logo

Genes within 1Mb (chr1:70862719:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.01e-02 -0.169 0.0995 0.19 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0135 0.0776 0.19 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.34e-01 -0.135 0.09 0.19 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.38e-01 0.0731 0.0761 0.19 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0965 0.0996 0.19 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 6.15e-01 0.0435 0.0862 0.19 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00568 0.0678 0.19 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.99e-02 0.113 0.0683 0.19 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0472 0.0628 0.19 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.57e-01 0.0231 0.0743 0.19 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 2.70e-01 0.0962 0.0871 0.19 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.81e-01 0.00224 0.0955 0.19 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.38e-01 0.0163 0.0796 0.19 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 3.70e-01 0.0698 0.0777 0.19 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0714 0.075 0.19 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.74e-01 0.0492 0.0873 0.19 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 6.38e-01 0.0419 0.0891 0.19 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0752 0.123 0.187 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 1.21e-01 0.127 0.0816 0.187 DC L1
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.91e-02 0.174 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 2.01e-01 -0.125 0.0975 0.187 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.111 0.187 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 3.12e-01 0.112 0.11 0.19 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.77e-01 0.00187 0.0641 0.19 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 2.02e-01 0.112 0.0875 0.19 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0346 0.104 0.19 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 8.59e-01 -0.016 0.0901 0.19 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 8.85e-01 0.0138 0.0951 0.191 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0402 0.0839 0.191 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 4.76e-01 0.0601 0.0842 0.191 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 6.01e-01 0.0454 0.0868 0.191 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 7.85e-01 0.0289 0.106 0.191 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0845 0.112 0.19 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0182 0.0884 0.19 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0797 0.1 0.19 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0451 0.107 0.19 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 9.76e-01 0.00297 0.0996 0.19 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0957 0.113 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.10e-02 -0.233 0.119 0.196 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 2.88e-01 -0.135 0.127 0.196 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00683 0.128 0.196 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.06e-01 -0.086 0.129 0.196 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 6.12e-01 0.0544 0.107 0.196 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.57e-02 -0.266 0.118 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.24e-02 -0.171 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.36e-01 -0.173 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.88e-01 0.0625 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 1.31e-01 -0.184 0.121 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.82e-01 0.134 0.124 0.19 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.11 0.19 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0694 0.102 0.19 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.45e-01 0.0909 0.119 0.19 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 1.43e-01 -0.171 0.117 0.19 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.112 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.76e-01 0.00274 0.0893 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0335 0.0952 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0271 0.0963 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 7.42e-01 0.0359 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00465 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.89e-01 0.0145 0.104 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0776 0.122 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 1.54e-01 0.135 0.0942 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 9.95e-01 0.000768 0.112 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0296 0.121 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 3.65e-01 -0.113 0.125 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 5.63e-01 0.0607 0.105 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.94e-01 0.0302 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.16e-01 0.0814 0.125 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 1.53e-01 -0.167 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 6.52e-01 0.0434 0.0961 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0361 0.0697 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 7.34e-02 0.132 0.0733 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0525 0.0735 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.98e-01 0.0204 0.0793 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 3.74e-01 0.0819 0.0919 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 4.93e-01 -0.077 0.112 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0255 0.0828 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.34e-01 0.00757 0.0909 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0632 0.086 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0571 0.0931 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0214 0.113 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 7.91e-01 0.0303 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 7.90e-01 0.0265 0.0995 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 1.84e-01 0.134 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0358 0.101 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 1.22e-01 0.172 0.111 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 7.02e-01 0.0438 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0783 0.0995 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.63e-01 0.0045 0.097 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0842 0.108 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0653 0.113 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0434 0.118 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 5.93e-01 -0.047 0.0878 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 5.73e-01 0.0518 0.0918 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0466 0.0859 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0791 0.0914 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 4.31e-01 0.0775 0.0982 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00968 0.125 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 2.32e-01 0.137 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 7.00e-01 0.0442 0.114 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 8.73e-01 0.0191 0.12 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 9.08e-02 0.207 0.122 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 9.96e-01 0.000679 0.121 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0399 0.118 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 5.16e-01 0.0713 0.11 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0458 0.122 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 6.73e-01 0.0532 0.126 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0334 0.116 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000195 0.119 0.186 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.13e-01 0.0592 0.117 0.186 