logo

Genes within 1Mb (chr1:77410750:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.50e-01 0.25 0.173 0.064 B L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 8.36e-01 -0.026 0.126 0.064 B L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.01e-01 0.0167 0.135 0.064 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 3.63e-01 -0.114 0.125 0.064 B L1
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 2.41e-02 -0.374 0.164 0.064 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.75e-02 -0.412 0.172 0.064 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.64e-01 -0.11 0.149 0.064 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00994 0.131 0.064 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 6.21e-02 0.29 0.155 0.064 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0287 0.0995 0.064 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.134 0.064 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 2.50e-01 0.118 0.102 0.064 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 5.41e-01 0.0575 0.0939 0.064 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.25e-01 -0.138 0.113 0.064 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00643 0.117 0.064 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.99e-01 0.109 0.16 0.064 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.16e-01 0.24 0.152 0.064 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0108 0.163 0.064 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 4.70e-01 0.0727 0.101 0.064 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.42e-01 0.0246 0.123 0.064 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 3.66e-01 0.152 0.168 0.064 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0565 0.17 0.064 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 1.65e-01 0.23 0.165 0.064 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.75e-03 0.514 0.18 0.065 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0903 0.166 0.065 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.81e-01 0.0291 0.194 0.065 DC L1
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 9.36e-01 0.0127 0.157 0.065 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 6.06e-01 -0.094 0.182 0.065 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 8.57e-01 0.0315 0.175 0.065 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.99e-01 0.0483 0.19 0.065 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00352 0.205 0.065 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.41e-01 -0.12 0.195 0.065 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0501 0.175 0.064 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.24e-01 -0.158 0.102 0.064 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.33e-01 0.209 0.175 0.064 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 7.53e-01 0.0447 0.142 0.064 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0725 0.115 0.064 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0314 0.157 0.064 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0759 0.159 0.064 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0953 0.163 0.064 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 3.56e-01 0.165 0.179 0.064 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 4.15e-01 0.115 0.141 0.064 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 3.30e-01 0.161 0.165 0.064 NK L1
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.27e-11 1.13 0.157 0.064 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.117 0.064 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0515 0.161 0.064 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.50e-01 0.0924 0.154 0.064 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.77e-01 0.129 0.181 0.064 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.86e-01 -0.154 0.144 0.064 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 3.09e-01 0.146 0.143 0.064 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.94e-03 0.557 0.178 0.064 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0204 0.126 0.064 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0368 0.193 0.064 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.90e-02 -0.406 0.185 0.064 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0304 0.171 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 2.26e-01 -0.25 0.206 0.064 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.43e-01 0.299 0.203 0.064 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 5.52e-01 0.116 0.194 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 5.23e-01 -0.126 0.197 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 5.55e-01 0.0949 0.16 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.64e-02 -0.457 0.189 0.064 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.51e-02 -0.344 0.205 0.064 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 2.75e-01 -0.201 0.184 0.064 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 9.28e-01 0.0169 0.188 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000974 0.17 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0472 0.197 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 4.33e-02 -0.325 0.16 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 2.28e-01 -0.217 0.18 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.46e-01 -0.276 0.189 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.65e-01 0.00786 0.179 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0323 0.154 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 3.04e-02 0.402 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00858 0.181 0.062 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.29e-01 0.0431 0.2 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.76e-01 0.0289 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 5.18e-01 -0.117 0.181 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.63e-01 -0.261 0.186 0.062 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.06e-01 -0.156 0.187 0.062 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 1.87e-01 -0.21 0.159 0.062 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.15e-01 0.281 0.178 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.14e-01 -0.238 0.15 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.92e-01 -0.195 0.184 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 6.92e-01 0.0553 0.139 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0863 0.167 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 3.24e-01 -0.18 0.182 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0975 0.176 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 6.42e-01 -0.064 0.137 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0341 0.189 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 7.83e-01 0.0471 0.171 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.35e-01 -0.232 0.194 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 5.68e-01 -0.093 0.163 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 1.85e-01 -0.22 0.165 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.98e-01 0.201 0.193 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 1.54e-01 -0.273 0.19 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 2.29e-01 0.196 0.162 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.93e-01 -0.273 0.209 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.81e-02 -0.435 0.197 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.21e-01 0.0455 0.201 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.23e-01 0.278 0.18 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 4.14e-01 -0.162 0.198 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.44e-01 0.0636 0.195 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00174 0.203 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 3.01e-02 0.355 0.163 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.71e-01 -0.168 0.122 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.12e-01 0.174 0.139 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 2.58e-01 0.136 0.12 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 2.04e-01 0.133 0.104 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.35e-02 -0.2 0.111 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 6.05e-01 0.0665 0.128 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 8.23e-02 0.301 0.173 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.48e-02 0.24 0.129 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.64e-01 0.208 0.186 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 5.96e-01 0.0648 0.122 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0033 0.13 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 5.60e-01 0.0948 0.162 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.14e-01 -0.14 0.171 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0371 0.166 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0492 0.171 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0545 0.181 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.20e-01 0.265 0.17 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.70e-01 0.00589 0.155 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.64e-01 0.202 0.18 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.16e-01 -0.121 0.186 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.13e-01 -0.161 0.196 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.33e-01 0.0828 0.173 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00166 0.193 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.19e-03 0.585 0.178 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0772 0.158 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0525 0.187 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.92e-01 -0.183 0.173 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 4.33e-01 0.139 0.178 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.12e-02 0.351 0.171 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 4.29e-01 -0.127 0.161 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.59e-01 0.185 0.164 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 2.71e-01 -0.138 0.125 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 3.02e-01 0.141 0.136 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.30e-01 0.197 0.164 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0747 0.166 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.51e-01 0.0962 0.161 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.68e-02 -0.361 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 8.07e-01 0.0449 0.183 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0807 0.198 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0498 0.179 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.05e-01 0.0412 0.167 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00689 0.183 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.00e-01 0.239 0.186 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.04e-01 -0.11 0.164 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 7.67e-01 0.0663 0.223 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 8.84e-02 0.381 0.223 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.92e-01 0.00211 0.213 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 3.70e-01 0.136 0.151 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0932 0.206 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 6.35e-01 0.0986 0.208 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.43e-02 0.442 0.218 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0791 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000842 0.199 0.061 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0998 0.174 0.061 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.52e-01 0.0368 0.197 0.061 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.39e-01 0.229 0.154 0.061 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.06e-01 0.0225 0.19 0.061 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.58e-02 -0.343 0.192 0.061 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.16e-01 -0.239 0.192 0.061 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0114 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.74e-01 -0.136 0.189 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0803 0.189 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0205 0.195 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 4.79e-03 0.471 0.165 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0288 0.173 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 4.90e-01 -0.125 0.181 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.42e-01 -0.204 0.174 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 8.68e-01 0.0305 0.184 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.90e-01 0.162 0.152 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 4.25e-01 0.138 0.172 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 3.08e-11 1.11 0.158 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.20e-01 0.0317 0.139 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0475 0.179 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.60e-01 0.189 0.167 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.45e-02 0.468 0.19 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0965 0.189 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.96e-01 0.206 0.197 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.20e-10 1.09 0.161 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 4.39e-01 -0.14 0.18 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.71e-01 0.194 0.175 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0896 0.183 0.064 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 2.50e-01 0.208 0.18 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.67e-01 0.0698 0.162 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 7.49e-01 0.0543 0.17 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 1.67e-11 1.11 0.155 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 3.10e-01 0.155 0.153 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 4.23e-01 -0.129 0.16 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.41e-01 -0.107 0.175 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.81e-01 0.163 0.231 0.081 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.78e-01 0.0846 0.203 0.081 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 7.38e-01 0.039 0.116 0.081 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 1.64e-01 0.267 0.191 0.081 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 3.57e-01 -0.161 0.175 0.081 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.68e-01 -0.211 0.189 0.081 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.89e-01 0.12 0.221 0.081 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 2.64e-01 -0.217 0.193 0.081 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.27e-01 -0.294 0.192 0.065 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0271 0.178 0.065 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 3.13e-01 -0.151 0.15 0.065 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 3.76e-04 0.543 0.15 0.065 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 7.25e-01 0.0575 0.163 0.065 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0244 0.186 0.065 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.15e-01 0.118 0.181 0.065 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 3.62e-01 0.128 0.141 0.065 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 3.96e-01 0.155 0.182 0.064 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 5.87e-01 0.0892 0.164 0.064 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 4.92e-01 0.124 0.18 0.064 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 8.48e-02 0.192 0.111 0.064 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.36e-01 0.0127 0.158 0.064 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0542 0.175 0.064 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.72e-01 0.129 0.179 0.064 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.97e-01 0.296 0.229 0.051 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 3.13e-01 -0.199 0.197 0.051 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 9.85e-01 0.00397 0.212 0.051 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 4.59e-01 0.129 0.174 0.051 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0716 0.205 0.051 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 5.23e-01 -0.107 0.167 0.051 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0348 0.208 0.051 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 1.61e-01 0.32 0.228 0.051 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.77e-01 0.117 0.21 0.051 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 9.57e-01 0.0097 0.18 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 1.91e-01 -0.148 0.113 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0237 0.181 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 1.78e-01 -0.223 0.165 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00415 0.133 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0798 0.169 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 7.49e-01 0.0585 0.183 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 4.82e-01 -0.118 0.168 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.32e-01 -0.152 0.193 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.76e-02 -0.254 0.138 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 1.78e-01 0.238 0.176 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 1.56e-01 0.239 0.168 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 9.38e-01 0.0113 0.145 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 9.77e-01 0.0053 0.183 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.63e-01 0.00866 0.187 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0109 0.182 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 7.12e-01 0.0877 0.237 0.055 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.70e-01 -0.247 0.223 0.055 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 1.45e-02 0.579 0.234 0.055 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 2.04e-02 0.412 0.176 0.055 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0135 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 7.19e-01 0.0793 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.05e-01 -0.194 0.232 0.055 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 4.34e-01 -0.159 0.202 0.055 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.66e-01 0.283 0.204 0.062 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.32e-01 -0.203 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0441 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 1.86e-01 0.247 0.186 0.062 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 6.58e-01 0.064 0.144 0.062 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.22e-01 0.0391 0.174 0.062 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 7.67e-01 0.0567 0.191 0.062 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 3.81e-01 -0.161 0.184 0.062 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0593 0.19 0.066 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 3.09e-01 0.147 0.144 0.066 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.97e-01 0.182 0.174 0.066 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 7.25e-01 0.063 0.179 0.066 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 4.43e-01 -0.117 0.152 0.066 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 2.53e-01 0.199 0.173 0.066 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 5.66e-01 -0.108 0.187 0.066 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 6.52e-01 0.0792 0.175 0.066 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.77e-02 0.505 0.211 0.056 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0116 0.22 0.056 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 8.11e-01 0.0557 0.233 0.056 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0868 0.151 0.056 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 3.47e-01 -0.201 0.213 0.056 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 3.22e-01 -0.206 0.207 0.056 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.99e-01 0.277 0.215 0.056 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0609 0.241 0.056 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 3.83e-01 -0.187 0.214 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 4.35e-01 0.142 0.182 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 6.23e-01 0.0713 0.145 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 5.37e-01 0.118 0.19 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 2.49e-01 -0.181 0.157 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 3.24e-01 -0.178 0.18 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 1.59e-02 -0.449 0.185 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 1.58e-01 -0.244 0.172 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 3.65e-01 -0.131 0.144 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 1.65e-01 0.244 0.175 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 2.47e-01 -0.163 0.14 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 1.49e-01 -0.264 0.182 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 6.69e-01 0.0567 0.132 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 4.27e-01 -0.135 0.169 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0406 0.185 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 4.85e-01 -0.12 0.171 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 8.35e-01 0.0278 0.133 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0988 0.18 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 5.34e-02 -0.211 0.109 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 3.39e-01 0.167 0.174 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0325 0.145 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0422 0.129 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0124 0.166 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.171 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 5.69e-01 -0.095 0.167 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 8.70e-02 0.311 0.181 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0688 0.121 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 6.44e-01 0.0803 0.174 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 8.57e-02 0.287 0.166 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -477763 sc-eQTL 9.91e-01 0.00161 0.139 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 9.05e-01 0.0199 0.167 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0387 0.173 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -593804 sc-eQTL 7.02e-01 -0.068 0.177 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -272669 sc-eQTL 3.26e-01 0.178 0.181 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -349102 sc-eQTL 3.80e-01 0.125 0.142 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 191320 sc-eQTL 2.93e-01 0.17 0.161 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 128731 sc-eQTL 7.73e-12 1.14 0.157 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -568360 sc-eQTL 7.58e-01 0.0375 0.122 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -568425 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0651 0.153 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -368874 sc-eQTL 2.87e-01 0.172 0.161 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 191320 eQTL 0.0384 0.0755 0.0364 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000154027 AK5 128731 eQTL 5.46e-19 0.326 0.0359 0.0 0.0 0.0682

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK 191320 9.72e-06 1.33e-05 5.92e-06 7.65e-06 2.38e-06 5.16e-06 1.64e-05 1.43e-06 9.65e-06 4.76e-06 1.1e-05 5.74e-06 1.64e-05 3.88e-06 5.1e-06 6.54e-06 1.02e-05 7.6e-06 3.04e-06 1.69e-06 6.18e-06 8.15e-06 1.23e-05 3.28e-06 1.78e-05 5.08e-06 3.95e-06 3.31e-06 1.3e-05 1.05e-05 4.57e-06 6.26e-07 7.99e-07 3.24e-06 5.42e-06 2.81e-06 1.42e-06 1.95e-06 1.6e-06 1.11e-06 7.14e-07 1.51e-05 2.39e-06 5.27e-07 7.99e-07 2.44e-06 1.06e-06 8.47e-07 4.47e-07
ENSG00000154027 AK5 128731 1.14e-05 1.68e-05 8.06e-06 8.95e-06 2.96e-06 6.19e-06 2.27e-05 2.12e-06 1.18e-05 5.41e-06 1.49e-05 7.33e-06 2.44e-05 3.72e-06 5.88e-06 7.26e-06 1.47e-05 1.04e-05 3.78e-06 2.78e-06 7.43e-06 1.18e-05 1.84e-05 3.81e-06 2.61e-05 5.31e-06 5.79e-06 5.04e-06 1.65e-05 1.42e-05 6.28e-06 5.42e-07 1.26e-06 3.69e-06 6.68e-06 3.9e-06 1.89e-06 2.33e-06 2.01e-06 2.1e-06 9.55e-07 1.99e-05 2.7e-06 4.41e-07 1.13e-06 2.97e-06 1.72e-06 1.41e-06 6.66e-07