logo

Genes within 1Mb (chr1:77437296:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0531 0.145 0.083 B L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.80e-01 0.0915 0.104 0.083 B L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 3.03e-01 0.115 0.112 0.083 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 9.69e-01 -0.004 0.104 0.083 B L1
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 7.92e-01 0.0366 0.138 0.083 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.97e-02 -0.253 0.144 0.083 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.91e-01 -0.033 0.124 0.083 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 8.93e-02 0.184 0.108 0.083 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 3.83e-01 -0.116 0.133 0.083 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0255 0.0847 0.083 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0506 0.114 0.083 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 7.84e-02 0.153 0.0864 0.083 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.77e-01 0.0569 0.0799 0.083 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.54e-01 0.0724 0.0965 0.083 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0996 0.083 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.84e-01 0.0178 0.122 0.083 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 1.01e-01 0.19 0.115 0.083 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 3.96e-01 0.105 0.124 0.083 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.60e-01 0.0135 0.0766 0.083 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0282 0.0937 0.083 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 3.78e-01 -0.113 0.128 0.083 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 3.18e-01 0.129 0.129 0.083 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 8.57e-02 0.216 0.125 0.083 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.95e-01 -0.193 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.76e-01 0.146 0.134 0.081 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0417 0.157 0.081 DC L1
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0939 0.127 0.081 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.17e-01 0.182 0.147 0.081 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 2.70e-01 -0.156 0.141 0.081 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.25e-01 -0.236 0.153 0.081 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.40e-01 -0.102 0.166 0.081 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 5.46e-01 0.0957 0.158 0.081 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.72e-01 -0.107 0.149 0.083 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0825 0.0874 0.083 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0795 0.149 0.083 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.56e-01 0.0901 0.121 0.083 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.89e-01 0.068 0.0981 0.083 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.97e-01 0.0173 0.134 0.083 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 6.91e-01 0.0538 0.135 0.083 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 3.00e-01 0.144 0.138 0.083 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 9.78e-02 -0.251 0.151 0.084 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.64e-01 -0.133 0.119 0.084 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.47e-01 -0.162 0.14 0.084 NK L1
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.63e-02 -0.282 0.147 0.084 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 3.30e-01 0.0965 0.0987 0.084 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0242 0.136 0.084 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 1.76e-01 0.177 0.13 0.084 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.22e-01 -0.118 0.147 0.083 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0816 0.117 0.083 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 1.99e-01 -0.149 0.116 0.083 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0265 0.148 0.083 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0463 0.102 0.083 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.73e-01 0.0251 0.156 0.083 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 4.67e-01 0.11 0.151 0.083 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 6.48e-02 0.255 0.138 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 2.71e-01 -0.195 0.177 0.084 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 1.93e-01 0.228 0.175 0.084 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0276 0.167 0.084 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0855 0.17 0.084 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 7.33e-01 0.0472 0.138 0.084 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0373 0.165 0.084 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 6.16e-01 0.0891 0.178 0.084 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0981 0.158 0.084 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 2.00e-01 -0.2 0.155 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0739 0.141 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.16e-01 0.202 0.162 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0359 0.134 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.24e-01 -0.12 0.149 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0566 0.157 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0729 0.148 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.71e-01 0.0919 0.127 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.17e-01 -0.125 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 9.91e-01 0.00175 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0199 0.165 0.084 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 8.90e-02 -0.259 0.152 0.084 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 5.77e-01 0.0831 0.149 0.084 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.57e-01 0.0478 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 4.97e-01 0.105 0.154 0.084 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.76e-01 0.0938 0.131 0.084 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 3.49e-01 -0.141 0.15 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 7.31e-01 0.0435 0.126 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 9.54e-01 0.00897 0.155 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.22e-01 0.143 0.117 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.05e-01 0.117 0.14 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.96e-02 -0.26 0.152 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0818 0.148 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 5.76e-02 0.218 0.114 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.74e-01 0.216 0.158 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.88e-01 0.124 0.143 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0919 0.163 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 6.79e-01 0.0566 0.136 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 9.80e-01 0.00354 0.139 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 9.52e-02 -0.27 0.161 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.50e-01 0.096 0.16 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.47e-01 0.104 0.136 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.51e-01 0.0308 0.164 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 7.11e-01 0.0575 0.155 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 1.12e-01 0.248 0.155 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 1.14e-01 -0.222 0.14 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.73e-01 -0.111 0.154 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 5.95e-02 0.285 0.15 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 8.67e-01 0.0266 0.158 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 7.19e-01 -0.05 0.139 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0194 0.104 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0859 0.118 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.46e-02 0.194 0.1 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 5.81e-01 0.0489 0.0884 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.57e-01 0.134 0.094 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.30e-01 0.0682 0.108 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.61e-01 -0.108 0.146 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.98e-02 -0.238 0.109 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0756 0.157 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.56e-01 0.0607 0.103 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.16e-01 0.0892 0.11 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.55e-01 0.0428 0.137 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 6.75e-01 0.0605 0.144 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.50e-01 -0.106 0.141 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0385 0.145 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.99e-01 -0.16 0.154 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 6.27e-01 0.0705 0.145 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 1.43e-01 0.192 0.131 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0628 0.153 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0974 0.158 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 7.12e-01 -0.056 0.152 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 6.09e-01 0.0684 0.134 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 4.97e-01 0.101 0.149 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.32e-01 0.03 0.141 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0925 0.122 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 2.20e-01 -0.177 0.144 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 2.23e-01 0.163 0.133 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.69e-01 0.152 0.137 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00075 0.144 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.45e-01 0.157 0.135 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 5.39e-01 0.0845 0.137 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.67e-01 0.0176 0.105 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.05e-01 0.145 0.114 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0511 0.138 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.139 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.39e-01 0.105 0.135 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.41e-01 0.224 0.152 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.76e-02 0.303 0.152 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 8.38e-01 -0.034 0.166 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.16e-01 0.0977 0.15 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0703 0.14 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.17e-01 -0.124 0.153 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.14e-01 -0.017 0.157 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.91e-02 0.299 0.136 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 2.51e-01 -0.193 0.168 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 5.20e-01 0.109 0.169 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 6.65e-02 0.294 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0739 0.114 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.88e-01 -0.108 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0253 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 2.58e-01 -0.188 0.166 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 7.04e-02 0.245 0.135 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0946 0.154 0.084 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.21e-01 -0.109 0.135 0.084 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 1.30e-01 -0.232 0.152 0.084 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 1.39e-01 -0.178 0.12 0.084 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 3.23e-01 -0.145 0.147 0.084 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0278 0.15 0.084 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.57e-02 0.249 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 1.44e-02 0.334 0.135 0.084 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 3.10e-01 -0.161 0.159 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 7.63e-01 0.0478 0.159 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 7.20e-01 0.0588 0.164 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.62e-01 -0.082 0.141 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 3.70e-01 -0.13 0.145 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.60e-01 -0.112 0.152 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.24e-02 0.246 0.146 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.01e-01 -0.255 0.155 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0616 0.129 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 3.07e-01 -0.149 0.146 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 3.98e-02 -0.305 0.148 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 3.52e-01 0.11 0.118 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 5.09e-01 0.1 0.151 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 6.58e-01 0.0631 0.142 0.084 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 9.68e-01 0.00662 0.165 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 9.48e-02 -0.271 0.161 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 3.77e-01 0.149 0.169 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 2.93e-01 -0.161 0.153 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 5.67e-01 0.0885 0.154 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.43e-01 0.116 0.15 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00476 0.157 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.38e-01 -0.12 0.154 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0753 0.138 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.15e-01 -0.18 0.144 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 6.35e-02 -0.274 0.147 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0894 0.13 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.34e-01 0.0465 0.137 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 3.04e-01 0.154 0.149 0.084 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 5.34e-01 -0.13 0.208 0.093 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.18e-01 0.183 0.183 0.093 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 4.16e-01 0.0852 0.104 0.093 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 8.09e-01 -0.042 0.173 0.093 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 6.08e-01 -0.081 0.158 0.093 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.39e-01 0.253 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0714 0.199 0.093 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 6.60e-01 -0.077 0.175 0.093 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 4.83e-02 -0.317 0.16 0.083 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.43e-01 -0.114 0.149 0.083 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0521 0.125 0.083 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.70e-01 0.0213 0.129 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 3.27e-01 0.134 0.136 0.083 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 2.75e-01 0.17 0.155 0.083 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.29e-01 0.0526 0.152 0.083 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 7.00e-01 0.0454 0.118 0.083 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.68e-01 0.0263 0.158 0.083 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 6.04e-01 0.0741 0.142 0.083 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 1.44e-01 0.229 0.156 0.083 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 2.04e-01 -0.123 0.0965 0.083 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.90e-01 0.0945 0.137 0.083 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 3.17e-01 0.152 0.152 0.083 