Genes within 1Mb (chr1:77141475:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.69e-01 0.156 0.113 0.143 B L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 1.44e-01 -0.119 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00512 0.0877 0.143 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0155 0.0814 0.143 B L1
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.15e-01 0.171 0.108 0.143 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.113 0.143 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 8.97e-01 0.0126 0.0974 0.143 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 4.35e-02 -0.171 0.0844 0.143 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.45e-02 0.217 0.102 0.143 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0271 0.0656 0.143 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.58e-02 0.196 0.0873 0.143 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 6.78e-01 0.028 0.0674 0.143 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0671 0.0618 0.143 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00871 0.0748 0.143 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0971 0.077 0.143 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.63e-01 0.0877 0.0962 0.143 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.77e-01 0.0382 0.0917 0.143 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.63e-01 0.109 0.0975 0.143 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 7.21e-01 0.0217 0.0605 0.143 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0717 0.0739 0.143 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.36e-01 0.00809 0.101 0.143 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 8.60e-01 -0.018 0.102 0.143 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0993 0.143 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0243 0.11 0.146 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 5.85e-01 0.0544 0.0994 0.146 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.87e-01 0.153 0.116 0.146 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 8.77e-01 0.0145 0.0939 0.146 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 3.21e-01 0.108 0.109 0.146 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 7.25e-01 0.0369 0.105 0.146 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.114 0.146 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 7.07e-01 0.0462 0.123 0.146 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 9.25e-01 -0.011 0.117 0.146 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.32e-01 0.174 0.115 0.143 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0701 0.0679 0.143 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.116 0.143 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0563 0.0939 0.143 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.99e-01 0.098 0.0761 0.143 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.39e-01 0.0211 0.104 0.143 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00298 0.105 0.143 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0891 0.108 0.143 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.36e-01 0.115 0.119 0.144 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0705 0.0936 0.144 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.17e-01 0.172 0.109 0.144 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 6.16e-04 0.394 0.113 0.144 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.17e-01 0.018 0.0777 0.144 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.25e-01 -0.01 0.107 0.144 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0311 0.103 0.144 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 8.68e-02 0.198 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 2.20e-01 0.113 0.092 0.143 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0915 0.143 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 5.79e-02 0.22 0.115 0.143 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0216 0.0809 0.143 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 3.08e-01 -0.126 0.123 0.143 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 1.44e-01 0.175 0.119 0.143 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0617 0.109 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0813 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.20e-02 -0.25 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 3.89e-01 -0.11 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 6.25e-01 0.0636 0.13 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 3.91e-01 0.0907 0.106 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.145 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0171 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 1.47e-01 -0.175 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.75e-01 0.109 0.122 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0922 0.11 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.33e-01 -0.192 0.127 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0579 0.105 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 4.95e-01 0.0799 0.117 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.98e-01 0.000311 0.123 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0618 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 2.34e-01 -0.119 0.0995 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0675 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0273 0.129 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 4.13e-01 0.0981 0.12 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 1.28e-02 0.3 0.119 0.14 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.77e-01 -0.132 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.09e-02 -0.201 0.102 0.14 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.43e-01 0.174 0.118 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0531 0.0998 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 3.92e-01 0.105 0.122 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 5.60e-01 -0.054 0.0924 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 1.48e-01 -0.175 0.12 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.00e-01 -0.079 0.117 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0326 0.0911 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0982 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 5.03e-02 -0.218 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.22e-01 -0.156 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.14e-01 0.0391 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.108 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 1.51e-01 0.181 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 3.63e-02 0.261 0.124 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 2.85e-01 -0.114 0.106 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 7.17e-01 0.0471 0.13 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 7.11e-01 0.0457 0.123 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0579 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 6.95e-01 0.0439 0.112 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 1.30e-01 0.185 0.122 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.74e-02 -0.238 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.41e-01 0.126 0.107 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0801 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.02e-02 0.233 0.0898 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 8.82e-01 0.0117 0.0783 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 3.89e-01 -0.059 0.0683 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0601 0.0729 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0675 0.0837 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.46e-03 0.344 0.112 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0645 0.0858 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 7.98e-01 0.0316 0.123 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0805 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.54e-02 -0.152 0.0852 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.92e-01 -0.119 0.113 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.55e-01 0.156 0.11 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00437 0.114 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.20e-01 0.0972 0.12 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 6.47e-01 0.0519 0.113 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.72e-01 0.0166 0.103 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 2.72e-02 -0.264 0.119 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0311 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0719 0.119 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 7.04e-01 0.0401 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.75e-01 0.128 0.117 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 1.78e-03 0.343 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00785 0.0962 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 7.15e-01 0.0415 0.114 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 1.32e-01 -0.158 0.105 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00138 0.108 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 5.63e-01 0.0613 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 7.19e-01 0.0389 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0211 0.0823 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0677 0.0896 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 7.28e-01 0.0376 0.108 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0577 0.109 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0659 0.106 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.23e-02 0.279 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.67e-01 0.0531 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 9.71e-01 0.00483 0.133 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 6.89e-01 0.0485 0.121 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.112 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 2.19e-01 -0.151 0.123 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 4.79e-01 0.0891 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 8.30e-02 -0.191 0.11 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 6.00e-01 0.0688 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 3.56e-01 -0.122 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.72e-01 0.09 0.125 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0305 0.0887 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0435 0.121 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.98e-01 0.000346 0.122 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.129 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0599 0.105 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 5.59e-01 0.0711 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 1.67e-01 0.147 0.106 0.145 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.85e-01 0.0845 0.121 0.145 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 5.39e-01 0.0582 0.0947 0.145 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00406 0.116 0.145 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 1.43e-01 -0.173 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 9.80e-01 0.00292 0.118 0.145 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0821 0.108 0.145 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0402 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.78e-01 0.0902 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 2.68e-01 0.125 0.113 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 7.68e-01 0.0348 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0901 0.114 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.71e-01 0.167 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0103 0.102 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.33e-01 0.0901 0.115 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 1.10e-03 0.377 0.114 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.51e-01 0.0174 0.0926 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0962 0.119 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.13e-01 0.139 0.111 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.87e-01 -0.136 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0246 0.125 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 5.72e-01 0.074 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 1.40e-03 0.373 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 1.70e-01 -0.163 0.119 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0228 0.116 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0373 0.121 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.82e-01 0.161 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.56e-02 -0.198 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 3.70e-04 0.406 0.112 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 5.60e-01 0.0596 0.102 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.33e-01 0.0227 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 1.15e-01 -0.184 0.117 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.44e-01 0.282 0.192 0.126 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 7.35e-01 0.0576 0.17 0.126 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 1.91e-01 -0.127 0.0963 0.126 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 1.97e-01 -0.206 0.159 0.126 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 5.09e-01 0.0967 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 2.75e-02 -0.347 0.155 0.126 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.81e-01 -0.102 0.184 0.126 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 1.63e-02 -0.385 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 8.46e-01 0.0248 0.128 0.141 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 7.86e-01 0.0321 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.45e-01 0.0761 0.0994 0.141 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 8.26e-03 0.269 0.101 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 3.93e-02 0.223 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 5.11e-01 0.0812 0.123 0.141 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.28e-03 0.333 0.118 0.141 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.0933 0.141 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.19e-02 0.279 0.121 0.143 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.75e-02 -0.201 0.109 0.143 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 5.90e-02 0.228 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 3.12e-01 0.0759 0.0749 0.143 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 6.23e-01 0.052 0.106 0.143 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.56e-01 0.0877 0.118 0.143 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.85e-01 0.129 0.12 0.143 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 4.08e-01 -0.107 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 9.06e-01 0.0131 0.111 0.156 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 7.15e-01 0.0436 0.119 0.156 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0756 0.0976 0.156 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 2.16e-02 0.264 0.114 0.156 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0756 0.0937 0.156 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0911 0.117 0.156 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.13e-01 0.0842 0.129 0.156 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.59e-01 0.069 0.118 0.156 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.73e-01 0.162 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 1.57e-01 -0.106 0.0743 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0481 0.119 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0321 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 3.20e-01 0.087 0.0873 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 4.40e-01 0.0861 0.111 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0684 0.121 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 1.81e-01 -0.148 0.11 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.32e-01 0.152 0.127 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0822 0.0917 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000966 0.117 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 5.50e-02 -0.212 0.11 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 3.78e-01 0.0839 0.0951 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 3.89e-01 -0.104 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.94e-01 0.129 0.123 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 6.87e-01 0.0484 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.01e-01 0.225 0.136 0.158 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 2.88e-01 0.138 0.129 0.158 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 6.69e-01 0.0594 0.139 0.158 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 3.82e-01 0.0909 0.104 0.158 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 1.50e-01 0.192 0.132 0.158 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 3.00e-01 -0.132 0.127 0.158 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.02e-02 -0.229 0.116 0.158 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 7.05e-01 0.0496 0.131 0.147 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.46e-01 -0.083 0.109 0.147 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00887 0.116 0.147 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 2.58e-01 0.135 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 3.47e-02 0.194 0.0914 0.147 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.28e-01 0.0242 0.111 0.147 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 7.13e-01 0.0451 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 1.46e-01 -0.171 0.117 0.147 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 6.03e-01 0.0638 0.123 0.145 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.29e-01 0.0738 0.093 0.145 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 4.31e-02 0.227 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.66e-01 0.0195 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.58e-01 0.139 0.0978 0.145 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.83e-01 0.0165 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 3.53e-01 0.112 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.113 0.145 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 8.13e-01 0.0284 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 6.66e-01 0.0528 0.122 0.155 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 5.20e-01 0.0835 0.129 0.155 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 5.86e-01 0.046 0.0843 0.155 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 2.36e-01 -0.141 0.118 0.155 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.23e-01 0.178 0.115 0.155 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.45e-01 0.0083 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 2.73e-01 0.147 0.134 0.155 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 5.29e-01 0.0752 0.119 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.119 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 2.05e-01 -0.12 0.0945 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.43e-01 -0.146 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.18e-01 0.0238 0.103 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 2.58e-01 0.139 0.122 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 3.56e-01 -0.105 0.113 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 3.60e-03 -0.272 0.0925 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 4.56e-01 0.0869 0.116 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 1.56e-01 -0.132 0.0928 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0275 0.121 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0157 0.0877 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 4.29e-02 0.227 0.111 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.01e-01 -0.031 0.123 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 4.89e-01 0.0786 0.113 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0915 0.0879 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 1.19e-01 0.185 0.118 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0926 0.072 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0279 0.115 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 1.70e-01 -0.131 0.0953 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 4.37e-01 0.066 0.0847 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 8.47e-01 0.0211 0.109 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0167 0.113 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0878 0.11 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 3.29e-01 0.118 0.121 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 8.34e-01 0.0168 0.0802 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 3.95e-01 0.0983 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 6.19e-01 0.0553 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -747038 sc-eQTL 1.15e-02 0.232 0.0908 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 9.80e-01 0.00274 0.111 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -863079 sc-eQTL 3.36e-01 -0.114 0.118 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.121 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -618377 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0793 0.0948 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -77955 sc-eQTL 2.88e-01 0.114 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -140544 sc-eQTL 1.27e-03 0.372 0.114 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -837635 sc-eQTL 7.47e-01 0.0262 0.081 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -837700 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0293 0.102 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -638149 sc-eQTL 9.69e-01 0.00415 0.107 0.144 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 eQTL 0.00262 0.0435 0.0144 0.00119 0.0 0.156
ENSG00000137960 GIPC2 -838067 pQTL 0.0142 0.0699 0.0285 0.0 0.0 0.15
ENSG00000142892 PIGK -77955 eQTL 5.1e-12 0.168 0.024 0.00488 0.0216 0.156
ENSG00000154027 AK5 -140544 eQTL 2.7e-08 0.139 0.0248 0.0 0.0 0.156
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -748064 eQTL 0.0257 0.0648 0.029 0.0 0.0 0.156


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -541944 1.24e-06 9.23e-07 3.45e-07 7e-07 2.19e-07 4.35e-07 1.09e-06 2.84e-07 1.14e-06 3.76e-07 1.35e-06 5.7e-07 1.99e-06 2.9e-07 4.61e-07 7.19e-07 7.74e-07 5.48e-07 7.7e-07 6.44e-07 3.91e-07 1.01e-06 8.03e-07 5.01e-07 1.95e-06 3.28e-07 6.53e-07 7.59e-07 8.81e-07 1.21e-06 5.67e-07 3.8e-08 2.33e-07 3.78e-07 4.2e-07 3.71e-07 5.17e-07 1.61e-07 3.2e-07 2.29e-07 2.19e-07 1.43e-06 5.81e-08 1.38e-07 1.69e-07 7.84e-08 1.85e-07 8.8e-08 7.91e-08
ENSG00000142892 PIGK -77955 1.27e-05 1.53e-05 2.65e-06 1.03e-05 2.79e-06 6.28e-06 2.08e-05 3.25e-06 1.6e-05 7.46e-06 1.9e-05 7.38e-06 2.82e-05 6.39e-06 4.83e-06 9.51e-06 8.12e-06 1.23e-05 4.95e-06 4.38e-06 8.07e-06 1.44e-05 1.51e-05 5.75e-06 2.59e-05 5.18e-06 7.59e-06 7.57e-06 1.62e-05 1.74e-05 1.05e-05 1.52e-06 1.88e-06 4.31e-06 7.35e-06 4.06e-06 2.36e-06 2.73e-06 3.31e-06 2.54e-06 1.63e-06 2e-05 2.48e-06 4.21e-07 1.76e-06 2.61e-06 2.46e-06 1.22e-06 1.02e-06
ENSG00000154027 AK5 -140544 7.55e-06 9.55e-06 1.21e-06 5.59e-06 2.26e-06 3.93e-06 1e-05 1.81e-06 8.38e-06 4.81e-06 1.05e-05 4.77e-06 1.36e-05 3.85e-06 2.45e-06 6.38e-06 4.02e-06 5.81e-06 2.54e-06 2.85e-06 4.99e-06 8.12e-06 7.06e-06 3.35e-06 1.29e-05 3.04e-06 4.47e-06 4.08e-06 8.26e-06 8.21e-06 5.07e-06 1.11e-06 1.19e-06 2.9e-06 4.02e-06 2.36e-06 1.91e-06 1.91e-06 2.15e-06 1.03e-06 1.02e-06 1.2e-05 1.4e-06 2.52e-07 7.51e-07 1.68e-06 1.09e-06 8.43e-07 4.19e-07