Genes within 1Mb (chr1:77033182:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 2.93e-01 -0.146 0.139 0.105 B L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 4.73e-01 0.072 0.1 0.105 B L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0237 0.107 0.105 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 2.93e-01 0.105 0.0994 0.105 B L1
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0918 0.133 0.105 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 8.21e-01 0.0315 0.139 0.105 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 5.22e-01 0.0764 0.119 0.105 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.105 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 4.45e-01 0.0797 0.104 0.105 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 6.34e-02 -0.234 0.125 0.105 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.47e-01 0.0759 0.0805 0.105 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.91e-01 -0.015 0.109 0.105 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 8.45e-01 0.0162 0.0829 0.105 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0465 0.0761 0.105 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0732 0.0919 0.105 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00549 0.0951 0.105 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 2.55e-01 -0.135 0.119 0.105 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.105 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.18e-02 -0.225 0.12 0.105 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 2.91e-01 0.0788 0.0745 0.105 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.45e-01 0.0298 0.0913 0.105 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.90e-02 0.291 0.123 0.105 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0213 0.126 0.105 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 6.04e-01 0.0603 0.116 0.105 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 8.24e-01 0.0275 0.123 0.105 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0889 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0677 0.121 0.101 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 3.11e-01 -0.144 0.141 0.101 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0954 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.49e-01 0.0426 0.133 0.101 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 2.61e-01 0.144 0.127 0.101 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.43e-01 0.0456 0.139 0.101 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 5.81e-01 0.0827 0.15 0.101 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 6.24e-02 0.204 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 3.82e-01 -0.125 0.143 0.101 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0657 0.142 0.105 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.74e-02 0.173 0.0826 0.105 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 1.47e-01 -0.206 0.142 0.105 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 2.78e-01 0.125 0.115 0.105 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 4.72e-01 0.0673 0.0935 0.105 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0983 0.127 0.105 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.94e-01 -0.11 0.129 0.105 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.10e-01 0.0255 0.106 0.105 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 6.66e-01 0.0571 0.132 0.105 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 2.08e-01 -0.185 0.147 0.105 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 8.77e-01 -0.018 0.116 0.105 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 1.01e-01 -0.222 0.135 0.105 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 1.11e-01 -0.229 0.143 0.105 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 3.02e-01 0.0991 0.0957 0.105 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.06e-02 0.238 0.131 0.105 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0266 0.127 0.105 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.92e-01 -0.184 0.141 0.105 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 2.47e-01 0.13 0.112 0.105 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.26e-01 -0.071 0.112 0.105 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 2.81e-01 -0.153 0.141 0.105 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 9.20e-01 0.00989 0.0984 0.105 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 5.18e-02 0.291 0.149 0.105 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0246 0.146 0.105 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0354 0.133 0.105 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.49e-01 0.237 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0176 0.163 0.107 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 3.44e-01 0.147 0.154 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.40e-01 0.232 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0164 0.128 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 3.03e-01 0.157 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 4.01e-01 -0.138 0.164 0.107 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 1.58e-01 0.192 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0307 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0454 0.147 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0131 0.133 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.34e-01 0.0958 0.154 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.53e-01 0.075 0.126 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 7.86e-01 0.0385 0.141 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 3.36e-01 0.143 0.148 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0325 0.14 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.93e-01 0.0187 0.139 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.33e-02 0.232 0.119 0.105 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0117 0.146 0.106 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 8.28e-01 0.0308 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0248 0.157 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 6.88e-01 0.0583 0.145 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 4.11e-01 0.116 0.141 0.106 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.13e-01 -0.054 0.147 0.106 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.04e-01 0.187 0.146 0.106 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.32e-01 0.0276 0.13 0.106 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0363 0.125 0.106 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0308 0.144 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.61e-01 0.111 0.121 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.59e-01 0.0657 0.149 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 6.32e-01 0.0539 0.112 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0445 0.135 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0465 0.147 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 8.26e-01 0.0314 0.142 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 2.27e-01 -0.155 0.128 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 4.01e-01 0.0932 0.111 0.105 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.84e-03 -0.383 0.147 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 8.96e-01 0.0176 0.135 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.58e-01 0.0277 0.154 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.25e-01 0.0452 0.128 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 8.64e-01 0.0225 0.131 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 6.69e-01 0.0652 0.152 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.65e-01 0.209 0.15 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0153 0.141 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 4.36e-01 0.1 0.128 0.105 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 8.55e-01 0.0295 0.161 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 5.95e-01 0.0811 0.152 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00177 0.154 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 2.24e-01 -0.168 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.81e-01 0.0838 0.152 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 6.45e-01 0.0688 0.149 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.57e-01 -0.176 0.155 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.55e-02 -0.219 0.131 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.86e-01 0.0853 0.0982 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0403 0.112 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 4.75e-01 0.0689 0.0961 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.29e-01 -0.053 0.084 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.34e-01 -0.134 0.0893 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 5.09e-01 0.0681 0.103 0.105 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 7.80e-02 -0.249 0.14 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 6.64e-01 0.0461 0.106 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 2.71e-01 -0.167 0.152 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 9.01e-01 0.0124 0.0994 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0074 0.106 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0694 0.132 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 7.02e-01 0.0533 0.139 0.105 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 6.14e-01 0.0683 0.135 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 4.95e-01 0.0953 0.139 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.98e-03 0.384 0.145 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 4.82e-01 0.098 0.139 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 2.68e-01 -0.14 0.126 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 2.51e-01 0.169 0.147 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.35e-01 0.226 0.151 0.105 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.56e-01 0.00801 0.145 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 7.40e-01 0.0423 0.128 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.01e-01 0.036 0.142 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0453 0.134 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 8.42e-01 0.0233 0.117 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 2.13e-02 0.315 0.136 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 9.83e-01 0.00272 0.127 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 2.26e-01 -0.149 0.122 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 7.76e-01 0.0372 0.131 0.105 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.13e-02 -0.35 0.137 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 2.46e-01 0.151 0.13 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 7.67e-02 -0.234 0.131 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 1.20e-01 0.157 0.101 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0497 0.11 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 4.91e-01 0.0913 0.132 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.63e-01 0.122 0.134 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 9.68e-01 0.00562 0.14 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0281 0.13 0.105 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000648 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 7.86e-01 0.0437 0.161 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 4.62e-01 -0.128 0.173 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 9.74e-01 0.00517 0.158 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 9.29e-01 0.0131 0.147 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 2.33e-01 0.192 0.16 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 7.07e-01 0.0616 0.164 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00272 0.113 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 4.25e-01 -0.115 0.144 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 8.58e-01 0.029 0.162 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 1.13e-01 0.258 0.162 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 1.23e-01 -0.239 0.154 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 3.62e-01 0.1 0.11 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 3.48e-01 -0.141 0.15 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 2.02e-02 0.349 0.149 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.43e-01 -0.152 0.16 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0436 0.111 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 2.77e-01 -0.142 0.13 0.107 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 5.77e-01 0.0832 0.149 0.102 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 4.64e-01 0.0958 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0559 0.148 0.102 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 5.50e-01 0.0695 0.116 0.102 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 4.67e-01 -0.104 0.142 0.102 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.10e-02 0.367 0.143 0.102 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 5.36e-02 0.279 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0811 0.133 0.102 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 3.79e-01 0.137 0.156 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.60e-01 -0.143 0.155 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0219 0.161 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0293 0.139 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 6.23e-01 0.0703 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 2.48e-03 0.446 0.146 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 9.72e-02 0.238 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.28e-02 -0.258 0.153 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0924 0.127 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.41e-02 -0.277 0.143 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 1.57e-01 -0.208 0.146 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.37e-01 0.0719 0.116 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0821 0.149 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0453 0.14 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 5.55e-02 -0.303 0.157 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.37e-01 -0.15 0.156 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 1.74e-01 -0.221 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 8.16e-02 -0.256 0.146 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 2.33e-02 0.336 0.147 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0414 0.145 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.09e-01 0.242 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.57e-01 -0.221 0.156 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0139 0.14 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0469 0.147 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 3.40e-01 -0.143 0.15 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.99e-01 0.0338 0.132 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.22e-01 0.215 0.138 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.31e-01 -0.182 0.151 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.23e-01 -0.294 0.189 0.119 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00761 0.168 0.119 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0404 0.0959 0.119 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 3.01e-01 -0.164 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 2.37e-01 -0.171 0.144 0.119 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.157 0.119 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0525 0.182 0.119 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0659 0.132 0.119 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0243 0.16 0.119 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 3.32e-02 -0.325 0.152 0.107 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 1.24e-01 0.218 0.141 0.107 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.09e-01 -0.061 0.119 0.107 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 4.85e-02 0.256 0.129 0.107 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 8.92e-02 0.251 0.147 0.107 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.70e-01 -0.159 0.144 0.107 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0611 0.112 0.107 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 2.34e-01 -0.18 0.151 0.105 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.16e-01 0.0144 0.136 0.105 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 9.25e-01 0.014 0.15 0.105 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00292 0.0925 0.105 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.07e-01 0.0867 0.13 0.105 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 6.97e-01 0.0565 0.145 0.105 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.77e-01 -0.131 0.148 0.105 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.75e-01 -0.231 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.09e-01 -0.149 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 4.95e-01 -0.107 0.157 0.1 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 6.36e-01 0.0611 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.20e-01 0.0547 0.152 0.1 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 5.40e-01 -0.076 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.41e-01 -0.227 0.153 0.1 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 4.38e-01 0.132 0.169 0.1 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 3.66e-01 0.115 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 6.81e-02 -0.283 0.154 0.1 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 3.72e-03 -0.42 0.143 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 4.20e-01 0.0741 0.0917 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0968 0.146 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.75e-01 0.182 0.134 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 6.90e-01 0.0429 0.108 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.10e-01 -0.051 0.137 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0588 0.148 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.38e-01 0.0243 0.119 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 6.67e-01 0.0586 0.136 0.105 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 3.96e-01 0.133 0.156 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 1.10e-01 0.18 0.112 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 4.11e-02 -0.291 0.142 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00578 0.136 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 9.59e-01 0.00608 0.117 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00418 0.148 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.92e-01 -0.197 0.151 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.92e-01 0.0165 0.122 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.59e-01 0.086 0.147 0.105 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 7.29e-02 -0.341 0.189 0.097 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 5.01e-01 0.122 0.18 0.097 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0157 0.193 0.097 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 6.39e-01 0.0679 0.144 0.097 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.06e-01 -0.299 0.184 0.097 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 8.41e-01 0.0356 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.54e-01 -0.267 0.186 0.097 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0736 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 4.86e-01 0.117 0.168 0.1 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 6.33e-02 0.258 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0809 0.149 0.1 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.97e-02 0.355 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 5.86e-01 0.0646 0.118 0.1 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.91e-01 0.186 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.65e-01 -0.175 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 2.01e-01 -0.183 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 7.95e-01 0.0393 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 6.95e-01 0.0616 0.157 0.102 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0762 0.119 0.102 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 5.02e-01 0.0966 0.144 0.102 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 5.08e-01 0.0978 0.147 0.102 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 8.20e-01 0.0285 0.126 0.102 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0125 0.143 0.102 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.19e-02 0.331 0.153 0.102 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 7.71e-02 0.258 0.145 0.102 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 1.98e-01 0.186 0.144 0.102 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 5.25e-01 0.104 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 9.61e-01 0.00822 0.167 0.09 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 3.93e-01 0.152 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.09 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 3.71e-01 0.146 0.162 0.09 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 1.35e-02 0.389 0.156 0.09 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 1.26e-01 0.251 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 6.68e-01 -0.079 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 5.13e-01 0.0689 0.105 0.09 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 3.66e-01 -0.148 0.163 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 7.34e-01 -0.049 0.144 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0279 0.115 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 3.88e-01 0.131 0.151 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 9.61e-02 0.208 0.124 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0618 0.143 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 7.51e-01 0.0473 0.149 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 6.08e-01 0.0704 0.137 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 9.78e-01 0.00383 0.139 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 1.78e-01 0.154 0.114 0.105 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 9.89e-02 -0.233 0.141 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 3.01e-01 0.117 0.113 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 3.54e-01 0.137 0.147 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 7.09e-01 0.0399 0.107 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0432 0.136 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 9.11e-01 0.0167 0.149 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 3.34e-01 0.133 0.138 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 3.54e-01 -0.115 0.124 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.89e-01 0.0579 0.107 0.105 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 3.01e-01 -0.151 0.146 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 1.08e-01 0.143 0.0886 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.99e-02 -0.257 0.141 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.85e-01 0.156 0.117 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 5.05e-01 0.0698 0.105 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0771 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 2.32e-01 -0.166 0.138 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 8.42e-01 0.022 0.11 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 5.81e-01 0.0749 0.135 0.105 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 6.05e-01 0.0794 0.153 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 2.31e-01 0.122 0.101 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0366 0.146 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 1.98e-01 0.181 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -855331 sc-eQTL 5.73e-01 0.0659 0.117 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 3.83e-01 0.123 0.14 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 1.60e-01 0.205 0.145 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0484 0.148 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -971372 sc-eQTL 3.33e-01 0.145 0.149 0.106 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 sc-eQTL 1.13e-01 -0.236 0.148 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -726670 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0265 0.117 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -186248 sc-eQTL 6.50e-02 -0.244 0.132 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -248837 sc-eQTL 7.45e-02 -0.256 0.143 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -945928 sc-eQTL 2.55e-01 0.114 0.0998 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -945993 sc-eQTL 3.25e-01 0.124 0.125 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -746442 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0635 0.133 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 eQTL 0.0159 0.0465 0.0193 0.00218 0.0 0.0868
ENSG00000162614 NEXN -855331 pQTL 0.038 -0.0525 0.0253 0.0 0.0 0.0914
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 958436 eQTL 0.00394 0.0838 0.029 0.00372 0.00188 0.0868
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -856357 eQTL 0.001 -0.127 0.0386 0.0 0.0 0.0868


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000036549 AC118549.1 -650237 2.6e-07 1.06e-07 3.69e-08 1.78e-07 9.91e-08 9.36e-08 1.41e-07 5.24e-08 1.42e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.6e-08 1.3e-07 6.07e-08 4.89e-08 8.01e-08 5.15e-08 1.1e-07 5.19e-08 3.15e-08 1.05e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.99e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.13e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.82e-08 2.74e-08 8.26e-08 9.56e-08 3.97e-08 5.54e-08 8.28e-08 8.14e-08 3.09e-08 3.89e-08 1.31e-07 4.34e-08 2.88e-08 1.09e-07 1.74e-08 1.26e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -856357 2.56e-07 1.11e-07 3.44e-08 1.68e-07 1.02e-07 9.05e-08 1.36e-07 5.29e-08 1.36e-07 3.99e-08 1.61e-07 7.49e-08 1.23e-07 6.1e-08 4.77e-08 7.76e-08 5.15e-08 1.06e-07 5.22e-08 2.88e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.19e-08 1.33e-07 1.09e-07 1.11e-07 8.49e-08 1.05e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.59e-08 2.75e-08 8.09e-08 1.01e-07 4.19e-08 5.1e-08 8.48e-08 8.48e-08 3.69e-08 3.07e-08 1.37e-07 4.33e-08 3.48e-08 1.12e-07 1.8e-08 1.44e-07 4.96e-09 4.72e-08