logo

Genes within 1Mb (chr1:76137963:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.01e-01 0.00864 0.0691 0.16 B L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 3.99e-01 0.0488 0.0577 0.16 B L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 1.45e-01 0.139 0.0946 0.16 B L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.34e-01 0.0663 0.0555 0.16 CD4T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 5.75e-01 0.027 0.0482 0.16 CD4T L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.53e-01 0.0797 0.0695 0.16 CD8T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 4.86e-01 -0.039 0.0559 0.16 CD8T L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0615 0.0939 0.16 CD8T L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.98e-01 -0.104 0.1 0.158 DC L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 4.19e-01 0.0952 0.118 0.158 DC L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.17e-01 0.0726 0.0892 0.158 DC L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 8.85e-01 0.012 0.0833 0.16 Mono L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0606 0.0913 0.16 Mono L1
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.15e-01 0.0709 0.0868 0.16 Mono L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 3.01e-02 0.184 0.0842 0.159 NK L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.04e-01 0.0158 0.0638 0.159 NK L1
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 7.57e-01 0.0226 0.0727 0.16 Other_T L1
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 2.12e-01 0.0998 0.0797 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 5.85e-01 0.0686 0.125 0.161 B_Activated L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0899 0.119 0.161 B_Activated L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0207 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0955 0.0961 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 6.30e-01 0.0424 0.0877 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.115 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 1.69e-01 -0.141 0.102 0.159 B_Memory L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 1.72e-01 0.123 0.0898 0.159 B_Memory L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 3.69e-01 0.0959 0.107 0.159 B_Memory L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0108 0.0868 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 2.99e-01 0.0756 0.0727 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 8.68e-02 0.179 0.104 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.49e-01 0.126 0.109 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 5.38e-01 0.0551 0.0894 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0589 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 1.07e-01 0.2 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 1.85e-01 -0.15 0.113 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 8.46e-01 0.0128 0.066 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 7.60e-01 0.0159 0.052 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 1.81e-01 0.113 0.0845 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00225 0.0617 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0232 0.1 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.59e-01 0.0158 0.0887 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 3.75e-01 0.0849 0.0955 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0221 0.081 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 7.94e-01 0.0266 0.101 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 4.90e-01 0.0621 0.0897 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0586 0.0658 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0931 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0187 0.116 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 7.90e-01 0.0238 0.0892 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 1.99e-01 -0.109 0.085 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 6.14e-01 0.0623 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 5.58e-01 0.0685 0.117 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 9.83e-01 0.00198 0.0928 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 4.72e-01 0.0742 0.103 0.16 MAIT L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 5.49e-01 0.0504 0.084 0.16 MAIT L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0932 0.111 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 4.94e-01 0.0721 0.105 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 1.34e-02 0.255 0.102 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00377 0.0776 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.11e-01 -0.153 0.122 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.106 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 7.89e-02 0.176 0.0997 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 7.04e-01 0.0285 0.0747 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0496 0.111 0.193 PB L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 6.78e-01 0.0527 0.127 0.193 PB L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.56e-01 -0.081 0.108 0.193 PB L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0347 0.0927 0.163 Pro_T L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0033 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 5.62e-01 0.0666 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 7.77e-01 0.0264 0.0931 0.16 Treg L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0815 0.113 0.159 cDC L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 4.70e-01 0.0918 0.127 0.159 cDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.63e-01 0.0724 0.0984 0.159 cDC L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0138 0.097 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 2.00e-01 -0.121 0.0938 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 2.12e-01 0.121 0.0965 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00258 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 9.47e-01 0.00721 0.109 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 6.36e-01 0.0472 0.0996 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.79e-01 0.00377 0.144 0.155 gdT L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.27e-01 0.0266 0.121 0.155 gdT L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00661 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0629 0.122 0.158 intMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0257 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 2.53e-01 -0.132 0.115 0.161 ncMono L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.11 0.161 ncMono L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 1.22e-01 0.182 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0622 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 1.16e-01 0.21 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00587 0.0784 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0831 0.0879 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 6.57e-01 0.0346 0.0778 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 4.08e-01 0.095 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 4.29e-01 0.065 0.0821 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 3.44e-01 0.0612 0.0645 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 3.85e-01 0.0891 0.102 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 9.89e-01 0.0012 0.0903 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 2.55e-01 -0.105 0.0919 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 2.63e-01 0.0999 0.0891 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0525 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184005 ST6GALNAC3 63217 sc-eQTL 2.67e-01 0.132 0.118 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000117054 ACADM 413616 sc-eQTL 5.79e-03 0.237 0.085 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000137955 RABGGTB 351766 sc-eQTL 8.55e-01 -0.012 0.0657 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000181227 DLSTP1 393187 eQTL 0.0137 0.131 0.0531 0.00229 0.0 0.149

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina