logo

Genes within 1Mb (chr1:77394196:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.46e-02 0.189 0.0979 0.222 B L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.95e-01 0.038 0.0712 0.222 B L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 1.51e-01 -0.11 0.076 0.222 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 5.65e-01 0.0408 0.0708 0.222 B L1
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0659 0.0943 0.222 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 8.09e-02 -0.172 0.0981 0.222 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.61e-01 0.00414 0.0848 0.222 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.50e-03 0.204 0.0728 0.222 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.08e-01 0.145 0.0896 0.222 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 6.95e-01 0.0226 0.0575 0.222 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.02e-01 -0.052 0.0774 0.222 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 1.59e-03 -0.185 0.0577 0.222 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0367 0.0542 0.222 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0202 0.0655 0.222 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0408 0.0677 0.222 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 2.42e-01 0.1 0.0855 0.222 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.73e-01 0.111 0.0813 0.222 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 1.37e-01 -0.129 0.0866 0.222 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 9.25e-03 -0.139 0.053 0.222 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0566 0.0658 0.222 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 8.28e-01 0.0195 0.09 0.222 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 1.58e-01 -0.128 0.0902 0.222 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 3.29e-01 0.0865 0.0885 0.222 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 3.34e-01 0.0958 0.0989 0.227 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 4.41e-01 -0.069 0.0893 0.227 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.88e-01 0.0147 0.105 0.227 DC L1
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0406 0.0844 0.227 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.29e-02 -0.182 0.0974 0.227 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 2.13e-01 0.117 0.0939 0.227 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.67e-02 0.181 0.102 0.227 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.11 0.227 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0449 0.105 0.227 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.47e-02 0.196 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 3.68e-02 -0.125 0.0596 0.222 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 6.51e-02 0.189 0.102 0.222 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 8.11e-01 0.0199 0.0831 0.222 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 6.72e-01 0.0286 0.0675 0.222 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.35e-02 0.226 0.0906 0.222 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.65e-01 0.00413 0.093 0.222 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 1.20e-02 0.238 0.0941 0.222 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 4.23e-01 0.085 0.106 0.221 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 4.49e-02 0.167 0.0826 0.221 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00122 0.0978 0.221 NK L1
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0831 0.104 0.221 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.11e-01 0.07 0.069 0.221 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0719 0.0949 0.221 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 2.15e-01 -0.113 0.0911 0.221 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.35e-01 0.153 0.102 0.222 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.96e-02 -0.19 0.0808 0.222 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.42e-01 0.0497 0.0813 0.222 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0826 0.103 0.222 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0699 0.0715 0.222 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.06e-01 -0.176 0.109 0.222 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00856 0.106 0.222 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0946 0.0968 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.70e-01 0.164 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0992 0.118 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 4.45e-01 0.0857 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 5.54e-01 0.0676 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00835 0.0926 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.41e-02 -0.197 0.11 0.235 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.67e-01 -0.02 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 2.06e-01 0.134 0.106 0.235 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.69e-01 0.146 0.106 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 3.80e-01 0.0843 0.0959 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0218 0.111 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 2.99e-01 0.0947 0.0909 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 7.83e-01 0.0282 0.102 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.60e-02 -0.257 0.106 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0395 0.101 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 3.81e-01 0.0763 0.0869 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 2.80e-01 0.115 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 9.79e-01 0.00272 0.103 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 7.83e-01 0.0313 0.114 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 8.04e-01 0.0262 0.105 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0938 0.103 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0931 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.77e-01 0.00307 0.107 0.224 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.57e-01 0.0404 0.0907 0.224 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 9.29e-02 0.174 0.103 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0214 0.0873 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 9.09e-02 -0.18 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0315 0.0808 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0362 0.0971 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 8.20e-01 0.0241 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 2.33e-01 0.122 0.102 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 2.89e-02 0.173 0.0788 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.18e-01 0.153 0.0972 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.21e-01 -0.111 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.27e-01 -0.142 0.0927 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0771 0.095 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 5.05e-02 -0.216 0.11 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.00e-02 -0.186 0.109 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.20e-04 0.32 0.0907 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0663 0.119 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.113 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.114 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 1.98e-01 -0.132 0.102 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 2.84e-01 0.121 0.112 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0569 0.111 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0191 0.115 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 6.67e-02 0.173 0.0937 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0355 0.0705 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0678 0.0801 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 3.94e-03 -0.197 0.0676 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0279 0.0602 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00615 0.0643 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.73e-01 0.0311 0.0737 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.46e-01 0.0604 0.1 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 8.07e-02 0.131 0.0745 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 9.11e-01 0.012 0.108 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 3.62e-05 -0.285 0.0676 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0945 0.0747 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.59e-01 0.0288 0.0936 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0858 0.0984 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 6.98e-01 0.0375 0.0963 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0556 0.0993 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.84e-01 0.0577 0.105 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 2.82e-02 -0.217 0.098 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.82e-01 -0.12 0.0894 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.92e-02 0.184 0.104 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0532 0.108 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 4.16e-01 0.0871 0.107 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 4.20e-01 0.0763 0.0943 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 1.95e-01 -0.137 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 8.54e-02 -0.171 0.0987 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.34e-01 0.0412 0.0863 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 6.47e-01 0.0467 0.102 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.76e-01 0.0148 0.0944 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.75e-03 0.265 0.0951 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.06e-02 0.193 0.098 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 7.88e-01 0.0249 0.0924 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0178 0.0942 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 9.89e-03 -0.184 0.0708 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 8.34e-01 0.0165 0.0784 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.72e-01 -0.129 0.0939 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 4.34e-02 -0.192 0.0944 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00593 0.0925 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0667 0.108 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 7.42e-01 -0.036 0.109 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 2.05e-01 -0.149 0.117 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 2.03e-02 -0.246 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0186 0.0993 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0665 0.109 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0824 0.111 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 3.43e-01 0.0927 0.0974 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 2.63e-01 -0.138 0.123 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.38e-01 0.183 0.123 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 2.52e-02 -0.262 0.116 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 5.94e-01 0.0446 0.0834 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 7.23e-02 -0.204 0.113 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0748 0.115 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0522 0.122 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.60e-01 0.0438 0.0992 0.215 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 7.72e-01 0.0312 0.108 0.219 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 6.98e-02 -0.171 0.0937 0.219 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.85e-01 0.093 0.107 0.219 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0338 0.0839 0.219 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 9.94e-02 -0.169 0.102 0.219 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 2.59e-01 -0.119 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.44e-01 0.0484 0.105 0.219 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0477 0.096 0.219 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 6.20e-01 0.0555 0.112 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.55e-01 -0.066 0.112 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0992 0.115 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 9.27e-01 0.00907 0.0995 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 7.48e-01 0.0329 0.102 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 9.50e-01 0.00667 0.107 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0924 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 4.93e-01 0.0757 0.11 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 6.14e-01 0.0462 0.0914 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0155 0.103 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0742 0.105 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.14e-01 0.131 0.0829 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0275 0.107 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0952 0.1 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 4.56e-01 0.0867 0.116 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.59e-01 0.161 0.114 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.66e-01 -0.108 0.119 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0895 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.65e-01 0.0985 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.12e-01 0.0392 0.106 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.56e-02 -0.184 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 7.68e-01 0.0323 0.109 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0975 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0495 0.103 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 3.06e-01 -0.107 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.91e-01 0.0793 0.0923 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.70e-01 -0.133 0.0966 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0026 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0763 0.145 0.237 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 6.89e-01 0.0511 0.128 0.237 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 7.95e-01 -0.019 0.0729 0.237 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.27e-01 0.184 0.119 0.237 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 1.47e-01 -0.159 0.109 0.237 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.119 0.237 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 1.27e-01 0.211 0.137 0.237 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 4.64e-02 0.241 0.12 0.237 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.23e-02 0.214 0.109 0.22 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.46e-01 -0.148 0.102 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0943 0.0857 0.22 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 6.05e-01 0.0459 0.0886 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0222 0.0937 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0891 0.107 0.22 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.87e-01 0.0148 0.104 0.22 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 8.24e-01 0.0179 0.0808 0.22 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 9.65e-01 0.00465 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 2.40e-01 0.113 0.096 0.222 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0594 0.106 0.222 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 4.10e-01 -0.054 0.0654 0.222 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.60e-02 0.193 0.0915 0.222 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 7.20e-02 -0.184 0.102 0.222 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0177 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0265 0.12 0.212 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 4.41e-01 0.0792 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0599 0.11 0.212 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0357 0.0904 0.212 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.58e-02 -0.256 0.105 0.212 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 5.78e-01 0.0484 0.0868 0.212 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 6.43e-01 0.0503 0.108 0.212 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 5.12e-02 -0.231 0.118 0.212 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 9.72e-01 0.00383 0.109 0.212 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.20e-01 0.163 0.104 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.33e-02 -0.162 0.0649 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 4.92e-01 0.0722 0.105 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 9.81e-01 0.0023 0.0961 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 6.90e-01 0.0308 0.0771 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 2.44e-01 0.114 0.0978 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.35e-01 0.00862 0.106 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.76e-04 0.332 0.0949 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 2.80e-01 0.121 0.112 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0519 0.0807 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 1.32e-02 0.253 0.101 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0972 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 6.06e-01 0.0432 0.0837 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 2.06e-02 0.244 0.105 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0274 0.108 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.54e-01 0.0624 0.105 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.28e-01 0.2 0.131 0.227 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 9.01e-02 -0.211 0.124 0.227 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.133 0.227 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 2.08e-01 -0.125 0.0992 0.227 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 4.92e-02 0.25 0.126 0.227 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.56e-01 0.174 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0783 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 5.73e-01 0.0638 0.113 0.227 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 4.10e-02 0.234 0.114 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0951 0.22 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 9.77e-01 0.00292 0.102 0.22 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.98e-01 0.0886 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0945 0.0807 0.22 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.93e-01 0.127 0.0971 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 3.82e-02 0.221 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.56e-01 0.046 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0352 0.111 0.217 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0521 0.0845 0.217 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.97e-01 0.0132 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0488 0.105 0.217 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 2.19e-01 -0.11 0.0888 0.217 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 3.55e-01 0.0941 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 6.28e-01 0.0532 0.11 0.217 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00173 0.103 0.217 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 3.16e-01 0.115 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.57e-01 -0.166 0.116 0.229 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 3.71e-01 0.111 0.124 0.229 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00481 0.0809 0.229 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00731 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0479 0.111 0.229 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 9.72e-02 0.191 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00899 0.129 0.229 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.114 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 2.90e-02 0.225 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 8.29e-01 0.0179 0.0827 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 7.83e-01 0.03 0.109 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 1.78e-01 0.121 0.0894 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 6.56e-01 0.0458 0.103 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 2.46e-03 -0.321 0.105 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0629 0.0985 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 2.46e-01 0.0955 0.082 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 8.53e-02 0.174 0.101 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 5.43e-01 0.0494 0.0811 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.43e-02 -0.182 0.105 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0439 0.0763 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0155 0.0977 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 4.72e-01 -0.077 0.107 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00831 0.0988 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 1.45e-03 0.242 0.0749 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.05e-01 0.17 0.104 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.99e-02 -0.148 0.0632 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 4.92e-02 0.2 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 6.52e-01 0.0382 0.0848 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 7.12e-01 0.0278 0.0752 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.58e-02 0.233 0.0956 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0532 0.0998 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 6.07e-03 0.265 0.0958 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 1.13e-01 0.168 0.106 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0968 0.0704 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 5.92e-01 0.0546 0.102 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0114 0.098 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -494317 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0877 0.0811 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 1.12e-01 0.155 0.0973 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 2.01e-02 0.234 0.1 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -610358 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00757 0.104 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -289223 sc-eQTL 5.16e-01 0.07 0.107 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -365656 sc-eQTL 3.08e-02 0.182 0.0835 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 174766 sc-eQTL 8.68e-01 0.0159 0.0957 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 112177 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0678 0.104 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -584914 sc-eQTL 3.06e-01 0.0739 0.0719 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -584979 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0773 0.0904 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -385428 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0751 0.0954 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000077254 \N -365656 1.24e-06 7.46e-07 1e-07 4.29e-07 1.06e-07 2.46e-07 6.29e-07 1.55e-07 6.53e-07 2.82e-07 1.02e-06 4.62e-07 1.23e-06 1.57e-07 2.96e-07 2.83e-07 3.69e-07 4.11e-07 2.42e-07 1.55e-07 1.92e-07 5.17e-07 4.2e-07 1.76e-07 1.25e-06 2.54e-07 2.62e-07 2.71e-07 4.88e-07 7.6e-07 4.61e-07 8.25e-08 4.28e-08 1.64e-07 3.38e-07 1.49e-07 1.1e-07 6.97e-08 4.55e-08 5.12e-08 4.4e-08 9.49e-07 2.75e-08 2.05e-08 1.01e-07 1.29e-08 7.25e-08 3.3e-09 5.35e-08
ENSG00000154027 \N 112177 4.68e-06 5.13e-06 7.84e-07 2.61e-06 1.08e-06 1.35e-06 4.25e-06 9.52e-07 4.94e-06 2.01e-06 5.34e-06 3.52e-06 7.72e-06 2.22e-06 1.35e-06 2.63e-06 2.05e-06 2.88e-06 1.43e-06 9.5e-07 2.41e-06 4.79e-06 3.78e-06 1.57e-06 6.41e-06 1.39e-06 2.25e-06 1.79e-06 4.19e-06 4.26e-06 2.87e-06 4.71e-07 7.52e-07 1.85e-06 2.01e-06 9.03e-07 9.13e-07 4.91e-07 1.19e-06 3.81e-07 2.54e-07 6.32e-06 3.98e-07 1.89e-07 3.82e-07 3.93e-07 8.59e-07 2.07e-07 1.77e-07
ENSG00000180488 \N -385428 1.04e-06 6.46e-07 1.03e-07 3.92e-07 1.08e-07 2.08e-07 5.9e-07 1.38e-07 5.3e-07 2.37e-07 8.58e-07 4.03e-07 1.03e-06 1.52e-07 2.35e-07 2.1e-07 2.77e-07 3.74e-07 1.93e-07 1.28e-07 1.91e-07 4.11e-07 3.77e-07 1.32e-07 9.82e-07 2.39e-07 2.43e-07 2.44e-07 4.06e-07 6.42e-07 4.08e-07 6.04e-08 5.68e-08 1.4e-07 3.36e-07 1.16e-07 9.9e-08 6.31e-08 4.04e-08 5.64e-08 2.81e-08 7.54e-07 1.65e-08 1.55e-08 8.43e-08 1.91e-08 9.68e-08 2.94e-09 5.69e-08