Genes within 1Mb (chr1:77150463:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.143 B L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00512 0.0877 0.143 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0155 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.143 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.143 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 8.97e-01 0.0126 0.0974 0.143 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 4.35e-02 -0.171 0.0844 0.143 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.45e-02 0.217 0.102 0.143 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0271 0.0656 0.143 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.58e-02 0.196 0.0873 0.143 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 6.78e-01 0.028 0.0674 0.143 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0671 0.0618 0.143 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00871 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0971 0.077 0.143 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.63e-01 0.0877 0.0962 0.143 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.77e-01 0.0382 0.0917 0.143 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0975 0.143 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 7.21e-01 0.0217 0.0605 0.143 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0717 0.0739 0.143 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.36e-01 0.00809 0.101 0.143 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 8.60e-01 -0.018 0.102 0.143 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0993 0.143 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0243 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 5.85e-01 0.0544 0.0994 0.146 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.87e-01 0.153 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 8.77e-01 0.0145 0.0939 0.146 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 3.21e-01 0.108 0.109 0.146 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 7.25e-01 0.0369 0.105 0.146 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 7.07e-01 0.0462 0.123 0.146 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.117 0.146 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.143 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0701 0.0679 0.143 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.143 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0563 0.0939 0.143 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.99e-01 0.098 0.0761 0.143 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.39e-01 0.0211 0.104 0.143 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00298 0.105 0.143 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0891 0.108 0.143 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.36e-01 0.115 0.119 0.144 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0705 0.0936 0.144 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.17e-01 0.172 0.109 0.144 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 6.16e-04 0.394 0.113 0.144 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.17e-01 0.018 0.0777 0.144 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.25e-01 -0.01 0.107 0.144 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0311 0.103 0.144 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 8.68e-02 0.198 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 2.20e-01 0.113 0.092 0.143 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0915 0.143 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 5.79e-02 0.22 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0216 0.0809 0.143 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 3.08e-01 -0.126 0.123 0.143 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 1.44e-01 0.175 0.119 0.143 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0617 0.109 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0813 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.20e-02 -0.25 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 3.89e-01 -0.11 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 6.25e-01 0.0636 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 3.91e-01 0.0907 0.106 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0171 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 1.47e-01 -0.175 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.75e-01 0.109 0.122 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0922 0.11 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.33e-01 -0.192 0.127 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0579 0.105 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 4.95e-01 0.0799 0.117 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.98e-01 0.000311 0.123 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0618 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 2.34e-01 -0.119 0.0995 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0675 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0273 0.129 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 4.13e-01 0.0981 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 1.28e-02 0.3 0.119 0.14 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.77e-01 -0.132 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.09e-02 -0.201 0.102 0.14 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.43e-01 0.174 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0531 0.0998 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 3.92e-01 0.105 0.122 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 5.60e-01 -0.054 0.0924 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 1.48e-01 -0.175 0.12 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.00e-01 -0.079 0.117 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0326 0.0911 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0982 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 5.03e-02 -0.218 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.22e-01 -0.156 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.14e-01 0.0391 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.108 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 1.51e-01 0.181 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 3.63e-02 0.261 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 2.85e-01 -0.114 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 7.17e-01 0.0471 0.13 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 7.11e-01 0.0457 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0579 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 6.95e-01 0.0439 0.112 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 1.30e-01 0.185 0.122 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.74e-02 -0.238 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.41e-01 0.126 0.107 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0801 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.02e-02 0.233 0.0898 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 8.82e-01 0.0117 0.0783 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 3.89e-01 -0.059 0.0683 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0601 0.0729 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0675 0.0837 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.46e-03 0.344 0.112 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0645 