Genes within 1Mb (chr1:77038317:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 2.93e-01 -0.146 0.139 0.105 B L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 4.73e-01 0.072 0.1 0.105 B L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0237 0.107 0.105 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 2.93e-01 0.105 0.0994 0.105 B L1
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0918 0.133 0.105 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 8.21e-01 0.0315 0.139 0.105 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 5.22e-01 0.0764 0.119 0.105 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.105 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 4.45e-01 0.0797 0.104 0.105 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 6.34e-02 -0.234 0.125 0.105 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.47e-01 0.0759 0.0805 0.105 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.105 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 8.45e-01 0.0162 0.0829 0.105 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0465 0.0761 0.105 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0732 0.0919 0.105 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00549 0.0951 0.105 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 2.55e-01 -0.135 0.119 0.105 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.105 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.18e-02 -0.225 0.12 0.105 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 2.91e-01 0.0788 0.0745 0.105 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.45e-01 0.0298 0.0913 0.105 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.90e-02 0.291 0.123 0.105 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0213 0.126 0.105 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 6.04e-01 0.0603 0.116 0.105 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 8.24e-01 0.0275 0.123 0.105 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0889 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0677 0.121 0.101 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.141 0.101 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0954 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.49e-01 0.0426 0.133 0.101 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 2.61e-01 0.144 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.43e-01 0.0456 0.139 0.101 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 5.81e-01 0.0827 0.15 0.101 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 6.24e-02 0.204 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 3.82e-01 -0.125 0.143 0.101 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0657 0.142 0.105 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.74e-02 0.173 0.0826 0.105 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 1.47e-01 -0.206 0.142 0.105 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 2.78e-01 0.125 0.115 0.105 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 4.72e-01 0.0673 0.0935 0.105 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0983 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.94e-01 -0.11 0.129 0.105 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.10e-01 0.0255 0.106 0.105 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 6.66e-01 0.0571 0.132 0.105 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 2.08e-01 -0.185 0.147 0.105 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 8.77e-01 -0.018 0.116 0.105 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 1.01e-01 -0.222 0.135 0.105 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 1.11e-01 -0.229 0.143 0.105 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 3.02e-01 0.0991 0.0957 0.105 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.06e-02 0.238 0.131 0.105 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0266 0.127 0.105 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.92e-01 -0.184 0.141 0.105 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 2.47e-01 0.13 0.112 0.105 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.26e-01 -0.071 0.112 0.105 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 2.81e-01 -0.153 0.141 0.105 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 9.20e-01 0.00989 0.0984 0.105 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 5.18e-02 0.291 0.149 0.105 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.105 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0354 0.133 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.49e-01 0.237 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0176 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 3.44e-01 0.147 0.154 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.40e-01 0.232 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0164 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 3.03e-01 0.157 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 4.01e-01 -0.138 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0307 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0454 0.147 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0131 0.133 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.34e-01 0.0958 0.154 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.53e-01 0.075 0.126 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 7.86e-01 0.0385 0.141 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 3.36e-01 0.143 0.148 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0325 0.14 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.93e-01 0.0187 0.139 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.33e-02 0.232 0.119 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0117 0.146 0.106 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 8.28e-01 0.0308 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0248 0.157 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 6.88e-01 0.0583 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 4.11e-01 0.116 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.13e-01 -0.054 0.147 0.106 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.04e-01 0.187 0.146 0.106 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.32e-01 0.0276 0.13 0.106 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0363 0.125 0.106 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0308 0.144 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.61e-01 0.111 0.121 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.59e-01 0.0657 0.149 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 6.32e-01 0.0539 0.112 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0445 0.135 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0465 0.147 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 8.26e-01 0.0314 0.142 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 2.27e-01 -0.155 0.128 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 4.01e-01 0.0932 0.111 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.84e-03 -0.383 0.147 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 8.96e-01 0.0176 0.135 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.58e-01 0.0277 0.154 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.25e-01 0.0452 0.128 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 8.64e-01 0.0225 0.131 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 6.69e-01 0.0652 0.152 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.65e-01 0.209 0.15 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0153 0.141 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 4.36e-01 0.1 0.128 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 8.55e-01 0.0295 0.161 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 5.95e-01 0.0811 0.152 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00177 0.154 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 2.24e-01 -0.168 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.81e-01 0.0838 0.152 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 6.45e-01 0.0688 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.57e-01 -0.176 0.155 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.55e-02 -0.219 0.131 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.86e-01 0.0853 0.0982 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0403 0.112 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 4.75e-01 0.0689 0.0961 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.29e-01 -0.053 0.084 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.34e-01 -0.134 0.0893 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 5.09e-01 0.0681 0.103 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 7.80e-02 -0.249 0.14 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 6.64e-01 0.0461 0.106 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 2.71e-01 -0.167 0.152 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.0994 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0074 0.106 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0694 0.132 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 7.02e-01 0.0533 0.139 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 6.14e-01 0.0683 0.135 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 4.95e-01 0.0953 0.139 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.98e-03 0.384 0.145 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 4.82e-01 0.098 0.139 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 2.68e-01 -0.14 0.126 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 2.51e-01 0.169 0.147 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.35e-01 0.226 0.151 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.56e-01 0.00801 0.145 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 7.40e-01 0.0423 0.128 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.01e-01 0.036 0.142 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0453 0.134 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 8.42e-01 0.0233 0.117 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 2.13e-02 0.315 0.136 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 9.83e-01 0.00272 0.127 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 2.26e-01 -0.149 0.122 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 7.76e-01 0.0372 0.131 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.13e-02 -0.35 0.137 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 2.46e-01 0.151 0.13 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 7.67e-02 -0.234 0.131 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 1.20e-01 0.157 0.101 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0497 0.11 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 4.91e-01 0.0913 0.132 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.63e-01 0.122 0.134 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 9.68e-01 0.00562 0.14 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0281 0.13 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000648 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 7.86e-01 0.0437 0.161 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 4.62e-01 -0.128 0.173 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 9.74e-01 0.00517 0.158 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 9.29e-01 0.0131 0.147 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 2.33e-01 0.192 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 7.07e-01 0.0616 0.164 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00272 0.113 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 4.25e-01 -0.115 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 8.58e-01 0.029 0.162 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 1.13e-01 0.258 0.162 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 1.23e-01 -0.239 0.154 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 3.62e-01 0.1 0.11 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 3.48e-01 -0.141 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 2.02e-02 0.349 0.149 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.43e-01 -0.152 0.16 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0436 0.111 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 2.77e-01 -0.142 0.13 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 5.77e-01 0.0832 0.149 0.102 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 4.64e-01 0.0958 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0559 0.148 0.102 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 5.50e-01 0.0695 0.116 0.102 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 4.67e-01 -0.104 0.142 0.102 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.10e-02 0.367 0.143 0.102 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 5.36e-02 0.279 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0811 0.133 0.102 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 3.79e-01 0.137 0.156 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.60e-01 -0.143 0.155 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0219 0.161 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0293 0.139 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 6.23e-01 0.0703 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 2.48e-03 0.446 0.146 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 9.72e-02 0.238 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.28e-02 -0.258 0.153 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0924 0.127 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.41e-02 -0.277 0.143 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 1.57e-01 -0.208 0.146 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.37e-01 0.0719 0.116 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0821 0.149 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0453 0.14 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 5.55e-02 -0.303 0.157 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.37e-01 -0.15 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 1.74e-01 -0.221 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 8.16e-02 -0.256 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 2.33e-02 0.336 0.147 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0414 0.145 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.09e-01 0.242 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.57e-01 -0.221 0.156 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0139 0.14 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0469 0.147 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 3.40e-01 -0.143 0.15 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.99e-01 0.0338 0.132 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.22e-01 0.215 0.138 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.31e-01 -0.182 0.151 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.23e-01 -0.294 0.189 0.119 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00761 0.168 0.119 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0404 0.0959 0.119 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 3.01e-01 -0.164 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 2.37e-01 -0.171 0.144 0.119 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0525 0.182 0.119 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0659 0.132 0.119 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0243 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 3.32e-02 -0.325 0.152 0.107 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 1.24e-01 0.218 0.141 0.107 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.09e-01 -0.061 0.119 0.107 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 4.85e-02 0.256 0.129 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 8.92e-02 0.251 0.147 0.107 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.70e-01 -0.159 0.144 0.107 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0611 0.112 0.107 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 2.34e-01 -0.18 0.151 0.105 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.16e-01 0.0144 0.136 0.105 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 9.25e-01 0.014 0.15 0.105 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00292 0.0925 0.105 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.07e-01 0.0867 0.13 0.105 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 6.97e-01 0.0565 0.145 0.105 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.77e-01 -0.131 0.148 0.105 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.75e-01 -0.231 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.09e-01 -0.149 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 4.95e-01 -0.107 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 6.36e-01 0.0611 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.20e-01 0.0547 0.152 0.1 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 5.40e-01 -0.076 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.41e-01 -0.227 0.153 0.1 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 4.38e-01 0.132 0.169 0.1 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 3.66e-01 0.115 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 6.81e-02 -0.283 0.154 0.1 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 3.72e-03 -0.42 0.143 