logo

Genes within 1Mb (chr1:76238517:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.51e-01 0.121 0.0841 0.1 B L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 3.51e-01 0.0659 0.0705 0.1 B L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 2.89e-01 -0.114 0.107 0.1 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 2.39e-01 -0.137 0.116 0.1 B L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.15e-01 0.108 0.0681 0.1 CD4T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0156 0.0593 0.1 CD4T L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.90e-01 0.0753 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.49e-01 0.0986 0.0852 0.1 CD8T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.58e-02 0.114 0.0681 0.1 CD8T L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 2.42e-01 0.14 0.119 0.1 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 9.97e-02 -0.189 0.114 0.1 CD8T L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 7.55e-01 -0.041 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.04e-01 0.0186 0.154 0.099 DC L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0345 0.151 0.099 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 6.25e-02 -0.217 0.116 0.099 DC L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0921 0.1 0.1 Mono L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 4.46e-02 0.22 0.109 0.1 Mono L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0126 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0445 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 5.81e-01 0.0581 0.105 0.099 NK L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 7.44e-01 0.0257 0.0788 0.099 NK L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.13e-01 0.0689 0.136 0.099 NK L1
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 8.37e-02 -0.157 0.0901 0.1 Other_T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 6.76e-01 0.0417 0.0997 0.1 Other_T L1
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.44e-01 0.0532 0.115 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 9.59e-01 0.00857 0.166 0.089 B_Activated L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 6.02e-01 0.0822 0.158 0.089 B_Activated L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0436 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 3.09e-01 -0.15 0.147 0.089 B_Activated L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.08e-01 0.125 0.122 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 4.70e-01 0.0808 0.112 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 3.59e-01 -0.15 0.163 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 5.83e-01 0.0806 0.146 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.31e-01 -0.125 0.129 0.099 B_Memory L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 2.87e-01 0.121 0.113 0.099 B_Memory L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.20e-01 0.0368 0.162 0.099 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0358 0.134 0.099 B_Memory L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.06e-01 0.134 0.106 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 8.72e-01 0.0144 0.0893 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0759 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 7.01e-01 0.0494 0.128 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 5.40e-01 0.0813 0.132 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.79e-01 0.145 0.108 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0609 0.154 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 6.75e-02 -0.257 0.14 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.19e-01 0.232 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 5.33e-01 0.0848 0.136 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.50e-01 0.115 0.152 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.37e-02 0.184 0.0809 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0417 0.0645 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.14e-01 0.0573 0.113 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0673 0.106 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 4.75e-01 0.0552 0.0771 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0296 0.155 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0651 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 6.63e-01 0.0467 0.107 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 5.17e-03 -0.412 0.146 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 6.81e-01 0.0486 0.118 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.31e-01 0.151 0.0996 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0203 0.145 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 8.43e-01 0.0249 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.11 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 2.67e-02 0.178 0.0799 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0516 0.132 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 3.72e-02 -0.29 0.139 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 8.17e-01 0.0343 0.148 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0216 0.114 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0128 0.168 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 3.39e-01 -0.104 0.109 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.52e-01 0.137 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.14e-01 -0.219 0.138 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.70e-01 0.111 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 2.56e-01 -0.126 0.11 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.19e-01 -0.157 0.128 0.1 MAIT L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 2.16e-01 0.129 0.104 0.1 MAIT L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0256 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.92e-01 -0.117 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.85e-01 0.00241 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.21e-01 -0.129 0.16 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.09e-01 0.16 0.127 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.77e-01 0.0028 0.0955 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 7.09e-01 0.0531 0.142 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 9.16e-01 0.0155 0.147 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00514 0.127 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.16e-02 0.302 0.161 0.1 NK_HLA L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 7.98e-01 0.0312 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.23e-01 0.139 0.0901 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0732 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 6.14e-01 0.0745 0.147 0.104 PB L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 2.63e-01 0.188 0.167 0.104 PB L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0366 0.105 0.104 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 4.03e-01 -0.12 0.144 0.104 PB L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 5.39e-02 -0.219 0.113 0.1 Pro_T L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 3.20e-01 0.145 0.145 0.1 Pro_T L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0197 0.121 0.1 Pro_T L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 7.00e-01 0.0531 0.138 0.1 Treg L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00211 0.112 0.1 Treg L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0704 0.151 0.1 Treg L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 4.23e-01 -0.116 0.145 0.1 cDC L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0179 0.163 0.1 cDC L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.08e-01 0.129 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 3.26e-03 -0.368 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 4.91e-01 0.0776 0.112 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.30e-01 0.0689 0.143 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 2.95e-01 0.121 0.116 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.15e-01 -0.162 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 7.78e-02 0.23 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 4.32e-01 -0.111 0.141 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0905 0.12 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 4.88e-01 -0.133 0.191 0.085 gdT L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0839 0.16 0.085 gdT L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 9.32e-01 0.0172 0.202 0.085 gdT L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.102 intMono L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 5.14e-02 0.285 0.145 0.102 intMono L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.42e-02 0.261 0.14 0.102 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0623 0.136 0.102 intMono L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.31e-02 0.327 0.143 0.097 ncMono L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 7.45e-02 0.244 0.136 0.097 ncMono L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 7.00e-01 -0.056 0.145 0.097 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 7.11e-01 0.0548 0.147 0.097 ncMono L2
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 2.18e-01 0.186 0.151 0.096 pDC L2
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 3.96e-01 -0.154 0.181 0.096 pDC L2
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 6.24e-01 0.0881 0.179 0.096 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 2.59e-02 0.235 0.105 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.91e-01 0.0955 0.111 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 2.32e-01 0.118 0.098 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 9.96e-01 0.000812 0.158 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0724 0.145 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.69e-01 0.137 0.0994 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 5.40e-01 0.0482 0.0784 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0985 0.147 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 7.85e-01 -0.034 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.67e-01 -0.15 0.108 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.03e-01 0.18 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 8.71e-01 0.0225 0.139 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 8.80e-01 0.0163 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 1.12e-01 0.198 0.124 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 1.87e-02 0.289 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 7.00e-01 0.0549 0.142 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 163771 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0196 0.143 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 514170 sc-eQTL 3.28e-01 0.104 0.106 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 452320 sc-eQTL 9.36e-01 0.0065 0.0809 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000142892 PIGK -980913 sc-eQTL 3.82e-01 0.116 0.133 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000181227 \N 493741 2.77e-07 2.88e-07 6.55e-08 2.09e-07 9.79e-08 8.33e-08 2.95e-07 5.21e-08 1.44e-07 5.42e-08 1.63e-07 8.68e-08 3.6e-07 8.15e-08 6.93e-08 7.74e-08 8.42e-08 2.04e-07 7.36e-08 4.31e-08 1.26e-07 1.98e-07 1.64e-07 4.05e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.2e-07 1.01e-07 1.39e-07 1.38e-07 1.06e-07 3.95e-08 2.91e-08 8.11e-08 8.21e-08 3.95e-08 4.95e-08 8.78e-08 6.37e-08 3.71e-08 3.07e-08 2.41e-07 4.52e-08 1.55e-08 7.79e-08 1.99e-08 1.22e-07 4.7e-09 4.61e-08