Genes within 1Mb (chr1:70637709:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 4.95e-01 0.0661 0.0967 0.201 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0208 0.0751 0.201 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 7.56e-01 0.0272 0.0875 0.201 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.33e-01 -0.046 0.0736 0.201 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 4.05e-01 0.0804 0.0963 0.201 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.34e-01 -0.124 0.0826 0.201 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00333 0.0652 0.201 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0883 0.0659 0.201 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 1.70e-01 -0.083 0.0603 0.201 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.12e-01 -0.114 0.0711 0.201 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00295 0.084 0.201 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 7.04e-01 0.0356 0.0936 0.201 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.59e-01 -0.024 0.078 0.201 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0699 0.0761 0.201 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 2.20e-01 0.0903 0.0734 0.201 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.86e-01 -0.113 0.0853 0.201 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0511 0.0873 0.201 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 8.52e-01 0.0213 0.114 0.203 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.27e-01 0.00703 0.0765 0.203 DC L1
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 8.51e-01 0.0186 0.0986 0.203 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 3.51e-01 0.0972 0.104 0.203 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 6.13e-01 0.0461 0.0912 0.203 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 2.85e-02 0.225 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.01e-01 -0.175 0.106 0.201 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.21e-02 -0.141 0.0612 0.201 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.00e-01 -0.109 0.0846 0.201 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0473 0.1 0.201 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0261 0.0872 0.201 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 6.44e-01 0.0428 0.0924 0.2 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.16e-02 -0.205 0.0804 0.2 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0783 0.0818 0.2 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 2.25e-02 -0.192 0.0834 0.2 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 3.66e-01 0.093 0.103 0.2 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.02e-01 0.176 0.108 0.201 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.19e-01 -0.104 0.0847 0.201 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 4.87e-01 0.0672 0.0966 0.201 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0337 0.102 0.201 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0573 0.0957 0.201 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 8.01e-02 0.189 0.108 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 4.75e-02 0.242 0.121 0.191 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0821 0.129 0.191 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 2.56e-01 -0.148 0.13 0.191 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 2.82e-01 -0.142 0.131 0.191 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00714 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.78e-01 0.151 0.112 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.45e-01 0.031 0.0953 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 7.95e-01 0.0283 0.109 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.31e-01 -0.162 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 5.46e-01 0.0688 0.114 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 8.74e-02 -0.201 0.117 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 4.88e-01 0.0723 0.104 0.198 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 6.25e-01 0.0474 0.0967 0.198 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0414 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.67e-02 0.203 0.11 0.198 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.36e-01 0.106 0.11 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0844 0.0872 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 9.20e-01 0.00941 0.0931 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0595 0.0941 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0459 0.107 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.43e-01 -0.109 0.115 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0107 0.101 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0219 0.119 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.92e-01 -0.12 0.0918 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 7.95e-01 0.0283 0.109 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 9.98e-01 0.00027 0.113 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00374 0.118 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0277 0.0987 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.39e-02 -0.209 0.108 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 3.04e-01 -0.121 0.117 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.09e-01 0.0563 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0957 0.0935 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0212 0.0679 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 1.31e-01 -0.109 0.0717 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 1.29e-01 -0.109 0.0713 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0609 0.0772 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.49e-01 0.0409 0.0897 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0977 0.109 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0765 0.0802 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.17e-01 -0.109 0.0878 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0437 0.0835 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 6.60e-04 -0.304 0.0879 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 3.04e-01 -0.112 0.109 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00104 0.11 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.39e-02 -0.235 0.0948 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 5.69e-03 -0.269 0.0962 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 3.56e-02 0.204 0.0962 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 4.53e-02 -0.215 0.107 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.65e-01 0.048 0.11 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 7.38e-01 0.0347 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 3.20e-01 0.0977 0.0979 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0544 0.0954 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 4.30e-01 0.0884 0.112 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.47e-01 0.0643 0.106 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0653 0.112 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 8.18e-01 0.0265 0.115 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.21e-01 -0.105 0.0853 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.23e-01 -0.109 0.0892 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0455 0.0837 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0674 0.0891 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0328 0.0958 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0795 0.118 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 4.62e-01 -0.08 0.109 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.43e-01 0.127 0.108 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 9.48e-02 0.189 0.113 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 3.85e-01 -0.101 0.116 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 1.01e-01 0.189 0.114 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0699 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 4.75e-01 0.0756 0.106 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 9.33e-01 0.00864 0.102 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 8.78e-01 0.018 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0694 0.121 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0905 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 2.05e-02 0.256 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0757 