Genes within 1Mb (chr1:77441719:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 5.23e-01 0.0802 0.125 0.13 B L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0777 0.0904 0.13 B L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0473 0.097 0.13 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0716 0.0899 0.13 B L1
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0784 0.12 0.13 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 7.02e-01 0.048 0.126 0.13 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 2.27e-01 0.13 0.107 0.13 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 9.13e-01 0.0104 0.0943 0.13 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 8.93e-01 0.0156 0.115 0.13 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0853 0.0733 0.13 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 6.78e-01 0.0411 0.099 0.13 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 1.28e-01 0.115 0.0752 0.13 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 6.15e-02 0.129 0.0689 0.13 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 1.86e-01 -0.111 0.0835 0.13 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 4.58e-01 0.0644 0.0866 0.13 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0305 0.108 0.13 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 8.38e-03 -0.269 0.101 0.13 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 5.39e-01 0.0675 0.11 0.13 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0113 0.0678 0.13 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 5.18e-01 0.0537 0.0829 0.13 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.85e-01 0.0165 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0187 0.114 0.13 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 8.39e-02 -0.193 0.111 0.13 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 2.83e-01 -0.133 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0675 0.112 0.128 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 6.04e-01 0.0678 0.131 0.128 DC L1
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0934 0.105 0.128 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0407 0.123 0.128 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 7.81e-01 0.0328 0.118 0.128 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.59e-01 0.0229 0.128 0.128 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 4.21e-01 -0.111 0.138 0.128 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 6.05e-01 0.0683 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.69e-01 0.0372 0.126 0.13 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 8.06e-01 0.0183 0.0744 0.13 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.07e-03 -0.411 0.124 0.13 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.59e-01 0.0941 0.103 0.13 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0698 0.0833 0.13 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.99e-01 -0.118 0.113 0.13 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.02e-01 0.187 0.114 0.13 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 1.73e-01 -0.161 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 8.01e-01 0.0343 0.136 0.129 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 1.39e-01 -0.158 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.32e-02 -0.283 0.124 0.129 NK L1
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0504 0.133 0.129 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0564 0.0886 0.129 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0747 0.122 0.129 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 5.36e-01 0.0726 0.117 0.129 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.13e-01 0.106 0.13 0.13 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 1.97e-01 0.133 0.103 0.13 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0152 0.103 0.13 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 5.28e-01 0.0825 0.13 0.13 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 4.20e-01 0.0732 0.0905 0.13 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.97e-01 0.000502 0.138 0.13 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.33e-01 -0.064 0.134 0.13 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 9.63e-01 0.00563 0.123 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.91e-01 -0.102 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.76e-01 -0.13 0.146 0.13 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.15e-01 0.219 0.139 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 6.94e-01 0.0558 0.142 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0844 0.115 0.13 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.52e-01 0.00828 0.138 0.13 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 2.99e-01 0.154 0.148 0.13 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 1.91e-01 0.173 0.131 0.13 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.11e-01 -0.015 0.134 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0564 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 5.63e-01 0.081 0.14 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 8.64e-01 0.0196 0.115 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0785 0.128 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 1.75e-01 0.183 0.135 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.57e-01 0.0565 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.44e-01 0.0838 0.109 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0152 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.30e-01 -0.126 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.18e-01 0.176 0.143 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 9.51e-01 0.00813 0.133 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.77e-01 -0.146 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0332 0.135 0.131 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0648 0.114 0.131 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0557 0.131 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.70e-01 0.0796 0.11 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 6.32e-01 0.0648 0.135 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0707 0.102 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00623 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0256 0.134 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.32e-01 0.0618 0.129 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 5.28e-01 0.0636 0.1 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.03e-01 0.0513 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.39e-02 -0.243 0.12 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0585 0.139 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.57e-01 0.107 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0326 0.118 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.66e-01 0.0232 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.44e-01 0.198 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 5.12e-02 0.276 0.141 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.30e-02 -0.304 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.16e-01 0.0317 0.136 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.122 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0234 0.134 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0228 0.132 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.19e-01 0.0494 0.137 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0275 0.12 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0707 0.0896 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 9.85e-01 0.00193 0.102 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 3.39e-01 0.0839 0.0876 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.56e-02 0.17 0.0758 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 1.68e-01 -0.113 0.0815 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.36e-01 0.14 0.0934 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 3.53e-01 0.119 0.128 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 1.53e-01 -0.137 0.0958 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 7.54e-01 