Genes within 1Mb (chr1:77428755:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000861 0.119 0.141 B L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 7.50e-01 0.0274 0.086 0.141 B L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 8.68e-01 0.0154 0.0922 0.141 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000626 0.0855 0.141 B L1
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 9.72e-01 0.00395 0.114 0.141 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0071 0.119 0.141 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.86e-02 0.211 0.101 0.141 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0854 0.0894 0.141 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 5.28e-01 0.0671 0.106 0.141 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0828 0.0676 0.141 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00904 0.0913 0.141 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0322 0.0697 0.141 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 3.85e-01 0.0557 0.0639 0.141 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0924 0.0771 0.141 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.70e-01 0.11 0.0796 0.141 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0429 0.0987 0.141 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.32e-03 -0.299 0.0917 0.141 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0716 0.1 0.141 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 5.87e-02 -0.117 0.0614 0.141 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.30e-02 0.127 0.0753 0.141 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 7.97e-01 0.0267 0.104 0.141 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0612 0.104 0.141 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.42e-02 -0.196 0.101 0.141 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 3.23e-01 -0.114 0.115 0.142 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.45e-01 -0.152 0.104 0.142 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 9.96e-01 0.00057 0.122 0.142 DC L1
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0895 0.0983 0.142 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.06e-01 0.185 0.114 0.142 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 6.19e-01 0.0547 0.11 0.142 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.73e-01 -0.131 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 8.26e-01 0.0284 0.129 0.142 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.26e-01 0.188 0.122 0.142 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.68e-01 0.00485 0.119 0.141 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 5.66e-01 0.0402 0.07 0.141 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.37e-01 -0.178 0.119 0.141 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.63e-01 0.134 0.0962 0.141 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0622 0.0784 0.141 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0658 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.74e-02 0.256 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 2.25e-01 -0.135 0.111 0.141 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.28e-01 -0.188 0.123 0.139 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0382 0.0973 0.139 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.74e-01 -0.155 0.114 0.139 NK L1
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 8.45e-01 0.0237 0.121 0.139 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0017 0.0807 0.139 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.79e-01 -0.12 0.111 0.139 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0449 0.107 0.139 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.98e-01 0.0306 0.12 0.141 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 6.90e-01 0.038 0.0951 0.141 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0294 0.0947 0.141 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 7.99e-01 0.0306 0.12 0.141 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 4.19e-02 0.169 0.0825 0.141 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0297 0.127 0.141 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 7.48e-01 0.0396 0.123 0.141 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0987 0.113 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0289 0.137 0.14 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.59e-01 -0.191 0.135 0.14 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 3.81e-01 0.113 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0206 0.107 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0116 0.127 0.14 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.26e-01 0.135 0.137 0.14 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 3.29e-01 0.119 0.122 0.14 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0676 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.97e-01 0.000439 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.77e-01 -0.055 0.132 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0216 0.108 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0511 0.121 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 6.07e-01 0.0656 0.127 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.33e-01 0.116 0.119 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0101 0.103 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 8.88e-01 -0.018 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0853 0.123 0.138 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.69e-01 0.188 0.136 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 5.86e-01 0.069 0.127 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0427 0.123 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0769 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.91e-01 0.11 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0774 0.109 0.138 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.89e-01 0.0721 0.104 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.64e-01 0.178 0.127 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 6.64e-01 -0.042 0.0964 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 4.63e-01 0.085 0.116 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00343 0.126 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.48e-01 0.176 0.121 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0535 0.0949 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.49e-01 0.0417 0.13 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.96e-01 -0.152 0.117 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.44e-01 -0.196 0.134 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.22e-01 0.173 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0204 0.114 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 8.41e-01 0.0268 0.133 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.50e-01 0.19 0.131 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0232 0.112 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.49e-01 0.193 0.133 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0945 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0357 0.128 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 1.51e-01 0.165 0.115 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 7.29e-01 0.0438 0.126 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 4.18e-01 -0.1 0.124 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00153 0.129 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.89e-01 0.0016 0.111 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0148 0.083 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.89e-01 0.0379 0.0945 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0797 0.081 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.08e-01 0.114 0.0705 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0754 0.0755 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.11e-01 0.138 0.0863 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.41e-01 0.174 0.118 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 6.54e-02 -0.163 0.0879 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0311 0.127 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 5.24e-01 0.0529 0.0829 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00809 0.0885 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0319 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00749 0.114 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000564 0.118 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.56e-01 0.176 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 2.64e-01 -0.119 0.106 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00681 0.124 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 7.52e-01 0.0404 0.128 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00581 0.123 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0756 0.108 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0626 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 7.53e-01 -0.036 0.114 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 4.01e-01 0.0834 0.099 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 1.71e-01 0.16 0.117 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.82e-01 -0.145 0.108 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.73e-01 -0.151 0.111 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.08e-01 -0.188 0.116 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 5.07e-03 -0.305 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 7.47e-01 0.036 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 1.59e-01 -0.12 0.0849 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0156 0.093 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0674 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 7.29e-02 0.202 0.112 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.28e-01 -0.166 0.109 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00388 0.13 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00953 0.13 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0401 0.14 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 6.05e-01 0.066 0.127 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.21e-01 0.184 0.118 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 1.72e-02 0.308 0.128 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00413 0.133 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0274 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.28e-01 0.0125 0.137 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.27e-02 -0.239 0.137 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0813 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 9.47e-01 0.00621 0.0931 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.97e-01 0.164 0.126 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0957 0.128 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0951 0.136 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0619 0.111 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00514 0.124 0.143 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.143 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.62e-01 0.0538 0.123 0.143 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 7.97e-01 0.0248 0.0964 0.143 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 5.63e-02 0.225 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.28e-01 -0.118 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0389 0.11 0.143 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 2.78e-02 -0.278 0.125 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 2.25e-02 -0.287 0.125 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 8.01e-01 0.0331 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0575 0.113 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 3.52e-01 0.108 0.116 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 7.06e-01 0.0457 0.121 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 3.22e-01 0.116 0.117 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0684 0.127 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0222 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.47e-01 -0.173 0.119 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 7.89e-01 0.0325 0.121 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.71e-01 -0.132 0.0957 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.94e-02 -0.268 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.01e-01 0.0145 0.116 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0949 0.135 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0158 0.133 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 4.36e-01 -0.108 0.139 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 7.43e-02 -0.224 0.125 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0811 0.127 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 8.57e-01 0.0223 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00626 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0336 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0284 0.112 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0843 0.118 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0283 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 7.27e-01 0.0371 0.106 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 4.00e-01 0.0939 0.111 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.28e-01 -0.011 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0876 0.17 0.144 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 3.14e-01 -0.15 0.149 0.144 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.88e-01 -0.112 0.0847 0.144 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0385 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 8.23e-01 0.0289 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 1.58e-02 -0.334 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.44e-01 -0.237 0.161 0.144 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.25e-01 -0.218 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0353 0.131 0.141 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0282 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 2.71e-02 -0.224 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 4.47e-01 -0.08 0.105 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.64e-01 0.005 0.111 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0656 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00658 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.18e-02 -0.24 0.0944 0.141 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 8.42e-01 0.0254 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0825 0.115 0.141 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00454 0.126 0.141 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 1.73e-01 -0.106 0.0777 0.141 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.61e-01 0.0054 0.11 0.141 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0698 0.122 0.141 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.81e-01 0.00304 0.125 0.141 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0441 0.135 0.146 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 1.68e-01 -0.16 0.115 0.146 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 2.40e-01 0.146 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0666 0.102 0.146 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 3.49e-01 0.113 0.12 0.146 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 2.90e-01 0.104 0.0978 0.146 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0571 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0209 0.135 0.146 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.95e-01 0.0657 0.123 0.146 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.36e-01 0.00978 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.42e-01 -0.059 0.0767 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 9.89e-01 0.00165 0.123 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 4.67e-03 0.315 0.11 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 1.72e-01 -0.123 0.0895 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0536 0.114 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.40e-01 0.183 0.123 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 3.99e-01 -0.096 0.114 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0782 