logo

Genes within 1Mb (chr1:76930481:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 5.16e-01 0.0648 0.0997 0.233 B L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0314 0.0719 0.233 B L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0749 0.077 0.233 B L1
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 7.46e-01 0.0309 0.0953 0.233 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0347 0.0857 0.233 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0144 0.0837 0.233 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 5.86e-01 0.0485 0.089 0.233 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0195 0.0568 0.233 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 9.39e-01 0.00583 0.0766 0.233 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 6.21e-01 0.0289 0.0584 0.233 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.30e-01 0.0323 0.067 0.233 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 1.49e-01 -0.121 0.0834 0.233 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 3.34e-01 0.0771 0.0796 0.233 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0756 0.0849 0.233 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 8.00e-01 0.0133 0.0526 0.233 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0291 0.0886 0.233 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 9.85e-01 0.0015 0.0818 0.233 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.17e-01 0.102 0.101 0.221 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 1.21e-01 0.142 0.0913 0.221 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 9.92e-01 0.00102 0.107 0.221 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0599 0.0867 0.221 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0964 0.221 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.113 0.221 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 1.38e-01 -0.123 0.0826 0.221 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 6.96e-01 0.04 0.102 0.233 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 4.26e-02 -0.121 0.0595 0.233 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 9.81e-01 0.0024 0.103 0.233 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 7.69e-01 0.0198 0.0674 0.233 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0482 0.0927 0.233 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 9.52e-01 0.00464 0.0764 0.233 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 1.52e-01 0.151 0.105 0.232 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 8.08e-02 0.144 0.0822 0.232 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 9.47e-01 0.00647 0.0972 0.232 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 4.30e-01 0.0813 0.103 0.232 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.92e-01 -0.118 0.0905 0.232 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 8.75e-01 0.0159 0.1 0.233 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000725 0.0799 0.233 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00738 0.0796 0.233 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 2.97e-01 0.105 0.101 0.233 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.34e-01 0.0493 0.104 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0118 0.122 0.23 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.47e-02 -0.201 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0439 0.115 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 5.44e-01 0.0574 0.0945 0.23 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0682 0.122 0.23 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 6.95e-01 0.0396 0.101 0.23 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.42e-01 0.00722 0.0994 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.85e-01 0.1 0.115 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 6.93e-01 0.0418 0.106 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.89e-01 -0.137 0.104 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0607 0.104 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 5.89e-01 0.0585 0.108 0.228 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 5.31e-01 0.0656 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.94e-01 0.0303 0.116 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0462 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 2.25e-01 0.132 0.108 0.228 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 1.57e-02 0.231 0.0947 0.228 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.65e-01 0.0936 0.103 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 4.78e-01 0.0618 0.0868 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0145 0.107 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0661 0.0965 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.54e-01 -0.145 0.101 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 8.88e-01 -0.013 0.0918 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.85e-01 0.0942 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0377 0.0977 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0326 0.112 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 9.02e-01 0.0117 0.0952 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.21e-02 0.204 0.109 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 4.89e-01 0.0707 0.102 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.19e-01 -0.117 0.117 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0515 0.111 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0145 0.112 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 6.21e-01 0.0498 0.101 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0505 0.113 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.26e-01 0.0914 0.093 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0445 0.0695 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.62e-01 0.0723 0.079 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 4.97e-01 0.0462 0.0679 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0355 0.0727 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 1.34e-01 -0.149 0.0988 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 3.75e-01 0.0661 0.0744 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0258 0.107 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0348 0.0698 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.66e-01 0.135 0.0974 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 6.70e-01 0.0408 0.0955 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0256 0.0985 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 5.49e-02 -0.2 0.103 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 3.51e-01 0.0918 0.0981 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 7.92e-01 0.0283 0.107 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 5.75e-02 -0.203 0.106 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.95e-02 0.155 0.0938 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.105 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 1.09e-01 0.159 0.0988 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 2.33e-01 0.113 0.094 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0228 0.091 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0924 0.0976 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0685 0.0914 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.44e-01 0.0304 0.0932 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 7.33e-01 0.0243 0.0712 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00399 0.0943 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00884 0.0987 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 9.57e-01 0.00579 0.107 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 8.94e-01 0.0155 0.116 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 9.58e-03 -0.272 0.104 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 4.19e-01 -0.089 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0906 0.0755 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 2.14e-01 0.145 0.116 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00324 0.117 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.80e-01 0.0313 0.112 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0968 0.0789 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.92e-01 0.0158 0.116 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0257 0.0801 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 6.62e-01 0.0469 0.107 0.234 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0938 0.234 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.16e-01 0.0389 0.107 0.234 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 2.28e-01 0.101 0.0834 0.234 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.27e-01 0.0228 0.104 0.234 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0261 0.11 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 8.80e-02 0.188 0.109 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.71e-01 -0.102 0.114 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 4.68e-01 0.0713 0.0981 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0224 0.102 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.21e-02 0.232 0.107 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 8.64e-02 0.154 0.0895 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0693 0.102 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 5.94e-01 0.0553 0.104 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0856 0.0989 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 5.99e-01 0.0586 0.111 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.41e-02 0.183 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0262 0.114 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.103 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 9.08e-01 0.0122 0.106 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 7.75e-01 0.0312 0.109 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0697 0.0975 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 2.91e-01 0.108 0.102 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 2.60e-01 0.118 0.104 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0383 0.106 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.17e-01 -0.159 0.158 0.233 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 2.53e-01 -0.159 0.139 0.233 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 2.82e-01 0.0856 0.0792 0.233 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 2.36e-01 0.142 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.43e-01 -0.221 0.15 0.233 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.00e-01 0.0422 0.109 0.233 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 4.51e-01 0.0837 0.111 0.237 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.62e-01 0.0312 0.103 0.237 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0388 0.0863 0.237 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 1.47e-01 0.129 0.0886 0.237 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00435 0.104 0.237 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.86e-01 0.0932 0.107 0.233 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0338 0.0968 0.233 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0743 0.106 0.233 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 6.86e-01 0.0266 0.0658 0.233 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.26e-01 0.161 0.105 0.233 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 1.71e-01 0.171 0.124 0.215 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 5.05e-01 0.0716 0.107 0.215 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 3.60e-01 -0.105 0.115 0.215 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 2.45e-01 -0.11 0.0941 0.215 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 1.79e-01 -0.122 0.0902 0.215 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0581 0.124 0.215 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0921 0.093 0.215 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 9.42e-01 0.00769 0.106 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 1.30e-01 -0.1 0.066 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.11e-01 0.0393 0.106 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 8.85e-01 0.0112 0.0777 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 2.68e-01 -0.119 0.107 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 3.14e-01 0.0865 0.0857 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 9.83e-01 0.00235 0.113 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.13e-01 0.0302 0.0818 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.69e-01 0.0304 0.104 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0735 0.0847 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.54e-01 0.0202 0.11 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.76e-01 0.0252 0.0883 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 2.91e-01 -0.136 0.129 0.23 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 8.36e-01 0.0253 0.122 0.23 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0897 0.13 0.23 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0416 0.0974 0.23 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0953 0.127 0.23 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 3.51e-01 0.11 0.118 0.229 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 8.53e-01 0.0182 0.0978 0.229 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 1.92e-01 -0.136 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0651 0.083 0.229 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.31e-02 0.19 0.109 0.229 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 8.03e-02 -0.175 0.0997 0.229 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 7.61e-02 0.198 0.111 0.229 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0658 0.0848 0.229 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 6.13e-01 0.052 0.103 0.229 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 9.07e-02 0.151 0.089 0.229 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0596 0.11 0.229 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0333 0.104 0.229 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 6.71e-01 0.05 0.118 0.229 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 5.38e-02 0.231 0.119 0.229 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.68e-01 0.0376 0.127 0.229 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0188 0.083 0.229 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 7.34e-01 0.0389 0.114 0.229 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 7.44e-01 0.0432 0.132 0.229 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 5.45e-01 0.0457 0.0755 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0274 0.106 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 7.12e-01 0.0311 0.0842 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.79e-01 0.0311 0.111 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 8.41e-01 0.0211 0.105 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0947 0.1 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0355 0.102 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 2.11e-01 0.127 0.101 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00393 0.0815 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 5.40e-01 -0.065 0.106 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0581 0.098 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0239 0.0992 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0329 0.0894 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0305 0.104 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 1.10e-01 -0.101 0.0632 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 4.47e-01 0.0772 0.101 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0171 0.0747 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0787 0.099 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 2.59e-01 0.0887 0.0783 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 4.46e-02 0.213 0.106 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0867 0.0705 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0742 0.102 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -958032 sc-eQTL 6.44e-01 0.0376 0.0813 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 4.59e-01 0.075 0.101 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 sc-eQTL 4.53e-01 -0.077 0.103 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -752938 sc-eQTL 7.06e-02 0.192 0.106 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -829371 sc-eQTL 1.22e-01 0.129 0.0832 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -288949 sc-eQTL 7.10e-01 0.0354 0.0948 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -351538 sc-eQTL 4.74e-01 0.0737 0.103 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -849143 sc-eQTL 1.64e-01 -0.132 0.0943 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 eQTL 0.0208 -0.0442 0.0191 0.00186 0.0 0.224
ENSG00000226084 AC113935.1 -198633 eQTL 0.0305 -0.0521 0.024 0.00107 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 855735 2.67e-07 1.27e-07 5.03e-08 1.82e-07 1.01e-07 9.9e-08 1.6e-07 5.66e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.57e-07 1.01e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.44e-07 6.32e-08 4.21e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.79e-08 1.55e-07 1.26e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.22e-07 9.49e-08 1.06e-07 3.08e-08 4.02e-08 8.23e-08 6.67e-08 3.28e-08 5.22e-08 8.93e-08 6.63e-08 4.47e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.11e-08 3.42e-08 1.86e-08 1.2e-07 3.79e-09 5e-08