0.0433 0.138 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 2.03e-03 0.276 0.0882 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00453 0.0961 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0562 0.12 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.68e-01 0.0357 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.07e-01 0.158 0.125 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.53e-01 0.189 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 3.00e-01 0.129 0.124 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 1.61e-01 -0.158 0.112 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 3.32e-01 0.128 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 9.74e-01 0.00436 0.136 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.74e-01 0.0963 0.134 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.48e-01 -0.137 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0356 0.132 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0521 0.125 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 6.16e-01 0.0543 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 7.65e-02 0.226 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.44e-01 0.0548 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 3.12e-01 -0.123 0.121 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.70e-02 -0.22 0.124 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 1.79e-03 -0.361 0.114 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.16e-01 0.186 0.118 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 4.05e-01 0.0757 0.0907 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.55e-01 -0.113 0.0988 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.27e-01 -0.144 0.119 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.40e-01 0.178 0.12 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.57e-02 -0.233 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0876 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 6.15e-01 0.0688 0.137 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0162 0.148 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 5.98e-02 0.251 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.62e-01 0.14 0.124 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.37e-02 0.228 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0366 0.139 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00117 0.123 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00354 0.148 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0383 0.149 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0239 0.142 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 5.77e-01 0.0561 0.1 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.96e-01 -0.116 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 6.40e-01 0.0647 0.138 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.38e-01 -0.217 0.146 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 1.54e-01 -0.17 0.119 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 5.83e-01 0.0738 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 5.58e-02 0.225 0.117 0.13 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.84e-01 0.143 0.133 0.13 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 9.32e-01 0.00893 0.105 0.13 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.13 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 8.44e-01 0.0258 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.21e-01 0.0965 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 1.58e-01 -0.194 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 5.51e-03 -0.378 0.135 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0308 0.142 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 7.99e-01 0.0312 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.73e-01 0.112 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0384 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.57e-02 0.225 0.126 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.41e-01 0.106 0.137 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.12e-01 -0.115 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 9.35e-02 -0.216 0.128 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0303 0.131 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 5.68e-02 -0.197 0.103 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.58e-01 -0.151 0.133 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.53e-01 0.179 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00262 0.152 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0542 0.15 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 3.99e-01 -0.132 0.156 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 1.60e-01 -0.199 0.141 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 5.56e-01 0.0841 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.50e-01 -0.16 0.139 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0772 0.145 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0198 0.137 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.54e-01 -0.113 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.58e-01 -0.145 0.128 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0494 0.131 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.77e-01 -0.126 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 3.22e-01 0.12 0.121 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.07e-01 0.05 0.133 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 8.26e-01 0.0416 0.189 0.148 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.43e-01 -0.157 0.165 0.148 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0343 0.0946 0.148 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0358 0.156 0.148 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 7.97e-01 0.0368 0.143 0.148 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 4.11e-01 -0.127 0.155 0.148 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.65e-01 -0.25 0.178 0.148 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.13e-01 -0.13 0.158 0.148 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 3.60e-01 -0.131 0.142 0.133 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0293 0.132 0.133 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.76e-03 -0.289 0.109 0.133 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 8.80e-01 0.0174 0.115 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 6.81e-02 -0.22 0.12 0.133 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0406 0.138 0.133 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0833 0.134 0.133 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.133 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 1.98e-01 -0.172 0.134 0.13 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0938 0.121 0.13 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 4.23e-01 0.107 0.133 0.13 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0501 0.0821 0.13 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 7.97e-01 0.0299 0.116 0.13 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 4.22e-01 0.104 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 9.48e-02 -0.22 0.131 0.13 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000818 0.146 0.127 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0987 0.125 0.127 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 3.41e-01 0.128 0.134 0.127 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0541 0.11 0.127 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0455 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 8.16e-01 0.0247 0.106 0.127 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 3.85e-01 0.115 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0248 0.146 0.127 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.18e-01 -0.108 0.133 0.127 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0422 0.13 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0703 0.0814 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.73e-01 -0.177 0.13 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 1.06e-02 0.302 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 1.18e-01 -0.149 0.095 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.25e-01 -0.147 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 4.50e-01 0.0996 0.132 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.23e-02 -0.245 0.12 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.71e-01 0.0402 0.138 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.28e-01 0.12 0.0994 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 3.98e-03 -0.361 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.79e-02 -0.263 0.119 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 1.82e-01 -0.138 0.103 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.131 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 2.41e-02 0.3 0.132 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 5.02e-01 0.0873 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.33e-01 0.0137 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 8.35e-01 0.0319 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 3.02e-01 0.168 0.163 0.127 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 8.90e-01 0.0169 0.122 0.127 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.25e-01 0.155 0.156 0.127 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0161 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0548 0.159 0.127 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0379 0.139 0.127 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 7.18e-01 -0.052 0.144 0.131 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 2.56e-01 0.136 0.119 0.131 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.72e-01 -0.14 0.127 0.131 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0652 0.131 0.131 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0812 0.101 0.131 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 2.77e-01 0.133 0.122 0.131 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 7.48e-02 -0.239 0.133 0.131 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 2.87e-01 -0.138 0.129 0.131 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 2.33e-01 0.163 0.136 0.129 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 1.30e-01 -0.157 0.103 0.129 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0948 0.125 0.129 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.38e-01 0.123 0.129 0.129 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 5.73e-01 0.0618 0.11 0.129 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0641 0.125 0.129 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 5.95e-01 0.0719 0.135 0.129 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 7.88e-01 -0.034 0.126 0.129 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.07e-01 -0.115 0.139 0.121 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 8.30e-01 0.0306 0.142 0.121 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0923 0.15 0.121 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 3.76e-02 -0.203 0.0967 0.121 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 3.35e-01 0.133 0.138 0.121 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0145 0.135 0.121 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0172 0.14 0.121 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 2.87e-01 -0.166 0.156 0.121 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 3.30e-01 0.135 0.138 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.08e-01 -0.108 0.13 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 6.34e-02 -0.192 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 1.61e-01 0.191 0.136 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 8.89e-01 0.0157 0.113 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0857 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 1.39e-01 0.199 0.134 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 5.24e-01 0.0791 0.124 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.40e-01 0.0799 0.103 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.51e-01 0.00783 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0552 0.103 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 8.10e-01 0.0321 0.134 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0559 0.0965 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00165 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 8.73e-01 0.0216 0.135 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 1.23e-01 0.192 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.097 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.10e-01 0.0147 0.13 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 5.35e-01 0.0491 0.079 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 7.49e-03 -0.334 0.124 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0839 0.0927 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 3.02e-01 -0.123 0.119 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.44e-02 0.227 0.122 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.12 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0116 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 7.80e-01 0.0246 0.0882 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 9.19e-02 -0.214 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00503 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -446794 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0659 0.101 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 9.72e-01 0.00428 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 2.84e-01 -0.135 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -562835 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0975 0.13 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -241700 sc-eQTL 4.21e-01 0.111 0.138 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -318133 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0887 0.108 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 222289 sc-eQTL 2.52e-02 -0.274 0.121 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 159700 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0716 0.133 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -537391 sc-eQTL 1.67e-01 -0.128 0.0923 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -537456 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0858 0.116 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -337905 sc-eQTL 6.49e-01 0.0559 0.123 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000077254 USP33 -318133 eQTL 0.0419 -0.0285 0.014 0.0 0.0 0.161
ENSG00000142892 PIGK 222289 eQTL 2.95e-08 -0.136 0.0243 0.0316 0.00914 0.161
ENSG00000154027 AK5 159700 eQTL 0.000157 -0.0952 0.0251 0.0896 0.0751 0.161
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -447820 eQTL 0.0414 -0.0594 0.0291 0.0 0.0 0.161


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 222289 1.88e-06 2.15e-06 2.8e-07 1.42e-06 4.73e-07 6.91e-07 1.3e-06 4.41e-07 1.76e-06 6.77e-07 1.87e-06 1.32e-06 2.94e-06 6.86e-07 4.02e-07 1.1e-06 1.13e-06 1.34e-06 5.52e-07 7.92e-07 6.24e-07 1.97e-06 1.65e-06 9.8e-07 2.57e-06 1.13e-06 1.04e-06 1.04e-06 1.65e-06 1.59e-06 7.71e-07 2.7e-07 3.85e-07 1.12e-06 9.62e-07 6.4e-07 7.44e-07 3.45e-07 7.83e-07 1.71e-07 1.82e-07 2.45e-06 3.9e-07 1.41e-07 3.99e-07 3.12e-07 3.78e-07 2.24e-07 2.71e-07
ENSG00000154027 AK5 159700 3.54e-06 3.03e-06 5.35e-07 1.96e-06 7.98e-07 7.41e-07 2.47e-06 9.96e-07 2.43e-06 1.42e-06 2.98e-06 1.77e-06 5.21e-06 1.44e-06 9.15e-07 2e-06 1.59e-06 2.13e-06 1.56e-06 1.2e-06 1.43e-06 3.37e-06 3.3e-06 1.82e-06 4.27e-06 1.17e-06 1.59e-06 1.77e-06 3.5e-06 2.75e-06 1.91e-06 4.71e-07 5.48e-07 1.74e-06 1.72e-06 9.54e-07 9.39e-07 3.97e-07 1.25e-06 3.82e-07 4.51e-07 3.95e-06 6.36e-07 1.95e-07 3.7e-07 3.64e-07 8.74e-07 2.62e-07 1.74e-07
ENSG00000273338 \N -562835 6.09e-07 3.11e-07 7.97e-08 2.87e-07 1.07e-07 1.54e-07 4.05e-07 8.86e-08 2.78e-07 1.65e-07 3.66e-07 2.49e-07 5.39e-07 9.18e-08 1.18e-07 1.63e-07 1.18e-07 3.02e-07 1.13e-07 8.41e-08 1.6e-07 2.63e-07 2.56e-07 1.03e-07 4.54e-07 2.32e-07 1.83e-07 1.77e-07 2.13e-07 2.59e-07 1.93e-07 5.54e-08 4.96e-08 1.19e-07 2.15e-07 5.2e-08 8.75e-08 6.56e-08 4.9e-08 7.67e-08 4.82e-08 2.9e-07 2.89e-08 7.24e-09 8.01e-08 9.49e-09 1.04e-07 0.0 4.54e-08