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 2.05e-01 0.197 0.155 0.083 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 2.80e-01 -0.195 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.77e-01 0.11 0.155 0.078 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 3.97e-01 -0.141 0.166 0.078 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0887 0.136 0.078 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 1.83e-02 0.378 0.159 0.078 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 1.19e-01 -0.204 0.13 0.078 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.17e-01 -0.132 0.163 0.078 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0494 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 5.72e-01 0.0931 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.67e-01 0.0266 0.158 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0251 0.0996 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0544 0.159 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.97e-01 0.0989 0.145 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 9.59e-02 0.194 0.116 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0395 0.148 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0194 0.161 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.79e-01 0.16 0.147 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 5.35e-01 -0.106 0.17 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.123 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0476 0.156 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 1.89e-01 0.195 0.148 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 8.41e-01 0.0257 0.128 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.33e-01 -0.242 0.161 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 2.02e-01 0.21 0.164 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.35e-01 0.19 0.16 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.64e-01 0.0331 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 1.72e-01 0.248 0.181 0.088 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 1.17e-01 -0.303 0.192 0.088 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.55e-01 0.0267 0.145 0.088 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0336 0.186 0.088 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.16e-01 -0.28 0.177 0.088 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 3.76e-01 -0.167 0.189 0.088 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.83e-01 -0.177 0.164 0.088 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 3.46e-01 -0.165 0.175 0.082 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 2.65e-01 0.162 0.145 0.082 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.53e-01 -0.177 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.26e-01 0.193 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 2.29e-01 0.149 0.123 0.082 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.71e-01 0.203 0.148 0.082 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.40e-01 0.185 0.157 0.082 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0945 0.161 0.081 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.97e-01 0.104 0.122 0.081 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.72e-01 0.162 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 9.49e-01 0.00969 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 7.74e-01 0.0372 0.129 0.081 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 3.73e-01 0.131 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 8.61e-01 0.028 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 3.30e-02 0.315 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00523 0.174 0.076 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 3.70e-01 0.16 0.177 0.076 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.54e-01 0.215 0.188 0.076 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 6.20e-01 0.0609 0.123 0.076 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0934 0.173 0.076 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.33e-01 -0.132 0.168 0.076 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 6.90e-01 -0.07 0.175 0.076 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 9.24e-01 0.0188 0.195 0.076 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 8.24e-01 0.0386 0.173 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.88e-01 -0.201 0.152 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 8.41e-01 0.0245 0.122 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.02e-01 0.205 0.16 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.30e-01 -0.159 0.132 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0273 0.152 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 4.61e-01 -0.116 0.158 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.35e-01 0.0493 0.145 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 6.62e-01 0.0531 0.121 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0288 0.149 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 4.59e-01 0.0882 0.119 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0201 0.155 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.111 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 9.44e-01 0.0101 0.143 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 3.67e-02 -0.326 0.155 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0459 0.145 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.40e-02 0.226 0.111 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0938 0.155 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 1.86e-01 -0.125 0.0939 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0556 0.15 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.12e-01 0.156 0.124 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.91e-01 0.0764 0.111 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 1.90e-01 -0.187 0.142 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 4.26e-01 0.117 0.147 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 4.01e-01 0.121 0.143 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 3.59e-01 -0.142 0.154 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 8.87e-02 0.174 0.102 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 8.74e-01 0.0235 0.148 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 4.77e-01 0.101 0.142 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -451217 sc-eQTL 4.97e-01 0.0803 0.118 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 2.69e-01 0.157 0.142 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 7.98e-02 -0.257 0.146 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 sc-eQTL 2.09e-02 0.347 0.149 0.084 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -246123 sc-eQTL 1.54e-01 -0.219 0.153 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -322556 sc-eQTL 1.69e-01 -0.166 0.12 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 217866 sc-eQTL 2.20e-01 -0.168 0.136 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 155277 sc-eQTL 8.22e-02 -0.258 0.148 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -541814 sc-eQTL 2.78e-01 0.112 0.103 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -541879 sc-eQTL 9.51e-01 0.00804 0.13 0.084 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -342328 sc-eQTL 5.28e-01 0.0865 0.137 0.084 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000137960 GIPC2 -542246 pQTL 0.0428 0.0892 0.044 0.00269 0.0 0.0549
ENSG00000273338 AC103591.3 -567258 eQTL 3.38e-02 0.09 0.0423 0.0 0.0 0.0535

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226084 \N 308182 1.86e-06 2.1e-06 2.66e-07 1.64e-06 4.51e-07 8.1e-07 1.31e-06 4.08e-07 1.73e-06 6.9e-07 1.91e-06 1.25e-06 2.84e-06 9.52e-07 3.96e-07 1.01e-06 9.95e-07 1.1e-06 5.55e-07 4.71e-07 7.49e-07 2e-06 1.47e-06 5.94e-07 2.59e-06 7.38e-07 1e-06 9.59e-07 1.67e-06 1.61e-06 7.63e-07 2.95e-07 2.75e-07 7.25e-07 8.57e-07 6.07e-07 7.26e-07 3.43e-07 5.07e-07 2.28e-07 3.03e-07 2.7e-06 3.32e-07 1.41e-07 3.3e-07 3.17e-07 2.45e-07 1.38e-07 1.6e-07