Genes within 1Mb (chr1:77011419:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.194 B L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 8.40e-01 0.015 0.0738 0.194 B L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0486 0.0791 0.194 B L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0512 0.0733 0.194 B L1
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 2.89e-01 0.104 0.0975 0.194 B L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0544 0.102 0.194 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00617 0.0879 0.194 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0482 0.0858 0.194 B L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0473 0.0768 0.194 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 1.68e-01 0.13 0.0941 0.194 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 2.74e-02 -0.132 0.0596 0.194 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0812 0.194 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0194 0.0619 0.194 CD4T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.01e-01 0.0931 0.0566 0.194 CD4T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.21e-01 0.0441 0.0687 0.194 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 1.90e-01 -0.093 0.0708 0.194 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 6.98e-01 0.0342 0.0879 0.194 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.50e-01 -0.12 0.0834 0.194 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 9.46e-01 0.00609 0.0893 0.194 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 9.86e-01 -0.001 0.0552 0.194 CD8T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0675 0.194 CD8T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 7.93e-01 0.0242 0.0923 0.194 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 3.64e-01 0.0845 0.0928 0.194 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0855 0.194 CD8T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 2.93e-04 -0.325 0.0882 0.194 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.14e-01 0.0374 0.102 0.198 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0657 0.0916 0.198 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 3.45e-01 0.101 0.107 0.198 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0575 0.0866 0.198 DC L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 7.24e-01 0.0356 0.101 0.198 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 2.09e-02 0.222 0.0954 0.198 DC L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 3.39e-01 0.1 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.95e-01 0.0604 0.113 0.198 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0766 0.0828 0.198 DC L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0991 0.108 0.198 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 1.21e-01 0.163 0.105 0.194 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.80e-01 0.0545 0.0619 0.194 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 2.50e-01 0.122 0.105 0.194 Mono L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0537 0.0855 0.194 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0484 0.0695 0.194 Mono L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00175 0.0947 0.194 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 4.75e-01 0.0684 0.0956 0.194 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 7.88e-01 0.0212 0.0788 0.194 Mono L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 4.53e-02 -0.196 0.0974 0.194 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.32e-01 0.128 0.107 0.195 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0556 0.0842 0.195 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.67e-02 -0.181 0.098 0.195 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.98e-01 0.0135 0.105 0.195 NK L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 8.68e-01 0.0116 0.0698 0.195 NK L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 4.37e-01 0.0747 0.0959 0.195 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 7.54e-01 0.029 0.0924 0.195 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.52e-01 0.0969 0.104 0.194 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.03e-01 0.0431 0.0828 0.194 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.63e-01 0.0359 0.0824 0.194 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 6.02e-01 0.0545 0.104 0.194 Other_T L1
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.64e-01 0.101 0.0722 0.194 Other_T L1
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.14e-01 0.012 0.111 0.194 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0642 0.107 0.194 Other_T L1
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.04e-01 0.0373 0.0981 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.31e-01 0.123 0.127 0.186 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0715 0.125 0.186 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.23e-01 0.184 0.119 0.186 B_Activated L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0113 0.121 0.186 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.0986 0.186 B_Activated L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.63e-01 -0.164 0.117 0.186 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.90e-01 0.00154 0.127 0.186 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 5.17e-03 -0.291 0.103 0.186 B_Activated L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 4.46e-01 0.0863 0.113 0.186 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.09e-01 0.0409 0.11 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0743 0.0987 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0775 0.114 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.80e-01 0.126 0.0934 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 3.49e-01 0.0983 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.46e-01 0.0668 0.11 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 8.80e-01 0.0157 0.104 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00783 0.103 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0922 0.0893 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 4.27e-02 0.219 0.107 0.196 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.50e-01 0.0477 0.105 0.196 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0534 0.116 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 7.75e-01 0.0308 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 5.67e-02 0.2 0.104 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0813 0.109 0.196 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0549 0.109 0.196 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 6.11e-02 -0.18 0.0955 0.196 B_Memory L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0358 0.0926 0.196 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 8.06e-01 0.0266 0.108 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.96e-01 0.0355 0.0908 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0139 0.111 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0498 0.0841 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0639 0.101 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.68e-02 -0.183 0.109 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 1.76e-01 -0.144 0.106 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 6.84e-01 0.0392 0.0959 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0573 0.0828 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.23e-01 0.0109 0.112 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.87e-01 0.0407 0.101 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0837 0.115 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0409 0.0963 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 8.77e-01 0.0153 0.0984 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.76e-01 0.00349 0.114 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.62e-01 0.00541 0.113 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0411 0.106 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 9.70e-01 0.00368 0.0964 0.195 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 1.48e-02 0.297 0.121 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 2.24e-01 0.141 0.116 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 4.92e-01 0.0807 0.117 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 9.35e-01 0.00861 0.106 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 3.58e-01 -0.106 0.115 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 8.27e-01 0.0249 0.114 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.00e-01 0.126 0.0983 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.72e-02 -0.175 0.0727 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 9.42e-01 0.00608 0.0839 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0144 0.072 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 4.97e-01 0.0428 0.0629 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0721 0.067 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0599 0.077 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.87e-01 0.109 0.102 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.39e-02 -0.188 0.0759 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0655 0.11 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 5.17e-01 0.0469 0.0721 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.49e-01 0.0462 0.0769 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.76e-01 0.13 0.0956 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0959 0.101 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.43e-01 0.116 0.0986 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 2.57e-01 -0.116 0.102 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 2.16e-01 0.134 0.108 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0912 0.102 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 7.79e-01 0.0259 0.0921 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0318 0.108 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.83e-01 0.00231 0.111 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.22e-03 0.28 0.107 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.90e-01 0.082 0.0953 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 8.41e-01 0.0214 0.107 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.35e-01 -0.021 0.101 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 9.99e-01 -5.69e-05 0.0873 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 2.52e-01 0.118 0.103 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.10e-01 0.0629 0.0953 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.47e-01 0.0866 0.0918 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.02e-04 -0.328 0.0953 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 8.42e-01 0.0202 0.101 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0754 0.0947 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 7.93e-01 0.0254 0.0966 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 7.62e-01 0.0224 0.0738 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 9.46e-01 0.00544 0.0805 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.71e-01 -0.132 0.0963 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 8.45e-01 0.0192 0.0978 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.04e-01 -0.105 0.102 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 9.91e-02 -0.156 0.0943 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.64e-02 -0.183 0.109 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.36e-02 -0.222 0.109 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 2.67e-01 -0.132 0.119 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 7.14e-01 0.0397 0.108 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0581 0.101 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.46e-01 0.00743 0.11 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 8.18e-01 0.026 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.64e-01 0.0705 0.0774 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0937 0.0988 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0467 0.123 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0926 0.124 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0636 0.118 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 1.33e-02 0.205 0.0822 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 4.08e-01 0.0943 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 8.38e-01 0.0235 0.115 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0769 0.122 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0488 0.0843 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 4.64e-02 -0.197 0.0983 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 6.59e-01 0.0488 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.41e-01 0.0453 0.0969 0.195 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0526 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0189 0.0861 0.195 MAIT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.78e-01 0.0587 0.105 0.195 MAIT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0564 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 1.06e-01 -0.173 0.107 0.195 MAIT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.74e-01 0.0283 0.0985 0.195 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.10e-01 0.113 0.111 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 4.14e-02 -0.225 0.11 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.10e-01 0.0756 0.114 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 6.42e-01 0.0461 0.0989 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.26e-01 0.0647 0.102 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0515 0.106 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 1.52e-01 -0.147 0.102 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.111 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0152 0.0919 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0969 0.104 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.62e-01 0.0184 0.106 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0417 0.0838 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.17e-01 0.0698 0.107 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 7.06e-01 0.0382 0.101 0.194 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.17e-01 0.0416 0.115 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0198 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 4.76e-02 -0.232 0.116 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0851 0.106 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 7.84e-01 0.0294 0.107 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.35e-01 -0.156 0.104 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.11e-01 0.0718 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.47e-01 0.126 0.109 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.91e-01 0.127 0.097 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0262 0.104 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 3.65e-01 0.0835 0.0919 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 6.63e-01 0.0421 0.0966 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 8.20e-01 -0.024 0.106 0.194 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.44e-01 0.0114 0.162 0.2 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 9.90e-01 0.00174 0.142 0.2 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.85e-01 -0.107 0.0804 0.2 PB L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 7.35e-01 0.0456 0.134 0.2 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 3.75e-01 -0.108 0.122 0.2 PB L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 3.24e-01 0.131 0.132 0.2 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0936 0.154 0.2 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 8.42e-01 0.0223 0.111 0.2 PB L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0305 0.135 0.2 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.65e-02 0.207 0.116 0.193 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0995 0.108 0.193 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.50e-02 -0.168 0.0905 0.193 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 5.48e-01 0.0566 0.0941 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.39e-01 0.0612 0.0994 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0736 0.113 0.193 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 8.53e-01 0.0205 0.11 0.193 Pro_T L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 6.26e-02 -0.159 0.0851 0.193 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00553 0.111 0.194 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.30e-01 0.151 0.0995 0.194 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.53e-01 0.0653 0.11 0.194 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0746 0.0678 0.194 Treg L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.32e-01 0.144 0.0955 0.194 Treg L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0283 0.107 0.194 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.22e-02 -0.211 0.108 0.194 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 6.25e-01 -0.058 0.118 0.202 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 7.95e-01 0.0265 0.102 0.202 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 8.10e-01 0.0262 0.109 0.202 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0678 0.0893 0.202 cDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.79e-02 0.2 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00979 0.0859 0.202 cDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.04e-01 0.173 0.106 0.202 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 5.76e-01 0.0659 0.118 0.202 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0477 0.0883 0.202 cDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0808 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.48e-02 0.241 0.107 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0673 0.0677 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 7.61e-01 0.033 0.108 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0498 0.099 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0622 0.0794 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 2.05e-01 0.128 0.101 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000415 0.11 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0216 0.0878 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 1.11e-01 -0.16 0.1 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 4.09e-01 0.0948 0.115 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00729 0.0829 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.65e-01 0.146 0.105 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.62e-01 -0.14 0.0996 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 4.54e-01 0.0644 0.0858 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.109 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 2.37e-01 0.131 0.111 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 8.47e-01 0.0172 0.0895 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 1.35e-01 -0.161 0.108 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 1.14e-01 0.198 0.124 0.203 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 7.94e-01 0.031 0.119 0.203 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.15e-01 0.199 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 9.96e-01 0.000446 0.0948 0.203 gdT L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 1.77e-01 0.164 0.121 0.203 gdT L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 1.20e-01 0.181 0.116 0.203 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 1.42e-01 0.181 0.122 0.203 gdT L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 8.28e-01 0.0234 0.107 0.203 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 3.02e-01 -0.124 0.12 0.2 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0999 0.2 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0116 0.106 0.2 intMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0443 0.11 0.2 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 3.46e-01 -0.08 0.0847 0.2 intMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0709 0.102 0.2 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 6.07e-01 0.0578 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 7.81e-01 0.0286 0.103 0.2 intMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 3.65e-01 -0.098 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 8.44e-01 0.0222 0.112 0.197 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 8.52e-02 0.146 0.0847 0.197 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 2.51e-01 -0.118 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 8.80e-01 0.016 0.106 0.197 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0274 0.0899 0.197 ncMono L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 4.59e-01 0.0761 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.04e-01 0.0134 0.111 0.197 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 1.97e-01 -0.135 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 5.61e-02 -0.197 0.103 0.197 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 7.05e-01 0.0459 0.121 0.184 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.77e-01 -0.11 0.124 0.184 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 5.50e-01 0.0784 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0182 0.0854 0.184 pDC L2
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0653 0.12 0.184 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 1.16e-01 0.184 0.116 0.184 pDC L2
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0792 0.122 0.184 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 2.49e-01 0.157 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 5.63e-01 -0.045 0.0777 0.184 pDC L2
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0331 0.121 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 1.31e-01 0.16 0.106 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0763 0.0845 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0355 0.111 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 4.78e-01 0.0653 0.0919 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 3.92e-02 0.217 0.104 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0439 0.109 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0363 0.101 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0911 0.102 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 8.87e-01 -0.012 0.0842 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 9.37e-01 0.00835 0.105 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 6.03e-01 0.0437 0.0839 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0463 0.109 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0444 0.0789 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00896 0.101 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0999 0.11 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0968 0.102 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 8.49e-01 0.0176 0.0921 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0763 0.0791 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 4.01e-02 0.22 0.107 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 9.90e-01 0.000801 0.0656 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 2.40e-01 0.123 0.104 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 2.21e-01 -0.106 0.0866 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0192 0.0771 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.74e-01 0.0559 0.0992 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 4.94e-01 0.07 0.102 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0166 0.081 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 7.57e-02 -0.177 0.0991 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0182 0.111 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 1.42e-01 0.108 0.0731 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0431 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0211 0.102 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -877094 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0444 0.0844 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0968 0.101 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00541 0.105 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 936673 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0945 0.106 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000273338 AC103591.3 -993135 sc-eQTL 5.69e-02 -0.205 0.107 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -672000 sc-eQTL 2.49e-01 0.125 0.108 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -748433 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0234 0.0854 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -208011 sc-eQTL 1.65e-02 -0.231 0.0954 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -270600 sc-eQTL 9.65e-01 0.00459 0.105 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162613 FUBP1 -967691 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0174 0.0729 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162616 DNAJB4 -967756 sc-eQTL 5.09e-01 0.0605 0.0914 0.194 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 sc-eQTL 3.66e-01 0.0873 0.0965 0.194 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000180488 MIGA1 -768205 eQTL 1.44e-02 -0.0452 0.0184 0.00172 0.0 0.179


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000154027 \N -270600 1.29e-06 9.3e-07 3e-07 6.06e-07 2.43e-07 4.39e-07 1.24e-06 3.52e-07 1.15e-06 3.76e-07 1.36e-06 5.97e-07 1.83e-06 2.61e-07 4.32e-07 6.89e-07 8.28e-07 5.45e-07 4.24e-07 6.07e-07 3.61e-07 1.08e-06 8.52e-07 5.86e-07 1.94e-06 3.17e-07 6.16e-07 5.44e-07 1.07e-06 1.18e-06 5.58e-07 4.99e-08 1.79e-07 6.19e-07 4.2e-07 4.15e-07 3.96e-07 1.61e-07 2.21e-07 9.07e-08 2.56e-07 1.5e-06 6.58e-08 3.38e-08 1.74e-07 7.57e-08 2.09e-07 8.81e-08 8.83e-08
ENSG00000219201 \N -800362 2.67e-07 1.3e-07 3.88e-08 1.86e-07 9.21e-08 1e-07 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.54e-07 8.68e-08 1.47e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.36e-08 4.04e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.12e-07 1.02e-07 9.92e-08 3.87e-08 3.35e-08 8.25e-08 7.51e-08 3.62e-08 5.03e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.98e-08 5.13e-08 1.35e-07 4.7e-08 1.57e-08 5.15e-08 1.99e-08 1.19e-07 3.83e-09 4.81e-08