logo

Genes within 1Mb (chr1:76931343:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 1.21e-01 -0.159 0.103 0.216 B L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 4.42e-01 0.0573 0.0743 0.216 B L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 3.28e-01 0.078 0.0796 0.216 B L1
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 3.76e-01 0.0872 0.0984 0.216 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.74e-01 0.0141 0.0886 0.216 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00129 0.0865 0.216 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0569 0.0933 0.216 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 4.66e-01 0.0435 0.0595 0.216 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 8.72e-01 0.013 0.0803 0.216 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 4.17e-02 -0.124 0.0606 0.216 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0334 0.0702 0.216 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 3.62e-01 0.079 0.0864 0.216 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.33e-01 0.0394 0.0824 0.216 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0882 0.0877 0.216 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 2.39e-02 -0.122 0.0537 0.216 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 9.94e-01 0.000677 0.0915 0.216 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00382 0.0846 0.216 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0391 0.102 0.225 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0568 0.0917 0.225 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0892 0.107 0.225 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 6.73e-02 0.158 0.086 0.225 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 6.68e-02 -0.177 0.096 0.225 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0919 0.113 0.225 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0827 0.225 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 2.84e-01 -0.115 0.107 0.216 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00705 0.063 0.216 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0676 0.107 0.216 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0277 0.0706 0.216 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.39e-01 0.144 0.0967 0.216 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.78e-02 -0.132 0.0795 0.216 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 8.48e-02 -0.185 0.107 0.217 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0499 0.0845 0.217 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.66e-01 0.0723 0.099 0.217 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 9.25e-03 -0.272 0.103 0.217 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 3.22e-01 0.0919 0.0925 0.217 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0153 0.106 0.216 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 2.02e-01 -0.108 0.084 0.216 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.77e-01 0.0597 0.0839 0.216 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.38e-01 -0.157 0.106 0.216 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 2.16e-01 -0.135 0.109 0.216 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.11e-01 0.0851 0.129 0.214 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.45e-01 0.0773 0.128 0.214 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 6.51e-01 0.0549 0.121 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0975 0.1 0.214 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.89e-01 0.169 0.129 0.214 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0759 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0978 0.11 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 4.79e-01 0.0703 0.0991 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.29e-01 -0.174 0.114 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0909 0.105 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 9.40e-01 0.00786 0.104 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0586 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0624 0.109 0.218 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0158 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 7.57e-01 0.0362 0.117 0.218 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 7.26e-01 0.0369 0.105 0.218 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.82e-01 0.0303 0.109 0.218 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.18e-01 0.00997 0.0967 0.218 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 2.36e-01 -0.127 0.107 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0229 0.09 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 9.32e-01 0.00946 0.11 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 9.97e-02 0.165 0.0995 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.63e-01 0.147 0.105 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 8.63e-01 0.0165 0.0951 0.216 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0724 0.111 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.87e-02 0.182 0.0992 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 2.74e-01 0.125 0.114 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 4.18e-01 0.0789 0.0972 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.00e-01 -0.184 0.111 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.105 0.217 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.23e-02 -0.216 0.119 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0103 0.114 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 5.90e-01 0.062 0.115 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.69e-01 -0.142 0.103 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0272 0.116 0.214 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0892 0.0972 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 3.66e-01 0.0657 0.0726 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0473 0.0827 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 4.05e-02 -0.145 0.0704 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 6.37e-01 0.0359 0.076 0.216 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 6.35e-01 0.0497 0.104 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 7.86e-01 0.0213 0.0784 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 8.53e-01 0.0209 0.112 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0588 0.0734 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.103 0.216 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0735 0.101 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.75e-01 0.0165 0.105 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 7.04e-01 0.0422 0.111 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0196 0.104 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.01e-01 0.0437 0.114 0.216 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0902 0.109 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 1.29e-01 -0.145 0.0955 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0702 0.107 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 5.41e-02 -0.194 0.1 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 3.07e-01 -0.098 0.0957 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0388 0.0924 0.216 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.41e-01 0.034 0.103 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 1.84e-01 0.127 0.0956 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 9.93e-02 -0.161 0.0971 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.59e-01 -0.105 0.0743 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.72e-01 0.0286 0.0989 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0704 0.103 0.216 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0269 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 1.78e-01 0.148 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.05e-01 0.192 0.118 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 4.61e-01 0.0792 0.107 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 5.76e-01 0.0626 0.112 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 7.26e-01 0.027 0.0769 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0466 0.122 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0349 0.123 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 9.77e-01 0.0033 0.116 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 6.95e-02 -0.15 0.082 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 6.43e-02 0.222 0.119 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 7.21e-02 -0.15 0.0829 0.21 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 2.92e-01 -0.117 