Genes within 1Mb (chr1:77447034:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.62e-01 -0.177 0.157 0.081 B L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0839 0.113 0.081 B L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0962 0.122 0.081 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.26e-01 -0.111 0.113 0.081 B L1
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 2.37e-01 0.178 0.15 0.081 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.06e-01 0.0813 0.157 0.081 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 8.95e-01 0.0179 0.135 0.081 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.91e-01 0.0314 0.118 0.081 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 1.60e-01 -0.202 0.143 0.081 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.08e-01 -0.147 0.0909 0.081 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 1.06e-01 -0.199 0.122 0.081 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 1.17e-02 -0.236 0.0926 0.081 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0486 0.0863 0.081 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0506 0.104 0.081 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.27e-01 0.00994 0.108 0.081 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.45e-02 -0.3 0.132 0.081 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 3.36e-03 -0.371 0.125 0.081 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0798 0.136 0.081 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 1.60e-02 -0.201 0.083 0.081 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.24e-02 0.184 0.102 0.081 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 1.16e-01 -0.221 0.14 0.081 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 3.80e-02 0.293 0.14 0.081 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 8.23e-01 -0.031 0.139 0.081 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 6.20e-01 0.0765 0.154 0.083 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 3.14e-01 -0.14 0.139 0.083 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00188 0.162 0.083 DC L1
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0295 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 2.25e-01 0.185 0.152 0.083 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 6.25e-01 0.0716 0.146 0.083 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0855 0.159 0.083 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 5.78e-01 0.0955 0.172 0.083 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 3.11e-01 -0.166 0.163 0.083 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 6.33e-01 0.0765 0.16 0.081 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 4.75e-01 0.0674 0.0942 0.081 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 7.19e-01 0.0578 0.161 0.081 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.97e-01 -0.11 0.13 0.081 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 1.82e-01 0.141 0.105 0.081 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 5.19e-01 0.0928 0.144 0.081 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0147 0.145 0.081 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 4.92e-01 0.103 0.149 0.081 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.92e-01 -0.174 0.165 0.082 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0104 0.13 0.082 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 2.85e-01 -0.163 0.152 0.082 NK L1
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 1.72e-03 -0.502 0.158 0.082 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0559 0.108 0.082 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0336 0.148 0.082 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0617 0.143 0.082 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 3.80e-01 -0.142 0.162 0.081 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.79e-01 -0.173 0.128 0.081 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 2.91e-01 -0.136 0.128 0.081 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 9.25e-02 -0.273 0.162 0.081 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 1.33e-02 -0.278 0.111 0.081 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.40e-01 0.0808 0.172 0.081 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.12e-01 -0.137 0.167 0.081 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 1.38e-01 0.226 0.152 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.99e-01 0.208 0.2 0.077 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0548 0.198 0.077 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 1.14e-01 -0.297 0.187 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0569 0.191 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 4.57e-01 -0.116 0.155 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 8.09e-01 -0.045 0.186 0.077 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 3.30e-01 0.195 0.2 0.077 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0665 0.178 0.077 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.11e-01 -0.215 0.171 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0685 0.155 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 1.93e-01 -0.234 0.179 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 8.12e-01 0.0351 0.147 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0702 0.165 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.75e-02 -0.306 0.172 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 3.86e-01 0.141 0.163 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 2.94e-01 0.147 0.14 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 6.57e-01 0.0761 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 9.70e-01 0.00617 0.165 0.08 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 5.67e-01 0.105 0.183 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.74e-01 -0.151 0.169 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 6.47e-01 0.0758 0.165 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 5.52e-01 -0.102 0.171 0.08 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00588 0.172 0.08 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 2.14e-01 0.181 0.145 0.08 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 3.61e-01 -0.151 0.165 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0659 0.139 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 6.26e-01 0.0832 0.17 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 1.92e-01 -0.168 0.128 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 8.24e-01 0.0343 0.155 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.57e-01 0.0522 0.169 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 8.07e-01 0.0397 0.163 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0211 0.127 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 6.01e-01 0.0904 0.173 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 2.44e-01 -0.181 0.155 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0296 0.178 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0591 0.149 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 5.63e-02 0.289 0.15 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 8.99e-02 0.299 0.175 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.78e-01 0.00488 0.175 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 3.85e-01 0.129 0.148 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.82e-01 -0.102 0.184 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00861 0.175 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 4.04e-01 -0.147 0.176 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0612 0.159 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 1.36e-01 -0.259 0.173 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 8.89e-01 0.0238 0.171 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 1.57e-01 -0.252 0.177 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 3.23e-01 -0.149 0.15 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 2.91e-01 -0.119 0.112 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.35e-01 0.0104 0.128 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 6.20e-03 -0.298 0.108 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 8.37e-01 0.0198 0.0959 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0345 0.102 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 7.73e-01 0.034 0.117 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.79e-02 -0.302 0.158 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0688 0.12 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 1.17e-01 -0.269 0.171 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 9.46e-02 -0.187 0.111 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00137 0.12 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.63e-01 -0.11 0.149 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0603 0.157 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0347 0.155 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.70e-01 -0.219 0.159 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 2.33e-01 -0.202 0.169 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 5.26e-02 -0.308 0.158 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 6.37e-01 0.0682 0.144 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 3.32e-02 -0.357 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.10e-01 0.143 0.173 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.66e-02 -0.282 0.164 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0949 0.145 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.38e-01 0.0126 0.162 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 3.10e-01 -0.155 0.153 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 6.15e-01 0.0669 0.133 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.92e-02 -0.275 0.156 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 1.18e-02 0.364 0.143 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0564 0.149 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0969 0.157 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 3.70e-02 -0.306 0.146 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.62e-01 0.00721 0.15 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 2.11e-02 -0.263 0.113 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 1.00e-01 0.205 0.124 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0465 0.15 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.95e-01 0.104 0.152 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.73e-01 0.0426 0.147 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.76e-01 -0.193 0.177 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.41e-01 0.0833 0.178 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 5.44e-01 0.117 0.192 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 9.06e-02 -0.295 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 4.17e-02 0.329 0.161 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 3.28e-01 -0.174 0.178 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 1.75e-01 0.246 0.181 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 2.28e-01 -0.192 0.159 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 9.54e-01 0.011 0.189 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.38e-01 -0.281 0.188 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.93e-01 0.00158 0.18 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 3.27e-01 -0.125 0.128 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.71e-01 0.0508 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.75e-01 -0.125 0.175 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 1.08e-01 0.299 0.185 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0276 0.152 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.57e-01 0.0306 0.17 0.08 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 4.49e-01 -0.113 0.149 0.08 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 3.93e-01 -0.144 0.168 0.08 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0939 0.132 0.08 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 1.44e-01 -0.236 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 3.70e-01 0.148 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.81e-01 -0.116 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.11e-01 0.0561 0.151 0.08 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 4.06e-01 -0.148 0.178 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.46e-01 0.258 0.177 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 2.64e-02 -0.406 0.182 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 5.37e-03 -0.438 0.156 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.16e-01 -0.164 0.163 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.70e-01 -0.123 0.17 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.68e-01 0.12 0.164 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.74e-01 0.027 0.169 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.18e-01 0.0701 0.14 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0601 0.159 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 7.38e-04 -0.539 0.157 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 2.14e-01 -0.159 0.128 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.21e-01 0.132 0.164 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0608 0.154 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 9.86e-01 0.00322 0.178 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0645 0.175 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0813 0.182 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 2.85e-02 -0.36 0.163 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.96e-01 0.141 0.166 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.46e-01 0.0747 0.162 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 8.06e-01 0.0416 0.169 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 1.03e-01 -0.278 0.169 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.22e-01 -0.235 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 6.32e-01 0.0768 0.16 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 5.20e-02 -0.316 0.162 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 9.19e-01 0.0147 0.144 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.90e-01 0.0604 0.151 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 3.89e-01 0.143 0.165 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0762 0.251 0.074 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0523 0.221 0.074 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 7.47e-01 0.0408 0.126 0.074 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0774 0.208 0.074 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 4.51e-02 0.378 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0904 0.206 0.074 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.48e-02 0.399 0.237 0.074 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 7.25e-01 0.0741 0.21 0.074 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0292 0.177 0.08 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 4.46e-01 0.125 0.164 0.08 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0382 0.138 0.08 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 1.02e-02 -0.363 0.14 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.26e-01 -0.148 0.15 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 6.05e-01 0.0886 0.171 0.08 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0163 0.167 0.08 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 9.86e-01 0.00231 0.13 0.08 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 4.57e-01 -0.13 0.175 0.081 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0761 0.158 0.081 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 1.36e-01 -0.258 0.172 0.081 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 2.70e-01 -0.118 0.107 0.081 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.82e-01 0.0419 0.151 0.081 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 2.58e-01 -0.19 0.168 0.081 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.12e-01 -0.141 0.172 0.081 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.39e-01 -0.213 0.181 0.088 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 2.66e-01 -0.173 0.155 0.088 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 6.59e-01 0.0738 0.167 0.088 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0493 0.137 0.088 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 5.94e-01 0.0864 0.162 0.088 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 3.52e-01 0.123 0.131 0.088 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 1.32e-01 0.246 0.163 0.088 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0649 0.181 0.088 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0934 0.165 0.088 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 4.60e-01 -0.121 0.164 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.25e-01 0.0505 0.103 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 4.85e-01 0.115 0.164 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 4.93e-01 -0.103 0.15 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 2.66e-01 0.134 0.12 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 3.21e-01 0.152 0.153 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 9.04e-01 0.0201 0.167 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 4.63e-01 0.112 0.153 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.23e-01 0.215 0.175 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 6.33e-01 0.0607 0.127 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 5.73e-01 0.091 0.161 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0484 0.154 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 5.82e-01 0.0727 0.132 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 7.52e-01 0.0527 0.167 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0277 0.171 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 8.96e-01 0.0217 0.166 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.61e-01 0.0363 0.208 0.082 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 1.87e-01 -0.259 0.195 0.082 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 8.97e-01 0.0273 0.209 0.082 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 3.72e-01 -0.14 0.156 0.082 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 9.98e-01 0.000428 0.201 0.082 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 5.34e-01 -0.12 0.193 0.082 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0975 0.204 0.082 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 5.41e-02 0.341 0.175 0.082 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 3.54e-01 -0.17 0.183 0.082 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0318 0.152 0.082 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 4.61e-01 -0.12 0.162 0.082 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0965 0.167 0.082 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 4.32e-01 0.102 0.129 0.082 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.01e-01 -0.131 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 5.54e-01 0.101 0.171 0.082 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0237 0.165 0.082 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 7.81e-01 0.0476 0.171 0.084 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00239 0.13 0.084 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 2.52e-01 -0.18 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.57e-01 -0.148 0.161 0.084 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0468 0.137 0.084 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0129 0.156 0.084 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 6.46e-02 -0.311 0.167 0.084 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 9.05e-02 -0.267 0.157 0.084 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.07e-01 0.109 0.164 0.096 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0887 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00136 0.177 0.096 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0124 0.116 0.096 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0157 0.163 0.096 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 8.78e-01 0.0244 0.159 0.096 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 1.64e-01 -0.229 0.164 0.096 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.36e-01 0.143 0.184 0.096 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0646 0.163 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 2.37e-01 -0.194 0.164 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0143 0.131 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 3.19e-01 -0.172 0.172 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0797 0.142 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0603 0.163 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 4.25e-01 -0.135 0.169 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.28e-01 0.124 0.156 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 1.97e-01 0.168 0.13 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0861 0.162 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 2.29e-01 -0.156 0.129 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 6.50e-01 0.0767 0.169 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 2.22e-01 -0.149 0.122 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 2.19e-01 0.192 0.156 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 2.73e-01 0.188 0.171 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0549 0.158 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0028 0.123 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 6.17e-01 0.0824 0.165 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 4.98e-01 0.0681 0.1 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 4.88e-01 0.111 0.16 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0904 0.133 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 2.00e-01 0.151 0.117 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 2.95e-01 0.159 0.151 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 8.06e-01 0.0384 0.156 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 4.36e-01 0.119 0.153 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0428 0.169 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0288 0.112 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 3.60e-01 -0.148 0.161 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 3.58e-01 -0.143 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -441479 sc-eQTL 8.17e-01 0.03 0.129 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000583 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.49e-01 -0.122 0.161 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 sc-eQTL 1.41e-01 -0.243 0.164 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -236385 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0889 0.168 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -312818 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0273 0.132 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 227604 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0509 0.149 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 165015 sc-eQTL 3.24e-03 -0.472 0.158 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -532076 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0616 0.112 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -532141 sc-eQTL 9.06e-01 0.0167 0.141 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -332590 sc-eQTL 4.86e-01 -0.104 0.149 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 227604 eQTL 0.00869 -0.0842 0.032 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000154027 AK5 165015 eQTL 0.00471 -0.0929 0.0328 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000162614 NEXN -441479 pQTL 0.0182 0.0616 0.0261 0.0 0.0 0.0863
ENSG00000273338 AC103591.3 -557520 eQTL 6.48e-03 0.0946 0.0347 0.0 0.0 0.0883


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 227604 4.92e-06 4.68e-06 4.62e-07 2.1e-06 6.17e-07 1.19e-06 2.4e-06 4.97e-07 2.36e-06 8.08e-07 4.02e-06 2.65e-06 4.84e-06 1.4e-06 9.69e-07 2.56e-06 1.11e-06 2.09e-06 1.17e-06 1.07e-06 1.37e-06 5.5e-06 3.53e-06 9.69e-07 5.24e-06 1.26e-06 1.77e-06 1.72e-06 2.71e-06 1.88e-06 2e-06 2.81e-07 4.61e-07 1.8e-06 1.73e-06 6.84e-07 7.76e-07 4.23e-07 5.34e-07 2.33e-07 2.23e-07 6.09e-06 1.39e-06 1.64e-07 1.69e-07 1.2e-06 2.87e-07 1.69e-07 1.08e-07
ENSG00000154027 AK5 165015 9.21e-06 9.39e-06 6.31e-07 3.85e-06 1.48e-06 2.55e-06 8.96e-06 9.98e-07 4.55e-06 2.43e-06 9e-06 3.3e-06 9.39e-06 3.18e-06 1.54e-06 5.84e-06 2.07e-06 3.74e-06 1.44e-06 1.04e-06 2.66e-06 1.06e-05 5.53e-06 1.44e-06 1.16e-05 1.76e-06 3.44e-06 1.8e-06 5.1e-06 4.36e-06 3.43e-06 5.93e-07 5.29e-07 2.24e-06 1.99e-06 9.01e-07 9.06e-07 5.14e-07 1.27e-06 3.45e-07 7.14e-07 1.33e-05 2.39e-06 2.27e-07 3.41e-07 1.68e-06 7.44e-07 2.4e-07 2.1e-07