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.30e-01 -0.111 0.0918 0.203 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0142 0.102 0.203 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.40e-01 -0.163 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 2.57e-01 0.112 0.0989 0.203 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 6.80e-01 0.048 0.116 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 6.39e-01 0.0482 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 7.33e-01 0.0395 0.115 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 7.03e-03 -0.28 0.103 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0228 0.111 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.71e-01 0.135 0.0985 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.32e-01 -0.145 0.0957 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0633 0.0964 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 2.97e-03 -0.279 0.0928 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 9.77e-01 0.00335 0.114 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.78e-01 -0.102 0.115 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.31e-01 -0.157 0.104 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 4.69e-02 -0.234 0.117 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 2.19e-01 -0.141 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 1.78e-01 0.156 0.115 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 9.61e-02 -0.184 0.11 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.38e-02 -0.232 0.0933 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 6.93e-01 0.042 0.106 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.0982 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 7.67e-01 0.0307 0.103 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.80e-01 -0.191 0.142 0.2 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 4.59e-02 -0.255 0.126 0.2 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 3.18e-01 0.145 0.144 0.2 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0669 0.102 0.2 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 4.59e-01 0.102 0.137 0.2 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 5.75e-01 0.0616 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0118 0.0949 0.2 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.28e-01 0.104 0.0862 0.2 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 2.12e-01 -0.138 0.111 0.2 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0639 0.107 0.2 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0846 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0355 0.115 0.201 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.41e-01 -0.113 0.0958 0.201 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.39e-01 0.0905 0.0766 0.201 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.06e-01 0.0672 0.101 0.201 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.25e-01 -0.16 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0614 0.111 0.201 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.11 0.2 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.16e-01 0.0303 0.0829 0.2 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 3.48e-01 0.0944 0.1 0.2 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 4.16e-02 0.239 0.116 0.2 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.98e-01 0.0611 0.116 0.2 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 1.54e-01 0.153 0.107 0.2 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.46e-01 -0.102 0.108 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.28e-02 -0.162 0.0707 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0425 0.0889 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.76e-01 -0.059 0.105 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 6.27e-01 0.0461 0.0948 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.92e-01 -0.151 0.115 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.39e-01 -0.122 0.0822 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 4.09e-02 -0.204 0.0994 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 8.88e-01 0.0167 0.118 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0708 0.1 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 8.66e-01 -0.023 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0504 0.129 0.197 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0549 0.124 0.197 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 1.06e-01 -0.216 0.133 0.197 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.59e-01 -0.184 0.13 0.197 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0287 0.126 0.197 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.47e-01 -0.164 0.112 0.204 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00185 0.0987 0.204 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 1.69e-01 -0.121 0.0878 0.204 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 3.08e-01 -0.117 0.115 0.204 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.65e-01 0.0666 0.116 0.204 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 9.90e-01 0.00144 0.113 0.206 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 1.69e-01 0.12 0.087 0.206 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0697 0.0872 0.206 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 7.05e-01 0.0373 0.0984 0.206 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 3.08e-01 -0.106 0.104 0.206 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 3.61e-01 0.114 0.125 0.198 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0525 0.106 0.198 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 2.32e-01 -0.115 0.096 0.198 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 2.11e-01 -0.159 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 2.69e-01 0.117 0.105 0.198 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 2.77e-01 0.122 0.111 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 8.01e-01 0.0269 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.61e-01 0.0285 0.0938 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 9.85e-01 0.00188 0.101 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0558 0.102 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 2.76e-01 0.121 0.11 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 4.68e-01 0.0774 0.106 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0549 0.0904 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0514 0.0913 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0759 0.085 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0444 0.103 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 1.24e-01 -0.166 0.107 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 7.44e-03 -0.172 0.0637 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 1.90e-01 -0.112 0.0849 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0523 0.108 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 9.70e-01 0.00326 0.0878 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0296 0.11 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 5.69e-01 0.0484 0.0849 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 226491 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0831 0.0828 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0613 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0614 0.0981 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 432130 sc-eQTL 9.55e-01 0.00546 0.0968 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 432027 sc-eQTL 2.97e-03 -0.248 0.0825 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 282975 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0965 0.0852 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -443580 sc-eQTL 1.98e-02 -0.201 0.0857 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 282904 sc-eQTL 5.95e-01 0.0556 0.104 0.198 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000050628 \N -410099 7.87e-07 6.42e-07 1.14e-07 4.31e-07 9.16e-08 2.16e-07 5.8e-07 1.45e-07 5.06e-07 2.39e-07 8.08e-07 3.91e-07 1.02e-06 1.6e-07 2.07e-07 2.45e-07 3.35e-07 3.73e-07 2.51e-07 1.73e-07 1.92e-07 4.38e-07 3.77e-07 2.17e-07 1.16e-06 2.13e-07 3.1e-07 2.74e-07 3.58e-07 7.39e-07 3.67e-07 5.82e-08 5.71e-08 1.77e-07 3.35e-07 1.66e-07 8.6e-08 7.64e-08 6.72e-08 3.58e-08 2.78e-08 6.27e-07 1.65e-08 3.38e-08 1.01e-07 1.33e-08 8.75e-08 2.35e-08 5.93e-08