logo

Genes within 1Mb (chr1:77295668:ATTCT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 8.36e-02 0.175 0.101 0.222 B L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 3.97e-01 0.0619 0.073 0.222 B L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0651 0.0783 0.222 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 8.57e-01 0.0132 0.0727 0.222 B L1
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00401 0.0969 0.222 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.34e-01 -0.152 0.101 0.222 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0691 0.087 0.222 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 1.99e-02 0.176 0.0752 0.222 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.86e-02 0.201 0.091 0.222 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.33e-01 0.0366 0.0587 0.222 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000691 0.0791 0.222 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 2.09e-02 -0.139 0.0596 0.222 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0468 0.0554 0.222 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 4.40e-01 0.0517 0.0669 0.222 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.32e-01 0.0332 0.0692 0.222 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 3.76e-01 0.0771 0.0869 0.222 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 1.72e-01 0.113 0.0825 0.222 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0501 0.0883 0.222 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 6.38e-02 -0.101 0.0542 0.222 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0972 0.0665 0.222 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.59e-01 0.0839 0.0912 0.222 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0493 0.092 0.222 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 1.97e-01 0.116 0.0896 0.222 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 6.80e-01 0.0411 0.0995 0.225 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0863 0.0897 0.225 DC L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.59e-01 0.0615 0.105 0.225 DC L1
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 4.91e-01 0.0585 0.0848 0.225 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 9.92e-02 -0.162 0.098 0.225 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0943 0.225 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 4.25e-02 0.208 0.102 0.225 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0495 0.111 0.225 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0589 0.106 0.225 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.52e-02 0.233 0.103 0.222 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.43e-02 -0.118 0.061 0.222 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 3.89e-01 0.0904 0.105 0.222 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 8.01e-01 0.0214 0.0849 0.222 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 2.80e-01 0.0745 0.0688 0.222 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 2.80e-02 0.205 0.0928 0.222 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0544 0.0949 0.222 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.88e-02 0.191 0.0966 0.222 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.15e-01 0.0701 0.107 0.221 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.13e-02 0.152 0.0839 0.221 NK L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0237 0.0991 0.221 NK L1
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0928 0.105 0.221 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 8.46e-01 0.0136 0.0701 0.221 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.89e-01 -0.083 0.0962 0.221 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0634 0.0926 0.221 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 3.92e-01 0.0888 0.104 0.222 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 2.02e-01 -0.105 0.0823 0.222 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 8.82e-02 0.14 0.0816 0.222 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.65e-01 -0.145 0.104 0.222 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0507 0.0722 0.222 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.91e-01 -0.144 0.11 0.222 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.93e-01 0.0423 0.107 0.222 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0899 0.0977 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.53e-01 0.174 0.121 0.235 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0277 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 1.83e-01 0.152 0.114 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 8.91e-01 0.016 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 3.79e-01 0.083 0.0942 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.67e-01 -0.102 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0242 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.37e-01 0.0842 0.108 0.235 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.38e-01 0.13 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.88e-01 0.0537 0.099 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 8.66e-01 0.0194 0.115 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0938 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 9.40e-01 0.00794 0.105 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 4.86e-02 -0.218 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0149 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 9.65e-01 0.00399 0.0898 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 7.79e-01 0.0308 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 9.09e-01 0.0121 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 9.20e-01 0.0118 0.117 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.36e-01 0.0515 0.109 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00962 0.106 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0984 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0245 0.11 0.224 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 5.50e-01 0.056 0.0935 0.224 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.70e-01 0.146 0.106 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0202 0.0899 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 4.65e-02 -0.218 0.109 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.84e-01 -0.034 0.0832 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 8.94e-01 0.0133 0.0999 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.23e-01 0.0697 0.109 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 9.22e-01 0.0103 0.105 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.47e-02 0.164 0.0812 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.16e-01 0.175 0.111 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 1.34e-01 0.15 0.0999 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0689 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0838 0.0956 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00754 0.0978 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 4.58e-02 -0.226 0.113 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 2.00e-01 -0.144 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 5.44e-02 0.184 0.0951 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.64e-01 -0.133 0.118 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 9.31e-01 0.00969 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0616 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 4.65e-02 -0.203 0.101 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.02e-01 0.0584 0.112 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.99e-01 -0.058 0.11 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 9.94e-01 0.000815 0.115 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.98e-02 0.209 0.0956 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 8.48e-01 0.0138 0.0722 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0293 0.0822 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 5.20e-02 -0.137 0.07 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0611 0.0615 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.96e-01 0.0349 0.0658 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 3.57e-01 0.0696 0.0754 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 3.45e-01 0.0967 0.102 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 3.89e-01 0.0662 0.0767 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 6.59e-01 0.0486 0.11 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 3.20e-04 -0.255 0.0698 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0762 0.0766 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 9.64e-02 0.159 0.0951 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.60e-01 0.0178 0.101 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 3.22e-01 0.0972 0.0979 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 6.94e-01 0.0399 0.101 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 2.36e-01 0.127 0.107 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.23e-02 -0.251 0.0995 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0462 0.0914 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 8.32e-02 0.185 0.106 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 5.86e-01 -0.06 0.11 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 4.06e-01 0.0887 0.107 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 2.50e-01 0.108 0.0939 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 3.25e-01 -0.103 0.105 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 2.10e-02 -0.228 0.0979 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 9.39e-01 0.00658 0.0861 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 6.10e-01 0.0519 0.102 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 3.91e-01 0.0807 0.094 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 9.83e-04 0.315 0.0941 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 6.22e-02 0.189 0.101 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.53e-01 0.0565 0.0952 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 8.55e-01 0.0178 0.097 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.41e-01 -0.109 0.0737 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0952 0.0805 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 2.17e-01 -0.12 0.0968 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 3.36e-02 -0.208 0.0971 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0726 0.0952 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 4.01e-01 0.0933 0.111 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0137 0.112 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0602 0.12 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 5.56e-02 -0.209 0.108 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0352 0.102 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 6.47e-01 0.0512 0.112 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0503 0.114 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.18e-01 0.0812 0.0999 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0695 0.122 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 1.12e-01 0.195 0.122 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 1.64e-01 -0.162 0.116 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 6.28e-01 0.0401 0.0827 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 1.94e-02 -0.263 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0128 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0608 0.121 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 2.98e-01 0.102 0.0982 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0455 0.108 0.221 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0952 0.095 0.221 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.12e-02 0.194 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0623 0.0845 0.221 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 2.15e-01 -0.128 0.103 0.221 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0377 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 3.27e-01 0.103 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 6.72e-01 -0.041 0.0967 0.221 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.52e-01 0.133 0.115 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0696 0.115 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.95e-01 -0.031 0.119 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 8.91e-01 0.0142 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 7.07e-01 0.0398 0.106 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 7.80e-01 0.0309 0.11 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.80e-01 -0.044 0.107 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0143 0.112 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.46e-01 0.03 0.0926 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 4.92e-01 0.0721 0.105 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 4.10e-01 -0.088 0.107 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.30e-01 0.0824 0.0843 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 9.22e-01 0.0107 0.108 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0543 0.102 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.26e-01 0.0733 0.115 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.69e-01 0.0334 0.113 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 3.38e-01 -0.113 0.118 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.72e-01 -0.146 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.41e-01 0.0504 0.108 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.68e-01 0.0601 0.105 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 1.40e-01 -0.162 0.109 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 6.81e-01 0.0457 0.111 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 2.31e-01 0.119 0.0991 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 1.57e-01 -0.147 0.104 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 2.62e-01 -0.119 0.106 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00861 0.094 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.79e-02 -0.186 0.0978 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 6.69e-01 0.0461 0.108 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 9.66e-01 0.0066 0.154 0.233 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 8.24e-01 0.0302 0.135 0.233 PB L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.25e-01 0.0492 0.0772 0.233 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 1.13e-01 0.202 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 3.08e-01 -0.119 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 6.55e-01 0.0567 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 2.22e-01 0.18 0.146 0.233 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 1.10e-01 0.206 0.128 0.233 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 9.11e-02 0.191 0.113 0.22 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0689 0.105 0.22 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 9.96e-01 0.000402 0.0882 0.22 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 7.16e-01 0.0331 0.091 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0355 0.0961 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 2.51e-01 -0.126 0.109 0.22 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0205 0.107 0.22 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 5.87e-01 0.0451 0.0829 0.22 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.94e-01 0.142 0.109 0.222 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 4.37e-01 0.0765 0.0983 0.222 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0355 0.108 0.222 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0284 0.0669 0.222 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 3.34e-02 0.2 0.0934 0.222 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0191 0.105 0.222 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 9.80e-01 0.00264 0.107 0.222 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 8.40e-01 0.0245 0.121 0.215 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 1.86e-01 0.137 0.103 0.215 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.80e-01 0.0617 0.111 0.215 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 7.47e-01 0.0296 0.0915 0.215 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 8.56e-02 -0.185 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 2.14e-01 0.109 0.0875 0.215 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.109 0.215 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 3.76e-01 -0.107 0.12 0.215 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0459 0.11 0.215 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.26e-02 0.241 0.105 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.56e-02 -0.118 0.0663 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.17e-01 0.0691 0.106 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 4.64e-01 0.0714 0.0974 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 6.04e-01 0.0406 0.0782 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.52e-01 0.0592 0.0994 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 1.95e-01 -0.14 0.107 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 1.35e-02 0.243 0.0976 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.87e-01 0.121 0.113 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 8.81e-01 0.0123 0.0819 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 2.12e-01 0.129 0.103 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 1.96e-01 0.128 0.0985 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 7.34e-01 0.0289 0.0849 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.48e-02 0.226 0.106 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0629 0.11 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.64e-01 0.0782 0.107 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 2.08e-01 0.167 0.132 0.233 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 2.97e-01 -0.131 0.125 0.233 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 2.28e-01 0.162 0.133 0.233 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.20e-01 -0.156 0.0996 0.233 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 4.70e-02 0.255 0.127 0.233 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 9.04e-02 0.209 0.122 0.233 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0343 0.131 0.233 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 7.85e-01 0.0312 0.114 0.233 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.14e-01 0.184 0.116 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0721 0.0969 0.22 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0281 0.103 0.22 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 5.59e-01 0.0623 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0223 0.0824 0.22 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.83e-01 0.132 0.0987 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 1.03e-01 0.178 0.108 0.22 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 4.09e-01 0.0867 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0625 0.113 0.222 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0696 0.086 0.222 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.222 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 2.05e-01 -0.135 0.106 0.222 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 5.50e-01 0.0543 0.0908 0.222 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 3.26e-01 0.102 0.103 0.222 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 2.36e-01 0.133 0.112 0.222 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 8.78e-01 0.016 0.105 0.222 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.96e-01 0.0603 0.113 0.232 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 6.87e-02 -0.21 0.115 0.232 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 4.12e-01 0.101 0.123 0.232 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 1.25e-01 0.123 0.0795 0.232 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0911 0.113 0.232 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0409 0.11 0.232 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 6.96e-02 0.206 0.113 0.232 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 7.17e-01 0.0463 0.127 0.232 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0984 0.113 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 1.37e-01 0.158 0.106 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.10e-01 0.0316 0.0849 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 6.11e-01 0.0569 0.112 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 1.36e-01 0.137 0.0917 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 3.78e-01 0.0931 0.106 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.36e-02 -0.269 0.108 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0346 0.101 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 7.58e-01 0.0261 0.0845 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 5.31e-02 0.202 0.104 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 4.94e-01 0.0573 0.0836 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 5.94e-02 -0.204 0.108 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0406 0.0786 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 7.44e-01 0.0329 0.101 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0464 0.11 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0725 0.102 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 1.25e-02 0.196 0.0779 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 3.54e-02 0.223 0.105 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 7.71e-02 -0.115 0.0645 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 2.05e-01 0.131 0.103 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 2.63e-01 0.0963 0.0858 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 6.40e-01 0.0357 0.0763 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 1.12e-01 0.156 0.0977 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 1.34e-01 -0.151 0.101 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 3.13e-02 0.212 0.0978 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 4.64e-01 0.0804 0.11 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0862 0.0725 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 7.83e-01 0.0288 0.105 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0738 0.101 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -592845 sc-eQTL 7.35e-01 0.0283 0.0836 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 5.76e-02 0.191 0.0998 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 8.78e-03 0.271 0.103 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -708886 sc-eQTL 6.75e-01 0.0449 0.107 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -387751 sc-eQTL 7.83e-01 0.0301 0.109 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -464184 sc-eQTL 6.79e-02 0.156 0.0849 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK 76238 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0102 0.0969 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 13649 sc-eQTL 4.25e-01 -0.084 0.105 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -683442 sc-eQTL 9.83e-01 0.00155 0.0731 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -683507 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0767 0.0916 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -483956 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0365 0.0968 0.222 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000077254 USP33 -464184 eQTL 0.0227 -0.0278 0.0122 0.0 0.0 0.231
ENSG00000154027 AK5 13649 eQTL 6.24e-05 -0.0879 0.0218 0.0 0.0 0.231
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -593871 eQTL 0.0124 0.0635 0.0254 0.00158 0.0 0.231

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000077254 USP33 -464184 1.27e-06 1.25e-06 3.29e-07 1.14e-06 1.07e-07 3.24e-07 1.02e-06 5.78e-08 1.25e-06 1.6e-07 2.03e-06 2.33e-07 2.02e-06 1.48e-07 9.2e-08 3.57e-07 5.64e-07 5.67e-07 1.97e-07 8.69e-08 2.38e-07 8.66e-07 9.28e-07 4.07e-08 1.52e-06 2.55e-07 2.22e-07 2.68e-07 7.61e-07 9.22e-07 4.53e-07 3.96e-08 3.66e-08 1.9e-07 3.42e-07 5.2e-08 4.47e-08 8.72e-08 6.42e-08 5.72e-08 5.48e-08 4.29e-06 5.08e-08 5.68e-09 6.92e-08 8.59e-09 8.67e-08 4.33e-09 4.73e-08
ENSG00000154027 AK5 13649 5.67e-05 3.82e-05 9.36e-06 1.4e-05 5.05e-06 1.29e-05 4.4e-05 3.34e-06 2.72e-05 1.19e-05 3.34e-05 1.59e-05 4.65e-05 1.49e-05 7.23e-06 1.64e-05 2.47e-05 2.33e-05 7.49e-06 4.99e-06 1.42e-05 3.03e-05 3.45e-05 7.57e-06 4.91e-05 7.48e-06 1.25e-05 9.24e-06 3.42e-05 3.11e-05 1.66e-05 1.42e-06 1.46e-06 5.81e-06 1.19e-05 4.84e-06 2.48e-06 2.76e-06 3.44e-06 2.05e-06 1.48e-06 4.74e-05 5.36e-06 4.08e-07 2.75e-06 3.1e-06 3.67e-06 1.52e-06 1.08e-06
ENSG00000180488 \N -483956 1.29e-06 1.08e-06 3.05e-07 9.43e-07 1.07e-07 3.24e-07 8.7e-07 5.68e-08 1.15e-06 1.39e-07 1.83e-06 2.09e-07 1.99e-06 1.23e-07 7.35e-08 2.99e-07 5.27e-07 5.31e-07 1.7e-07 6.73e-08 2.17e-07 7.26e-07 8.1e-07 3.58e-08 1.36e-06 2.42e-07 1.87e-07 2.19e-07 6.91e-07 8.5e-07 4.59e-07 4.07e-08 3.35e-08 1.75e-07 3.22e-07 5.05e-08 4.49e-08 8.93e-08 6.71e-08 7.55e-08 5.39e-08 3.87e-06 5.21e-08 1.05e-08 7.79e-08 1.01e-08 8.81e-08 4.41e-09 5.04e-08