Genes within 1Mb (chr1:70683694:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.28e-01 0.137 0.0896 0.259 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0487 0.0698 0.259 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00599 0.0814 0.259 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0192 0.0686 0.259 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0133 0.0898 0.259 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.46e-01 -0.11 0.0752 0.259 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0186 0.0594 0.259 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 8.39e-01 0.0122 0.0603 0.259 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0211 0.0551 0.259 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0182 0.0651 0.259 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0389 0.0765 0.259 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00563 0.0862 0.259 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 7.33e-01 0.0245 0.0718 0.259 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 6.60e-01 0.0309 0.0702 0.259 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 5.56e-01 -0.04 0.0678 0.259 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 8.11e-01 0.0189 0.0788 0.259 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 7.14e-01 0.0295 0.0804 0.259 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0442 0.112 0.255 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.67e-01 -0.103 0.0742 0.255 DC L1
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 9.80e-01 0.00236 0.0961 0.255 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0342 0.102 0.255 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0833 0.0887 0.255 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.22e-01 -0.081 0.101 0.255 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.76e-01 0.134 0.0988 0.259 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.90e-01 0.0753 0.0572 0.259 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.55e-01 0.0897 0.0785 0.259 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.34e-01 0.14 0.0928 0.259 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 1.01e-01 0.132 0.0804 0.259 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0227 0.086 0.26 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0808 0.0757 0.26 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.75e-01 0.032 0.0762 0.26 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 2.66e-01 0.0874 0.0783 0.26 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0743 0.0957 0.26 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.49e-03 -0.322 0.0999 0.259 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 4.97e-01 0.0546 0.0803 0.259 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 5.26e-01 -0.058 0.0914 0.259 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0452 0.0969 0.259 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 7.55e-01 0.0283 0.0905 0.259 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 1.17e-01 -0.16 0.102 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0363 0.11 0.263 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 3.89e-01 -0.101 0.116 0.263 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0699 0.117 0.263 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 8.74e-01 0.0188 0.119 0.263 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0841 0.0983 0.263 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00939 0.107 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0403 0.0908 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0924 0.103 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 2.28e-01 0.124 0.102 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.46e-01 0.0073 0.108 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0696 0.111 0.259 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.45e-02 -0.239 0.0968 0.259 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 2.15e-01 -0.113 0.0907 0.259 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 2.18e-01 -0.13 0.105 0.259 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.66e-01 0.00444 0.104 0.259 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 9.47e-01 0.0068 0.102 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 6.56e-01 -0.036 0.0806 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0428 0.086 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0387 0.0869 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0683 0.0983 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.02e-01 0.174 0.106 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0965 0.0938 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.11 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 8.17e-01 0.0198 0.0855 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.13e-01 0.011 0.101 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 3.22e-01 -0.105 0.105 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.11 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.18e-01 -0.113 0.0914 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0911 0.101 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 2.33e-01 -0.131 0.109 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0143 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 2.35e-02 -0.192 0.0843 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0134 0.0619 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 7.67e-01 0.0195 0.0656 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 7.52e-01 0.0206 0.0653 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.80e-01 -0.039 0.0704 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0695 0.0816 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0545 0.1 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 8.13e-01 0.0175 0.0738 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 8.57e-01 0.0146 0.0809 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.17e-01 -0.12 0.0763 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 2.02e-01 0.106 0.0827 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.37e-01 0.0207 0.1 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 8.03e-01 0.0254 0.102 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0884 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.64e-01 0.101 0.0903 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 4.71e-02 -0.178 0.089 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 1.65e-01 -0.138 0.0989 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 5.56e-01 0.0602 0.102 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.28e-01 -0.143 0.0939 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 5.41e-02 -0.172 0.0886 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0108 0.087 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.32e-01 0.0489 0.102 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 4.50e-01 0.0734 0.097 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 5.57e-01 0.0598 0.102 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.79e-01 -0.142 0.106 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.04e-01 0.1 0.0786 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.57e-01 0.0934 0.0822 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0382 0.0771 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0681 0.0821 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0469 0.0882 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00687 0.112 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0445 0.103 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 1.25e-02 -0.255 0.101 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0554 0.107 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 8.12e-01 0.0261 0.11 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 2.17e-01 -0.135 0.109 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00938 0.106 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0608 0.0985 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0264 0.095 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 9.24e-01 0.0105 0.109 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 6.89e-01 0.0454 0.113 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0056 0.104 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 6.59e-03 -0.284 0.104 0.26 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.56e-01 0.118 0.103 0.26 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 9.34e-01 0.00726 0.0875 0.26 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 3.98e-01 0.0821 0.0968 0.26 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 6.78e-01 0.0437 0.105 0.26 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00409 0.0941 0.26 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 6.53e-01 0.0494 0.11 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.30e-03 -0.292 0.0945 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 2.93e-01 -0.114 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 3.67e-01 0.0891 0.0986 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.96e-01 0.000496 0.105 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0225 0.0915 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0886 0.0888 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0266 0.0892 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.36e-01 0.0544 0.0876 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0163 0.105 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0665 0.108 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 3.99e-01 0.0821 0.0971 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 2.91e-01 0.117 0.11 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0686 0.107 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0735 0.108 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 2.62e-01 -0.118 0.105 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0856 0.0896 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.77e-01 0.0421 0.101 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.88e-01 0.0506 0.0932 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0917 0.0977 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 3.26e-01 0.14 0.142 0.252 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 8.16e-01 0.0299 0.128 0.252 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 3.80e-01 0.127 0.144 0.252 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 9.14e-01 0.011 0.102 0.252 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00165 0.137 0.252 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0183 0.104 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.29e-01 0.108 0.0896 0.261 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 9.38e-02 -0.137 0.0814 0.261 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 7.25e-01 -0.037 0.105 0.261 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0917 0.101 0.261 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0115 0.104 0.261 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 2.85e-01 0.114 0.107 0.259 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0345 0.0895 0.259 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0817 0.0713 0.259 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0437 0.0939 0.259 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.46e-01 0.0588 0.0971 0.259 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 1.40e-01 0.153 0.103 0.259 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.65e-01 -0.15 0.108 0.251 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.71e-01 -0.111 0.0806 0.251 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0787 0.0981 0.251 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0687 0.115 0.251 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 1.74e-01 -0.153 0.112 0.251 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.15e-01 0.0246 0.105 0.251 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 6.82e-01 0.0413 0.101 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.15e-01 0.105 0.0663 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 3.17e-01 0.0828 0.0827 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.52e-02 0.237 0.0967 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 4.40e-02 0.177 0.0875 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.107 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 6.57e-01 0.0343 0.0772 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 1.71e-01 0.128 0.0935 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 8.90e-01 0.0152 0.11 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 4.55e-01 0.0701 0.0937 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.56e-01 -0.176 0.124 0.267 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 6.61e-01 0.0522 0.119 0.267 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0429 0.114 0.267 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00946 0.123 0.267 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0144 0.121 0.267 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0875 0.115 0.267 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 3.50e-01 0.0976 0.104 0.26 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 4.84e-01 0.0638 0.0911 0.26 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0369 0.0815 0.26 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.15e-01 0.167 0.105 0.26 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 4.79e-01 0.0757 0.107 0.26 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.99e-01 0.139 0.108 0.265 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.55e-01 -0.119 0.0832 0.265 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 2.37e-02 0.188 0.0825 0.265 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0938 0.265 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0106 0.0995 0.265 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.257 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0777 0.102 0.257 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 9.32e-01 0.00787 0.0927 0.257 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0238 0.122 0.257 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 3.21e-01 -0.101 0.101 0.257 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0737 0.107 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 8.48e-01 0.0194 0.101 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 1.09e-01 -0.142 0.088 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0951 0.0951 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00552 0.0964 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0263 0.105 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 3.53e-01 0.0913 0.098 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0967 0.0831 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 4.05e-01 0.0701 0.0841 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0454 0.0784 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000441 0.0946 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.86e-01 0.133 0.1 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 9.90e-02 0.0994 0.06 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 1.87e-01 0.105 0.0791 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 4.79e-02 0.199 0.1 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 1.32e-01 0.123 0.0813 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 1.93e-01 0.133 0.102 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0624 0.0793 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 272476 sc-eQTL 8.68e-02 0.133 0.0771 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0234 0.0961 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 9.46e-01 0.00627 0.0919 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 478115 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0422 0.0902 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 478012 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0485 0.0785 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 328960 sc-eQTL 5.76e-01 0.0446 0.0796 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -397595 sc-eQTL 3.91e-01 0.0695 0.0808 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 328889 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0801 0.0971 0.261 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 272476 eQTL 0.0152 0.0865 0.0355 0.0 0.0 0.233


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 272476 1.24e-06 9e-07 2.24e-07 9.43e-07 3.73e-07 5.4e-07 1.63e-06 3.99e-07 1.41e-06 5.98e-07 1.79e-06 7.48e-07 2.15e-06 3.07e-07 5.69e-07 9.54e-07 8.95e-07 7.78e-07 8.61e-07 6.16e-07 7.68e-07 1.74e-06 8.92e-07 5.17e-07 2.3e-06 6.73e-07 9.18e-07 7.09e-07 1.46e-06 1.31e-06 6.96e-07 2.42e-07 2.61e-07 6.24e-07 5.87e-07 4.6e-07 6.19e-07 2.26e-07 4.99e-07 3.11e-07 3.05e-07 1.53e-06 9.42e-08 6.41e-08 3.22e-07 1.37e-07 2.57e-07 2.77e-08 1.82e-07