Genes within 1Mb (chr1:77419414:G:GA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.68e-01 0.00467 0.117 0.139 B L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 8.78e-01 0.013 0.0845 0.139 B L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.22e-01 0.0322 0.0905 0.139 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0155 0.084 0.139 B L1
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0374 0.112 0.139 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0313 0.117 0.139 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 2.56e-02 0.224 0.0994 0.139 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0929 0.0877 0.139 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 4.32e-01 0.0823 0.104 0.139 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0774 0.0665 0.139 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 8.10e-01 0.0216 0.0898 0.139 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0183 0.0685 0.139 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.67e-01 0.0361 0.063 0.139 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0958 0.0758 0.139 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 2.47e-01 0.0911 0.0784 0.139 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.50e-01 -0.031 0.0972 0.139 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 8.48e-04 -0.305 0.0901 0.139 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0474 0.0986 0.139 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0902 0.0607 0.139 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 2.22e-01 0.091 0.0744 0.139 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.10e-01 0.038 0.102 0.139 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0494 0.103 0.139 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 6.06e-02 -0.188 0.0996 0.139 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 3.09e-01 -0.115 0.113 0.14 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 1.05e-01 -0.166 0.102 0.14 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0465 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0866 0.0965 0.14 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 1.28e-01 0.171 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 4.54e-01 0.0807 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.117 0.14 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000391 0.126 0.14 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.08e-01 0.152 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.36e-01 0.00943 0.117 0.139 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 6.29e-01 0.0334 0.069 0.139 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.83e-01 -0.126 0.117 0.139 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.97e-01 0.0808 0.0951 0.139 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0675 0.0773 0.139 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0813 0.105 0.139 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.32e-02 0.205 0.106 0.139 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.53e-01 -0.125 0.109 0.139 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 1.85e-01 -0.162 0.121 0.137 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0716 0.0958 0.137 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.112 0.137 NK L1
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 7.09e-01 0.0445 0.119 0.137 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 8.02e-01 -0.02 0.0795 0.137 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 2.43e-01 -0.128 0.109 0.137 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0699 0.105 0.137 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.47e-01 0.0379 0.118 0.139 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.84e-01 0.0257 0.0936 0.139 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 9.22e-01 0.00919 0.0932 0.139 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 6.65e-01 0.0511 0.118 0.139 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.75e-02 0.155 0.0813 0.139 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0214 0.125 0.139 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0141 0.121 0.139 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 3.46e-01 -0.105 0.111 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0445 0.139 0.135 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 1.43e-01 -0.201 0.136 0.135 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.43e-01 0.152 0.13 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 6.62e-01 0.058 0.132 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0148 0.108 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 9.28e-01 0.0117 0.129 0.135 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.56e-01 0.0817 0.139 0.135 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 3.96e-01 0.105 0.123 0.135 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0591 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 9.74e-01 0.00368 0.112 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0337 0.13 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0231 0.106 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0745 0.119 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.15e-01 0.0458 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0198 0.101 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 8.42e-01 0.0251 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0799 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 1.44e-01 0.196 0.134 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.43e-01 0.0759 0.125 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0713 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0838 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 3.11e-01 0.128 0.126 0.136 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0888 0.107 0.136 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 2.45e-01 -0.141 0.121 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.12e-01 0.0378 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 1.58e-01 0.177 0.125 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0534 0.0945 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 4.68e-01 0.0825 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0031 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.92e-02 0.197 0.119 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 6.83e-01 -0.038 0.0931 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.29e-01 0.0114 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 2.16e-01 -0.143 0.115 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.35e-01 -0.157 0.132 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 1.23e-01 0.17 0.109 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0618 0.112 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0117 0.131 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.53e-01 0.185 0.129 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0821 0.11 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 1.76e-01 0.179 0.131 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 4.23e-01 -0.1 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00166 0.126 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 8.26e-02 0.197 0.113 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 8.50e-01 0.0236 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 3.48e-01 -0.115 0.122 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0269 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00787 0.109 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00994 0.0816 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.39e-01 0.0436 0.0928 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0568 0.0797 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 2.00e-01 0.0892 0.0694 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0868 0.0742 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.31e-02 0.143 0.0848 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 8.12e-02 0.202 0.116 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 1.02e-01 -0.142 0.0867 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0153 0.125 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 5.43e-01 0.0498 0.0817 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0284 0.0872 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0358 0.109 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.25e-01 0.0729 0.114 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 5.20e-01 0.0723 0.112 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0296 0.116 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.64e-01 0.137 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 3.99e-01 0.0976 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.26e-01 -0.103 0.104 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0261 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.36e-01 0.0425 0.126 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0107 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 6.34e-01 -0.051 0.107 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0578 0.119 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 4.94e-01 -0.077 0.112 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.42e-01 0.0597 0.0977 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 2.12e-01 0.144 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.17e-01 -0.167 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 1.99e-01 -0.141 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 1.67e-01 -0.159 0.115 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 5.48e-03 -0.297 0.106 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.11 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0606 0.0836 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 7.93e-01 -0.024 0.0913 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0597 0.11 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.51e-02 0.185 0.11 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 8.84e-01 0.0186 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0207 0.128 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 8.91e-01 -0.019 0.138 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 8.34e-01 0.0264 0.125 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 2.53e-01 0.133 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.95e-03 0.349 0.125 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.85e-01 0.0715 0.131 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0789 0.115 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 6.14e-01 0.0681 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 6.77e-02 -0.247 0.134 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0733 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 8.70e-01 0.015 0.0915 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.51e-01 0.116 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0531 0.126 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 4.32e-01 -0.105 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0663 0.109 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.37e-01 0.00967 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 2.11e-01 0.134 0.107 0.141 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.72e-01 0.0515 0.121 0.141 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 5.68e-01 0.0544 0.0951 0.141 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.04e-02 0.227 0.115 0.141 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 4.41e-01 0.0919 0.119 0.141 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.87e-01 -0.156 0.118 0.141 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 7.48e-01 -0.035 0.109 0.141 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 3.07e-02 -0.27 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 3.51e-02 -0.262 0.124 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 5.88e-01 0.0701 0.129 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0418 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.97e-01 0.0973 0.115 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.89e-01 0.0321 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 3.42e-01 0.11 0.115 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0569 0.126 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 5.92e-01 -0.056 0.104 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.08e-01 -0.148 0.118 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 6.49e-01 0.0547 0.12 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 1.18e-01 -0.149 0.0946 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 1.99e-02 -0.283 0.12 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00931 0.115 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0992 0.133 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0422 0.131 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0616 0.137 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 1.18e-01 -0.193 0.123 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0723 0.125 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.06e-01 0.0811 0.122 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.92e-01 0.00124 0.127 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.63e-01 0.00572 0.124 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0592 0.111 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.37e-01 -0.039 0.116 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 9.95e-01 0.000732 0.119 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 7.99e-01 0.0268 0.105 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.53e-01 0.0653 0.11 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0447 0.12 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 4.05e-01 -0.144 0.172 0.137 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0758 0.152 0.137 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 1.30e-01 -0.131 0.0858 0.137 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0703 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 9.97e-01 0.000567 0.131 0.137 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 1.14e-02 -0.355 0.138 0.137 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.11e-01 -0.262 0.163 0.137 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.46e-02 -0.289 0.142 0.137 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00562 0.129 0.139 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0365 0.12 0.139 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.90e-02 -0.182 0.0997 0.139 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0624 0.104 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00309 0.11 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0728 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0032 0.121 0.139 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.51e-03 -0.283 0.0924 0.139 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.39e-01 0.0419 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 3.22e-01 -0.112 0.113 0.139 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 6.27e-01 0.0604 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 1.69e-01 -0.106 0.0765 0.139 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0169 0.108 0.139 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0922 0.12 0.139 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0467 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0703 0.133 0.146 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 1.41e-01 -0.168 0.113 0.146 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 3.38e-01 0.117 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0891 0.1 0.146 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.47e-01 0.112 0.118 0.146 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 3.32e-01 0.0937 0.0963 0.146 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0369 0.12 0.146 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0443 0.132 0.146 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 6.04e-01 0.063 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 8.60e-01 0.0212 0.12 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 5.09e-01 -0.05 0.0756 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.24e-01 0.0427 