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00567 0.0989 0.186 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 3.26e-01 -0.108 0.109 0.186 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0952 0.119 0.186 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0382 0.106 0.186 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 8.57e-01 0.0219 0.121 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0502 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 6.66e-01 0.0519 0.12 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 2.12e-01 -0.136 0.109 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.116 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0805 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 1.60e-01 -0.138 0.0982 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0299 0.099 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 2.99e-01 0.101 0.097 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 6.61e-01 0.0512 0.117 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00139 0.119 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.63e-01 0.0785 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.43e-01 0.177 0.121 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.45e-01 0.0713 0.118 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 6.56e-01 0.053 0.119 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.14e-01 0.144 0.116 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.14e-01 0.081 0.0991 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 8.87e-01 0.0158 0.111 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.34e-01 -0.035 0.103 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 9.24e-01 0.0103 0.108 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 1.61e-01 -0.215 0.152 0.196 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.37e-01 0.0285 0.138 0.196 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0489 0.156 0.196 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 2.33e-01 -0.131 0.109 0.196 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00663 0.148 0.196 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0294 0.116 0.191 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0838 0.1 0.191 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0212 0.0914 0.191 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 3.08e-01 0.12 0.117 0.191 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.83e-02 0.234 0.112 0.191 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 2.36e-01 0.138 0.116 0.191 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0846 0.123 0.19 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.62e-01 0.0759 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 4.69e-01 0.0597 0.0824 0.19 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 2.89e-01 0.115 0.108 0.19 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.56e-01 0.0348 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0239 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.16e-01 0.078 0.12 0.193 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0042 0.0899 0.193 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 3.12e-01 0.11 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 8.49e-02 -0.219 0.126 0.193 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.15e-01 -0.126 0.125 0.193 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 8.22e-01 0.0262 0.116 0.193 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 7.30e-01 0.0388 0.112 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0357 0.0743 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 6.31e-02 0.171 0.0917 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00889 0.109 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.34e-01 -0.077 0.0984 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.06e-01 0.0795 0.119 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 5.24e-01 0.0544 0.0853 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 6.21e-02 0.193 0.103 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0606 0.122 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 9.87e-01 0.0017 0.104 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.03e-01 0.0172 0.141 0.182 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00859 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 2.51e-01 0.149 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.89e-01 0.184 0.139 0.182 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.00e-01 0.142 0.136 0.182 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 3.80e-01 0.115 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.30e-01 0.0756 0.12 0.182 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0829 0.105 0.182 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 3.20e-02 0.2 0.0927 0.182 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0121 0.122 0.182 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0408 0.123 0.182 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 5.15e-01 -0.078 0.12 0.186 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 8.28e-02 -0.16 0.0916 0.186 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0959 0.092 0.186 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.25e-01 -0.159 0.103 0.186 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00452 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 1.68e-01 -0.182 0.131 0.195 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 1.30e-01 0.169 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 5.84e-01 0.0559 0.102 0.195 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 6.38e-01 0.0632 0.134 0.195 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 2.68e-01 0.131 0.118 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.66e-02 -0.249 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 1.41e-01 -0.146 0.0986 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 1.04e-01 -0.173 0.106 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.84e-01 0.0755 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 1.17e-01 -0.183 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.15e-01 0.0462 0.0918 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0991 0.0926 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 4.02e-01 0.0724 0.0863 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 8.80e-01 0.0157 0.104 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 2.92e-01 0.118 0.112 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 6.82e-01 0.0276 0.0673 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 1.30e-01 0.134 0.0881 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0497 0.113 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0529 0.0911 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0923 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 2.09e-01 -0.111 0.0877 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 451501 sc-eQTL 7.78e-01 0.0243 0.086 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 2.81e-01 -0.115 0.106 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 5.79e-01 0.0566 0.102 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 657140 sc-eQTL 9.38e-01 0.00782 0.1 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 657037 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0526 0.0869 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 507985 sc-eQTL 7.54e-01 0.0277 0.0883 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -218570 sc-eQTL 3.05e-01 0.092 0.0895 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 507914 sc-eQTL 6.34e-01 0.0513 0.108 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -185089 2.71e-06 2.24e-06 2.45e-07 1.42e-06 3.79e-07 7.89e-07 1.32e-06 4.35e-07 1.7e-06 7.22e-07 1.84e-06 1.3e-06 2.68e-06 6.67e-07 3.68e-07 9.88e-07 1.07e-06 1.21e-06 5.99e-07 4.69e-07 7.61e-07 1.95e-06 1.61e-06 6.86e-07 2.52e-06 7.53e-07 1.05e-06 8.14e-07 1.67e-06 1.66e-06 8.07e-07 2.24e-07 2.65e-07 5.72e-07 7.35e-07 4.3e-07 6.25e-07 2.44e-07 4.87e-07 2.37e-07 3.06e-07 2.82e-06 3.57e-07 5.72e-08 2.87e-07 2.45e-07 2.74e-07 8.42e-08 1.9e-07