Genes within 1Mb (chr1:77202024:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.143 B L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00512 0.0877 0.143 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0155 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.143 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.143 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 8.97e-01 0.0126 0.0974 0.143 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 4.35e-02 -0.171 0.0844 0.143 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.45e-02 0.217 0.102 0.143 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0271 0.0656 0.143 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.58e-02 0.196 0.0873 0.143 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 6.78e-01 0.028 0.0674 0.143 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0671 0.0618 0.143 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00871 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0971 0.077 0.143 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.63e-01 0.0877 0.0962 0.143 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.77e-01 0.0382 0.0917 0.143 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0975 0.143 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 7.21e-01 0.0217 0.0605 0.143 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0717 0.0739 0.143 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.36e-01 0.00809 0.101 0.143 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 8.60e-01 -0.018 0.102 0.143 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0993 0.143 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0243 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 5.85e-01 0.0544 0.0994 0.146 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.87e-01 0.153 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 8.77e-01 0.0145 0.0939 0.146 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 3.21e-01 0.108 0.109 0.146 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 7.25e-01 0.0369 0.105 0.146 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 7.07e-01 0.0462 0.123 0.146 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.117 0.146 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.143 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0701 0.0679 0.143 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.143 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0563 0.0939 0.143 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.99e-01 0.098 0.0761 0.143 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.39e-01 0.0211 0.104 0.143 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00298 0.105 0.143 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0891 0.108 0.143 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.36e-01 0.115 0.119 0.144 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0705 0.0936 0.144 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.17e-01 0.172 0.109 0.144 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 6.16e-04 0.394 0.113 0.144 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.17e-01 0.018 0.0777 0.144 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.25e-01 -0.01 0.107 0.144 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0311 0.103 0.144 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 8.68e-02 0.198 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 2.20e-01 0.113 0.092 0.143 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0915 0.143 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 5.79e-02 0.22 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0216 0.0809 0.143 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 3.08e-01 -0.126 0.123 0.143 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 1.44e-01 0.175 0.119 0.143 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0617 0.109 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0813 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.20e-02 -0.25 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 3.89e-01 -0.11 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 6.25e-01 0.0636 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 3.91e-01 0.0907 0.106 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0171 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 1.47e-01 -0.175 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.75e-01 0.109 0.122 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0922 0.11 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.33e-01 -0.192 0.127 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0579 0.105 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 4.95e-01 0.0799 0.117 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.98e-01 0.000311 0.123 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0618 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 2.34e-01 -0.119 0.0995 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0675 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0273 0.129 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 4.13e-01 0.0981 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 1.28e-02 0.3 0.119 0.14 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.77e-01 -0.132 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.09e-02 -0.201 0.102 0.14 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.43e-01 0.174 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0531 0.0998 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 3.92e-01 0.105 0.122 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 5.60e-01 -0.054 0.0924 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 1.48e-01 -0.175 0.12 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.00e-01 -0.079 0.117 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0326 0.0911 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0982 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 5.03e-02 -0.218 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.22e-01 -0.156 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.14e-01 0.0391 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.108 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 1.51e-01 0.181 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 3.63e-02 0.261 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 2.85e-01 -0.114 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 7.17e-01 0.0471 0.13 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 7.11e-01 0.0457 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0579 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 6.95e-01 0.0439 0.112 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 1.30e-01 0.185 0.122 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.74e-02 -0.238 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.41e-01 0.126 0.107 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0801 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.02e-02 0.233 0.0898 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 8.82e-01 0.0117 0.0783 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 3.89e-01 -0.059 0.0683 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0601 0.0729 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0675 0.0837 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.46e-03 0.344 0.112 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0645 0.0858 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 7.98e-01 0.0316 0.123 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0805 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.54e-02 -0.152 0.0852 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.92e-01 -0.119 0.113 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.55e-01 0.156 0.11 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00437 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.20e-01 0.0972 0.12 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 6.47e-01 0.0519 0.113 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.72e-01 0.0166 0.103 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 2.72e-02 -0.264 0.119 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0311 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0719 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 7.04e-01 0.0401 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 1.78e-03 0.343 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00785 0.0962 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 7.15e-01 0.0415 0.114 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00138 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 5.63e-01 0.0613 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 7.19e-01 0.0389 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0211 0.0823 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0677 0.0896 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 7.28e-01 0.0376 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0577 0.109 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0659 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.23e-02 0.279 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.67e-01 0.0531 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 9.71e-01 0.00483 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 6.89e-01 0.0485 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.112 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 4.79e-01 0.0891 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 8.30e-02 -0.191 0.11 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 6.00e-01 0.0688 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 3.56e-01 -0.122 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.72e-01 0.09 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0305 0.0887 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0435 0.121 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.98e-01 0.000346 0.122 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0599 0.105 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 5.59e-01 0.0711 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 1.67e-01 0.147 0.106 0.145 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.85e-01 0.0845 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 5.39e-01 0.0582 0.0947 0.145 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00406 0.116 0.145 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 9.80e-01 0.00292 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0821 0.108 0.145 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0402 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.78e-01 0.0902 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 2.68e-01 0.125 0.113 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 7.68e-01 0.0348 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0901 0.114 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.71e-01 0.167 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.102 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.33e-01 0.0901 0.115 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 1.10e-03 0.377 0.114 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.51e-01 0.0174 0.0926 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0962 0.119 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.13e-01 0.139 0.111 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0246 0.125 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 5.72e-01 0.074 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 1.40e-03 0.373 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 1.70e-01 -0.163 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0228 0.116 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0373 0.121 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.82e-01 0.161 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.56e-02 -0.198 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 3.70e-04 0.406 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 5.60e-01 0.0596 0.102 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.33e-01 0.0227 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 1.15e-01 -0.184 0.117 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.44e-01 0.282 0.192 0.126 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 7.35e-01 0.0576 0.17 0.126 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 1.91e-01 -0.127 0.0963 0.126 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 1.97e-01 -0.206 0.159 0.126 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 5.09e-01 0.0967 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 2.75e-02 -0.347 0.155 0.126 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.81e-01 -0.102 0.184 0.126 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 1.63e-02 -0.385 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 8.46e-01 0.0248 0.128 0.141 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 7.86e-01 0.0321 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.45e-01 0.0761 0.0994 0.141 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 8.26e-03 0.269 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 5.11e-01 0.0812 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.28e-03 0.333 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.0933 0.141 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.19e-02 0.279 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.75e-02 -0.201 0.109 0.143 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 5.90e-02 0.228 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 3.12e-01 0.0759 0.0749 0.143 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.56e-01 0.0877 0.118 0.143 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.85e-01 0.129 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 4.08e-01 -0.107 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 9.06e-01 0.0131 0.111 0.156 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 7.15e-01 0.0436 0.119 0.156 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0756 0.0976 0.156 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 2.16e-02 0.264 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0756 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0911 0.117 0.156 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.13e-01 0.0842 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.59e-01 0.069 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.73e-01 0.162 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 1.57e-01 -0.106 0.0743 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0481 0.119 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0321 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 3.20e-01 0.087 0.0873 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 4.40e-01 0.0861 0.111 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0684 0.121 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 1.81e-01 -0.148 0.11 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0822 0.0917 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000966 0.117 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 5.50e-02 -0.212 0.11 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 3.78e-01 0.0839 0.0951 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 3.89e-01 -0.104 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.94e-01 0.129 0.123 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 6.87e-01 0.0484 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.01e-01 0.225 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 2.88e-01 0.138 0.129 0.158 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 6.69e-01 0.0594 0.139 0.158 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 3.82e-01 0.0909 0.104 0.158 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 1.50e-01 0.192 0.132 0.158 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 3.00e-01 -0.132 0.127 0.158 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.02e-02 -0.229 0.116 0.158 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 7.05e-01 0.0496 0.131 0.147 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.46e-01 -0.083 0.109 0.147 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00887 0.116 0.147 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 2.58e-01 0.135 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 3.47e-02 0.194 0.0914 0.147 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.28e-01 0.0242 0.111 0.147 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 7.13e-01 0.0451 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 1.46e-01 -0.171 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 6.03e-01 0.0638 0.123 0.145 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.29e-01 0.0738 0.093 0.145 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 4.31e-02 0.227 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.66e-01 0.0195 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.58e-01 0.139 0.0978 0.145 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.83e-01 0.0165 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.113 0.145 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 8.13e-01 0.0284 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 6.66e-01 0.0528 0.122 0.155 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 5.20e-01 0.0835 0.129 0.155 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 5.86e-01 0.046 0.0843 0.155 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 2.36e-01 -0.141 0.118 0.155 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.23e-01 0.178 0.115 0.155 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.45e-01 0.0083 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 2.73e-01 0.147 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 5.29e-01 0.0752 0.119 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 2.05e-01 -0.12 0.0945 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.43e-01 -0.146 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.18e-01 0.0238 0.103 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 2.58e-01 0.139 0.122 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.113 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 3.60e-03 -0.272 0.0925 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 4.56e-01 0.0869 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.0928 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0275 0.121 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0157 0.0877 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 4.29e-02 0.227 0.111 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.01e-01 -0.031 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 4.89e-01 0.0786 0.113 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0915 0.0879 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 1.19e-01 0.185 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0926 0.072 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0279 0.115 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0953 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 4.37e-01 0.066 0.0847 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.109 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.113 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0878 0.11 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.121 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 8.34e-01 0.0168 0.0802 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 3.95e-01 0.0983 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 6.19e-01 0.0553 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -686489 sc-eQTL 1.15e-02 0.232 0.0908 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 9.80e-01 0.00274 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -802530 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.121 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -557828 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0793 0.0948 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -17406 sc-eQTL 2.88e-01 0.114 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -79995 sc-eQTL 1.27e-03 0.372 0.114 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -777086 sc-eQTL 7.47e-01 0.0262 0.081 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -777151 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0293 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -577600 sc-eQTL 9.69e-01 0.00415 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 eQTL 0.00241 0.0444 0.0146 0.00118 0.0 0.156
ENSG00000137960 GIPC2 -777518 pQTL 0.0173 0.0688 0.0289 0.0 0.0 0.15
ENSG00000142892 PIGK -17406 eQTL 3.98e-12 0.171 0.0243 0.00418 0.0151 0.156
ENSG00000154027 AK5 -79995 eQTL 2.47e-08 0.141 0.0251 0.0 0.0 0.156
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -687515 eQTL 0.0202 0.0685 0.0294 0.0 0.0 0.156


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -481395 5.37e-07 3.11e-07 6.99e-08 2.92e-07 1.06e-07 1.25e-07 3.44e-07 8.37e-08 2.53e-07 1.37e-07 3.21e-07 2.04e-07 3.77e-07 8.55e-08 7.98e-08 1.26e-07 1.17e-07 2.9e-07 8e-08 8.52e-08 1.34e-07 2.24e-07 2.2e-07 4.34e-08 3.98e-07 2e-07 1.57e-07 1.54e-07 1.76e-07 2.02e-07 1.86e-07 5.22e-08 4.97e-08 9.98e-08 1.27e-07 4.86e-08 6.48e-08 5.8e-08 5.8e-08 7.17e-08 5.04e-08 2.6e-07 3.31e-08 1.75e-08 4e-08 1.05e-08 9.12e-08 0.0 4.59e-08
ENSG00000142892 PIGK -17406 2.78e-05 2.96e-05 5.66e-06 1.53e-05 5.54e-06 1.37e-05 4.02e-05 4.94e-06 2.89e-05 1.45e-05 3.69e-05 1.63e-05 4.6e-05 1.26e-05 6.69e-06 1.63e-05 1.53e-05 2.33e-05 7.5e-06 6.6e-06 1.35e-05 2.92e-05 2.89e-05 8.57e-06 4.15e-05 7.59e-06 1.3e-05 1.19e-05 3.01e-05 2.35e-05 1.92e-05 1.64e-06 2.6e-06 7.02e-06 1.12e-05 5.51e-06 3.13e-06 3.16e-06 4.75e-06 3.35e-06 1.74e-06 3.4e-05 2.93e-06 4.38e-07 2.45e-06 3.93e-06 4.08e-06 1.69e-06 1.52e-06
ENSG00000154027 AK5 -79995 7.7e-06 9.52e-06 1.35e-06 4.71e-06 2.1e-06 3.53e-06 9.6e-06 1.93e-06 8.03e-06 4.27e-06 1.06e-05 4.92e-06 1.17e-05 3.91e-06 2.06e-06 5.83e-06 3.86e-06 5.96e-06 2.34e-06 2.62e-06 3.73e-06 7.92e-06 6.78e-06 2.76e-06 1.24e-05 3.09e-06 4.46e-06 3.14e-06 8.02e-06 7.76e-06 4.77e-06 8.78e-07 8.4e-07 2.77e-06 3.56e-06 2.11e-06 1.35e-06 1.49e-06 1.39e-06 8.89e-07 8.78e-07 9.84e-06 1.09e-06 2.07e-07 7.51e-07 1.32e-06 1.08e-06 7.58e-07 5.59e-07