0.0858 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 7.98e-01 0.0316 0.123 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0805 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.54e-02 -0.152 0.0852 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.92e-01 -0.119 0.113 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.55e-01 0.156 0.11 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00437 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.20e-01 0.0972 0.12 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 6.47e-01 0.0519 0.113 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.72e-01 0.0166 0.103 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 2.72e-02 -0.264 0.119 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0311 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0719 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 7.04e-01 0.0401 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 1.78e-03 0.343 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00785 0.0962 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 7.15e-01 0.0415 0.114 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00138 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 5.63e-01 0.0613 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 7.19e-01 0.0389 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0211 0.0823 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0677 0.0896 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 7.28e-01 0.0376 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0577 0.109 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0659 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.23e-02 0.279 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.67e-01 0.0531 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 9.71e-01 0.00483 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 6.89e-01 0.0485 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.112 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 4.79e-01 0.0891 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 8.30e-02 -0.191 0.11 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 6.00e-01 0.0688 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 3.56e-01 -0.122 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.72e-01 0.09 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0305 0.0887 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0435 0.121 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.98e-01 0.000346 0.122 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0599 0.105 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 5.59e-01 0.0711 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 1.67e-01 0.147 0.106 0.145 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.85e-01 0.0845 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 5.39e-01 0.0582 0.0947 0.145 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00406 0.116 0.145 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 9.80e-01 0.00292 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0821 0.108 0.145 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0402 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.78e-01 0.0902 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 2.68e-01 0.125 0.113 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 7.68e-01 0.0348 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0901 0.114 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.71e-01 0.167 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.102 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.33e-01 0.0901 0.115 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 1.10e-03 0.377 0.114 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.51e-01 0.0174 0.0926 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0962 0.119 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.13e-01 0.139 0.111 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0246 0.125 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 5.72e-01 0.074 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 1.40e-03 0.373 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 1.70e-01 -0.163 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0228 0.116 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0373 0.121 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.82e-01 0.161 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.56e-02 -0.198 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 3.70e-04 0.406 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 5.60e-01 0.0596 0.102 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.33e-01 0.0227 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 1.15e-01 -0.184 0.117 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.44e-01 0.282 0.192 0.126 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 7.35e-01 0.0576 0.17 0.126 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 1.91e-01 -0.127 0.0963 0.126 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 1.97e-01 -0.206 0.159 0.126 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 5.09e-01 0.0967 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 2.75e-02 -0.347 0.155 0.126 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.81e-01 -0.102 0.184 0.126 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 1.63e-02 -0.385 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 8.46e-01 0.0248 0.128 0.141 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 7.86e-01 0.0321 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.45e-01 0.0761 0.0994 0.141 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 8.26e-03 0.269 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 5.11e-01 0.0812 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.28e-03 0.333 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.0933 0.141 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.19e-02 0.279 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.75e-02 -0.201 0.109 0.143 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 5.90e-02 0.228 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 3.12e-01 0.0759 0.0749 0.143 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.56e-01 0.0877 0.118 0.143 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.85e-01 0.129 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 4.08e-01 -0.107 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 9.06e-01 0.0131 0.111 0.156 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 7.15e-01 0.0436 0.119 0.156 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0756 0.0976 0.156 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 2.16e-02 0.264 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0756 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0911 0.117 0.156 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.13e-01 0.0842 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.59e-01 0.069 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.73e-01 0.162 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 1.57e-01 -0.106 0.0743 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0481 0.119 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0321 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 3.20e-01 0.087 0.0873 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 4.40e-01 0.0861 0.111 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0684 