0.129 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 2.78e-01 0.102 0.0933 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 3.24e-02 -0.253 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.02e-01 -0.184 0.112 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0425 0.0969 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 4.60e-01 0.0908 0.123 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 5.54e-02 0.239 0.124 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0365 0.122 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 4.10e-01 -0.124 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.56e-01 0.00792 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 2.83e-01 0.163 0.152 0.148 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 9.66e-01 0.00489 0.114 0.148 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 1.04e-01 0.237 0.145 0.148 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.92e-01 -0.148 0.14 0.148 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00543 0.148 0.148 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0402 0.129 0.148 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.63e-01 -0.189 0.135 0.142 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 2.01e-01 0.144 0.112 0.142 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0517 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0563 0.124 0.142 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0579 0.0957 0.142 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0821 0.115 0.142 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0782 0.127 0.142 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 9.83e-02 -0.201 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 4.56e-02 0.258 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0896 0.0981 0.14 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 7.37e-01 -0.04 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 2.98e-01 0.127 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 4.69e-01 0.0751 0.104 0.14 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0402 0.118 0.14 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 5.71e-01 0.0725 0.128 0.14 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0522 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 1.39e-01 -0.203 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.92e-01 0.00145 0.14 0.136 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.60e-01 -0.208 0.148 0.136 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 6.69e-02 -0.177 0.0957 0.136 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 2.81e-01 0.147 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 8.76e-01 0.0208 0.133 0.136 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0877 0.138 0.136 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0611 0.154 0.136 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 1.79e-01 0.183 0.136 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 3.83e-01 -0.105 0.121 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0986 0.0961 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 6.22e-01 0.0624 0.127 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.03e-01 0.0127 0.105 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 2.75e-01 -0.131 0.12 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 2.99e-01 0.129 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.77e-01 0.155 0.114 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0963 0.0956 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0863 0.122 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 9.85e-01 0.0018 0.0976 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00471 0.127 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 9.12e-01 0.0101 0.0918 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 6.33e-01 0.0561 0.117 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 7.18e-01 0.0464 0.129 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 1.70e-02 0.282 0.117 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0504 0.0922 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0136 0.122 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 4.41e-01 0.0573 0.0742 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 2.20e-01 -0.145 0.118 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 6.22e-02 0.183 0.0975 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0657 0.0871 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0105 0.112 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 2.64e-02 0.256 0.114 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0688 0.113 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 7.03e-01 0.0486 0.127 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 3.29e-01 0.0824 0.0842 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 2.93e-01 -0.128 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0417 0.117 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -459758 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0646 0.0969 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0631 0.117 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 6.10e-01 0.0617 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -575799 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -254664 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0939 0.126 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -331097 sc-eQTL 8.03e-01 0.0247 0.0989 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 209325 sc-eQTL 1.46e-01 -0.163 0.111 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 146736 sc-eQTL 8.87e-01 0.0173 0.122 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -550355 sc-eQTL 5.54e-01 -0.05 0.0844 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -550420 sc-eQTL 1.76e-01 -0.143 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -350869 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0634 0.112 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 209325 eQTL 1.68e-07 -0.123 0.0234 0.0358 0.0214 0.181
ENSG00000154027 AK5 146736 eQTL 5.17e-06 -0.11 0.024 0.0 0.003 0.181
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -460784 eQTL 0.00487 -0.0789 0.0279 0.0 0.0 0.181


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 209325 6.01e-06 1.02e-05 8.56e-07 4.16e-06 1.35e-06 1.51e-06 8.23e-06 1.01e-06 4.71e-06 2.41e-06 7.56e-06 3.33e-06 1.09e-05 3.13e-06 1.54e-06 3.09e-06 2.24e-06 3.95e-06 1.43e-06 1.01e-06 2.77e-06 5.44e-06 4.48e-06 1.85e-06 9e-06 1.87e-06 2.55e-06 1.75e-06 5.03e-06 4.73e-06 3.35e-06 4.51e-07 6.45e-07 1.86e-06 1.93e-06 9.61e-07 8.74e-07 4.2e-07 9.96e-07 4.17e-07 2.87e-07 8.14e-06 3.65e-07 1.51e-07 3.69e-07 1.19e-06 8.12e-07 2.41e-07 2.68e-07
ENSG00000154027 AK5 146736 1.07e-05 1.66e-05 1.11e-06 7.44e-06 1.73e-06 3.93e-06 1.08e-05 1.34e-06 9.26e-06 4.42e-06 1.2e-05 4.49e-06 1.8e-05 3.56e-06 2.6e-06 5.07e-06 4.11e-06 6.33e-06 2.65e-06 2.44e-06 3.41e-06 8.97e-06 7.06e-06 1.93e-06 1.54e-05 2.66e-06 4.16e-06 2.64e-06 9.56e-06 7.87e-06 5.8e-06 4.74e-07 7.54e-07 2.38e-06 4.3e-06 1.61e-06 1.08e-06 4.39e-07 1.84e-06 7.47e-07 1.96e-07 1.51e-05 9.02e-07 1.67e-07 5.79e-07 1.06e-06 1.05e-06 7.05e-07 3.9e-07
ENSG00000162613 \N -550355 6.8e-07 8.72e-07 6.55e-08 3.77e-07 1.07e-07 1.77e-07 5.13e-07 5.56e-08 2.76e-07 1.05e-07 7.44e-07 3.21e-07 7.36e-07 2.1e-07 3.86e-07 1.06e-07 7.3e-08 3.74e-07 9.71e-08 5.46e-08 1.33e-07 3.1e-07 2.33e-07 3.17e-08 5.75e-07 1.9e-07 1.74e-07 1.12e-07 1.58e-07 2.89e-07 2.55e-07 4.07e-08 3.43e-08 1.27e-07 2.43e-07 3.05e-08 4.54e-08 9.23e-08 5.86e-08 3.67e-08 3.34e-08 5.29e-07 4.83e-08 4.12e-08 3.81e-08 1.22e-08 1.19e-07 3.89e-09 4.74e-08
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -460784 1.25e-06 1.03e-06 8.9e-08 3.44e-07 9.82e-08 3.54e-07 7.99e-07 8.17e-08 6.92e-07 2.14e-07 1.25e-06 5.39e-07 1.46e-06 3.03e-07 5.22e-07 2.18e-07 3.69e-07 5.53e-07 2.65e-07 8.39e-08 1.92e-07 5.66e-07 4.01e-07 4.34e-08 1.47e-06 2.68e-07 3.68e-07 1.88e-07 4.33e-07 7.79e-07 4.55e-07 3.06e-08 4.74e-08 1.77e-07 3.35e-07 6.33e-08 7.97e-08 7.51e-08 8.06e-08 7.9e-08 4.41e-08 1.22e-06 1.65e-08 1.06e-07 4.91e-08 6.87e-08 8.46e-08 1.98e-09 5.04e-08