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 4.98e-01 0.0659 0.0971 0.212 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 6.23e-01 0.0541 0.11 0.212 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 6.19e-01 -0.043 0.0863 0.212 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0203 0.108 0.212 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 1.72e-01 -0.155 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 2.61e-01 -0.127 0.113 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 2.76e-01 0.128 0.117 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.62e-04 -0.375 0.0975 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00331 0.105 0.216 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 6.07e-03 -0.302 0.109 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 9.14e-02 -0.155 0.0913 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0238 0.104 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 2.10e-02 -0.243 0.104 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.91e-01 0.132 0.101 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 1.36e-01 0.174 0.116 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0588 0.115 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.71e-02 0.237 0.119 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 4.62e-02 -0.215 0.107 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0863 0.111 0.217 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.57e-01 0.034 0.11 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 2.51e-02 0.219 0.097 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.08e-01 0.0853 0.103 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 2.48e-02 -0.235 0.104 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.04e-01 0.0404 0.106 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 4.64e-01 -0.115 0.156 0.215 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.40e-01 0.0277 0.137 0.215 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 4.31e-01 0.0618 0.0781 0.215 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00865 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 4.25e-03 0.419 0.144 0.215 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 4.90e-01 0.0744 0.108 0.215 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0646 0.115 0.215 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0473 0.107 0.215 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 3.06e-01 0.092 0.0896 0.215 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.14e-02 -0.233 0.0912 0.215 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 9.42e-03 -0.28 0.107 0.215 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0341 0.111 0.216 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.57e-01 -0.018 0.0998 0.216 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 9.63e-01 0.00506 0.11 0.216 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0336 0.0678 0.216 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 3.67e-02 -0.226 0.108 0.216 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 9.48e-01 0.00797 0.122 0.227 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 3.74e-01 0.0935 0.105 0.227 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 9.46e-01 0.0077 0.113 0.227 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 1.65e-01 0.128 0.092 0.227 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0528 0.0888 0.227 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 3.29e-01 -0.119 0.122 0.227 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 1.26e-01 0.139 0.0907 0.227 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 2.15e-01 0.0839 0.0676 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.57e-01 -0.153 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 9.59e-01 0.00406 0.0794 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 9.93e-03 0.281 0.108 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 8.71e-02 -0.15 0.0871 0.216 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 3.01e-01 -0.12 0.116 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0537 0.0838 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0375 0.106 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 6.30e-01 -0.042 0.0869 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0978 0.0903 0.216 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.52e-01 0.0807 0.135 0.215 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.37e-01 0.0792 0.128 0.215 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 2.85e-01 -0.146 0.136 0.215 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 2.75e-01 0.112 0.102 0.215 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0221 0.133 0.215 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 3.45e-01 -0.114 0.12 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 9.31e-01 0.00861 0.0998 0.22 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 1.20e-01 0.132 0.0843 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0195 0.112 0.22 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 2.85e-01 0.11 0.102 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 7.69e-01 0.0332 0.113 0.224 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.56e-01 0.0383 0.0857 0.224 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0441 0.104 0.224 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0888 0.0903 0.224 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 4.52e-01 0.0838 0.111 0.224 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 6.11e-01 0.0537 0.105 0.224 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 8.92e-01 -0.015 0.11 0.234 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 1.48e-01 -0.162 0.111 0.234 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.64e-01 -0.165 0.118 0.234 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 5.09e-01 0.0512 0.0774 0.234 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 4.97e-02 -0.208 0.105 0.234 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0337 0.123 0.234 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0725 0.0703 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0644 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 7.39e-01 0.0283 0.0849 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0342 0.112 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0795 0.106 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.88e-01 0.0273 0.101 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000856 0.103 0.216 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 1.70e-01 -0.142 0.103 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 5.98e-01 0.0438 0.0828 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 5.25e-01 0.0685 0.108 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 1.58e-01 0.141 0.0993 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 6.50e-01 0.0458 0.101 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 6.19e-01 0.0452 0.091 0.216 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0582 0.108 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 6.87e-01 0.0266 0.066 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 2.24e-01 -0.128 0.105 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00653 0.0775 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 8.31e-02 0.178 0.102 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 2.70e-02 -0.179 0.0805 0.216 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.112 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.89e-01 0.0104 0.0743 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 1.51e-01 0.154 0.106 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -957170 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0868 0.0852 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 7.60e-01 0.0326 0.106 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 856597 sc-eQTL 1.59e-01 0.152 0.107 0.218 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752076 sc-eQTL 1.15e-01 -0.173 0.11 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -828509 sc-eQTL 8.09e-01 -0.021 0.0865 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288087 sc-eQTL 2.02e-01 0.125 0.0976 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -350676 sc-eQTL 2.57e-02 -0.236 0.105 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -848281 sc-eQTL 4.22e-01 0.0786 0.0978 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000154027 AK5 -350676 eQTL 0.00221 -0.0647 0.0211 0.0 0.0 0.259
ENSG00000226084 AC113935.1 -197771 eQTL 0.0446 0.0464 0.0231 0.0 0.0 0.259

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina