 1.35e-06 4.34e-07 1.7e-06 6.94e-07 2.05e-06 1.28e-06 2.64e-06 5.23e-07 3.95e-07 1.02e-06 1.04e-06 1.16e-06 5.99e-07 4.92e-07 7.33e-07 1.92e-06 1.47e-06 5.76e-07 2.43e-06 7.75e-07 1.03e-06 1.07e-06 1.65e-06 1.26e-06 7.35e-07 2.43e-07 2.77e-07 5.48e-07 7.35e-07 6.32e-07 7.26e-07 2.95e-07 5.09e-07 2.11e-07 2.85e-07 2.7e-06 1.66e-07 6.53e-08 2.96e-07 2.47e-07 2.66e-07 1.42e-07 1.97e-07
ENSG00000154027 AK5 173591 3.58e-06 3.14e-06 3.27e-07 2.02e-06 4.89e-07 7.73e-07 2.08e-06 6.93e-07 2.22e-06 1.06e-06 2.61e-06 1.53e-06 4.14e-06 1.43e-06 9.25e-07 1.95e-06 1.34e-06 2.22e-06 1.15e-06 1.43e-06 1.32e-06 3.15e-06 2.77e-06 1.01e-06 4.15e-06 1.21e-06 1.34e-06 1.84e-06 2.71e-06 2.2e-06 2.08e-06 3.28e-07 5.18e-07 1.25e-06 1.47e-06 8.95e-07 8.28e-07 4.1e-07 1.11e-06 3.76e-07 2.88e-07 4.1e-06 4.24e-07 1.67e-07 3.98e-07 3.33e-07 7.88e-07 2.33e-07 2.22e-07