Genes within 1Mb (chr1:77194477:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.85e-01 0.154 0.116 0.139 B L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 1.60e-01 -0.118 0.0837 0.139 B L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0157 0.0901 0.139 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0021 0.0836 0.139 B L1
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 1.03e-01 0.181 0.111 0.139 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0681 0.116 0.139 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0136 0.1 0.139 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 3.36e-02 -0.185 0.0866 0.139 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 7.10e-02 0.19 0.105 0.139 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0271 0.0674 0.139 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.47e-02 0.191 0.0899 0.139 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 6.72e-01 0.0294 0.0693 0.139 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0473 0.0636 0.139 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00953 0.0769 0.139 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0783 0.0793 0.139 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 6.77e-01 0.0414 0.0993 0.139 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 9.99e-01 0.000132 0.0946 0.139 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.101 0.139 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 5.99e-01 0.0328 0.0623 0.139 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0505 0.0762 0.139 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 8.40e-01 -0.021 0.104 0.139 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.80e-01 0.00263 0.105 0.139 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0994 0.102 0.139 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0416 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 7.74e-01 0.0294 0.102 0.142 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 1.20e-01 0.185 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0133 0.0965 0.142 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 4.57e-01 0.0834 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 7.39e-01 0.0359 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00618 0.117 0.142 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.53e-01 0.0397 0.126 0.142 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0132 0.12 0.142 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.119 0.139 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0816 0.0697 0.139 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 6.52e-01 0.0539 0.119 0.139 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0553 0.0964 0.139 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 2.93e-01 0.0825 0.0782 0.139 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.12e-01 0.0394 0.107 0.139 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00802 0.108 0.139 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0449 0.111 0.139 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 4.20e-01 0.0989 0.122 0.139 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0768 0.0963 0.139 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 1.78e-01 0.152 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 4.05e-04 0.418 0.116 0.139 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 6.97e-01 0.0312 0.08 0.139 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0323 0.11 0.139 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.41e-01 -0.035 0.106 0.139 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.23e-01 0.184 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 1.15e-01 0.15 0.0944 0.139 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 2.43e-01 0.11 0.0942 0.139 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 3.89e-02 0.247 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0294 0.0832 0.139 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 2.42e-01 -0.148 0.127 0.139 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.98e-01 0.128 0.123 0.139 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0295 0.113 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0734 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 7.97e-02 -0.241 0.137 0.14 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0973 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 4.46e-01 0.102 0.133 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 3.12e-01 0.109 0.108 0.14 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 5.44e-01 0.0786 0.129 0.14 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0275 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 9.14e-02 -0.209 0.123 0.14 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 4.96e-01 0.0858 0.126 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0862 0.113 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 1.21e-01 -0.204 0.131 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0188 0.108 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 5.51e-01 0.072 0.121 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.82e-01 0.0351 0.127 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 3.39e-01 -0.114 0.119 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0992 0.103 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.34e-01 0.12 0.124 0.136 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0531 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 9.43e-01 0.0095 0.133 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 2.95e-01 0.129 0.123 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 4.10e-01 0.0996 0.121 0.136 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.16e-02 0.225 0.124 0.136 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0655 0.125 0.136 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 5.49e-02 -0.204 0.106 0.136 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.24e-01 0.187 0.121 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0431 0.102 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.93e-01 0.0861 0.125 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0594 0.0948 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 8.40e-02 0.196 0.113 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 2.08e-01 -0.156 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.97e-01 -0.125 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 5.35e-01 -0.058 0.0934 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 2.86e-01 -0.136 0.127 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 3.24e-02 -0.245 0.114 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.75e-01 -0.117 0.131 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 7.38e-01 0.0367 0.109 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 1.36e-01 0.166 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 6.28e-02 0.241 0.129 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 4.56e-02 0.257 0.128 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 3.14e-01 -0.11 0.109 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 8.52e-01 0.025 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.67e-01 0.0548 0.127 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.64e-01 -0.022 0.128 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 5.03e-01 0.0773 0.115 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 2.17e-01 0.156 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 5.89e-01 0.0671 0.124 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 3.60e-02 -0.27 0.128 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.20e-01 0.11 0.11 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 8.89e-01 0.0115 0.0823 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 1.02e-02 0.239 0.0923 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 8.29e-01 0.0174 0.0805 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0346 0.0703 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0619 0.075 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0664 0.086 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.19e-02 