logo

Genes within 1Mb (chr1:70756810:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0251 0.0933 0.22 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 3.42e-01 0.0688 0.0722 0.22 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 6.68e-01 0.0361 0.0843 0.22 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.30e-01 -0.107 0.0706 0.22 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.75e-01 -0.039 0.0929 0.22 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0453 0.0801 0.22 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0466 0.0629 0.22 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0495 0.0638 0.22 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000547 0.0584 0.22 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0449 0.069 0.22 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 7.03e-01 0.031 0.0811 0.22 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 2.51e-01 -0.104 0.0902 0.22 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 2.59e-01 -0.085 0.0752 0.22 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 3.94e-02 -0.151 0.073 0.22 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0486 0.0711 0.22 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.57e-01 0.0257 0.0828 0.22 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0179 0.0844 0.22 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.68e-01 0.00448 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0126 0.0739 0.218 DC L1
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 1.35e-01 -0.142 0.0947 0.218 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.47e-01 -0.117 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 5.35e-01 0.0547 0.088 0.218 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 1.62e-01 -0.14 0.0994 0.218 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 2.84e-01 0.109 0.102 0.22 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.56e-02 0.101 0.0587 0.22 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0231 0.081 0.22 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0955 0.22 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0937 0.0829 0.22 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0237 0.0876 0.219 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.78e-02 0.153 0.0766 0.219 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 5.13e-01 0.0508 0.0776 0.219 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 5.32e-02 0.154 0.0793 0.219 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0974 0.219 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0122 0.103 0.22 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.10e-01 0.0195 0.0812 0.22 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0627 0.0923 0.22 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00786 0.0979 0.22 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0866 0.0913 0.22 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 4.24e-01 0.0829 0.103 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 8.25e-01 0.0249 0.113 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0706 0.119 0.227 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 6.57e-01 0.0534 0.12 0.227 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0316 0.121 0.227 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0346 0.101 0.227 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 4.97e-01 -0.074 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.11e-01 0.147 0.092 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0106 0.105 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0493 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.33e-01 0.0537 0.112 0.22 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 5.96e-01 0.0527 0.0993 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 1.38e-01 0.136 0.0917 0.22 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.26e-01 -0.164 0.107 0.22 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0423 0.106 0.22 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.21e-01 0.068 0.106 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.11e-01 0.0693 0.0841 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.63e-01 -0.101 0.0895 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.22e-01 -0.14 0.0903 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.39e-01 -0.052 0.111 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0292 0.0977 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.56e-01 0.0854 0.114 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.89e-01 -0.117 0.0885 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0185 0.105 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.83e-01 0.00235 0.11 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0977 0.114 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 1.26e-01 -0.147 0.0955 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.31e-01 0.127 0.106 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 9.37e-01 0.00906 0.115 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 3.03e-02 0.231 0.106 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0232 0.0898 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0353 0.0651 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0601 0.0689 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00049 0.0687 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0389 0.0741 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0145 0.086 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0304 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0192 0.0777 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 2.83e-01 0.0915 0.0849 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.28e-01 0.0974 0.0805 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 4.79e-01 0.0619 0.0872 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 1.66e-01 0.146 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0686 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 7.66e-01 0.0275 0.0922 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 1.81e-01 0.126 0.0935 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 7.61e-01 0.0283 0.0932 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 4.84e-01 0.0742 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.83e-02 -0.188 0.0987 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.98e-01 -0.121 0.0939 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 6.56e-01 0.0409 0.0917 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 1.93e-01 -0.14 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0973 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0559 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.68e-01 0.0465 0.108 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 9.16e-01 0.00856 0.0806 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0975 0.084 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0371 0.0788 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 8.64e-01 0.0144 0.084 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0424 0.0902 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 4.26e-01 0.0902 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 7.12e-01 0.0386 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 1.73e-01 -0.142 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.18e-01 0.134 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 2.80e-01 -0.12 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 2.02e-01 -0.142 0.111 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.51e-01 -0.149 0.103 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 2.36e-02 -0.225 0.0988 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.10e-01 -0.095 0.115 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0369 0.119 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 9.94e-01 0.000799 0.11 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0901 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 5.43e-01 -0.064 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0267 0.0889 0.221 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00791 0.0986 0.221 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 9.36e-02 -0.179 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 2.82e-01 -0.103 0.0954 0.221 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.47e-01 0.0073 0.111 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 3.51e-02 0.205 0.0964 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0989 0.109 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 8.95e-02 0.169 0.0989 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.48e-01 -0.056 0.093 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 3.64e-01 0.0822 0.0903 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.84e-01 0.0636 0.0907 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 8.13e-02 0.155 0.0885 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0724 0.107 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0135 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.30e-01 0.0784 0.0991 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0991 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00277 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.47e-02 0.198 0.107 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 6.12e-01 0.0465 0.0917 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 5.99e-01 0.0542 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.11e-01 0.0353 0.0953 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.0994 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.49e-01 0.0436 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 5.66e-01 0.0705 0.122 0.233 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.17e-02 0.28 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 4.69e-01 0.0708 0.0973 0.233 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0839 0.131 0.233 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0531 0.107 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.00e+00 1.67e-05 0.0925 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 6.43e-01 0.0391 0.0843 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.21e-01 0.087 0.108 0.22 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 5.03e-01 0.0699 0.104 0.22 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.94e-02 0.194 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0296 0.113 0.22 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 9.08e-01 -0.011 0.0943 0.22 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 1.36e-01 -0.112 0.075 0.22 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 4.13e-01 -0.081 0.0988 0.22 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 6.13e-02 -0.191 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 5.71e-01 -0.062 0.109 0.22 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.37e-01 0.0645 0.0828 0.21 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 2.96e-01 -0.105 0.1 0.21 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0155 0.118 0.21 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 9.08e-01 0.0134 0.116 0.21 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 1.58e-02 -0.258 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.59e-01 0.046 0.104 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.55e-03 0.18 0.0678 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0638 0.0856 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 2.64e-01 -0.113 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0173 0.0914 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.00e-01 -0.014 0.11 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0337 0.0789 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0416 0.0959 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 1.40e-01 -0.166 0.112 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0543 0.0958 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0658 0.139 0.221 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.221 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00626 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 3.28e-01 0.132 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 3.89e-01 0.111 0.129 0.221 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.50e-02 0.182 0.108 0.22 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 3.26e-01 0.0938 0.0952 0.22 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0494 0.0852 0.22 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 5.30e-01 0.0697 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 2.54e-01 0.127 0.111 0.217 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0212 0.0858 0.217 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0428 0.0857 0.217 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 5.10e-01 0.0638 0.0966 0.217 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0724 0.124 0.206 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 6.15e-01 0.0528 0.105 0.206 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0519 0.0954 0.206 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00932 0.126 0.206 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.75e-01 0.142 0.104 0.206 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0961 0.111 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00747 0.103 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 6.10e-02 0.168 0.0892 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 5.36e-01 0.0599 0.0967 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 1.55e-01 -0.139 0.0974 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00899 0.106 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 7.28e-01 0.0303 0.0868 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0877 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 8.41e-02 -0.141 0.0811 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0312 0.0986 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 8.79e-01 0.0158 0.104 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.36e-01 0.0924 0.0618 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0275 0.0817 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 1.09e-01 -0.166 0.103 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0274 0.0841 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 2.22e-02 0.24 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 4.78e-01 0.058 0.0816 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 345592 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0496 0.0798 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 3.94e-01 0.0843 0.0987 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0899 0.0943 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 551231 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.092 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 551128 sc-eQTL 1.21e-01 0.124 0.0796 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 402076 sc-eQTL 3.34e-01 0.0785 0.0811 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -324479 sc-eQTL 7.40e-02 0.147 0.082 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 402005 sc-eQTL 6.84e-01 0.0404 0.0991 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 345592 eQTL 0.0175 -0.0809 0.034 0.0 0.0 0.246

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 345592 5.59e-07 4.24e-07 7.97e-08 4.35e-07 1.07e-07 1.57e-07 4.05e-07 7.98e-08 2.6e-07 1.78e-07 3.66e-07 1.96e-07 6e-07 1.1e-07 1.24e-07 1.53e-07 1.35e-07 3.04e-07 1.62e-07 8.25e-08 1.92e-07 2.63e-07 2.67e-07 1.03e-07 5.75e-07 2.07e-07 1.87e-07 1.77e-07 1.98e-07 3.8e-07 2.19e-07 7.69e-08 5.55e-08 1.56e-07 3.07e-07 7.57e-08 1.82e-07 9.46e-08 8.43e-08 2.2e-08 9.7e-08 5.29e-07 2.16e-08 1.92e-08 5.32e-08 1.95e-08 1.05e-07 1.13e-08 5.35e-08