Genes within 1Mb (chr1:77453526:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.54e-03 -0.298 0.0928 0.229 B L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 5.83e-01 0.0377 0.0685 0.229 B L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0145 0.0735 0.229 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 7.25e-01 -0.024 0.0682 0.229 B L1
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 4.85e-01 0.0635 0.0907 0.229 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 5.95e-02 0.179 0.0943 0.229 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0373 0.0816 0.229 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.46e-03 -0.225 0.0697 0.229 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 8.81e-02 -0.147 0.0856 0.229 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.39e-04 0.191 0.0534 0.229 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 5.74e-01 0.0417 0.0741 0.229 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.21e-03 0.181 0.0552 0.229 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0302 0.0519 0.229 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.64e-01 0.0028 0.0627 0.229 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.20e-01 -0.101 0.0645 0.229 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 2.67e-02 -0.178 0.0799 0.229 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 2.93e-01 0.081 0.0768 0.229 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.80e-01 0.072 0.0819 0.229 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 8.91e-02 0.0861 0.0504 0.229 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 1.01e-01 -0.102 0.0617 0.229 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.33e-01 0.00717 0.0848 0.229 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.35e-01 -0.128 0.085 0.229 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 5.96e-03 -0.228 0.0821 0.229 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0539 0.0965 0.223 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.85e-01 0.0758 0.087 0.223 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.71e-01 0.0433 0.102 0.223 DC L1
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 3.44e-03 0.238 0.0806 0.223 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.66e-01 0.0413 0.0957 0.223 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0495 0.0918 0.223 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 6.47e-01 0.0458 0.0998 0.223 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0717 0.108 0.223 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 8.02e-01 0.0258 0.103 0.223 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.17e-02 -0.244 0.0961 0.229 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 6.97e-02 0.104 0.057 0.229 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0977 0.229 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 4.16e-01 0.0645 0.0791 0.229 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 8.33e-02 -0.111 0.0639 0.229 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 1.66e-01 -0.121 0.0872 0.229 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.83e-01 -0.118 0.0883 0.229 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 4.13e-02 -0.185 0.0901 0.229 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.38e-01 -0.147 0.0991 0.23 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 2.30e-01 0.0939 0.0781 0.23 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0989 0.0916 0.23 NK L1
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 2.09e-02 0.224 0.0962 0.23 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.00e-01 0.00816 0.0649 0.23 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 5.80e-01 0.0494 0.0892 0.23 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 7.17e-01 0.0311 0.0859 0.23 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0992 0.098 0.229 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 6.87e-02 0.142 0.0775 0.229 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.65e-01 0.0132 0.0778 0.229 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 8.87e-01 -0.014 0.0985 0.229 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.27e-01 0.0433 0.0684 0.229 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.68e-01 0.0309 0.104 0.229 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0989 0.101 0.229 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.32e-03 -0.294 0.0904 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.86e-01 -0.151 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.64e-01 0.103 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00618 0.108 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.41e-01 -0.067 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0648 0.0888 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00701 0.106 0.235 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 7.82e-01 0.0318 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0754 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 4.13e-02 -0.217 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 8.00e-01 0.0245 0.0963 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0644 0.112 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000929 0.0914 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 1.29e-01 0.155 0.102 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.33e-02 0.181 0.107 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0548 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.85e-01 -0.116 0.0869 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 5.58e-02 -0.2 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.101 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 2.32e-02 -0.254 0.111 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0279 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 4.57e-01 0.0757 0.102 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.57e-01 0.0327 0.105 0.224 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0521 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 2.40e-01 -0.105 0.0894 0.224 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.59e-03 -0.269 0.0982 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0371 0.0841 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0197 0.103 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 8.62e-01 0.0135 0.0779 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 2.27e-02 -0.212 0.0924 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 5.19e-01 0.0659 0.102 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0135 0.0985 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 2.34e-03 -0.231 0.0751 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.58e-01 -0.047 0.106 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 6.77e-01 0.0399 0.0955 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.66e-01 0.0988 0.109 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0581 0.091 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 8.19e-01 0.0213 0.093 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 4.06e-01 0.0899 0.108 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0555 0.107 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.40e-01 -0.134 0.0907 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 5.84e-01 0.0616 0.112 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.09e-01 0.108 0.106 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 7.26e-01 0.0377 0.107 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.05e-01 -0.157 0.0961 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 3.41e-01 0.101 0.106 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0269 0.104 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.27e-01 0.0864 0.108 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.48e-02 -0.167 0.09 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.83e-02 0.14 0.067 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00373 0.0771 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 2.99e-03 0.195 0.0648 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0233 0.0578 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.23e-01 0.00601 0.0617 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.06e-01 -0.114 0.0704 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.61e-02 -0.201 0.0951 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.16e-03 0.211 0.0706 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.74e-01 0.0918 0.103 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.47e-03 0.213 0.066 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.53e-01 0.00422 0.072 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0315 0.0898 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.88e-01 -0.125 0.0942 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 7.10e-01 -0.035 0.094 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 1.77e-01 0.131 0.0966 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0707 0.103 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 2.23e-01 0.118 0.0964 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0513 0.0875 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.16e-01 0.0373 0.102 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.13e-01 0.0864 0.105 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.51e-01 -0.094 0.101 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 5.36e-01 0.055 0.0888 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 4.74e-01 0.0711 0.099 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.26e-01 -0.143 0.093 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.61e-02 -0.149 0.0806 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00376 0.0958 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0721 0.0886 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 8.43e-02 -0.157 0.0905 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.54e-01 -0.136 0.0954 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 7.15e-01 0.0328 0.0896 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 1.73e-01 0.124 0.0909 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.10e-02 0.176 0.0687 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 2.79e-02 -0.166 0.0752 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 4.40e-01 0.0706 0.0913 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.85e-01 -0.122 0.092 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 8.89e-03 -0.233 0.0882 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0873 0.105 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0882 0.106 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 7.51e-01 0.0362 0.114 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 6.15e-01 0.0521 0.103 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.99e-01 0.0507 0.0962 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0505 0.105 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.43e-01 -0.05 0.108 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 2.00e-02 -0.219 0.0933 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 2.31e-01 -0.13 0.109 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 3.42e-01 0.104 0.109 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.24e-01 -0.051 0.104 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 3.25e-01 0.0727 0.0736 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00879 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.80e-01 0.0283 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 4.53e-02 -0.175 0.0869 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.17e-01 -0.161 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 2.00e-02 0.21 0.0894 0.232 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 4.72e-01 0.0739 0.102 0.232 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.90e-01 0.105 0.0801 0.232 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 7.15e-01 0.0359 0.0984 0.232 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0406 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 2.08e-02 -0.231 0.099 0.232 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.17e-01 -0.144 0.0915 0.232 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.75e-02 -0.218 0.104 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 5.49e-01 0.063 0.105 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 1.84e-02 -0.255 0.107 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 5.52e-02 0.179 0.0929 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 8.62e-02 0.165 0.0958 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 3.20e-01 -0.1 0.1 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 7.99e-01 0.0248 0.0973 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.14e-01 -0.103 0.102 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 2.14e-01 0.106 0.0847 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0417 0.0961 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.79e-02 0.231 0.0966 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.09e-01 0.00892 0.0776 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00324 0.0995 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0816 0.0933 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.20e-01 -0.17 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 9.05e-01 0.0128 0.108 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0695 0.112 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0297 0.102 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 4.49e-01 0.0775 0.102 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0221 0.0999 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.69e-01 0.143 0.104 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0922 0.103 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 7.72e-01 0.0268 0.0922 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0665 0.0965 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.82e-01 0.132 0.0983 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0374 0.0871 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.52e-02 0.162 0.0908 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 9.17e-01 0.0105 0.0999 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.74e-01 0.0636 0.151 0.207 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.53e-01 0.0994 0.132 0.207 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0767 0.0752 0.207 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 9.86e-01 0.00223 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.113 0.207 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 6.44e-01 0.0574 0.124 0.207 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 9.73e-01 0.00479 0.144 0.207 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 3.11e-01 -0.128 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.15e-01 -0.054 0.107 0.233 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.099 0.233 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0293 0.0835 0.233 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 5.95e-01 0.0458 0.0861 0.233 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 1.82e-01 -0.121 0.0906 0.233 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.06e-01 0.0391 0.104 0.233 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.90e-01 0.0698 0.101 0.233 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 5.53e-04 -0.268 0.0763 0.233 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.14e-01 -0.105 0.104 0.229 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0064 0.0939 0.229 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.21e-01 0.0511 0.103 0.229 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 3.85e-02 0.132 0.0632 0.229 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 1.40e-01 -0.133 0.0896 0.229 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 8.42e-01 0.02 0.1 0.229 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0952 0.102 0.229 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 8.13e-01 0.027 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0479 0.0976 0.227 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 7.34e-01 0.0357 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 1.02e-02 0.219 0.0845 0.227 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 3.06e-01 -0.104 0.101 0.227 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 4.65e-01 0.0604 0.0825 0.227 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.80e-01 0.00254 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 9.46e-01 0.00768 0.113 0.227 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 8.97e-01 0.0134 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.49e-01 -0.144 0.0991 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 7.95e-02 0.11 0.0622 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.42e-01 0.0199 0.0999 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0469 0.0914 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0922 0.0731 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 1.15e-01 -0.147 0.0928 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 1.41e-01 -0.149 0.101 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.52e-02 -0.224 0.0916 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 7.29e-03 -0.283 0.104 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 7.50e-01 0.0245 0.0767 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0914 0.0971 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0336 0.0925 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 8.57e-01 0.0143 0.0795 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.43e-02 -0.179 0.0999 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0769 0.103 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.02e-01 -0.163 0.0993 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0616 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 9.08e-01 0.0135 0.117 0.248 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 1.01e-01 0.204 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0631 0.0933 0.248 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 3.05e-01 -0.123 0.119 0.248 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 1.45e-01 0.167 0.114 0.248 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 8.96e-01 0.0159 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0417 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0612 0.111 0.229 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.20e-01 0.0745 0.0921 0.229 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.01e-01 0.0515 0.0983 0.229 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0477 0.101 0.229 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00721 0.0784 0.229 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 6.86e-02 -0.171 0.0935 0.229 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0725 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00612 0.0998 0.229 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00353 0.106 0.238 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 8.95e-01 0.0106 0.0803 0.238 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0922 0.0969 0.238 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 1.07e-02 0.252 0.0979 0.238 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0844 0.238 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 3.13e-01 0.0976 0.0965 0.238 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 2.75e-01 0.114 0.104 0.238 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 3.95e-01 -0.083 0.0974 0.238 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0449 0.105 0.232 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 1.97e-01 0.139 0.107 0.232 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.70e-01 0.0187 0.114 0.232 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 7.50e-01 0.0237 0.0743 0.232 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 2.47e-02 0.233 0.103 0.232 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 2.00e-01 -0.131 0.102 0.232 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 5.39e-01 0.0651 0.106 0.232 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 9.15e-02 -0.199 0.117 0.232 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0836 0.105 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.0993 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 5.67e-01 0.046 0.0803 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 3.05e-02 -0.227 0.104 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0721 0.0871 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 8.71e-02 0.171 0.0993 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 1.16e-01 0.163 0.103 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0486 0.0957 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.50e-01 -0.115 0.0795 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 4.10e-02 -0.199 0.097 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0113 0.0784 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 8.76e-01 0.016 0.102 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0354 0.0737 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 9.05e-02 -0.159 0.0937 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 7.36e-01 0.0349 0.103 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0127 0.0954 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 9.97e-04 -0.241 0.0722 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 5.93e-03 -0.273 0.0983 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 1.62e-01 0.0852 0.0607 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0483 0.0971 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0326 0.0808 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0691 0.0715 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 2.55e-02 -0.205 0.0912 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 6.78e-02 -0.173 0.0943 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 1.43e-02 -0.226 0.0915 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 3.24e-01 -0.101 0.102 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.15e-01 0.0554 0.0678 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0345 0.0977 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 5.04e-02 0.183 0.0931 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -434987 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0308 0.078 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 9.43e-01 0.00671 0.0939 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.0972 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0687 0.0996 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.101 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -306326 sc-eQTL 4.31e-01 0.0625 0.0793 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 234096 sc-eQTL 2.76e-01 -0.098 0.0897 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 171507 sc-eQTL 4.75e-02 0.193 0.0967 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -525584 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0138 0.0678 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 sc-eQTL 4.54e-02 0.17 0.0843 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -326098 sc-eQTL 5.57e-01 0.0528 0.0898 0.228 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 eQTL 0.0011 -0.0421 0.0129 0.0 0.0 0.223
ENSG00000077254 USP33 -306326 eQTL 0.00353 0.0364 0.0125 0.0 0.0 0.223
ENSG00000137960 GIPC2 -526016 pQTL 0.000346 -0.0896 0.025 0.0 0.0 0.225
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 eQTL 0.0178 0.0576 0.0243 0.0 0.0 0.223
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 eQTL 4.54e-05 -0.0968 0.0236 0.0 0.0 0.223


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -229893 1.32e-06 1.36e-06 2.2e-07 1.26e-06 4.48e-07 6.36e-07 1.41e-06 3.83e-07 1.72e-06 6.9e-07 2.07e-06 1.13e-06 2.57e-06 3.41e-07 4.05e-07 1.02e-06 1.02e-06 1.09e-06 5.65e-07 5.44e-07 7e-07 1.98e-06 1.27e-06 7.85e-07 2.45e-06 8.82e-07 9.97e-07 8.57e-07 1.69e-06 1.3e-06 8.13e-07 2.42e-07 3.45e-07 6.66e-07 6.12e-07 5.46e-07 7.12e-07 3.23e-07 4.82e-07 2.27e-07 2.88e-07 1.95e-06 3.01e-07 1.06e-07 3.75e-07 2.14e-07 2.8e-07 1.41e-07 2.6e-07
ENSG00000077254 USP33 -306326 1.33e-06 9.53e-07 3.2e-07 5.24e-07 2.79e-07 4.67e-07 1.18e-06 3.51e-07 1.27e-06 3.95e-07 1.4e-06 6.03e-07 1.86e-06 2.55e-07 4.48e-07 8.11e-07 8.26e-07 5.5e-07 5.83e-07 6.91e-07 4.43e-07 1.2e-06 8.1e-07 6.23e-07 1.94e-06 3.87e-07 6.91e-07 6.83e-07 1.17e-06 1.08e-06 5.66e-07 1.29e-07 2.31e-07 6.68e-07 4.25e-07 4.32e-07 4.73e-07 1.24e-07 3.5e-07 2.45e-07 2.59e-07 1.43e-06 5.41e-08 1.93e-08 1.74e-07 8.83e-08 2.45e-07 9.04e-08 8.44e-08
ENSG00000162616 DNAJB4 -525649 5.74e-07 2.89e-07 8.51e-08 2.57e-07 1.05e-07 1.44e-07 3.94e-07 9.26e-08 2.75e-07 1.7e-07 3.66e-07 2.55e-07 4.88e-07 9.18e-08 1.24e-07 1.63e-07 1.17e-07 3.02e-07 1.27e-07 8.1e-08 1.65e-07 2.51e-07 2.48e-07 1.03e-07 4.11e-07 2.29e-07 1.83e-07 1.67e-07 2.13e-07 2.39e-07 1.88e-07 6.04e-08 4.93e-08 1.15e-07 1.67e-07 5.41e-08 7.74e-08 5.53e-08 5.98e-08 7.28e-08 3.6e-08 2.72e-07 3.19e-08 7.23e-09 7.26e-08 8.76e-09 1.05e-07 0.0 4.66e-08
ENSG00000273338 AC103591.3 -551028 5.14e-07 2.5e-07 7.72e-08 2.54e-07 1.09e-07 1.26e-07 3.42e-07 8.17e-08 2.6e-07 1.5e-07 3.21e-07 2.22e-07 4.27e-07 8.55e-08 1.01e-07 1.46e-07 9.3e-08 2.9e-07 9.69e-08 7.4e-08 1.48e-07 2.3e-07 2.2e-07 6.65e-08 3.55e-07 2.07e-07 1.72e-07 1.68e-07 1.87e-07 2.02e-07 1.76e-07 4.75e-08 5.09e-08 1.24e-07 1.29e-07 5.32e-08 6.67e-08 5.71e-08 4.78e-08 7.53e-08 3.31e-08 2.43e-07 3.26e-08 1.07e-08 5.4e-08 8.07e-09 9.25e-08 0.0 4.61e-08