0.294 0.116 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0403 0.0883 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.60e-01 0.0224 0.127 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0135 0.0828 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 9.35e-02 -0.148 0.0876 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0543 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0971 0.116 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.41e-01 0.166 0.112 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0115 0.117 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 7.69e-01 0.0363 0.123 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 5.07e-01 0.0772 0.116 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 9.35e-01 0.00857 0.105 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 1.98e-02 -0.285 0.121 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 8.75e-01 0.0199 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.42e-01 -0.117 0.123 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.49e-01 0.0494 0.108 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.64e-01 0.0887 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 1.53e-03 0.358 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00368 0.0991 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 8.11e-01 -0.028 0.117 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 1.38e-01 -0.16 0.108 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 9.77e-01 0.00327 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.32e-01 0.113 0.116 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 9.24e-01 0.0105 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 5.44e-01 0.0674 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0119 0.0848 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0273 0.0925 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.22e-01 0.0396 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0434 0.112 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0327 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.09e-01 0.202 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.20e-01 0.063 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0162 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 7.88e-01 0.0335 0.124 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 3.49e-01 -0.108 0.115 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 3.85e-01 -0.11 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 4.42e-01 0.0995 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 1.24e-01 -0.175 0.113 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 5.56e-01 0.08 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 2.72e-01 -0.15 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 5.67e-01 0.0742 0.129 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 5.22e-01 -0.059 0.0919 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0188 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0448 0.126 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.56e-02 0.238 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0675 0.109 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 5.01e-01 0.0842 0.125 0.141 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 8.94e-02 0.186 0.109 0.141 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 7.47e-01 0.0402 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 3.60e-01 0.0894 0.0974 0.141 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0399 0.119 0.141 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 1.97e-01 -0.157 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0464 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0479 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0288 0.127 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 2.57e-01 0.143 0.126 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.97e-01 0.111 0.13 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 7.75e-02 0.198 0.112 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 3.50e-01 0.108 0.116 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.46e-01 0.00821 0.121 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 3.73e-01 -0.104 0.117 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.85e-01 0.167 0.126 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0311 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.97e-01 0.0804 0.118 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 1.13e-03 0.388 0.117 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 8.73e-01 0.0153 0.0954 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 3.19e-01 -0.122 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.51e-01 0.132 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.39e-01 -0.193 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00681 0.129 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.07e-01 0.0327 0.134 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 7.13e-04 0.406 0.118 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 1.88e-01 -0.161 0.122 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.62e-01 0.00574 0.119 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.28e-01 0.0113 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.124 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 7.97e-02 -0.194 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 2.20e-01 0.143 0.116 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 2.15e-04 0.433 0.115 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 3.92e-01 0.09 0.105 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0402 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 6.86e-02 -0.219 0.119 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 2.70e-01 0.223 0.201 0.122 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.15e-01 0.0894 0.177 0.122 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 1.70e-01 -0.139 0.1 0.122 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 2.92e-01 -0.177 0.167 0.122 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 6.68e-01 0.0656 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.69e-02 -0.292 0.164 0.122 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0568 0.193 0.122 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 1.38e-02 -0.412 0.165 0.122 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 9.00e-01 0.0166 0.131 0.137 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 5.72e-01 0.0577 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 6.86e-03 0.283 0.104 0.137 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 7.92e-02 0.195 0.11 0.137 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.98e-01 0.0325 0.127 0.137 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.02e-03 0.33 0.121 0.137 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 2.89e-01 -0.102 0.0957 0.137 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 4.90e-02 0.247 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 5.85e-02 -0.214 0.112 0.139 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.46e-02 0.25 0.124 0.139 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 3.56e-01 0.0712 0.077 0.139 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 8.89e-01 0.0152 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 4.85e-01 0.0845 0.121 0.139 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.63e-01 0.138 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 4.20e-01 -0.107 0.132 0.151 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0203 0.114 0.151 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 7.62e-01 0.037 0.122 0.151 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 3.08e-01 -0.102 0.0997 0.151 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 3.15e-02 0.253 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0834 0.0959 0.151 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0618 0.12 0.151 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 5.92e-01 0.0707 0.132 0.151 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 6.19e-01 0.0602 0.121 0.151 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.43e-01 0.115 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 1.81e-01 -0.102 0.0761 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00641 0.122 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0448 0.112 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 3.49e-01 0.0839 0.0893 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 4.08e-01 0.0944 0.114 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0517 0.123 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0889 0.113 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.79e-01 0.115 0.13 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.0936 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 9.00e-01 0.0151 0.119 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 6.93e-02 -0.206 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 3.31e-01 0.0947 0.0972 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0838 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.68e-01 0.14 0.126 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 5.96e-01 0.065 0.122 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.148 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 2.56e-01 0.153 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.33e-01 0.0303 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 3.81e-01 0.0943 0.107 0.148 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 1.51e-01 0.197 0.137 0.148 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 2.55e-01 -0.15 0.132 0.148 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00646 0.14 0.148 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 3.12e-02 -0.261 0.12 0.148 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 9.23e-01 -0.013 0.134 0.142 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 3.17e-01 -0.112 0.111 0.142 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0285 0.119 0.142 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 3.08e-01 0.125 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 6.34e-02 0.175 0.0939 0.142 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.35e-01 0.00933 0.114 0.142 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 6.27e-01 0.0609 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 1.41e-01 -0.178 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 9.56e-01 -0.007 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 6.76e-01 0.0401 0.0959 0.14 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.97e-02 0.238 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 9.12e-01 0.0132 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 4.64e-01 0.0742 0.101 0.14 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.48e-01 0.00757 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 6.38e-01 0.0587 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0847 0.116 0.14 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 9.54e-01 0.00723 0.124 0.15 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 7.86e-01 0.0345 0.127 0.15 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 2.63e-01 0.15 0.134 0.15 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 8.67e-01 0.0146 0.0874 0.15 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 1.39e-01 -0.182 0.122 0.15 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 8.32e-02 0.207 0.119 0.15 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.75e-01 0.00389 0.125 0.15 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.49e-01 0.16 0.139 0.15 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 4.47e-01 0.0939 0.123 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.47e-01 0.115 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0915 0.0975 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 3.43e-01 -0.122 0.128 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 4.86e-01 0.0739 0.106 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 6.55e-01 0.0543 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 3.61e-01 0.115 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 2.78e-01 -0.126 0.116 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 4.98e-03 -0.271 0.0954 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 5.06e-01 0.0798 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 1.35e-01 -0.143 0.0954 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 8.35e-01 -0.026 0.125 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0194 0.0902 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 2.47e-02 0.258 0.114 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.34e-01 0.0105 0.126 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 7.15e-01 0.0427 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0903 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 2.68e-01 0.135 0.121 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 1.69e-01 -0.102 0.0737 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 9.47e-01 0.00787 0.118 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 1.68e-01 -0.135 0.0976 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 4.48e-01 0.066 0.0868 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 7.18e-01 0.0406 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00626 0.115 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0467 0.113 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 7.76e-01 0.0354 0.124 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0163 0.0824 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.38e-01 0.092 0.118 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 6.83e-01 0.0466 0.114 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -694036 sc-eQTL 4.51e-02 0.189 0.0938 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00638 0.114 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 4.98e-01 0.0801 0.118 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -810077 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0864 0.121 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 sc-eQTL 3.29e-01 0.121 0.124 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -565375 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0863 0.0976 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -24953 sc-eQTL 4.31e-01 0.0873 0.111 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -87542 sc-eQTL 9.89e-04 0.391 0.117 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -784633 sc-eQTL 5.77e-01 0.0467 0.0835 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -784698 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0558 0.105 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -585147 sc-eQTL 9.77e-01 0.00325 0.111 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -488942 eQTL 0.0113 0.0399 0.0157 0.0 0.0 0.133
ENSG00000137960 GIPC2 -785065 pQTL 0.0222 0.0713 0.0312 0.0 0.0 0.128
ENSG00000142892 PIGK -24953 eQTL 4.46e-06 0.122 0.0265 0.0117 0.0 0.133
ENSG00000154027 AK5 -87542 eQTL 1.09e-05 0.12 0.0272 0.0 0.0 0.133
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -695062 eQTL 0.00335 0.0929 0.0316 0.00142 0.0 0.133


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000142892 PIGK -24953 1.48e-05 1.71e-05 4.28e-06 1.17e-05 4.43e-06 9.27e-06 2.53e-05 3.72e-06 1.85e-05 9.53e-06 2.29e-05 9.22e-06 3.35e-05 7.61e-06 5.37e-06 1.11e-05 1.05e-05 1.71e-05 6.91e-06 5.4e-06 9.77e-06 1.91e-05 1.9e-05 8.13e-06 3.04e-05 6.16e-06 8.36e-06 8.11e-06 2.23e-05 2.25e-05 1.24e-05 1.58e-06 2.56e-06 7.33e-06 8.71e-06 5.31e-06 3.43e-06 3.05e-06 4.75e-06 3.36e-06 1.77e-06 2.12e-05 2.66e-06 5.02e-07 2.48e-06 3.29e-06 3.67e-06 1.58e-06 1.53e-06
ENSG00000154027 AK5 -87542 6.69e-06 8.04e-06 1.34e-06 3.91e-06 2.36e-06 3.26e-06 9.67e-06 1.92e-06 6.61e-06 4.38e-06 9.18e-06 4.49e-06 1.14e-05 3.53e-06 1.91e-06 5.82e-06 3.77e-06 5.33e-06 2.48e-06 2.74e-06 4.52e-06 7.74e-06 6.75e-06 3.25e-06 1.11e-05 3.52e-06 4.46e-06 3e-06 7.98e-06 7.75e-06 4.12e-06 9.88e-07 1.27e-06 3.31e-06 3.3e-06 2.31e-06 1.83e-06 1.83e-06 1.89e-06 9.77e-07 1.05e-06 8.17e-06 1.32e-06 2.22e-07 7.94e-07 1.63e-06 1.35e-06 7.48e-07 4.64e-07