Genes within 1Mb (chr1:76926320:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 3.89e-01 0.0884 0.102 0.224 B L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00312 0.074 0.224 B L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0325 0.0793 0.224 B L1
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 7.53e-01 0.0308 0.098 0.224 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0458 0.0881 0.224 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.76e-01 0.0245 0.0861 0.224 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 3.38e-01 0.0884 0.0921 0.224 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00938 0.0589 0.224 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00672 0.0793 0.224 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 3.63e-01 0.055 0.0604 0.224 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 8.68e-01 0.0116 0.0694 0.224 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0795 0.086 0.224 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 2.67e-01 0.0909 0.0818 0.224 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0325 0.0874 0.224 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 8.29e-01 0.0117 0.0541 0.224 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0573 0.091 0.224 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 8.05e-01 0.0208 0.0841 0.224 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.66e-01 0.0757 0.104 0.214 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 1.38e-01 0.139 0.0932 0.214 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 4.50e-01 0.0829 0.109 0.214 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 3.78e-01 -0.078 0.0884 0.214 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0923 0.0985 0.214 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 7.70e-01 0.0339 0.116 0.214 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 2.21e-01 -0.104 0.0844 0.214 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.64e-01 0.0773 0.105 0.224 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 9.72e-02 -0.103 0.0616 0.224 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.34e-01 0.0659 0.106 0.224 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 5.64e-01 0.0402 0.0695 0.224 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 7.24e-01 0.0338 0.0957 0.224 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 5.66e-01 0.0452 0.0787 0.224 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.71e-01 0.148 0.108 0.223 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.08e-02 0.153 0.0845 0.223 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.66e-01 0.0432 0.0998 0.223 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 5.34e-01 0.0658 0.106 0.223 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.0929 0.223 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00971 0.104 0.224 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0107 0.0825 0.224 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0196 0.0821 0.224 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 2.07e-01 0.131 0.104 0.224 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 4.72e-01 0.0769 0.107 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 7.87e-01 0.0339 0.125 0.219 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 8.30e-02 -0.214 0.123 0.219 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.54e-01 -0.037 0.118 0.219 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00816 0.0974 0.219 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00383 0.125 0.219 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 9.01e-01 0.013 0.104 0.219 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 5.85e-01 -0.062 0.113 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.92e-01 0.027 0.102 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.72e-01 0.162 0.118 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 4.01e-01 0.0914 0.109 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0523 0.107 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 8.14e-01 0.0263 0.111 0.22 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 4.57e-01 0.0802 0.108 0.22 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.82e-01 0.0489 0.119 0.22 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0111 0.108 0.22 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.72e-01 0.153 0.111 0.22 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 1.22e-02 0.246 0.0973 0.22 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 3.78e-01 0.0939 0.106 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 5.27e-01 0.0568 0.0896 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0183 0.11 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0452 0.0997 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.64e-02 -0.174 0.104 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.67e-01 0.0281 0.0947 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 2.05e-01 0.141 0.111 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0181 0.101 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0495 0.115 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00593 0.098 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.74e-02 0.214 0.112 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 3.58e-01 0.0969 0.105 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 2.88e-01 -0.126 0.118 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0312 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.64e-01 0.0492 0.113 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 7.64e-01 0.0307 0.102 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0464 0.115 0.216 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.43e-01 0.141 0.0958 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0299 0.0719 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.99e-01 0.0431 0.0818 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 2.98e-01 0.0732 0.0701 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0469 0.0752 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.91e-01 -0.134 0.102 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 2.83e-01 0.0825 0.0767 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0324 0.11 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0161 0.072 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.98e-01 0.13 0.101 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.43e-01 0.0759 0.0988 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 9.10e-01 0.0116 0.102 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.51e-01 -0.155 0.108 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 2.53e-01 0.116 0.101 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 4.95e-01 0.0756 0.111 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.17e-01 -0.173 0.11 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 1.23e-01 0.15 0.097 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.31e-01 -0.164 0.108 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 1.96e-01 0.133 0.102 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 3.45e-01 0.0921 0.0973 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0282 0.094 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0462 0.101 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0374 0.0944 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 4.15e-01 0.0784 0.096 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 6.12e-01 0.0373 0.0734 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00235 0.0973 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.93e-01 0.0268 0.102 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0114 0.112 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.04e-01 0.0809 0.121 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 3.53e-02 -0.23 0.108 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.65e-01 -0.127 0.114 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 9.10e-02 -0.133 0.078 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.75e-01 0.16 0.118 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0405 0.119 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.00e-01 0.0435 0.113 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0928 0.0798 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0241 0.117 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0269 0.0809 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 8.38e-01 0.0224 0.11 0.225 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 1.48e-01 -0.139 0.0957 0.225 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.75e-01 0.0312 0.109 0.225 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 1.64e-01 0.119 0.0851 0.225 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 6.44e-01 0.0493 0.107 0.225 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0636 0.114 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 1.90e-01 0.149 0.113 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0995 0.117 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 6.43e-01 0.047 0.101 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0475 0.105 0.218 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.26e-02 0.226 0.111 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 3.74e-02 0.193 0.0919 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0294 0.105 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 6.76e-01 0.0446 0.107 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.25e-01 -0.124 0.102 0.222 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 6.00e-01 0.0602 0.115 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.92e-02 0.198 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0273 0.118 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 4.24e-01 0.0853 0.106 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0232 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 5.51e-01 0.0669 0.112 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.33e-01 -0.048 0.1 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 2.68e-01 0.117 0.105 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 2.98e-01 0.112 0.107 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0128 0.109 0.222 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0775 0.168 0.23 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0618 0.147 0.23 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.78e-01 0.113 0.0835 0.23 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 1.52e-01 0.181 0.126 0.23 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.65e-01 -0.178 0.159 0.23 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 8.16e-01 0.0269 0.116 0.23 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 6.37e-01 0.054 0.114 0.228 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.41e-01 0.035 0.106 0.228 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0444 0.0888 0.228 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 4.84e-02 0.18 0.0908 0.228 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00576 0.107 0.228 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.11 0.224 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0659 0.0998 0.224 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0321 0.11 0.224 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 7.36e-01 0.0229 0.0679 0.224 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.31e-01 0.13 0.109 0.224 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.56e-01 0.182 0.128 0.205 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.205 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0596 0.118 0.205 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 1.05e-01 -0.157 0.0964 0.205 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0956 0.093 0.205 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0268 0.128 0.205 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0498 0.0958 0.205 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 7.52e-01 0.0341 0.108 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0786 0.0678 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.58e-01 0.0481 0.108 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 8.54e-01 0.0147 0.0796 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0646 0.11 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 2.20e-01 0.108 0.0877 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 9.10e-01 0.0133 0.117 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00441 0.0845 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.89e-01 0.141 0.107 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0348 0.0876 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 2.98e-01 0.118 0.113 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.23e-01 0.0324 0.0912 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0944 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.82e-01 0.0343 0.124 0.218 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0787 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0276 0.099 0.218 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 3.55e-01 -0.119 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 4.05e-01 0.1 0.12 0.22 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 4.14e-01 0.0818 0.0999 0.22 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0937 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0601 0.0849 0.22 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.08e-02 0.285 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 9.44e-02 -0.172 0.102 0.22 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 2.47e-02 0.26 0.115 0.219 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0463 0.0882 0.219 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.34e-01 0.0665 0.107 0.219 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 3.14e-02 0.2 0.092 0.219 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0344 0.115 0.219 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.46e-01 0.0352 0.109 0.219 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 9.47e-01 0.00802 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 4.38e-02 0.248 0.122 0.223 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 5.42e-01 0.0799 0.131 0.223 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0167 0.0852 0.223 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 8.69e-01 0.0194 0.117 0.223 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 6.10e-01 0.0693 0.136 0.223 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 4.06e-01 0.0644 0.0774 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 9.77e-01 0.00316 0.109 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 5.62e-01 0.0503 0.0868 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 4.71e-01 0.0823 0.114 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 7.17e-01 0.0392 0.108 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0673 0.103 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0324 0.105 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.65e-01 0.146 0.105 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 8.92e-01 0.0115 0.0842 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0824 0.109 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0566 0.101 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0562 0.102 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 9.50e-01 0.00584 0.0925 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0159 0.108 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 1.13e-01 -0.104 0.0652 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 1.60e-01 0.147 0.104 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00906 0.0771 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00951 0.102 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 1.01e-01 0.133 0.0804 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 1.53e-02 0.265 0.108 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 6.70e-01 -0.031 0.0728 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0434 0.105 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -962193 sc-eQTL 3.11e-01 0.0848 0.0835 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.83e-01 0.139 0.104 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 sc-eQTL 8.35e-01 -0.022 0.106 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -757099 sc-eQTL 7.71e-02 0.193 0.109 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -833532 sc-eQTL 7.72e-02 0.152 0.0854 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -293110 sc-eQTL 4.67e-01 0.0709 0.0973 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -355699 sc-eQTL 5.59e-01 0.0619 0.106 0.222 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -853304 sc-eQTL 1.51e-01 -0.14 0.0969 0.222 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK -293110 eQTL 0.0419 0.0438 0.0215 0.0 0.0 0.225
ENSG00000154027 AK5 -355699 eQTL 0.0369 0.0461 0.022 0.0 0.0 0.225
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 851574 eQTL 0.0465 -0.038 0.0191 0.00122 0.0 0.225
ENSG00000226084 AC113935.1 -202794 eQTL 0.0195 -0.0562 0.024 0.00128 0.0 0.225


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina