logo

Genes within 1Mb (chr1:74704668:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 4.64e-02 0.194 0.0969 0.09 B L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.89e-03 0.369 0.135 0.09 B L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 9.71e-01 0.00508 0.141 0.09 B L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.32e-01 0.123 0.103 0.09 CD4T L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 3.94e-04 0.43 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0778 0.122 0.09 CD4T L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.79e-01 0.0946 0.107 0.09 CD8T L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 9.28e-02 0.222 0.131 0.09 CD8T L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.66e-01 0.0434 0.145 0.09 CD8T L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.23e-01 -0.176 0.144 0.092 DC L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.14e-03 0.433 0.139 0.092 DC L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.54e-01 0.11 0.146 0.092 DC L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 7.05e-01 0.0602 0.159 0.09 Mono L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 5.27e-04 0.491 0.139 0.09 Mono L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0325 0.122 0.09 Mono L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0154 0.112 0.09 NK L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.11e-01 0.11 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0977 0.135 0.09 NK L1
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0724 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.46e-02 0.221 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 1.84e-01 -0.195 0.146 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 6.11e-02 0.309 0.164 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 9.27e-01 0.016 0.175 0.087 B_Activated L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.56e-01 -0.146 0.158 0.087 B_Activated L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0602 0.118 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 8.92e-01 0.0213 0.157 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0463 0.146 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 6.80e-01 0.0528 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.06e-01 0.191 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.29e-01 -0.149 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 4.08e-05 0.518 0.124 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 1.80e-02 0.371 0.155 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.84e-01 0.0807 0.147 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 1.38e-01 0.192 0.129 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 3.51e-02 0.324 0.153 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 8.80e-01 0.0225 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.28e-01 0.149 0.152 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 7.00e-01 0.0618 0.16 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0523 0.139 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.21e-01 0.141 0.115 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.91e-03 0.386 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.88e-01 0.0728 0.134 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 1.14e-01 0.182 0.114 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 1.16e-03 0.467 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.38e-01 -0.141 0.147 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 7.78e-02 -0.238 0.134 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 8.00e-02 0.272 0.155 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.35e-01 -0.115 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 4.72e-01 0.0919 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 1.65e-01 0.217 0.156 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.67e-01 -0.108 0.148 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 5.68e-01 0.0698 0.122 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.85e-01 0.147 0.137 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 6.14e-01 0.0728 0.144 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.15e-01 -0.138 0.137 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0395 0.159 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.99e-01 0.0755 0.143 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0351 0.153 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 8.79e-01 0.0238 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 6.93e-01 0.0558 0.141 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0408 0.139 0.089 MAIT L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 3.65e-02 0.343 0.163 0.089 MAIT L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0749 0.141 0.089 MAIT L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0292 0.146 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00451 0.157 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.47e-02 0.276 0.136 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.18e-01 -0.157 0.127 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.18e-01 0.117 0.144 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.62e-02 -0.283 0.147 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 4.75e-01 -0.109 0.152 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.95e-01 0.0618 0.157 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0742 0.153 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.68e-01 0.117 0.13 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.11e-01 0.117 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 1.19e-01 0.217 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.36e-01 0.204 0.211 0.078 PB L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0846 0.204 0.078 PB L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.92e-01 0.173 0.202 0.078 PB L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 9.29e-01 0.014 0.156 0.091 Pro_T L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 7.80e-01 0.0342 0.122 0.091 Pro_T L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 1.45e-01 -0.204 0.139 0.091 Pro_T L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.12e-01 0.147 0.145 0.09 Treg L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0601 0.148 0.09 Treg L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 1.21e-01 -0.223 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 1.74e-01 -0.204 0.15 0.093 cDC L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 5.52e-05 0.596 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 8.30e-01 0.0333 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.75e-01 0.138 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.76e-03 0.441 0.146 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 6.75e-01 0.0591 0.141 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.15e-01 0.191 0.154 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.77e-02 0.31 0.156 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0365 0.141 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 8.90e-01 0.0222 0.159 0.109 gdT L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0935 0.171 0.109 gdT L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.01e-01 -0.167 0.161 0.109 gdT L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0547 0.148 0.093 intMono L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 7.25e-02 0.287 0.159 0.093 intMono L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.42e-01 0.115 0.149 0.093 intMono L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.01e-01 -0.19 0.148 0.088 ncMono L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.30e-02 0.375 0.164 0.088 ncMono L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0703 0.142 0.088 ncMono L2
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 3.46e-01 -0.146 0.154 0.102 pDC L2
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 1.18e-01 0.238 0.151 0.102 pDC L2
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0831 0.142 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 8.50e-01 0.0204 0.108 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 4.47e-01 0.119 0.155 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 4.54e-01 -0.114 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.20e-04 0.423 0.112 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 3.21e-03 0.445 0.149 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 8.45e-01 0.0288 0.147 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 2.35e-01 0.189 0.159 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 5.57e-04 0.494 0.141 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 7.49e-01 0.0422 0.132 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 5.16e-01 -0.1 0.154 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 6.64e-03 0.423 0.154 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 8.42e-01 0.0288 0.145 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -28740 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0401 0.115 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -28484 sc-eQTL 2.43e-01 0.159 0.135 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 506456 sc-eQTL 3.02e-01 -0.147 0.142 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116791 CRYZ -28740 eQTL 0.000168 0.126 0.0334 0.0 0.0 0.112
ENSG00000162623 TYW3 -28484 eQTL 4.03e-08 0.119 0.0215 0.0 0.0 0.112

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116791 CRYZ -28740 1.45e-05 2.06e-05 3.05e-06 1.11e-05 2.55e-06 7.63e-06 2.09e-05 3.34e-06 1.77e-05 8.7e-06 2.33e-05 9.08e-06 3.08e-05 7.27e-06 4.72e-06 9.83e-06 8.8e-06 1.44e-05 4.55e-06 4.13e-06 7.99e-06 1.6e-05 1.67e-05 4.82e-06 2.91e-05 5.34e-06 7.98e-06 6.83e-06 1.65e-05 1.57e-05 1.25e-05 1.12e-06 1.33e-06 4.04e-06 8.27e-06 3.83e-06 1.84e-06 2.61e-06 2.7e-06 2.03e-06 1.16e-06 2.28e-05 2.47e-06 2.62e-07 1.07e-06 2.45e-06 2.8e-06 8.83e-07 7.87e-07
ENSG00000162623 TYW3 -28484 1.46e-05 2.1e-05 3.03e-06 1.11e-05 2.6e-06 7.63e-06 2.11e-05 3.34e-06 1.76e-05 8.72e-06 2.37e-05 9.14e-06 3.11e-05 7.35e-06 4.78e-06 9.88e-06 8.74e-06 1.46e-05 4.54e-06 4.14e-06 7.95e-06 1.62e-05 1.69e-05 4.85e-06 2.91e-05 5.25e-06 7.99e-06 6.87e-06 1.66e-05 1.57e-05 1.27e-05 1.11e-06 1.34e-06 4.07e-06 8.41e-06 3.82e-06 1.84e-06 2.61e-06 2.7e-06 2e-06 1.16e-06 2.31e-05 2.48e-06 2.69e-07 1.07e-06 2.44e-06 2.84e-06 8.57e-07 8.17e-07