Genes within 1Mb (chr1:77441929:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 5.23e-01 0.0802 0.125 0.13 B L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0777 0.0904 0.13 B L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0473 0.097 0.13 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0716 0.0899 0.13 B L1
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0784 0.12 0.13 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 7.02e-01 0.048 0.126 0.13 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 2.27e-01 0.13 0.107 0.13 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 9.13e-01 0.0104 0.0943 0.13 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 8.93e-01 0.0156 0.115 0.13 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0853 0.0733 0.13 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 6.78e-01 0.0411 0.099 0.13 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 1.28e-01 0.115 0.0752 0.13 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 6.15e-02 0.129 0.0689 0.13 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 1.86e-01 -0.111 0.0835 0.13 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 4.58e-01 0.0644 0.0866 0.13 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0305 0.108 0.13 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 8.38e-03 -0.269 0.101 0.13 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 5.39e-01 0.0675 0.11 0.13 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0113 0.0678 0.13 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 5.18e-01 0.0537 0.0829 0.13 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.85e-01 0.0165 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0187 0.114 0.13 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 8.39e-02 -0.193 0.111 0.13 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0675 0.112 0.128 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 6.04e-01 0.0678 0.131 0.128 DC L1
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0934 0.105 0.128 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0407 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 7.81e-01 0.0328 0.118 0.128 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.59e-01 0.0229 0.128 0.128 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 4.21e-01 -0.111 0.138 0.128 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 6.05e-01 0.0683 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.69e-01 0.0372 0.126 0.13 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 8.06e-01 0.0183 0.0744 0.13 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.07e-03 -0.411 0.124 0.13 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.59e-01 0.0941 0.103 0.13 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0698 0.0833 0.13 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.99e-01 -0.118 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.02e-01 0.187 0.114 0.13 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 1.73e-01 -0.161 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 8.01e-01 0.0343 0.136 0.129 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 1.39e-01 -0.158 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.32e-02 -0.283 0.124 0.129 NK L1
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0504 0.133 0.129 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0564 0.0886 0.129 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0747 0.122 0.129 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 5.36e-01 0.0726 0.117 0.129 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.13e-01 0.106 0.13 0.13 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 1.97e-01 0.133 0.103 0.13 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0152 0.103 0.13 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 5.28e-01 0.0825 0.13 0.13 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 4.20e-01 0.0732 0.0905 0.13 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.97e-01 0.000502 0.138 0.13 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.33e-01 -0.064 0.134 0.13 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 9.63e-01 0.00563 0.123 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.91e-01 -0.102 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.76e-01 -0.13 0.146 0.13 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.15e-01 0.219 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 6.94e-01 0.0558 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0844 0.115 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.52e-01 0.00828 0.138 0.13 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 2.99e-01 0.154 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 1.91e-01 0.173 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.11e-01 -0.015 0.134 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0564 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 5.63e-01 0.081 0.14 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 8.64e-01 0.0196 0.115 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0785 0.128 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 1.75e-01 0.183 0.135 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.57e-01 0.0565 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.44e-01 0.0838 0.109 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0152 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.18e-01 0.176 0.143 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 9.51e-01 0.00813 0.133 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.77e-01 -0.146 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0332 0.135 0.131 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0648 0.114 0.131 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0557 0.131 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.70e-01 0.0796 0.11 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 6.32e-01 0.0648 0.135 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0707 0.102 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00623 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0256 0.134 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.32e-01 0.0618 0.129 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 5.28e-01 0.0636 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.03e-01 0.0513 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.39e-02 -0.243 0.12 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0585 0.139 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.57e-01 0.107 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0326 0.118 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.66e-01 0.0232 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.44e-01 0.198 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 5.12e-02 0.276 0.141 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.30e-02 -0.304 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.16e-01 0.0317 0.136 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0234 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0228 0.132 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.19e-01 0.0494 0.137 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0275 0.12 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0707 0.0896 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 9.85e-01 0.00193 0.102 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 3.39e-01 0.0839 0.0876 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.56e-02 0.17 0.0758 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 1.68e-01 -0.113 0.0815 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.36e-01 0.14 0.0934 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 3.53e-01 0.119 0.128 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 1.53e-01 -0.137 0.0958 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 7.54e-01 0.0433 0.138 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 2.03e-03 0.276 0.0882 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00453 0.0961 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0562 0.12 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.68e-01 0.0357 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.07e-01 0.158 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.53e-01 0.189 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 3.00e-01 0.129 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 1.61e-01 -0.158 0.112 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 3.32e-01 0.128 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 9.74e-01 0.00436 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.74e-01 0.0963 0.134 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.48e-01 -0.137 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0356 0.132 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0521 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 6.16e-01 0.0543 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 7.65e-02 0.226 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.44e-01 0.0548 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 3.12e-01 -0.123 0.121 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.70e-02 -0.22 0.124 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 1.79e-03 -0.361 0.114 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.16e-01 0.186 0.118 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 4.05e-01 0.0757 0.0907 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.55e-01 -0.113 0.0988 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.40e-01 0.178 0.12 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.57e-02 -0.233 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0876 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 6.15e-01 0.0688 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0162 0.148 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 5.98e-02 0.251 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.62e-01 0.14 0.124 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.37e-02 0.228 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0366 0.139 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00117 0.123 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00354 0.148 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0383 0.149 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0239 0.142 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 5.77e-01 0.0561 0.1 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.96e-01 -0.116 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 6.40e-01 0.0647 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.38e-01 -0.217 0.146 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 1.54e-01 -0.17 0.119 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 5.83e-01 0.0738 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 5.58e-02 0.225 0.117 0.13 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.84e-01 0.143 0.133 0.13 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 9.32e-01 0.00893 0.105 0.13 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 8.44e-01 0.0258 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.21e-01 0.0965 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 1.58e-01 -0.194 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 5.51e-03 -0.378 0.135 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0308 0.142 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 7.99e-01 0.0312 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.73e-01 0.112 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0384 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.57e-02 0.225 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.41e-01 0.106 0.137 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.12e-01 -0.115 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 9.35e-02 -0.216 0.128 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0303 0.131 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 5.68e-02 -0.197 0.103 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.58e-01 -0.151 0.133 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.53e-01 0.179 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00262 0.152 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0542 0.15 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 3.99e-01 -0.132 0.156 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 1.60e-01 -0.199 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 5.56e-01 0.0841 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0772 0.145 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0198 0.137 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.54e-01 -0.113 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.58e-01 -0.145 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0494 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 3.22e-01 0.12 0.121 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.07e-01 0.05 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 8.26e-01 0.0416 0.189 0.148 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.43e-01 -0.157 0.165 0.148 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0343 0.0946 0.148 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0358 0.156 0.148 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 7.97e-01 0.0368 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 4.11e-01 -0.127 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.65e-01 -0.25 0.178 0.148 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.13e-01 -0.13 0.158 0.148 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 3.60e-01 -0.131 0.142 0.133 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0293 0.132 0.133 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.76e-03 -0.289 0.109 0.133 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 8.80e-01 0.0174 0.115 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 6.81e-02 -0.22 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0406 0.138 0.133 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0833 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.133 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 1.98e-01 -0.172 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0938 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 4.23e-01 0.107 0.133 0.13 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0501 0.0821 0.13 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 7.97e-01 0.0299 0.116 0.13 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 4.22e-01 0.104 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 9.48e-02 -0.22 0.131 0.13 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000818 0.146 0.127 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0987 0.125 0.127 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 3.41e-01 0.128 0.134 0.127 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0541 0.11 0.127 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0455 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 8.16e-01 0.0247 0.106 0.127 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 3.85e-01 0.115 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0248 0.146 0.127 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.127 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0422 0.13 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0703 0.0814 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.73e-01 -0.177 0.13 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 1.06e-02 0.302 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 1.18e-01 -0.149 0.095 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.25e-01 -0.147 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 4.50e-01 0.0996 0.132 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.23e-02 -0.245 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.71e-01 0.0402 0.138 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.28e-01 0.12 0.0994 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 3.98e-03 -0.361 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.79e-02 -0.263 0.119 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 1.82e-01 -0.138 0.103 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.131 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 2.41e-02 0.3 0.132 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 5.02e-01 0.0873 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.33e-01 0.0137 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 8.35e-01 0.0319 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 3.02e-01 0.168 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 8.90e-01 0.0169 0.122 0.127 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.25e-01 0.155 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0161 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0548 0.159 0.127 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0379 0.139 0.127 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 7.18e-01 -0.052 0.144 0.131 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 2.56e-01 0.136 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.72e-01 -0.14 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0652 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0812 0.101 0.131 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 2.77e-01 0.133 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 7.48e-02 -0.239 0.133 0.131 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.129 0.131 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 2.33e-01 0.163 0.136 0.129 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.103 0.129 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0948 0.125 0.129 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.38e-01 0.123 0.129 0.129 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 5.73e-01 0.0618 0.11 0.129 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0641 0.125 0.129 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 5.95e-01 0.0719 0.135 0.129 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 7.88e-01 -0.034 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.07e-01 -0.115 0.139 0.121 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 8.30e-01 0.0306 0.142 0.121 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0923 0.15 0.121 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 3.76e-02 -0.203 0.0967 0.121 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 3.35e-01 0.133 0.138 0.121 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0145 0.135 0.121 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0172 0.14 0.121 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 2.87e-01 -0.166 0.156 0.121 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 3.30e-01 0.135 0.138 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.08e-01 -0.108 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 6.34e-02 -0.192 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 1.61e-01 0.191 0.136 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 8.89e-01 0.0157 0.113 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0857 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 1.39e-01 0.199 0.134 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 5.24e-01 0.0791 0.124 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.40e-01 0.0799 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.51e-01 0.00783 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0552 0.103 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 8.10e-01 0.0321 0.134 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0559 0.0965 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00165 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 8.73e-01 0.0216 0.135 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 1.23e-01 0.192 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.097 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.10e-01 0.0147 0.13 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 5.35e-01 0.0491 0.079 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 7.49e-03 -0.334 0.124 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0839 0.0927 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.44e-02 0.227 0.122 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.12 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0116 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 7.80e-01 0.0246 0.0882 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 9.19e-02 -0.214 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00503 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446584 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0659 0.101 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 9.72e-01 0.00428 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 2.84e-01 -0.135 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562625 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0975 0.13 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241490 sc-eQTL 4.21e-01 0.111 0.138 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -317923 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0887 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222499 sc-eQTL 2.52e-02 -0.274 0.121 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 159910 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0716 0.133 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537181 sc-eQTL 1.67e-01 -0.128 0.0923 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537246 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0858 0.116 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337695 sc-eQTL 6.49e-01 0.0559 0.123 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000077254 USP33 -317923 eQTL 0.0417 -0.0286 0.014 0.0 0.0 0.161
ENSG00000142892 PIGK 222499 eQTL 2.96e-08 -0.136 0.0243 0.0316 0.0107 0.161
ENSG00000154027 AK5 159910 eQTL 0.000158 -0.0952 0.0251 0.0893 0.0741 0.161
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -447610 eQTL 0.0414 -0.0595 0.0291 0.0 0.0 0.161


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 222499 2.18e-06 2.54e-06 2.77e-07 1.27e-06 3.44e-07 6.38e-07 1.26e-06 3.97e-07 1.69e-06 5.9e-07 1.99e-06 8.15e-07 3.08e-06 7.13e-07 4.48e-07 9.67e-07 1.12e-06 1.16e-06 5.75e-07 4.74e-07 7.41e-07 1.98e-06 1.12e-06 5.73e-07 2.43e-06 6.52e-07 1.04e-06 9.25e-07 1.65e-06 1.64e-06 7.56e-07 2.08e-07 3.45e-07 5.53e-07 8.31e-07 4.74e-07 6.66e-07 2.15e-07 4.82e-07 2.09e-07 1.45e-07 2.77e-06 3.57e-07 1.3e-07 1.69e-07 2.17e-07 2.34e-07 8.31e-08 1.11e-07
ENSG00000154027 AK5 159910 4.25e-06 4.35e-06 3.17e-07 1.95e-06 4.49e-07 8.19e-07 2.37e-06 6.01e-07 2.28e-06 9.61e-07 3.01e-06 1.34e-06 5.56e-06 1.17e-06 9.01e-07 1.54e-06 1.52e-06 2.15e-06 1.53e-06 1.41e-06 1.15e-06 3.03e-06 2.3e-06 9.91e-07 4.02e-06 1.23e-06 1.31e-06 1.67e-06 2.61e-06 3.39e-06 1.99e-06 2.77e-07 6.12e-07 1.25e-06 1.65e-06 8.7e-07 7.01e-07 3.47e-07 9.59e-07 3.46e-07 2.93e-07 4.74e-06 6.52e-07 1.91e-07 3.89e-07 3.26e-07 2.87e-07 1.97e-07 2.61e-07
ENSG00000273338 \N -562625 4.68e-07 2.4e-07 6.15e-08 2.53e-07 9.8e-08 8.85e-08 2.5e-07 5.43e-08 1.66e-07 7.6e-08 1.83e-07 1.15e-07 3.4e-07 8.66e-08 5.43e-08 7.98e-08 5.42e-08 2.21e-07 7.76e-08 5.75e-08 1.27e-07 1.7e-07 1.64e-07 3.68e-08 2.28e-07 1.23e-07 1.2e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.85e-07 1.26e-07 3.78e-08 4.34e-08 9.3e-08 6.25e-08 2.74e-08 4.28e-08 8.89e-08 6.3e-08 6.31e-08 5.14e-08 1.68e-07 3.53e-08 2.05e-08 2.64e-08 9.65e-09 1.11e-07 1.9e-09 4.81e-08