logo

Genes within 1Mb (chr1:76892953:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.15e-01 0.0641 0.0981 0.248 B L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00869 0.0709 0.248 B L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 1.57e-01 -0.107 0.0756 0.248 B L1
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 6.34e-01 0.0447 0.0938 0.248 B L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0955 0.0842 0.248 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0227 0.0824 0.248 B L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.86e-01 0.0949 0.0888 0.248 CD4T L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00113 0.0568 0.248 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00404 0.0765 0.248 CD4T L1
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 9.44e-01 0.0041 0.0584 0.248 CD4T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 6.05e-01 0.0346 0.0669 0.248 CD4T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0723 0.0825 0.248 CD8T L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.44e-01 0.0745 0.0785 0.248 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0793 0.0837 0.248 CD8T L1
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0208 0.0519 0.248 CD8T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.75e-01 -0.025 0.0874 0.248 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.48e-01 0.0155 0.0807 0.248 CD8T L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.59e-01 0.0573 0.098 0.239 DC L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.53e-01 0.0823 0.0884 0.239 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.61e-01 0.0602 0.103 0.239 DC L1
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0379 0.0836 0.239 DC L1
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00896 0.0933 0.239 DC L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 6.72e-01 0.0464 0.109 0.239 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0387 0.08 0.239 DC L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 4.17e-01 0.0816 0.1 0.248 Mono L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0911 0.0589 0.248 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0071 0.101 0.248 Mono L1
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 1.86e-01 0.0877 0.0661 0.248 Mono L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 6.34e-01 0.0435 0.0913 0.248 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00132 0.0752 0.248 Mono L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 3.87e-01 0.0891 0.103 0.247 NK L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 6.51e-02 0.149 0.0803 0.247 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.23e-01 0.0606 0.0949 0.247 NK L1
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 4.19e-01 0.0814 0.101 0.247 NK L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.12e-02 -0.154 0.0881 0.247 NK L1
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0548 0.0997 0.248 Other_T L1
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0652 0.0792 0.248 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.94e-01 0.0541 0.0789 0.248 Other_T L1
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 3.95e-01 0.0852 0.0999 0.248 Other_T L1
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.85e-01 0.0281 0.103 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.61e-01 0.0712 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.42e-02 -0.255 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0746 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 8.99e-01 0.0121 0.095 0.235 B_Activated L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.54e-01 0.0384 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0175 0.101 0.235 B_Activated L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0783 0.109 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.55e-01 0.00556 0.0986 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.17e-01 0.0742 0.114 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 5.34e-01 0.0653 0.105 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.12e-01 -0.129 0.103 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 1.00e+00 5.99e-05 0.103 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 6.84e-01 0.044 0.108 0.244 B_Memory L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 6.04e-01 0.0541 0.104 0.244 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 9.54e-01 0.00664 0.115 0.244 B_Memory L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 5.95e-01 0.0555 0.104 0.244 B_Memory L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 5.41e-02 0.208 0.107 0.244 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 1.83e-02 0.224 0.0944 0.244 B_Memory L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.102 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 5.62e-01 0.0501 0.0864 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0661 0.106 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0594 0.096 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.39e-02 -0.18 0.1 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00398 0.0913 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 4.40e-01 0.0838 0.108 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0115 0.0976 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0644 0.112 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00433 0.0951 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.17e-01 0.135 0.109 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 9.82e-01 0.00233 0.102 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.28e-02 -0.256 0.111 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0084 0.107 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.20e-01 0.0871 0.108 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00692 0.0973 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0264 0.109 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.41e-01 0.136 0.0923 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0104 0.0692 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 6.18e-01 0.0394 0.0788 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 8.63e-01 0.0117 0.0677 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00218 0.0724 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.90e-01 -0.104 0.0982 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.66e-01 0.0668 0.0737 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0506 0.106 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0488 0.0691 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 1.95e-01 0.126 0.0966 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.91e-01 0.051 0.0946 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00987 0.0976 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 1.90e-01 -0.135 0.103 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 3.39e-01 0.0932 0.0972 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 3.78e-01 0.0934 0.106 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.04e-01 -0.171 0.105 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 2.17e-01 0.114 0.0925 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.25e-02 -0.209 0.103 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 1.72e-01 0.133 0.0972 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.60e-01 0.0284 0.0927 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0205 0.0894 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0302 0.097 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0433 0.0907 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.52e-01 0.055 0.0923 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0257 0.0705 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.20e-01 0.0213 0.0935 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0153 0.0979 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 9.11e-01 0.0119 0.107 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 1.66e-01 0.148 0.107 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 1.58e-01 0.163 0.115 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 2.88e-03 -0.309 0.102 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 1.93e-01 -0.142 0.109 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.65e-02 -0.128 0.0746 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.68e-01 0.126 0.114 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0752 0.114 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 8.73e-01 0.0174 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 1.11e-01 -0.123 0.0768 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.81e-01 0.0168 0.113 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 6.57e-01 0.0348 0.0781 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0202 