logo

Genes within 1Mb (chr1:70754229:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0251 0.0933 0.22 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 3.42e-01 0.0688 0.0722 0.22 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 6.68e-01 0.0361 0.0843 0.22 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.30e-01 -0.107 0.0706 0.22 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.75e-01 -0.039 0.0929 0.22 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0453 0.0801 0.22 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0466 0.0629 0.22 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0495 0.0638 0.22 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000547 0.0584 0.22 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0449 0.069 0.22 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 7.03e-01 0.031 0.0811 0.22 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 2.51e-01 -0.104 0.0902 0.22 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 2.59e-01 -0.085 0.0752 0.22 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 3.94e-02 -0.151 0.073 0.22 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0486 0.0711 0.22 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.57e-01 0.0257 0.0828 0.22 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0179 0.0844 0.22 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.68e-01 0.00448 0.111 0.218 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0126 0.0739 0.218 DC L1
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 1.35e-01 -0.142 0.0947 0.218 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.47e-01 -0.117 0.1 0.218 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 5.35e-01 0.0547 0.088 0.218 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 1.62e-01 -0.14 0.0994 0.218 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 2.84e-01 0.109 0.102 0.22 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.56e-02 0.101 0.0587 0.22 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0231 0.081 0.22 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 1.72e-01 -0.131 0.0955 0.22 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0937 0.0829 0.22 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0237 0.0876 0.219 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.78e-02 0.153 0.0766 0.219 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 5.13e-01 0.0508 0.0776 0.219 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 5.32e-02 0.154 0.0793 0.219 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0974 0.219 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0122 0.103 0.22 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.10e-01 0.0195 0.0812 0.22 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0627 0.0923 0.22 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00786 0.0979 0.22 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0866 0.0913 0.22 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 4.24e-01 0.0829 0.103 0.22 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 8.25e-01 0.0249 0.113 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0706 0.119 0.227 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 6.57e-01 0.0534 0.12 0.227 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0316 0.121 0.227 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0346 0.101 0.227 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 4.97e-01 -0.074 0.109 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.11e-01 0.147 0.092 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0106 0.105 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0493 0.104 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.11 0.221 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.33e-01 0.0537 0.112 0.22 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 5.96e-01 0.0527 0.0993 0.22 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 1.38e-01 0.136 0.0917 0.22 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.26e-01 -0.164 0.107 0.22 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0423 0.106 0.22 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.21e-01 0.068 0.106 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.11e-01 0.0693 0.0841 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.63e-01 -0.101 0.0895 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.22e-01 -0.14 0.0903 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.22 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.39e-01 -0.052 0.111 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0292 0.0977 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.56e-01 0.0854 0.114 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.89e-01 -0.117 0.0885 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0185 0.105 0.221 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.83e-01 0.00235 0.11 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0977 0.114 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 1.26e-01 -0.147 0.0955 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.31e-01 0.127 0.106 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 9.37e-01 0.00906 0.115 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 3.03e-02 0.231 0.106 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0232 0.0898 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0353 0.0651 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0601 0.0689 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00049 0.0687 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0389 0.0741 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0145 0.086 0.22 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0304 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0192 0.0777 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 2.83e-01 0.0915 0.0849 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.28e-01 0.0974 0.0805 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 4.79e-01 0.0619 0.0872 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 1.66e-01 0.146 0.105 0.22 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0686 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 7.66e-01 0.0275 0.0922 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 1.81e-01 0.126 0.0935 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 7.61e-01 0.0283 0.0932 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 4.84e-01 0.0742 0.106 0.22 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.83e-02 -0.188 0.0987 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.98e-01 -0.121 0.0939 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 6.56e-01 0.0409 0.0917 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 1.93e-01 -0.14 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0973 0.102 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0559 0.107 0.22 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.68e-01 0.0465 0.108 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 9.16e-01 0.00856 0.0806 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0975 0.084 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0371 0.0788 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 8.64e-01 0.0144 0.084 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0424 0.0902 0.22 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 4.26e-01 0.0902 0.113 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 7.12e-01 0.0386 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 1.73e-01 -0.142 0.104 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.18e-01 0.134 0.108 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 2.80e-01 -0.12 0.111 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.11 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 2.02e-01 -0.142 0.111 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.51e-01 -0.149 0.103 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 2.36e-02 -0.225 0.0988 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.10e-01 -0.095 0.115 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0369 0.119 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 9.94e-01 0.000799 0.11 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0901 0.107 0.221 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 5.43e-01 -0.064 0.105 0.221 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0267 0.0889 0.221 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00791 0.0986 0.221 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 9.36e-02 -0.179 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 2.82e-01 -0.103 0.0954 0.221 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.47e-01 0.0073 0.111 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 3.51e-02 0.205 0.0964 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0989 0.109 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 8.95e-02 0.169 0.0989 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.105 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.48e-01 -0.056 0.093 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 3.64e-01 0.0822 0.0903 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.84e-01 0.0636 0.0907 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 8.13e-02 0.155 0.0885 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0724 0.107 0.22 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0135 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.30e-01 0.0784 0.0991 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0991 0.112 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00277 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.47e-02 0.198 0.107 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 6.12e-01 0.0465 0.0917 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 5.99e-01 0.0542 0.103 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.11e-01 0.0353 0.0953 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.0994 0.22 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.49e-01 0.0436 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 5.66e-01 0.0705 0.122 0.233 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.17e-02 0.28 0.136 0.233 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 4.69e-01 0.0708 0.0973 0.233 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0839 0.131 0.233 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0531 0.107 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.00e+00 1.67e-05 0.0925 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 6.43e-01 0.0391 0.0843 0.22 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.21e-01 0.087 0.108 0.22 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 5.03e-01 0.0699 0.104 0.22 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.94e-02 0.194 0.106 0.22 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0296 0.113 0.22 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 9.08e-01 -0.011 0.0943 0.22 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 1.36e-01 -0.112 0.075 0.22 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 4.13e-01 -0.081 0.0988 0.22 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 6.13e-02 -0.191 0.102 0.22 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 5.71e-01 -0.062 0.109 0.22 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.37e-01 0.0645 0.0828 0.21 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 2.96e-01 -0.105 0.1 0.21 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0155 0.118 0.21 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 9.08e-01 0.0134 0.116 0.21 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 1.58e-02 -0.258 0.106 0.21 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.59e-01 0.046 0.104 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.55e-03 0.18 0.0678 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0638 0.0856 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 2.64e-01 -0.113 0.101 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0173 0.0914 0.22 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.00e-01 -0.014 0.11 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0337 0.0789 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0416 0.0959 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 1.40e-01 -0.166 0.112 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0543 0.0958 0.22 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0658 0.139 0.221 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.221 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00626 0.138 0.221 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 3.28e-01 0.132 0.134 0.221 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 3.89e-01 0.111 0.129 0.221 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.50e-02 0.182 0.108 0.22 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 3.26e-01 0.0938 0.0952 0.22 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0494 0.0852 0.22 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 5.30e-01 0.0697 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.32e-01 -0.168 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 2.54e-01 0.127 0.111 0.217 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0212 0.0858 0.217 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0428 0.0857 0.217 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 5.10e-01 0.0638 0.0966 0.217 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.217 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0724 0.124 0.206 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 6.15e-01 0.0528 0.105 0.206 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0519 0.0954 0.206 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00932 0.126 0.206 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.75e-01 0.142 0.104 0.206 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0961 0.111 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00747 0.103 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 6.10e-02 0.168 0.0892 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 5.36e-01 0.0599 0.0967 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 1.55e-01 -0.139 0.0974 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00899 0.106 0.22 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.102 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 7.28e-01 0.0303 0.0868 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0877 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 8.41e-02 -0.141 0.0811 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0312 0.0986 0.22 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 8.79e-01 0.0158 0.104 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.36e-01 0.0924 0.0618 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0275 0.0817 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 1.09e-01 -0.166 0.103 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0274 0.0841 0.22 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 2.22e-02 0.24 0.104 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 4.78e-01 0.058 0.0816 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 343011 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0496 0.0798 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 3.94e-01 0.0843 0.0987 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0899 0.0943 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 548650 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.092 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 548547 sc-eQTL 1.21e-01 0.124 0.0796 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 399495 sc-eQTL 3.34e-01 0.0785 0.0811 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -327060 sc-eQTL 7.40e-02 0.147 0.082 0.22 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 399424 sc-eQTL 6.84e-01 0.0404 0.0991 0.22 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 343011 eQTL 0.0149 -0.0831 0.0341 0.0 0.0 0.246

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 343011 1.26e-06 8.9e-07 2.52e-07 3.54e-07 1.87e-07 3.22e-07 8.36e-07 2.88e-07 9.89e-07 3.09e-07 1.1e-06 5.77e-07 1.37e-06 2.05e-07 4.3e-07 5.02e-07 7.62e-07 5.2e-07 3.95e-07 4.36e-07 2.97e-07 7.21e-07 6.11e-07 4.79e-07 1.57e-06 2.7e-07 5.82e-07 5.33e-07 8e-07 9.21e-07 4.61e-07 7.28e-08 1.73e-07 3.17e-07 3.42e-07 3.36e-07 3.1e-07 1.55e-07 1.49e-07 3.03e-08 2.98e-07 1.12e-06 6.37e-08 1.29e-08 1.62e-07 7.22e-08 1.76e-07 8.58e-08 6.27e-08