logo

Genes within 1Mb (chr1:77454931:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.16e-05 0.461 0.11 0.16 B L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0711 0.0826 0.16 B L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.06e-01 0.143 0.0881 0.16 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0656 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 1.86e-02 -0.256 0.108 0.16 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.18e-01 -0.141 0.114 0.16 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.55e-01 0.044 0.0984 0.16 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 5.91e-01 0.0463 0.0861 0.16 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 7.28e-09 0.582 0.0965 0.16 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00203 0.0666 0.16 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0892 0.16 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.88e-03 0.211 0.0669 0.16 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 4.29e-01 0.0498 0.0628 0.16 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0101 0.076 0.16 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 7.01e-01 0.0302 0.0785 0.16 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 7.55e-06 0.442 0.0962 0.16 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0592 0.096 0.16 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 5.12e-01 0.0672 0.102 0.16 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 2.18e-02 0.145 0.0625 0.16 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0463 0.0774 0.16 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0318 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 3.53e-01 0.0992 0.106 0.16 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.08e-03 0.365 0.11 0.167 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00896 0.102 0.167 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 9.55e-01 0.00667 0.119 0.167 DC L1
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0289 0.0962 0.167 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0368 0.112 0.167 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0554 0.107 0.167 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.02e-01 -0.098 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.78e-01 0.0524 0.126 0.167 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 6.64e-01 0.0523 0.12 0.167 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 6.27e-05 0.469 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0699 0.16 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.27e-02 0.297 0.118 0.16 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.39e-01 -0.114 0.0966 0.16 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 6.87e-01 0.0318 0.0788 0.16 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.27e-01 0.0852 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0662 0.108 0.16 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.16e-06 0.578 0.115 0.159 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 5.13e-01 0.0628 0.0959 0.159 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 6.09e-04 0.381 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 4.48e-25 1.09 0.0925 0.159 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 4.13e-02 -0.162 0.0788 0.159 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0515 0.109 0.159 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.159 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 3.92e-04 0.421 0.117 0.16 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0417 0.0957 0.16 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.41e-01 0.14 0.0948 0.16 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.51e-08 0.659 0.112 0.16 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0188 0.0838 0.16 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00486 0.128 0.16 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 5.30e-01 -0.078 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.29e-01 0.137 0.113 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 8.32e-01 0.0292 0.138 0.153 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0993 0.131 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 1.23e-01 -0.205 0.132 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 6.16e-01 0.0543 0.108 0.153 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 1.97e-01 0.167 0.129 0.153 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.67e-03 -0.414 0.136 0.153 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0448 0.124 0.153 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.48e-03 0.366 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0442 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.89e-01 0.11 0.128 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.14e-01 -0.13 0.104 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 5.41e-02 -0.225 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.55e-02 -0.274 0.122 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.115 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0378 0.0998 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.07e-03 0.37 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0167 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.78e-01 0.174 0.129 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.12 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 3.07e-01 -0.12 0.117 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.162 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.73e-01 0.0195 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 1.43e-01 -0.151 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.51e-04 0.451 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0921 0.102 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.68e-01 0.112 0.124 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 1.10e-01 -0.15 0.0937 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0579 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 6.00e-01 0.0648 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 7.59e-01 0.0366 0.119 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 5.99e-01 0.0489 0.0928 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 5.34e-01 0.0797 0.128 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 2.87e-01 -0.123 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0482 0.132 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0123 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0235 0.112 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.131 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00209 0.13 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 6.19e-01 0.0549 0.11 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0999 0.136 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 1.47e-01 -0.187 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.61e-01 -0.119 0.13 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.97e-04 0.429 0.113 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.38e-01 -0.152 0.128 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0134 0.126 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.83e-01 0.141 0.131 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.24e-07 0.55 0.103 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.0818 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 6.14e-02 0.174 0.0923 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 2.00e-03 0.245 0.0782 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 8.17e-01 0.0162 0.0698 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0442 0.0745 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00663 0.0856 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.53e-08 0.611 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 5.67e-01 0.0496 0.0867 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.68e-01 0.0367 0.124 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 3.44e-03 0.236 0.0797 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.15e-01 0.107 0.0863 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.09e-01 0.136 0.108 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0271 0.114 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.53e-01 0.158 0.11 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0294 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.02e-01 0.198 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 7.87e-03 0.301 0.112 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0179 0.103 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.85e-01 0.0844 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.99e-01 -0.048 0.124 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 7.63e-02 0.224 0.126 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0458 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 9.89e-01 0.00173 0.125 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.33e-11 0.755 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0514 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 3.94e-01 -0.103 0.12 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 3.32e-01 -0.108 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 1.51e-01 0.164 0.114 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.11e-07 0.584 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0535 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 5.58e-01 0.0634 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 3.74e-01 0.0736 0.0825 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0293 0.0902 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.77e-01 0.0771 0.108 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0218 0.11 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.106 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 3.40e-01 0.117 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0549 0.133 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 3.89e-01 0.104 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 4.98e-01 0.0764 0.113 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0883 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 4.76e-01 0.09 0.126 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 9.93e-01 0.000922 0.111 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.38e-01 0.206 0.138 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 2.38e-01 -0.165 0.139 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 5.93e-01 0.071 0.133 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 3.31e-01 0.0915 0.0939 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 9.46e-01 0.00865 0.128 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000943 0.129 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.73e-01 0.15 0.137 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 3.20e-01 0.111 0.112 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.88e-02 0.295 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 3.20e-01 -0.11 0.11 0.158 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.20e-01 0.045 0.125 0.158 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.66e-01 0.136 0.098 0.158 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.15e-01 0.0439 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.86e-01 -0.131 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.19e-01 -0.061 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.113 0.158 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.44e-01 0.0598 0.129 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 2.94e-01 0.14 0.133 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 9.58e-06 0.498 0.11 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.42e-01 -0.139 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 1.30e-01 -0.181 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 7.58e-04 0.414 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 7.84e-01 0.0284 0.103 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 5.12e-04 0.401 0.113 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 2.76e-24 1.08 0.0928 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.10e-01 -0.118 0.0939 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.80e-01 0.0183 0.121 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 7.85e-01 0.0309 0.114 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.17e-03 0.418 0.127 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0749 0.128 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 6.47e-01 0.0612 0.133 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.30e-23 1.07 0.0935 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0974 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.67e-02 -0.227 0.123 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.30e-05 0.52 0.117 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 5.23e-01 0.0698 0.109 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.69e-02 0.238 0.113 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.24e-24 1.06 0.0909 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0395 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.85e-01 -0.126 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 3.46e-01 0.167 0.176 0.17 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.155 0.17 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.05e-01 0.0912 0.0885 0.17 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 6.15e-01 0.074 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 1.12e-01 -0.212 0.132 0.17 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 1.14e-01 -0.229 0.144 0.17 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.15e-01 -0.085 0.169 0.17 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 1.32e-01 -0.223 0.147 0.17 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.22e-02 0.258 0.126 0.163 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 3.63e-01 -0.107 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.11e-01 0.1 0.099 0.163 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 9.81e-06 0.443 0.0977 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00782 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0196 0.123 0.163 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 9.13e-01 0.0132 0.12 0.163 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.96e-02 0.202 0.0923 0.163 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.23e-03 0.389 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0509 0.11 0.16 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 3.49e-03 0.216 0.073 0.16 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0397 0.105 0.16 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.63e-01 0.0201 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 1.11e-03 0.385 0.117 0.16 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.79e-01 0.181 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 7.78e-02 -0.204 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.39e-01 0.0415 0.124 0.161 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.161 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.01e-01 0.0464 0.12 0.161 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0968 0.161 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 6.97e-01 0.0477 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 5.57e-01 0.0789 0.134 0.161 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 1.37e-01 0.183 0.122 0.161 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 6.66e-05 0.477 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 1.11e-01 -0.122 0.0761 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.12e-02 0.262 0.121 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 6.26e-02 -0.207 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.0896 