logo

Genes within 1Mb (chr1:77376522:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 5.90e-03 -0.277 0.0997 0.182 B L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0158 0.0733 0.182 B L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 8.16e-02 0.136 0.078 0.182 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0835 0.0726 0.182 B L1
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0967 0.182 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0359 0.102 0.182 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.77e-01 0.0487 0.0872 0.182 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 1.85e-01 -0.101 0.076 0.182 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 9.16e-02 -0.155 0.0915 0.182 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.09e-01 0.00669 0.0588 0.182 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.97e-01 -0.102 0.0788 0.182 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0951 0.06 0.182 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00597 0.0555 0.182 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 5.75e-02 -0.127 0.0664 0.182 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00726 0.0693 0.182 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 9.94e-02 -0.142 0.0858 0.182 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 7.92e-02 -0.144 0.0817 0.182 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0442 0.0876 0.182 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0521 0.0541 0.182 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 3.00e-02 0.143 0.0656 0.182 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.66e-01 0.0392 0.0906 0.182 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 7.55e-02 0.162 0.0906 0.182 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0359 0.0893 0.182 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0727 0.102 0.182 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.70e-01 0.00347 0.0918 0.182 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.86e-01 0.142 0.107 0.182 DC L1
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 2.08e-01 0.109 0.0863 0.182 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0241 0.101 0.182 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0551 0.0966 0.182 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.25e-01 0.0515 0.105 0.182 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.65e-01 0.103 0.113 0.182 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 9.83e-02 -0.178 0.107 0.182 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.50e-02 -0.258 0.105 0.182 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 2.06e-01 0.0792 0.0625 0.182 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0643 0.107 0.182 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 5.42e-01 0.0528 0.0865 0.182 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.13e-01 -0.046 0.0703 0.182 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0692 0.0956 0.182 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00119 0.0968 0.182 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 8.94e-01 0.0133 0.0994 0.182 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.86e-01 -0.114 0.106 0.182 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0151 0.0839 0.182 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.16e-01 -0.122 0.0981 0.182 NK L1
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 3.32e-02 -0.221 0.103 0.182 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0354 0.0695 0.182 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 4.99e-01 0.0647 0.0956 0.182 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 4.85e-01 0.0643 0.0919 0.182 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0856 0.105 0.182 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 1.48e-01 0.121 0.083 0.182 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.82e-02 -0.151 0.0824 0.182 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0542 0.105 0.182 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0785 0.0729 0.182 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.08e-01 0.0573 0.112 0.182 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.182 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 5.36e-01 0.0613 0.0988 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0634 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 2.26e-01 0.148 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 7.71e-01 -0.034 0.116 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 8.61e-01 0.0208 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0936 0.0958 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0912 0.115 0.184 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 6.18e-01 0.0618 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0881 0.11 0.184 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.34e-01 -0.164 0.109 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0101 0.0986 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.23e-01 0.176 0.114 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.49e-01 -0.108 0.0933 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0566 0.105 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0945 0.11 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 7.30e-02 0.186 0.103 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0151 0.0894 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0516 0.106 0.183 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 4.20e-01 0.0943 0.117 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0734 0.108 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0491 0.106 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 5.89e-01 0.0593 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00147 0.11 0.183 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0719 0.0931 0.183 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 8.57e-02 -0.179 0.104 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0215 0.0881 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0744 0.108 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0606 0.0815 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 8.35e-01 0.0204 0.0979 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 1.41e-01 -0.157 0.106 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.89e-01 0.0558 0.103 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 1.16e-01 -0.126 0.0799 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 9.22e-02 -0.186 0.11 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0495 0.0998 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.23e-01 0.139 0.114 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0052 0.0952 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.31e-01 0.0609 0.0971 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 3.75e-01 0.1 0.113 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.13e-01 -0.113 0.112 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 1.42e-01 -0.14 0.0948 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 8.31e-02 -0.199 0.114 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0133 0.109 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0799 0.11 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 2.82e-01 0.107 0.0987 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 8.25e-01 -0.024 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.13e-01 0.0252 0.107 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 1.85e-01 -0.147 0.111 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0921 0.0958 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 4.30e-01 0.0566 0.0716 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.88e-01 0.0329 0.0816 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 4.98e-02 -0.137 0.0695 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.46e-01 0.00412 0.0612 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 4.10e-02 -0.133 0.0647 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.77e-01 0.0419 0.075 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 8.49e-03 -0.269 0.101 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 5.09e-01 -0.051 0.077 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.44e-01 -0.161 0.11 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 9.90e-01 0.000942 0.0723 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 7.59e-01 0.0236 0.077 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0284 0.0961 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 7.46e-01 0.0329 0.101 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.31e-01 -0.118 0.0987 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.29e-01 0.00905 0.102 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0848 0.102 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.44e-01 0.00649 0.0922 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 2.77e-01 -0.117 0.107 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.56e-01 0.102 0.111 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 3.11e-01 -0.109 0.107 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0331 0.0944 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 4.55e-01 0.0787 0.105 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0126 0.0993 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.37e-01 0.102 0.086 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 3.42e-01 0.0967 0.102 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 1.04e-01 0.153 0.0937 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 8.68e-02 -0.165 0.0961 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.07e-01 -0.161 0.0993 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 6.54e-02 -0.172 0.0927 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.02e-01 -0.121 0.0948 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0656 0.0725 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.50e-01 0.0911 0.079 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 3.66e-01 0.0862 0.0951 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.66e-01 0.087 0.0961 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 2.64e-01 0.104 0.0932 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.90e-01 -0.143 0.109 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.35e-01 -0.023 0.11 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 8.44e-01 0.0233 0.119 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.107 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 3.37e-01 0.0961 0.0999 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 2.40e-01 0.129 0.109 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.112 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0877 0.0982 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 6.61e-01 0.0541 0.123 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 5.57e-01 0.0726 0.124 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0455 0.117 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 5.27e-02 -0.161 0.0826 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 8.23e-01 0.0255 0.114 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0156 0.115 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.45e-03 0.352 0.119 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 3.70e-01 -0.089 0.099 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0149 0.108 0.182 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 5.19e-01 0.0614 0.0951 0.182 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.79e-01 -0.145 0.107 0.182 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 6.29e-01 0.041 0.0845 0.182 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 8.77e-01 0.0161 0.104 0.182 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 2.75e-01 0.116 0.106 0.182 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.13e-01 0.0691 0.105 0.182 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 6.57e-01 -0.043 0.0967 0.182 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00109 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 4.09e-01 0.0913 0.11 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.90e-01 -0.149 0.114 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 3.14e-02 -0.211 0.0974 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 1.57e-02 -0.244 0.1 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 2.20e-01 0.13 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 8.84e-01 0.0149 0.102 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.76e-01 -0.12 0.11 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.21e-01 0.00912 0.0916 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.85e-01 -0.111 0.103 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 6.08e-02 -0.197 0.105 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0472 0.0835 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 1.17e-01 0.168 0.107 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.14e-01 0.0658 0.101 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.40e-01 0.169 0.114 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 3.53e-02 -0.237 0.112 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.81e-01 -0.103 0.118 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 6.96e-02 -0.193 0.106 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 1.57e-01 0.152 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0448 0.105 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 1.26e-01 0.167 0.109 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 7.49e-02 -0.193 0.108 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.38e-01 0.02 0.0973 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.51e-01 0.0952 0.102 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 8.64e-02 -0.178 0.103 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0247 0.0919 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.94e-01 0.0128 0.0965 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0343 0.105 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.16e-01 0.192 0.155 0.156 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0935 0.136 0.156 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.34e-01 0.0373 0.078 0.156 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.57e-01 0.146 0.128 0.156 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 3.83e-02 0.242 0.115 0.156 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0646 0.128 0.156 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0315 0.148 0.156 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 6.10e-01 0.0667 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 9.89e-02 -0.191 0.115 0.183 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 3.83e-01 0.0937 0.107 0.183 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 8.30e-01 0.0194 0.0903 0.183 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 2.32e-02 -0.21 0.092 0.183 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.99e-01 -0.102 0.0982 0.183 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0422 0.112 0.183 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.26e-03 -0.318 0.107 0.183 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 2.83e-01 0.0911 0.0846 0.183 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.03e-01 -0.14 0.11 0.182 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0208 0.0994 0.182 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.33e-03 -0.318 0.107 0.182 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 8.94e-02 -0.115 0.0671 0.182 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0742 0.0952 0.182 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0434 0.106 0.182 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 1.50e-02 -0.262 0.107 0.182 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 3.77e-01 -0.109 0.123 0.188 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.48e-01 0.00683 0.105 0.188 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.70e-02 0.249 0.112 0.188 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 1.04e-01 0.151 0.0922 0.188 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00265 0.11 0.188 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 8.11e-01 0.0213 0.0892 0.188 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.24e-01 0.0392 0.111 0.188 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 2.85e-01 0.131 0.122 0.188 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 2.87e-01 -0.119 0.112 0.188 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 6.10e-03 -0.293 0.106 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 2.33e-01 0.0807 0.0675 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.96e-01 0.000504 0.0989 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0118 0.0793 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0792 0.101 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 4.56e-01 0.0817 0.109 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 7.55e-01 0.0313 0.1 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0755 0.114 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 4.07e-01 0.0684 0.0823 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 7.72e-01 0.0303 0.105 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 1.51e-01 0.143 0.099 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0451 0.0854 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0383 0.108 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0661 0.11 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00347 0.107 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 7.12e-01 -0.049 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0905 0.125 0.179 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0502 0.134 0.179 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 5.41e-01 0.0613 0.1 0.179 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.43e-01 -0.15 0.128 0.179 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 1.14e-01 -0.194 0.122 0.179 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0944 0.13 0.179 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 1.09e-01 0.181 0.112 0.179 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.76e-01 -0.135 0.124 0.182 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 3.04e-01 0.106 0.103 0.182 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.43e-01 0.104 0.11 0.182 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00339 0.113 0.182 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 3.13e-01 0.0883 0.0873 0.182 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0236 0.105 0.182 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 2.39e-01 -0.136 0.115 0.182 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00468 0.111 0.182 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0775 0.112 0.186 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.70e-01 0.00323 0.0852 0.186 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.36e-01 -0.153 0.102 0.186 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0849 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0806 0.0897 0.186 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 9.77e-01 0.00294 0.103 0.186 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 3.27e-01 -0.108 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0282 0.104 0.186 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 3.61e-01 -0.104 0.114 0.203 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 9.75e-01 0.00373 0.117 0.203 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0919 0.123 0.203 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 9.46e-01 0.00548 0.0805 0.203 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 3.76e-01 -0.1 0.113 0.203 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 2.64e-01 -0.123 0.11 0.203 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0226 0.115 0.203 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 2.35e-01 -0.152 0.128 0.203 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 2.55e-01 -0.13 0.113 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 5.41e-02 -0.204 0.106 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0131 0.0849 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 1.19e-01 0.174 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.23e-01 -0.112 0.0919 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0575 0.106 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 8.46e-01 0.0214 0.11 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 1.31e-01 0.153 0.101 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 8.31e-01 0.018 0.0845 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 1.56e-02 -0.247 0.101 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0366 0.0822 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 6.13e-01 0.0541 0.107 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0727 0.0772 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 5.52e-01 0.0589 0.0989 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0549 0.108 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00648 0.1 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 3.40e-02 -0.164 0.0769 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 4.71e-02 -0.214 0.107 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 1.61e-01 0.0923 0.0656 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.81e-01 -0.092 0.105 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 2.72e-01 0.0959 0.087 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0217 0.0774 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 3.72e-01 -0.089 0.0995 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.59e-01 0.0601 0.103 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 7.61e-01 0.0306 0.1 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.18e-01 -0.139 0.112 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0225 0.0747 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.09e-01 -0.109 0.107 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 3.69e-01 -0.093 0.103 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -511991 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0227 0.0859 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 7.78e-01 0.0292 0.103 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0697 0.107 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -628032 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0214 0.11 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -306897 sc-eQTL 2.86e-01 -0.116 0.108 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -383330 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0347 0.0849 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 157092 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0912 0.096 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 94503 sc-eQTL 4.51e-02 -0.209 0.103 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -602588 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0277 0.0725 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 sc-eQTL 5.17e-01 0.0591 0.091 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -403102 sc-eQTL 5.52e-01 0.0572 0.0961 0.183 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK 157092 eQTL 0.000182 -0.092 0.0245 0.0 0.0 0.17
ENSG00000154027 AK5 94503 eQTL 0.000358 -0.0899 0.0251 0.0 0.0 0.17
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 eQTL 0.00609 -0.0747 0.0272 0.00123 0.0 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162613 \N -602588 7.76e-07 6.46e-07 8.83e-08 4.04e-07 1.05e-07 2.54e-07 5.49e-07 1.11e-07 3.94e-07 1.89e-07 5.58e-07 2.55e-07 9.65e-07 1.54e-07 2.35e-07 1.96e-07 3.24e-07 3.56e-07 2.12e-07 1.73e-07 1.86e-07 3.15e-07 3.08e-07 1.15e-07 7.42e-07 2.46e-07 2.57e-07 2.71e-07 3.58e-07 4.61e-07 3.13e-07 6.13e-08 5.19e-08 1.69e-07 3.71e-07 7.68e-08 1.86e-07 1.07e-07 6.58e-08 2.56e-08 2.87e-08 5.79e-07 2.99e-08 1.94e-08 8.43e-08 2.68e-08 8.24e-08 1.24e-08 4.74e-08
ENSG00000162616 DNAJB4 -602653 7.76e-07 6.46e-07 8.83e-08 4.04e-07 1.05e-07 2.54e-07 5.49e-07 1.11e-07 3.94e-07 1.89e-07 5.58e-07 2.55e-07 9.65e-07 1.54e-07 2.35e-07 1.96e-07 3.24e-07 3.56e-07 2.12e-07 1.73e-07 1.86e-07 3.15e-07 3.08e-07 1.15e-07 7.42e-07 2.46e-07 2.57e-07 2.71e-07 3.58e-07 4.61e-07 3.13e-07 6.13e-08 5.19e-08 1.69e-07 3.71e-07 7.68e-08 1.86e-07 1.07e-07 6.58e-08 2.56e-08 2.87e-08 5.79e-07 2.99e-08 1.94e-08 8.43e-08 2.68e-08 8.24e-08 1.24e-08 4.74e-08