0.121 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 1.81e-01 -0.148 0.11 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0822 0.0917 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000966 0.117 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 5.50e-02 -0.212 0.11 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 3.78e-01 0.0839 0.0951 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 3.89e-01 -0.104 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.94e-01 0.129 0.123 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 6.87e-01 0.0484 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.01e-01 0.225 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 2.88e-01 0.138 0.129 0.158 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 6.69e-01 0.0594 0.139 0.158 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 3.82e-01 0.0909 0.104 0.158 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 1.50e-01 0.192 0.132 0.158 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 3.00e-01 -0.132 0.127 0.158 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.02e-02 -0.229 0.116 0.158 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 7.05e-01 0.0496 0.131 0.147 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.46e-01 -0.083 0.109 0.147 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00887 0.116 0.147 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 2.58e-01 0.135 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 3.47e-02 0.194 0.0914 0.147 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.28e-01 0.0242 0.111 0.147 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 7.13e-01 0.0451 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 1.46e-01 -0.171 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 6.03e-01 0.0638 0.123 0.145 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.29e-01 0.0738 0.093 0.145 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 4.31e-02 0.227 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.66e-01 0.0195 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.58e-01 0.139 0.0978 0.145 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.83e-01 0.0165 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.113 0.145 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 8.13e-01 0.0284 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 6.66e-01 0.0528 0.122 0.155 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 5.20e-01 0.0835 0.129 0.155 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 5.86e-01 0.046 0.0843 0.155 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 2.36e-01 -0.141 0.118 0.155 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.23e-01 0.178 0.115 0.155 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.45e-01 0.0083 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 2.73e-01 0.147 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 5.29e-01 0.0752 0.119 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 2.05e-01 -0.12 0.0945 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.43e-01 -0.146 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.18e-01 0.0238 0.103 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 2.58e-01 0.139 0.122 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.113 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 3.60e-03 -0.272 0.0925 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 4.56e-01 0.0869 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.0928 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0275 0.121 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0157 0.0877 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 4.29e-02 0.227 0.111 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.01e-01 -0.031 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 4.89e-01 0.0786 0.113 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0915 0.0879 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 1.19e-01 0.185 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0926 0.072 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0279 0.115 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0953 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 4.37e-01 0.066 0.0847 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.109 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.113 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0878 0.11 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.121 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 8.34e-01 0.0168 0.0802 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 3.95e-01 0.0983 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 6.19e-01 0.0553 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -738050 sc-eQTL 1.15e-02 0.232 0.0908 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 9.80e-01 0.00274 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -854091 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.121 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -609389 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0793 0.0948 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -68967 sc-eQTL 2.88e-01 0.114 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -131556 sc-eQTL 1.27e-03 0.372 0.114 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -828647 sc-eQTL 7.47e-01 0.0262 0.081 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -828712 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0293 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -629161 sc-eQTL 9.69e-01 0.00415 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 eQTL 0.00281 0.0435 0.0145 0.00114 0.0 0.156
ENSG00000137960 GIPC2 -829079 pQTL 0.0152 0.0699 0.0288 0.0 0.0 0.15
ENSG00000142892 PIGK -68967 eQTL 4.15e-12 0.17 0.0242 0.00486 0.0207 0.156
ENSG00000154027 AK5 -131556 eQTL 2.5e-08 0.141 0.025 0.0 0.0 0.156
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -739076 eQTL 0.0229 0.0667 0.0293 0.0 0.0 0.156


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -532956 8.43e-07 8.23e-07 2.88e-07 3.65e-07 1.96e-07 3.22e-07 7.1e-07 3.25e-07 9.02e-07 3.85e-07 1.13e-06 5.48e-07 1.3e-06 2.1e-07 4.26e-07 5.81e-07 7.57e-07 5.27e-07 5.34e-07 3.93e-07 6.13e-07 6.48e-07 5.67e-07 4.44e-07 1.35e-06 2.9e-07 5.04e-07 4.98e-07 6.33e-07 9.25e-07 4.59e-07 4.97e-08 1.79e-07 3.82e-07 3.46e-07 4.12e-07 5.31e-07 1.25e-07 3.5e-07 1.17e-07 1.43e-07 9.59e-07 1.1e-07 8.1e-08 1.82e-07 7.91e-08 2.08e-07 8.25e-08 1.63e-07
ENSG00000142892 PIGK -68967 3.36e-05 3.58e-05 8.72e-06 1.99e-05 9.91e-06 1.86e-05 5.35e-05 9.25e-06 4.86e-05 2.46e-05 5.66e-05 2.48e-05 6.83e-05 1.76e-05 1.03e-05 3.2e-05 2.36e-05 3.66e-05 1.3e-05 1.15e-05 2.68e-05 4.82e-05 3.89e-05 1.44e-05 6.07e-05 1.6e-05 2.38e-05 2.16e-05 4.34e-05 3.09e-05 2.88e-05 3.78e-06 5.88e-06 1.1e-05 1.61e-05 9.22e-06 6.05e-06 5.66e-06 8.56e-06 5.13e-06 2.59e-06 4.51e-05 4.94e-06 1.13e-06 5.4e-06 7.15e-06 6.85e-06 3.73e-06 3.26e-06
ENSG00000154027 AK5 -131556 9.86e-06 1.3e-05 3.38e-06 1.04e-05 3.83e-06 6.21e-06 1.87e-05 3.96e-06 1.73e-05 9.01e-06 1.96e-05 7.98e-06 2.52e-05 5.5e-06 5.11e-06 1.07e-05 8.15e-06 1.29e-05 5.17e-06 4.99e-06 9.45e-06 1.47e-05 1.39e-05 6.27e-06 2.4e-05 5.36e-06 8.03e-06 8.12e-06 1.61e-05 1.15e-05 1.06e-05 1.59e-06 2.22e-06 5.28e-06 6.89e-06 4.5e-06 3.19e-06 2.85e-06 4.13e-06 3.19e-06 1.71e-06 1.83e-05 2.64e-06 5.27e-07 2.49e-06 3.2e-06 3.46e-06 1.69e-06 1.54e-06