Genes within 1Mb (chr1:77345991:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 2.51e-02 0.227 0.101 0.222 B L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.56e-01 0.0548 0.0734 0.222 B L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0542 0.0787 0.222 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 7.22e-01 0.026 0.0731 0.222 B L1
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 8.07e-01 0.0238 0.0973 0.222 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.98e-01 -0.131 0.101 0.222 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0717 0.0873 0.222 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 8.67e-03 0.199 0.0753 0.222 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.20e-02 0.231 0.0912 0.222 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.13e-01 0.0387 0.059 0.222 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.52e-01 0.0252 0.0795 0.222 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 4.69e-02 -0.12 0.0601 0.222 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0566 0.0556 0.222 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 2.47e-01 0.0779 0.0671 0.222 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 3.85e-01 0.0605 0.0695 0.222 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.28e-01 0.132 0.0866 0.222 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 6.54e-02 0.152 0.0822 0.222 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0355 0.0883 0.222 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 3.85e-02 -0.113 0.0541 0.222 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0986 0.0665 0.222 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.88e-01 0.0788 0.0912 0.222 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 2.71e-01 -0.101 0.0917 0.222 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.75e-01 0.0983 0.0897 0.222 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.64e-01 0.0576 0.0995 0.225 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0737 0.0898 0.225 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.56e-01 0.0327 0.105 0.225 DC L1
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 4.38e-01 0.0659 0.0848 0.225 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.93e-01 -0.104 0.0985 0.225 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 2.27e-01 0.114 0.0944 0.225 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 7.31e-02 0.184 0.102 0.225 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.64e-01 0.00496 0.111 0.225 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0543 0.106 0.225 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 9.09e-03 0.271 0.103 0.222 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 3.90e-02 -0.127 0.0609 0.222 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 2.39e-01 0.124 0.105 0.222 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 4.42e-01 0.0654 0.0848 0.222 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 3.57e-01 0.0635 0.0689 0.222 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 4.31e-02 0.189 0.093 0.222 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0793 0.0948 0.222 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 1.19e-01 0.152 0.097 0.222 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 4.11e-01 0.0884 0.107 0.221 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.47e-01 0.122 0.0841 0.221 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 9.04e-01 0.012 0.0992 0.221 NK L1
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0944 0.105 0.221 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 6.49e-01 0.032 0.0701 0.221 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0853 0.0962 0.221 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0322 0.0927 0.221 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.07e-01 0.0687 0.103 0.222 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.09e-01 -0.132 0.0819 0.222 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.20e-02 0.175 0.0811 0.222 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 2.14e-01 -0.129 0.103 0.222 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0102 0.0721 0.222 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0868 0.11 0.222 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 8.83e-01 0.0157 0.107 0.222 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.74e-01 -0.107 0.0974 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.77e-01 0.164 0.121 0.235 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 8.56e-01 0.0217 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.87e-01 0.0986 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 9.63e-01 0.00541 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 2.68e-01 0.104 0.0938 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 2.90e-01 -0.119 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 8.37e-01 0.025 0.121 0.235 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.94e-01 0.113 0.108 0.235 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.62e-01 0.154 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 8.53e-01 0.0184 0.0991 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 8.55e-01 -0.021 0.115 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.64e-01 0.0855 0.0939 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 7.23e-01 0.0373 0.105 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 6.19e-02 -0.207 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0654 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 9.25e-01 0.00843 0.0898 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.71e-01 0.0619 0.109 0.224 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.07e-01 0.0439 0.117 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 7.41e-01 0.0358 0.108 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0188 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0947 0.109 0.224 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 7.85e-01 0.03 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 7.02e-01 0.0357 0.0931 0.224 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 6.50e-02 0.196 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0339 0.0897 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 8.24e-02 -0.191 0.109 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00286 0.0831 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 4.47e-01 0.0759 0.0997 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.80e-01 0.00265 0.105 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.88e-02 0.178 0.081 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 4.54e-02 0.222 0.11 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.41e-02 0.202 0.0995 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0834 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0803 0.0957 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00979 0.0979 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 5.42e-02 -0.218 0.113 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 1.75e-01 -0.153 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 3.67e-02 0.2 0.0949 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0675 0.118 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.10e-01 0.0126 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0596 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 2.05e-02 -0.234 0.1 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 5.13e-01 0.073 0.111 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0545 0.109 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 7.57e-01 0.0353 0.114 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 7.54e-03 0.258 0.0955 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 8.99e-01 0.0092 0.0725 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0162 0.0826 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 8.91e-02 -0.12 0.0704 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0645 0.0618 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.17e-01 0.0662 0.066 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 3.04e-01 0.0781 0.0757 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 3.35e-01 0.0991 0.103 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.25e-01 0.0615 0.0769 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 4.32e-01 0.0868 0.11 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 7.44e-04 -0.241 0.0703 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0805 0.0768 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.13e-01 0.152 0.0955 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 5.54e-01 0.0599 0.101 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 4.35e-01 0.0766 0.098 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 7.84e-01 0.0278 0.101 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 2.87e-01 0.114 0.107 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 1.05e-02 -0.257 0.0994 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0382 0.0913 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 8.34e-02 0.184 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0473 0.11 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 3.27e-01 0.105 0.106 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.79e-01 0.126 0.0936 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0869 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 1.77e-02 -0.233 0.0977 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 9.39e-01 0.00663 0.086 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.59e-01 0.00521 0.101 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 5.93e-01 0.0503 0.0939 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 1.07e-03 0.312 0.094 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 2.55e-02 0.226 0.101 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 2.80e-01 0.103 0.095 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 8.24e-01 0.0216 0.097 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 6.05e-02 -0.139 0.0735 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0947 0.0805 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0869 0.0969 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 2.60e-02 -0.218 0.097 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 1.83e-01 -0.127 0.0949 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 2.43e-01 0.13 0.111 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.98e-01 0.000337 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0987 0.121 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 4.67e-02 -0.217 0.109 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 7.14e-01 0.0411 0.112 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0854 0.114 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 4.22e-01 0.0806 0.1 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0593 0.121 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.34e-01 0.182 0.121 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 2.92e-01 -0.122 0.116 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 6.38e-01 0.0388 0.0823 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.55e-02 -0.27 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000467 0.113 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0586 0.12 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0977 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0711 0.108 0.221 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 2.18e-01 -0.117 0.0948 0.221 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.73e-02 0.19 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0979 0.0843 0.221 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.24e-01 -0.126 0.103 0.221 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00882 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.27e-01 0.0837 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0443 0.0967 0.221 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 2.27e-01 0.139 0.114 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0712 0.114 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0624 0.118 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 9.67e-01 0.00427 0.102 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 8.34e-01 0.0221 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.70e-01 0.00417 0.11 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0501 0.106 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 8.53e-01 0.0207 0.111 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 8.47e-01 0.0179 0.0925 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.18e-01 0.104 0.104 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 3.33e-01 -0.103 0.106 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.64e-01 0.117 0.0839 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 7.12e-01 0.04 0.108 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.32e-01 0.00871 0.102 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 6.72e-01 0.0488 0.115 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0119 0.113 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.83e-01 -0.103 0.118 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 1.31e-01 -0.161 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 6.31e-01 0.0518 0.108 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 4.82e-01 0.0739 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 1.49e-01 -0.158 0.109 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 5.88e-01 0.0601 0.111 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 2.14e-01 0.123 0.0989 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 2.30e-01 -0.125 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 9.26e-01 0.0087 0.0938 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 2.65e-02 -0.217 0.0973 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 8.22e-01 0.0242 0.108 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00178 0.155 0.241 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0118 0.136 0.241 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 5.94e-01 0.0414 0.0774 0.241 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.33e-01 0.192 0.127 0.241 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 3.02e-01 -0.121 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.35e-01 0.122 0.126 0.241 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 2.52e-01 0.169 0.147 0.241 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.12e-01 0.161 0.129 0.241 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.16e-01 0.178 0.112 0.22 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0675 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00828 0.088 0.22 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 5.81e-01 0.0501 0.0908 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00451 0.096 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.82e-01 -0.146 0.109 0.22 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00519 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 5.80e-01 0.0459 0.0827 0.22 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 7.14e-02 0.196 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 2.63e-01 0.11 0.0981 0.222 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 6.77e-01 0.0451 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0211 0.0669 0.222 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.07e-02 0.203 0.0933 0.222 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 7.27e-01 0.0367 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00306 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 7.21e-01 0.0433 0.121 0.215 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.50e-01 0.149 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.44e-01 0.0364 0.112 0.215 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 6.47e-01 0.0419 0.0915 0.215 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0989 0.108 0.215 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 1.59e-01 0.124 0.0875 0.215 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 2.82e-01 0.118 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0123 0.121 0.215 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0621 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 8.02e-03 0.279 0.104 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.68e-02 -0.127 0.0662 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.19e-01 0.106 0.106 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.53e-01 0.111 0.0972 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 5.56e-01 0.046 0.0781 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 5.90e-01 0.0537 0.0994 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 1.89e-01 -0.142 0.107 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 5.50e-02 0.189 0.0981 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 2.73e-01 0.124 0.113 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0139 0.0817 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 2.81e-01 0.112 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.52e-01 0.141 0.0982 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 5.64e-01 0.0489 0.0847 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.95e-02 0.22 0.106 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.06e-01 -0.091 0.109 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 6.94e-01 0.042 0.106 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.18e-01 0.207 0.132 0.233 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0723 0.125 0.233 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 1.69e-01 0.184 0.133 0.233 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 2.77e-01 -0.109 0.0999 0.233 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.02e-02 0.277 0.127 0.233 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 2.66e-02 0.272 0.121 0.233 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0543 0.13 0.233 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00986 0.114 0.233 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.95e-01 0.152 0.117 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0783 0.0971 0.22 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0276 0.104 0.22 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 3.89e-01 0.0919 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 7.90e-01 -0.022 0.0826 0.22 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.31e-01 0.15 0.0988 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 2.44e-01 0.127 0.109 0.22 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 2.74e-01 0.115 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 9.88e-01 0.0017 0.112 0.222 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0367 0.0853 0.222 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 5.01e-01 0.0695 0.103 0.222 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0788 0.106 0.222 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 4.78e-01 0.0639 0.0899 0.222 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 3.47e-01 0.0966 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.54e-01 0.083 0.111 0.222 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 4.75e-01 0.074 0.104 0.222 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 3.43e-01 0.108 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.31e-02 -0.225 0.115 0.226 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 3.57e-01 0.114 0.123 0.226 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 1.03e-01 0.131 0.0798 0.226 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0631 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0499 0.11 0.226 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.29e-02 0.192 0.114 0.226 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.45e-01 0.0591 0.128 0.226 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0862 0.114 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 6.38e-02 0.196 0.105 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 9.37e-01 0.00669 0.0848 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.04e-01 0.0424 0.111 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 2.08e-01 0.116 0.0917 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 2.51e-01 0.121 0.105 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.11e-02 -0.277 0.108 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0296 0.101 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 7.29e-01 0.0293 0.0843 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.11e-02 0.264 0.103 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.00e-01 0.0704 0.0834 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 9.03e-02 -0.184 0.108 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0143 0.0786 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 4.53e-01 0.0755 0.1 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0137 0.11 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0776 0.102 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 5.23e-03 0.219 0.0775 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 1.49e-02 0.258 0.105 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 5.48e-02 -0.124 0.0644 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 1.44e-01 0.151 0.103 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 1.34e-01 0.129 0.0856 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 5.93e-01 0.0409 0.0762 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 1.30e-01 0.149 0.0978 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 1.07e-01 -0.163 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 1.22e-01 0.152 0.0983 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 3.43e-01 0.104 0.11 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0592 0.0727 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 5.31e-01 0.0657 0.105 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0216 0.101 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -542522 sc-eQTL 9.04e-01 0.0101 0.0837 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 9.09e-02 0.17 0.1 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 6.66e-02 0.191 0.103 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -658563 sc-eQTL 3.97e-01 0.0907 0.107 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -337428 sc-eQTL 6.29e-01 0.0527 0.109 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -413861 sc-eQTL 1.41e-01 0.126 0.0851 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 126561 sc-eQTL 7.62e-01 0.0294 0.0969 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 63972 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0892 0.105 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 sc-eQTL 7.18e-01 0.0264 0.073 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -633184 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0712 0.0915 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -433633 sc-eQTL 9.99e-01 0.000111 0.0968 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000077254 USP33 -413861 eQTL 0.0257 -0.0272 0.0122 0.0 0.0 0.228
ENSG00000154027 AK5 63972 eQTL 6.49e-05 -0.0875 0.0218 0.0 0.0 0.228
ENSG00000162613 FUBP1 -633119 eQTL 0.0471 -0.0331 0.0167 0.0 0.0 0.228
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -543548 eQTL 0.0126 0.0633 0.0253 0.00154 0.0 0.228


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000077254 USP33 -413861 1.21e-06 6.99e-07 1.63e-07 4.31e-07 9.93e-08 2.95e-07 6.54e-07 2.26e-07 8.08e-07 3.1e-07 1.08e-06 5.28e-07 1.15e-06 1.57e-07 3.35e-07 4.29e-07 5.56e-07 4.52e-07 2.88e-07 2.15e-07 2.42e-07 5.76e-07 4.66e-07 2.92e-07 1.25e-06 2.38e-07 4.62e-07 3.51e-07 6.33e-07 7.09e-07 4.32e-07 6.63e-08 4.92e-08 2.06e-07 3.47e-07 1.8e-07 1.4e-07 9.71e-08 7.41e-08 1.6e-08 1.36e-07 7.38e-07 4.41e-08 1.1e-08 1.69e-07 1.42e-08 1.21e-07 1.24e-08 6.04e-08
ENSG00000154027 AK5 63972 8.31e-06 9.44e-06 1.35e-06 4.51e-06 2.42e-06 4e-06 9.87e-06 1.92e-06 7.77e-06 4.74e-06 1.05e-05 4.97e-06 1.31e-05 3.96e-06 2.28e-06 6.58e-06 3.74e-06 6.9e-06 2.67e-06 2.85e-06 4.98e-06 8.16e-06 7.15e-06 3.24e-06 1.25e-05 3.81e-06 4.88e-06 3.31e-06 9.09e-06 7.98e-06 4.77e-06 9.96e-07 1.12e-06 3.3e-06 3.58e-06 2.67e-06 1.78e-06 2.07e-06 2.19e-06 1.01e-06 1.12e-06 1.16e-05 1.32e-06 2.27e-07 7.75e-07 1.67e-06 1.47e-06 6.55e-07 4.65e-07
ENSG00000273338 \N -658563 3.71e-07 1.78e-07 6.57e-08 2.27e-07 1.1e-07 8.4e-08 2.86e-07 6.75e-08 2.04e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.62e-07 3.4e-07 8.44e-08 6.53e-08 1.14e-07 6.17e-08 2.43e-07 7.27e-08 6.02e-08 1.27e-07 2.09e-07 1.81e-07 4.37e-08 2.59e-07 1.82e-07 1.33e-07 1.42e-07 1.48e-07 1.36e-07 1.43e-07 3.78e-08 4.23e-08 1.02e-07 5.24e-08 3.36e-08 4.07e-08 8.2e-08 6.33e-08 6.31e-08 4.47e-08 1.68e-07 4.17e-08 1.43e-08 3.36e-08 1.01e-08 7.26e-08 1.95e-09 4.83e-08