logo

Genes within 1Mb (chr1:74698994:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 4.66e-01 0.0797 0.109 0.09 B L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.59e-03 0.422 0.151 0.09 B L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00154 0.157 0.09 B L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.78e-01 0.122 0.112 0.09 CD4T L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 1.01e-01 0.22 0.133 0.09 CD4T L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 1.89e-01 -0.175 0.133 0.09 CD4T L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.00e-01 0.192 0.116 0.09 CD8T L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0353 0.144 0.09 CD8T L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 5.31e-02 -0.305 0.157 0.09 CD8T L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.03e-02 0.423 0.163 0.088 DC L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0872 0.164 0.088 DC L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.87e-02 -0.331 0.167 0.088 DC L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 9.34e-02 0.294 0.175 0.09 Mono L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0179 0.159 0.09 Mono L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0406 0.135 0.09 Mono L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 3.79e-02 0.262 0.125 0.088 NK L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 4.13e-01 -0.124 0.151 0.088 NK L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.54e-01 -0.114 0.152 0.088 NK L1
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.40e-01 0.224 0.151 0.09 Other_T L1
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.39e-02 0.251 0.135 0.09 Other_T L1
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 1.55e-01 0.236 0.165 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 9.29e-02 0.302 0.179 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 4.28e-01 -0.151 0.19 0.092 B_Activated L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0338 0.172 0.092 B_Activated L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 7.61e-01 0.0396 0.13 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 4.63e-01 0.126 0.171 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 9.84e-01 0.00328 0.16 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 6.93e-01 0.0557 0.141 0.091 B_Memory L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.56e-01 0.155 0.167 0.091 B_Memory L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 5.95e-01 0.0899 0.169 0.091 B_Memory L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.07e-01 -0.229 0.141 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 2.29e-02 0.394 0.172 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 2.65e-01 0.181 0.162 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 5.72e-02 0.271 0.142 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.94e-02 0.321 0.169 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0511 0.164 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 6.83e-02 -0.3 0.164 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 8.55e-03 0.455 0.171 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0489 0.151 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.70e-01 0.138 0.125 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 1.96e-01 0.195 0.15 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 5.23e-03 -0.406 0.144 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.40e-01 0.186 0.125 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0208 0.159 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.09e-01 0.133 0.161 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 4.21e-01 0.119 0.148 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.15e-01 0.171 0.17 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 2.28e-01 0.194 0.161 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.96e-01 0.147 0.14 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 7.99e-01 0.0438 0.172 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0537 0.163 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.57e-02 0.3 0.134 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.81e-02 -0.314 0.15 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 1.51e-01 -0.228 0.159 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0682 0.156 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.63e-01 0.164 0.18 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0636 0.162 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 6.84e-03 0.437 0.16 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.30e-01 0.162 0.166 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.10e-01 -0.124 0.15 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 4.14e-02 0.309 0.151 0.089 MAIT L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 7.89e-01 0.0483 0.181 0.089 MAIT L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 9.28e-01 -0.014 0.155 0.089 MAIT L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.87e-01 0.223 0.168 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0212 0.182 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0383 0.159 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 3.94e-02 0.3 0.145 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0821 0.165 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.47e-01 0.0548 0.17 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 3.50e-02 0.354 0.167 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 9.24e-01 0.0165 0.174 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 3.87e-01 -0.146 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 5.21e-01 0.0958 0.149 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0805 0.163 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 6.32e-02 -0.296 0.159 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0382 0.194 0.104 PB L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 7.35e-01 0.0635 0.187 0.104 PB L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 3.73e-01 -0.165 0.185 0.104 PB L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.58e-01 0.247 0.174 0.087 Pro_T L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 4.00e-01 0.115 0.137 0.087 Pro_T L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.68e-01 0.114 0.157 0.087 Pro_T L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 4.07e-01 -0.132 0.159 0.09 Treg L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 8.25e-02 0.28 0.16 0.09 Treg L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.76e-01 0.113 0.158 0.09 Treg L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 6.53e-02 0.32 0.173 0.088 cDC L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.42e-02 -0.335 0.173 0.088 cDC L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.36e-02 -0.361 0.177 0.088 cDC L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.77e-01 0.187 0.172 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.48e-01 0.0751 0.164 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0154 0.156 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.83e-01 0.18 0.167 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 9.34e-01 0.0142 0.171 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.41e-01 -0.118 0.152 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 9.84e-01 0.00363 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.36e-02 0.414 0.193 0.091 gdT L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 1.77e-01 0.25 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.83e-02 0.383 0.161 0.091 intMono L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 7.42e-01 0.0586 0.177 0.091 intMono L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 2.58e-01 0.187 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 1.05e-02 0.412 0.159 0.09 ncMono L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0778 0.181 0.09 ncMono L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.43e-01 -0.119 0.155 0.09 ncMono L2
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 9.94e-01 0.00132 0.186 0.085 pDC L2
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.183 0.085 pDC L2
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 4.90e-01 -0.118 0.17 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 5.33e-01 0.0732 0.117 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 2.69e-01 0.187 0.169 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 6.36e-01 0.078 0.165 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 9.44e-01 0.009 0.129 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 6.21e-03 0.458 0.166 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 7.08e-01 0.061 0.163 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 3.24e-01 0.174 0.176 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 9.00e-01 0.0202 0.161 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0188 0.146 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 2.27e-03 0.515 0.167 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 3.37e-01 -0.166 0.173 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 5.37e-01 0.0987 0.16 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116791 CRYZ -34414 sc-eQTL 3.91e-02 0.271 0.131 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162623 TYW3 -34158 sc-eQTL 5.03e-01 -0.104 0.155 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000254685 FPGT 500782 sc-eQTL 5.37e-01 -0.101 0.163 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116791 CRYZ -34414 eQTL 3.22e-05 0.16 0.0382 0.0 0.0 0.0815
ENSG00000162623 TYW3 -34158 eQTL 0.0264 0.0554 0.0249 0.0 0.0 0.0815

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116791 CRYZ -34414 1.49e-05 1.78e-05 3.51e-06 1.14e-05 3.8e-06 8.67e-06 2.42e-05 3.75e-06 1.87e-05 9.82e-06 2.42e-05 9.81e-06 3.22e-05 7.86e-06 5.19e-06 1.09e-05 9.88e-06 1.64e-05 5.56e-06 5.22e-06 9.55e-06 1.94e-05 1.81e-05 6.49e-06 2.96e-05 5.78e-06 8.66e-06 8.34e-06 1.98e-05 1.7e-05 1.25e-05 1.65e-06 2.15e-06 5.74e-06 8.57e-06 4.48e-06 2.72e-06 2.79e-06 3.63e-06 2.71e-06 1.76e-06 2.21e-05 2.63e-06 3.84e-07 2.07e-06 2.97e-06 3.36e-06 1.44e-06 1.46e-06