logo

Genes within 1Mb (chr1:77022736:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 4.51e-01 -0.116 0.153 0.075 B L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0499 0.111 0.075 B L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.33e-01 -0.074 0.118 0.075 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 2.69e-01 0.121 0.11 0.075 B L1
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0977 0.146 0.075 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.12e-01 -0.243 0.152 0.075 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 6.88e-01 0.0528 0.132 0.075 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.14e-01 0.0139 0.129 0.075 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 2.87e-01 0.123 0.115 0.075 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.05e-01 -0.178 0.14 0.075 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0732 0.0894 0.075 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.121 0.075 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 9.45e-01 0.00633 0.092 0.075 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.49e-01 0.00536 0.0845 0.075 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0732 0.102 0.075 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.42e-01 -0.1 0.105 0.075 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0212 0.131 0.075 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 1.56e-01 0.177 0.124 0.075 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 2.97e-02 -0.288 0.131 0.075 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 8.93e-01 0.0111 0.0822 0.075 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.69e-01 0.0729 0.101 0.075 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.11e-01 0.139 0.137 0.075 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0731 0.138 0.075 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 3.61e-01 0.117 0.128 0.075 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.79e-01 0.119 0.135 0.075 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0388 0.156 0.07 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 1.57e-01 -0.199 0.14 0.07 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 3.63e-01 -0.15 0.164 0.07 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 3.01e-01 -0.138 0.133 0.07 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00586 0.155 0.07 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 2.11e-01 0.185 0.148 0.07 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 2.92e-01 -0.17 0.161 0.07 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.43e-01 0.134 0.174 0.07 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.63e-02 0.211 0.127 0.07 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 5.09e-01 -0.11 0.166 0.07 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 9.54e-01 0.00921 0.16 0.075 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 7.57e-02 0.166 0.0932 0.075 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 3.31e-02 -0.34 0.158 0.075 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 5.70e-01 0.0736 0.129 0.075 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.12e-01 0.0534 0.105 0.075 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 7.80e-01 -0.04 0.143 0.075 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.87e-01 -0.101 0.145 0.075 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.25e-01 0.0113 0.119 0.075 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 6.06e-01 0.0768 0.149 0.075 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 4.97e-01 -0.11 0.162 0.075 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 5.57e-01 0.075 0.128 0.075 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 3.37e-01 -0.144 0.149 0.075 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 2.86e-01 -0.169 0.158 0.075 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.39e-01 0.0353 0.106 0.075 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 9.67e-01 0.00606 0.145 0.075 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.14e-01 -0.141 0.14 0.075 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.07e-01 -0.197 0.156 0.075 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.82e-01 0.0185 0.124 0.075 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 1.09e-01 -0.198 0.123 0.075 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 1.67e-01 -0.216 0.156 0.075 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.60e-01 0.00542 0.109 0.075 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.00e-01 0.273 0.165 0.075 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0383 0.161 0.075 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 6.64e-01 -0.064 0.147 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 5.77e-01 0.101 0.181 0.079 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0189 0.179 0.079 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 7.20e-01 0.0611 0.17 0.079 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 8.62e-02 0.296 0.171 0.079 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 8.48e-01 -0.027 0.141 0.079 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0709 0.168 0.079 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 9.98e-01 0.000405 0.181 0.079 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 4.46e-01 0.114 0.15 0.079 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 7.62e-01 0.0489 0.161 0.079 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0212 0.164 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0214 0.148 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.67e-01 0.125 0.171 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.62e-01 0.103 0.14 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.67e-01 0.0675 0.157 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 9.28e-01 -0.015 0.165 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.66e-01 -0.113 0.155 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 3.94e-01 0.131 0.154 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 1.44e-01 0.195 0.133 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 3.46e-01 0.151 0.16 0.075 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0247 0.155 0.075 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0328 0.172 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.74e-01 0.114 0.159 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0227 0.156 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 8.82e-01 -0.024 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 2.86e-01 0.172 0.161 0.075 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 7.77e-01 0.0404 0.143 0.075 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 6.57e-01 0.061 0.137 0.075 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.41e-01 -0.032 0.159 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0154 0.134 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 8.19e-01 0.0376 0.164 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 6.55e-01 0.0553 0.124 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0662 0.148 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.76e-01 -0.219 0.161 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 6.17e-01 0.0783 0.156 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0545 0.141 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 2.58e-01 0.138 0.122 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 1.82e-02 -0.388 0.163 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0912 0.149 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0254 0.17 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 8.04e-01 0.0352 0.142 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.55e-01 -0.065 0.145 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.06e-01 -0.173 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.16e-01 0.168 0.167 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.44e-01 0.0109 0.156 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 7.80e-01 0.0398 0.142 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 3.22e-01 -0.18 0.181 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 6.52e-01 0.0777 0.172 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.66e-01 0.0998 0.173 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 4.20e-01 -0.126 0.156 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 6.63e-01 0.0747 0.171 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0729 0.168 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 1.72e-02 -0.415 0.173 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 1.43e-01 -0.213 0.145 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0964 0.108 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0831 0.124 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 6.11e-01 0.0541 0.106 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 8.06e-01 0.0229 0.0928 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0574 0.099 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0617 0.114 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 3.48e-01 -0.149 0.158 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0412 0.119 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0526 0.17 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0485 0.111 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.38e-01 0.00921 0.119 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0932 0.148 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.70e-01 0.113 0.156 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0356 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 5.94e-01 0.0829 0.155 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.06e-02 0.32 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 7.97e-01 0.0399 0.155 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0794 0.14 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.94e-01 0.213 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.20e-01 0.168 0.168 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.62e-01 0.0703 0.16 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.93e-01 0.0191 0.141 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 2.08e-01 -0.199 0.157 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0495 0.149 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 8.81e-01 0.0193 0.129 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.37e-01 0.147 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 9.75e-01 0.00443 0.141 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 1.98e-01 -0.175 0.136 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00748 0.145 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 5.00e-01 -0.104 0.154 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 4.70e-01 0.105 0.144 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 2.26e-01 -0.178 0.147 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 9.40e-01 0.00848 0.112 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.43e-01 0.0403 0.123 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0356 0.147 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.65e-01 0.135 0.149 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.00e-01 0.0196 0.156 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 5.06e-01 0.0962 0.145 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 7.27e-01 0.0631 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 2.49e-01 0.21 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 3.45e-01 -0.185 0.196 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 5.87e-01 0.0968 0.178 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0107 0.166 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.76e-01 0.102 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0613 0.185 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0888 0.127 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0038 0.163 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.69e-01 -0.078 0.182 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 6.04e-02 0.343 0.182 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.06e-01 -0.145 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 7.12e-01 0.0458 0.124 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0201 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.06e-01 0.174 0.169 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 2.39e-01 -0.212 0.18 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 4.13e-01 0.102 0.125 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 4.87e-01 -0.102 0.147 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.83e-01 0.0682 0.167 0.074 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0561 0.146 0.074 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0861 0.166 0.074 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 9.46e-01 0.00888 0.13 0.074 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.47e-01 -0.121 0.159 0.074 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.47e-03 0.472 0.16 0.074 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 1.30e-01 0.246 0.161 0.074 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 2.94e-01 -0.156 0.148 0.074 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.59e-01 0.198 0.176 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.48e-01 0.0338 0.176 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0464 0.181 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 5.82e-01 0.0862 0.156 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 3.76e-01 0.143 0.161 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.98e-01 0.216 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 6.02e-01 0.0848 0.162 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.03e-01 -0.218 0.17 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0325 0.142 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 1.72e-01 -0.219 0.16 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 4.01e-01 -0.137 0.163 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0702 0.129 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 4.18e-01 -0.134 0.166 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 1.71e-01 -0.213 0.155 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.73e-02 -0.307 0.179 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0427 0.177 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 2.86e-01 -0.197 0.184 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 6.12e-02 -0.312 0.166 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.21e-02 0.341 0.167 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.13e-01 0.166 0.164 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 1.01e-01 0.28 0.17 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0803 0.171 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 1.40e-01 -0.227 0.153 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0885 0.161 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0989 0.164 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0503 0.145 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.15e-02 0.284 0.151 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 2.92e-01 -0.176 0.166 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 1.01e-01 -0.345 0.209 0.085 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.14e-01 0.0438 0.185 0.085 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 3.02e-01 -0.109 0.105 0.085 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 2.96e-01 -0.183 0.174 0.085 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 1.89e-01 -0.21 0.159 0.085 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 4.88e-01 0.12 0.173 0.085 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0568 0.201 0.085 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0365 0.146 0.085 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 8.55e-01 0.0325 0.177 0.085 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 4.10e-02 -0.345 0.168 0.076 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 4.78e-01 0.111 0.157 0.076 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 1.63e-01 -0.184 0.131 0.076 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 1.86e-01 -0.179 0.135 0.076 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 2.18e-01 0.177 0.143 0.076 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.09e-01 0.108 0.163 0.076 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0842 0.159 0.076 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0324 0.124 0.076 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0373 0.17 0.075 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 9.30e-01 0.0134 0.153 0.075 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0943 0.168 0.075 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00717 0.104 0.075 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00961 0.147 0.075 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 9.91e-01 0.00176 0.163 0.075 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 9.98e-01 0.000494 0.167 0.075 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.33e-01 -0.093 0.195 0.068 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 4.68e-01 -0.122 0.167 0.068 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0873 0.179 0.068 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0057 0.147 0.068 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 5.57e-01 0.102 0.174 0.068 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0273 0.141 0.068 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.05e-01 -0.285 0.175 0.068 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.24e-01 0.155 0.194 0.068 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 6.99e-01 0.0564 0.145 0.068 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.03e-02 -0.383 0.176 0.068 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 1.74e-02 -0.388 0.162 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 3.23e-01 0.102 0.103 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.39e-01 -0.127 0.164 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 1.83e-01 0.2 0.15 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 5.24e-01 0.077 0.121 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 8.78e-01 0.0237 0.154 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0632 0.166 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 8.58e-01 0.0239 0.133 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.63e-01 0.139 0.152 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 3.23e-01 0.173 0.174 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 7.40e-02 0.225 0.125 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 1.56e-02 -0.384 0.158 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0559 0.152 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0538 0.131 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0734 0.165 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 4.45e-01 -0.129 0.169 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0295 0.136 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 4.22e-01 0.132 0.164 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.45e-01 -0.253 0.216 0.073 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 9.49e-02 0.342 0.203 0.073 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0182 0.219 0.073 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 2.12e-01 -0.205 0.163 0.073 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 2.06e-01 -0.266 0.209 0.073 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.61e-01 -0.185 0.201 0.073 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0884 0.213 0.073 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 5.46e-01 0.112 0.186 0.073 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 3.15e-01 0.191 0.19 0.073 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 1.70e-01 0.217 0.157 0.073 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0747 0.168 0.073 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 3.60e-02 0.362 0.172 0.073 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 9.06e-01 0.0159 0.134 0.073 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.01e-01 0.167 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 1.42e-01 -0.26 0.177 0.073 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0743 0.162 0.073 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0346 0.171 0.073 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 5.92e-01 0.0981 0.183 0.07 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 2.77e-01 -0.151 0.139 0.07 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.40e-01 0.13 0.168 0.07 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 1.00e+00 -8.69e-06 0.172 0.07 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0966 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.42e-01 -0.102 0.167 0.07 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 8.90e-01 0.0251 0.181 0.07 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 6.00e-02 0.321 0.17 0.07 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 6.85e-01 0.0686 0.169 0.07 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 9.90e-01 0.00254 0.194 0.062 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0634 0.198 0.062 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 9.56e-01 0.0117 0.21 0.062 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 2.32e-01 -0.163 0.136 0.062 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 3.10e-01 -0.196 0.192 0.062 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 1.05e-02 0.477 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 3.01e-01 0.202 0.194 0.062 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 6.08e-01 -0.112 0.218 0.062 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 8.01e-01 0.0315 0.125 0.062 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 7.37e-01 0.065 0.193 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 6.45e-01 0.073 0.158 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.126 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.95e-01 0.113 0.166 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 5.83e-02 0.259 0.136 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0803 0.157 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0853 0.163 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 7.52e-01 0.0476 0.151 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 6.37e-01 0.072 0.153 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.45e-01 0.119 0.125 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 1.56e-01 -0.222 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00834 0.125 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 7.70e-01 0.0477 0.163 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.28e-01 0.041 0.118 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 4.77e-01 -0.107 0.151 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 1.04e-01 -0.268 0.164 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.65e-01 0.138 0.152 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.20e-01 0.0139 0.137 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.47e-01 0.111 0.118 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 4.93e-01 -0.112 0.163 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 5.30e-02 0.191 0.0984 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 4.61e-02 -0.314 0.157 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 2.19e-01 0.161 0.131 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 6.25e-01 0.057 0.116 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0493 0.15 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 3.74e-01 -0.138 0.154 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 9.46e-01 0.00826 0.122 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 3.22e-01 0.15 0.151 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 4.45e-01 0.135 0.177 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 4.48e-01 0.089 0.117 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 9.44e-01 0.0119 0.169 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 4.02e-01 0.136 0.162 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -865777 sc-eQTL 7.10e-01 0.0502 0.135 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 6.01e-01 0.0849 0.162 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0143 0.168 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 sc-eQTL 8.85e-01 0.0247 0.17 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -981818 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0178 0.172 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -660683 sc-eQTL 2.85e-01 -0.176 0.164 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -737116 sc-eQTL 8.92e-01 0.0175 0.129 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -196694 sc-eQTL 2.62e-01 -0.164 0.146 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -259283 sc-eQTL 2.34e-01 -0.189 0.158 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -956374 sc-eQTL 7.52e-01 0.035 0.11 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -956439 sc-eQTL 5.76e-01 0.0776 0.139 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -756888 sc-eQTL 2.10e-01 -0.183 0.146 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 947990 eQTL 0.0107 0.0927 0.0362 0.00222 0.0 0.0535
ENSG00000235927 NEXN-AS1 -866803 eQTL 0.0135 -0.12 0.0483 0.0 0.0 0.0535

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000226084 \N -106378 4.33e-06 4.98e-06 8.56e-07 2.64e-06 1.31e-06 1.47e-06 4.25e-06 1.03e-06 4.96e-06 2.35e-06 5.02e-06 3.54e-06 7.06e-06 2.4e-06 1.35e-06 2.98e-06 1.78e-06 3.23e-06 1.47e-06 1.02e-06 2.91e-06 4.67e-06 3.8e-06 1.62e-06 5.89e-06 1.74e-06 2.61e-06 1.84e-06 4.53e-06 4.36e-06 2.68e-06 5.42e-07 5.47e-07 1.52e-06 2.15e-06 9.04e-07 9.37e-07 4.08e-07 9.24e-07 4.26e-07 4.42e-07 5.76e-06 4.18e-07 1.54e-07 4.35e-07 7.09e-07 8.55e-07 4.27e-07 3.24e-07