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 7.99e-01 0.0291 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0687 0.124 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.70e-01 0.125 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.54e-02 0.311 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0726 0.0933 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.29e-01 0.136 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 9.32e-01 0.00827 0.0968 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 5.41e-02 0.235 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 4.85e-01 0.0874 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 4.70e-01 0.088 0.122 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.11e-01 0.186 0.148 0.164 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 9.65e-01 0.00627 0.141 0.164 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 4.11e-01 0.124 0.15 0.164 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 1.77e-06 0.519 0.104 0.164 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 9.17e-02 0.243 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.13e-01 0.0329 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 4.74e-01 0.105 0.146 0.164 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 5.96e-01 0.0678 0.128 0.164 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.67e-03 0.424 0.133 0.158 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.69e-01 0.0484 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0478 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0195 0.124 0.158 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0959 0.158 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 5.92e-02 0.218 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 2.19e-01 0.157 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 5.46e-01 -0.074 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.89e-01 0.0879 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 6.83e-01 0.0393 0.0963 0.158 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 3.79e-01 0.102 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.19e-01 -0.147 0.119 0.158 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 8.82e-01 0.0152 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 5.40e-01 0.0711 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0301 0.125 0.158 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 6.72e-01 0.0497 0.117 0.158 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 6.61e-02 0.232 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 2.76e-01 0.141 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0315 0.137 0.164 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 6.69e-01 0.0383 0.0894 0.164 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 1.67e-01 -0.174 0.125 0.164 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0333 0.123 0.164 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0243 0.128 0.164 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.72e-01 -0.023 0.142 0.164 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 6.51e-01 0.0573 0.126 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 8.04e-04 0.394 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 8.94e-01 0.0127 0.0949 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.82e-02 0.219 0.124 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0365 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 1.10e-02 -0.298 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 4.77e-02 -0.242 0.122 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 8.16e-01 0.0264 0.113 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0785 0.0943 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 4.92e-04 0.41 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 1.69e-01 -0.131 0.0949 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.48e-01 0.0399 0.124 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0835 0.0895 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 8.35e-01 -0.024 0.115 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 3.00e-01 0.13 0.125 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 6.93e-01 0.0458 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 3.17e-01 0.0901 0.0899 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 1.99e-04 0.446 0.118 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 1.17e-01 -0.116 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.35e-03 0.315 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0981 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0286 0.0872 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 2.44e-01 0.131 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0415 0.116 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 2.33e-01 0.135 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.06e-04 0.461 0.122 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0322 0.0837 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 3.34e-01 -0.112 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -433582 sc-eQTL 3.55e-02 0.202 0.0953 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.88e-01 0.0164 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 7.20e-01 0.0431 0.12 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -549623 sc-eQTL 6.75e-01 0.0516 0.123 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 sc-eQTL 2.22e-06 0.571 0.117 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -304921 sc-eQTL 4.38e-01 0.0754 0.097 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 235501 sc-eQTL 7.32e-04 0.367 0.107 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 172912 sc-eQTL 8.99e-25 1.09 0.0927 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -524179 sc-eQTL 1.44e-01 -0.121 0.0825 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 sc-eQTL 8.03e-01 -0.026 0.104 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -324693 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0831 0.11 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 eQTL 4.67e-05 0.0613 0.015 0.0 0.0 0.147
ENSG00000077254 USP33 -304921 eQTL 0.00933 -0.0379 0.0145 0.0 0.0 0.147
ENSG00000137960 GIPC2 -524611 pQTL 2.96e-05 0.121 0.029 0.0 0.0 0.148
ENSG00000142892 PIGK 235501 eQTL 2.6e-05 0.107 0.0254 0.0 0.0 0.147
ENSG00000154027 AK5 172912 eQTL 7.889999999999999e-48 0.362 0.0235 0.0 0.0 0.147
ENSG00000162616 DNAJB4 -524244 eQTL 0.0265 -0.0629 0.0283 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -228488 6.87e-06 4.99e-06 4.93e-07 3.5e-06 6.85e-07 1.58e-06 4.31e-06 3.94e-07 2.42e-06 1.47e-06 4.33e-06 1.67e-06 7.37e-06 2.33e-06 1.4e-06 1.98e-06 1.79e-06 2.9e-06 1.33e-06 9.54e-07 1.39e-06 4.53e-06 3.45e-06 1.62e-06 6.48e-06 1.33e-06 1.73e-06 1.81e-06 3.88e-06 4.15e-06 2.02e-06 5.42e-07 4.45e-07 1.6e-06 2.26e-06 7.46e-07 8.89e-07 4.1e-07 8.52e-07 4.28e-07 1.52e-07 5.58e-06 6.7e-07 1.56e-07 3.6e-07 1.34e-06 5.64e-07 1.4e-07 1.97e-07
ENSG00000142892 PIGK 235501 6.55e-06 4.86e-06 4.5e-07 3.48e-06 6.39e-07 1.56e-06 3.96e-06 4.32e-07 2.37e-06 1.4e-06 4.2e-06 1.57e-06 7.09e-06 2.34e-06 1.2e-06 1.69e-06 1.58e-06 2.74e-06 1.32e-06 1.1e-06 1.36e-06 4.25e-06 3.24e-06 1.56e-06 5.89e-06 1.33e-06 1.6e-06 1.74e-06 3.82e-06 4.13e-06 2.01e-06 5.93e-07 4.74e-07 1.68e-06 2.15e-06 6.69e-07 8.05e-07 4.02e-07 8.58e-07 3.58e-07 1.98e-07 5.49e-06 6.4e-07 1.54e-07 3.4e-07 1.14e-06 4.97e-07 1.16e-07 2.04e-07
ENSG00000154027 AK5 172912 8.18e-06 7.85e-06 9.13e-07 4.71e-06 1.35e-06 2.96e-06 8.05e-06 8.37e-07 5.06e-06 2.45e-06 7.19e-06 3.41e-06 1.1e-05 2.5e-06 1.09e-06 3.03e-06 1.98e-06 3.99e-06 1.44e-06 1.19e-06 2.62e-06 5.44e-06 4.51e-06 1.39e-06 9.12e-06 1.35e-06 2.47e-06 1.81e-06 4.47e-06 6.2e-06 2.91e-06 4.44e-07 6.63e-07 2.33e-06 2.35e-06 9.54e-07 9.59e-07 3.97e-07 1.36e-06 6.22e-07 2.25e-07 8.22e-06 1.3e-06 1.61e-07 3.35e-07 9.83e-07 7.24e-07 2.22e-07 2.4e-07