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 4.20e-01 0.0741 0.0917 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0968 0.146 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.75e-01 0.182 0.134 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 6.90e-01 0.0429 0.108 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.10e-01 -0.051 0.137 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0588 0.148 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.38e-01 0.0243 0.119 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 6.67e-01 0.0586 0.136 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 3.96e-01 0.133 0.156 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 1.10e-01 0.18 0.112 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 4.11e-02 -0.291 0.142 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00578 0.136 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 9.59e-01 0.00608 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00418 0.148 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.92e-01 -0.197 0.151 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.92e-01 0.0165 0.122 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.59e-01 0.086 0.147 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 7.29e-02 -0.341 0.189 0.097 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 5.01e-01 0.122 0.18 0.097 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0157 0.193 0.097 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 6.39e-01 0.0679 0.144 0.097 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.06e-01 -0.299 0.184 0.097 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 8.41e-01 0.0356 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.54e-01 -0.267 0.186 0.097 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0736 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 4.86e-01 0.117 0.168 0.1 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 6.33e-02 0.258 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0809 0.149 0.1 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.97e-02 0.355 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 5.86e-01 0.0646 0.118 0.1 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.91e-01 0.186 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.65e-01 -0.175 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 2.01e-01 -0.183 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 7.95e-01 0.0393 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 6.95e-01 0.0616 0.157 0.102 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0762 0.119 0.102 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 5.02e-01 0.0966 0.144 0.102 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 5.08e-01 0.0978 0.147 0.102 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 8.20e-01 0.0285 0.126 0.102 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0125 0.143 0.102 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.19e-02 0.331 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 7.71e-02 0.258 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 1.98e-01 0.186 0.144 0.102 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 5.25e-01 0.104 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 9.61e-01 0.00822 0.167 0.09 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 3.93e-01 0.152 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.09 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 3.71e-01 0.146 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 1.35e-02 0.389 0.156 0.09 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 1.26e-01 0.251 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 6.68e-01 -0.079 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 5.13e-01 0.0689 0.105 0.09 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 3.66e-01 -0.148 0.163 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 7.34e-01 -0.049 0.144 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0279 0.115 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 3.88e-01 0.131 0.151 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 9.61e-02 0.208 0.124 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0618 0.143 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 7.51e-01 0.0473 0.149 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 6.08e-01 0.0704 0.137 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 9.78e-01 0.00383 0.139 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 1.78e-01 0.154 0.114 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 9.89e-02 -0.233 0.141 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 3.01e-01 0.117 0.113 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 3.54e-01 0.137 0.147 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 7.09e-01 0.0399 0.107 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0432 0.136 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 9.11e-01 0.0167 0.149 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 3.34e-01 0.133 0.138 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 3.54e-01 -0.115 0.124 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.89e-01 0.0579 0.107 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 3.01e-01 -0.151 0.146 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 1.08e-01 0.143 0.0886 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.99e-02 -0.257 0.141 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.85e-01 0.156 0.117 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 5.05e-01 0.0698 0.105 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0771 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 2.32e-01 -0.166 0.138 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 8.42e-01 0.022 0.11 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 5.81e-01 0.0749 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 6.05e-01 0.0794 0.153 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 2.31e-01 0.122 0.101 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0366 0.146 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 1.98e-01 0.181 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -850196 sc-eQTL 5.73e-01 0.0659 0.117 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 1.60e-01 0.205 0.145 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0484 0.148 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -966237 sc-eQTL 3.33e-01 0.145 0.149 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 sc-eQTL 1.13e-01 -0.236 0.148 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -721535 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0265 0.117 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -181113 sc-eQTL 6.50e-02 -0.244 0.132 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -243702 sc-eQTL 7.45e-02 -0.256 0.143 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -940793 sc-eQTL 2.55e-01 0.114 0.0998 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -940858 sc-eQTL 3.25e-01 0.124 0.125 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -741307 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0635 0.133 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 eQTL 0.0186 0.0455 0.0193 0.00199 0.0 0.0859
ENSG00000162614 NEXN -850196 pQTL 0.0423 -0.0514 0.0253 0.0 0.0 0.0907
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 963571 eQTL 0.00244 0.0884 0.0291 0.0049 0.00284 0.0859
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -851222 eQTL 0.000853 -0.13 0.0387 0.0 0.0 0.0859


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -645102 3.53e-07 1.92e-07 6.57e-08 2.45e-07 1.01e-07 1.13e-07 3.11e-07 5.89e-08 1.94e-07 1.05e-07 2.04e-07 1.52e-07 3.95e-07 8.54e-08 6.6e-08 9.48e-08 7.3e-08 2.15e-07 7.42e-08 7.05e-08 1.33e-07 1.98e-07 1.89e-07 4.37e-08 2.86e-07 1.56e-07 1.25e-07 1.42e-07 1.44e-07 1.69e-07 1.43e-07 4.29e-08 4.76e-08 1.03e-07 7.55e-08 3.18e-08 5.62e-08 5.92e-08 5.69e-08 6.55e-08 4.79e-08 2e-07 3.18e-08 1.75e-08 3.48e-08 6.53e-09 8.21e-08 2.23e-09 4.94e-08
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -851222 2.76e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.89e-07 9.24e-08 9.05e-08 1.73e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.79e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.49e-08 4.18e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.89e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.64e-08 1.65e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.23e-07 9.49e-08 1.08e-07 3.03e-08 3.51e-08 8.72e-08 3.46e-08 3.53e-08 5.65e-08 8.68e-08 6.43e-08 4.19e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.43e-08 4.67e-08 1.84e-08 1.2e-07 1.88e-09 4.88e-08