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.32e-02 0.234 0.109 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 1.41e-01 -0.13 0.0882 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0204 0.113 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 2.77e-01 0.133 0.122 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0764 0.112 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0592 0.128 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 4.03e-01 0.0774 0.0923 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 4.76e-02 -0.231 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 7.18e-02 -0.2 0.111 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0728 0.0957 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 6.64e-01 0.0527 0.121 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.10e-01 0.198 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0388 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 3.49e-01 -0.138 0.147 0.145 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0102 0.139 0.145 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 1.22e-01 0.229 0.147 0.145 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 9.55e-01 0.00632 0.111 0.145 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 1.60e-01 0.2 0.142 0.145 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 4.15e-01 -0.112 0.137 0.145 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0221 0.145 0.145 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0956 0.126 0.145 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 3.00e-01 -0.139 0.134 0.14 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 1.47e-01 0.161 0.111 0.14 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 9.98e-01 0.000371 0.119 0.14 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 6.71e-01 -0.052 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 4.85e-01 -0.066 0.0944 0.14 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0708 0.114 0.14 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0722 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 5.20e-02 -0.233 0.119 0.14 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.09e-02 0.229 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 2.77e-01 -0.105 0.0965 0.138 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0303 0.117 0.138 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.61e-01 0.11 0.12 0.138 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.138 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0673 0.116 0.138 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 6.64e-01 0.0547 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0628 0.118 0.138 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 1.38e-01 -0.197 0.132 0.136 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0504 0.136 0.136 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 1.36e-01 -0.215 0.143 0.136 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 7.53e-02 -0.166 0.0929 0.136 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 3.02e-01 0.137 0.132 0.136 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 6.11e-01 0.0658 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0764 0.134 0.136 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.64e-01 -0.045 0.149 0.136 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.94e-01 0.139 0.132 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0822 0.119 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0912 0.0947 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 4.86e-01 0.0871 0.125 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 9.61e-01 0.00499 0.103 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 1.82e-01 -0.158 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 3.65e-01 0.111 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.28e-01 0.172 0.112 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 2.42e-01 -0.11 0.0941 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0992 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0218 0.0958 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 8.90e-01 0.0173 0.125 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 9.70e-01 0.00336 0.0901 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 7.78e-01 0.0326 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 8.98e-01 0.0162 0.126 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 1.17e-02 0.292 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0544 0.0904 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0039 0.12 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 4.76e-01 0.0523 0.0732 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 3.83e-01 -0.102 0.116 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 2.23e-01 0.118 0.0967 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0832 0.0858 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0113 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.66e-02 0.202 0.113 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0529 0.111 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 7.36e-01 0.0423 0.125 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 3.20e-01 0.0827 0.083 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0829 0.12 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0507 0.115 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -469099 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0323 0.0956 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0943 0.115 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 7.14e-01 0.0437 0.119 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -585140 sc-eQTL 1.75e-01 -0.166 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -264005 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0693 0.124 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -340438 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0145 0.0976 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 199984 sc-eQTL 2.69e-01 -0.122 0.11 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 137395 sc-eQTL 7.70e-01 0.0351 0.12 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -559696 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0623 0.0832 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -559761 sc-eQTL 1.53e-01 -0.149 0.104 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -360210 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0914 0.11 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 199984 eQTL 9.01e-07 -0.116 0.0236 0.00889 0.0 0.177
ENSG00000154027 AK5 137395 eQTL 6e-06 -0.11 0.0242 0.0 0.0 0.177
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -470125 eQTL 0.014 -0.0693 0.0281 0.0 0.0 0.177


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 199984 1.88e-05 4.89e-06 1.68e-06 3.08e-06 8.7e-07 4.07e-06 7.3e-06 4.28e-07 3.73e-06 1.47e-06 4.99e-06 2.05e-06 9.33e-06 2.13e-06 1.35e-06 2.07e-06 1.88e-06 2.75e-06 1.33e-06 1.15e-06 2.68e-06 4.83e-06 5.5e-06 1.05e-06 6.16e-06 1.15e-06 1.57e-06 1.81e-06 6.95e-06 5.42e-06 2.13e-06 9.48e-08 5.51e-07 2.38e-06 2.15e-06 1.59e-06 7.8e-07 4.74e-07 1.35e-06 3.63e-07 2.81e-07 9.44e-06 4.65e-06 1.85e-07 3.64e-07 3.93e-07 6.73e-07 2.18e-07 2.24e-07
ENSG00000154027 AK5 137395 4.93e-05 9.28e-06 4.47e-06 3.81e-06 1.74e-06 5.8e-06 9.8e-06 8.5e-07 4.49e-06 2.88e-06 8.06e-06 3.37e-06 1.17e-05 2.39e-06 1.47e-06 3.81e-06 4.38e-06 3.85e-06 2.19e-06 9.7e-07 2.51e-06 7.92e-06 8.88e-06 1.62e-06 1.14e-05 2.07e-06 2.31e-06 1.73e-06 1.13e-05 8.01e-06 2.59e-06 2.7e-07 6.66e-07 2.93e-06 2.35e-06 2.7e-06 9.86e-07 4.36e-07 1.06e-06 5.64e-07 2.26e-07 1.7e-05 6.45e-06 1.56e-07 7.65e-07 1.1e-06 9.75e-07 2.26e-07 1.74e-07
ENSG00000162613 \N -559696 1.4e-06 7.58e-07 3.45e-07 4.88e-07 1.07e-07 6.01e-07 1.08e-06 7.56e-08 8.08e-07 1.65e-07 1.24e-06 4.03e-07 2.1e-06 2.06e-07 4.3e-07 2.83e-07 2.34e-07 4.27e-07 1.97e-07 8.52e-08 2.05e-07 6.48e-07 6.93e-07 4.25e-08 1.28e-06 1.65e-07 2.57e-07 2.13e-07 9.32e-07 1.11e-06 4.34e-07 2.96e-08 5.68e-08 6e-07 4.08e-07 3.59e-07 7.63e-08 6.89e-08 7.56e-08 8.59e-09 5.42e-08 1.15e-06 4.85e-07 7.32e-09 3.61e-08 9.77e-08 7.52e-08 2.23e-09 4.79e-08