0.105 0.249 MAIT L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 7.41e-02 -0.164 0.0915 0.249 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 2.70e-01 0.115 0.104 0.249 MAIT L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 1.92e-01 0.107 0.0816 0.249 MAIT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.45e-01 0.0332 0.102 0.249 MAIT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0682 0.109 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.108 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0942 0.112 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 8.49e-01 0.0184 0.0966 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0948 0.1 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.22e-01 0.13 0.106 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.30e-02 0.187 0.0872 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 9.81e-01 0.00239 0.0997 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 5.75e-01 0.057 0.101 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.35e-01 -0.115 0.0966 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.11 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.05e-02 0.233 0.107 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 6.57e-01 0.0502 0.113 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 2.79e-01 0.11 0.102 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0486 0.105 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 6.21e-01 0.0526 0.106 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0554 0.0951 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.07e-01 0.0828 0.0997 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 1.51e-01 0.146 0.101 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0242 0.103 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0801 0.16 0.241 PB L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0358 0.141 0.241 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 1.37e-01 0.119 0.0798 0.241 PB L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 2.01e-01 0.155 0.121 0.241 PB L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 3.60e-01 -0.14 0.153 0.241 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.111 0.241 PB L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 9.62e-01 0.0052 0.11 0.252 Pro_T L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 4.32e-01 0.0801 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0718 0.0854 0.252 Pro_T L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 2.76e-01 0.0961 0.088 0.252 Pro_T L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0351 0.103 0.252 Pro_T L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.43e-02 0.26 0.105 0.248 Treg L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0392 0.096 0.248 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0267 0.106 0.248 Treg L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00394 0.0653 0.248 Treg L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 5.27e-01 0.0664 0.105 0.248 Treg L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.80e-01 0.163 0.121 0.229 cDC L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 2.06e-01 0.132 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0109 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 2.48e-01 -0.107 0.0918 0.229 cDC L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0099 0.0885 0.229 cDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0527 0.121 0.229 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.93e-01 0.0122 0.091 0.229 cDC L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 5.15e-01 0.0674 0.103 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0486 0.065 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0217 0.104 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 3.44e-01 0.0721 0.0761 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0258 0.105 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 6.16e-01 0.0422 0.0842 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0186 0.112 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0112 0.0809 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 3.67e-01 0.0925 0.102 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 7.97e-01 0.0215 0.0838 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 4.85e-01 0.0757 0.108 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00985 0.0873 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0935 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.59e-01 0.00614 0.118 0.252 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 8.24e-01 0.0281 0.126 0.252 gdT L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0252 0.0942 0.252 gdT L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0743 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 6.76e-01 0.0482 0.115 0.244 intMono L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 5.66e-01 0.055 0.0955 0.244 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0868 0.102 0.244 intMono L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0564 0.0811 0.244 intMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 1.72e-02 0.254 0.106 0.244 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 2.36e-01 -0.116 0.0978 0.244 intMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.54e-02 0.263 0.107 0.244 ncMono L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0738 0.0827 0.244 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 7.84e-01 0.0275 0.1 0.244 ncMono L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 5.69e-02 0.166 0.0866 0.244 ncMono L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 9.86e-01 0.00193 0.108 0.244 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.05e-01 0.0251 0.102 0.244 ncMono L2
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 7.97e-01 0.0297 0.115 0.254 pDC L2
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 2.78e-01 0.128 0.118 0.254 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 7.20e-01 -0.045 0.125 0.254 pDC L2
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0208 0.0815 0.254 pDC L2
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 7.21e-01 0.04 0.112 0.254 pDC L2
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.10e-01 0.163 0.129 0.254 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 4.75e-01 0.053 0.074 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00703 0.105 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 7.41e-01 0.0276 0.0835 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 8.20e-01 -0.025 0.11 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 4.74e-01 0.0745 0.104 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0535 0.0994 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.82e-01 -0.015 0.101 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.49e-01 0.116 0.1 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000978 0.0805 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0645 0.0968 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 2.99e-01 -0.102 0.0978 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0241 0.0884 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 9.44e-01 0.00731 0.103 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0759 0.0627 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.01e-01 0.0674 0.1 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 4.22e-01 0.0593 0.0737 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.93e-01 0.0132 0.0979 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 5.10e-01 0.0512 0.0775 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 1.71e-02 0.248 0.103 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0631 0.0694 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 5.03e-01 -0.067 0.0999 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162614 NEXN -995560 sc-eQTL 3.39e-01 0.0764 0.0797 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 1.31e-01 0.15 0.099 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 818207 sc-eQTL 8.38e-01 0.0206 0.101 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000036549 AC118549.1 -790466 sc-eQTL 2.27e-01 0.126 0.104 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000077254 USP33 -866899 sc-eQTL 6.63e-02 0.15 0.0811 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -326477 sc-eQTL 3.56e-01 0.0855 0.0924 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000154027 AK5 -389066 sc-eQTL 4.31e-01 0.0793 0.1 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180488 MIGA1 -886671 sc-eQTL 8.84e-02 -0.157 0.0919 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000142892 PIGK -326477 eQTL 0.0191 0.0475 0.0202 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina