Genes within 1Mb (chr1:70627402:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0383 0.0892 0.263 B L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 6.18e-01 0.0345 0.0691 0.263 B L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 8.26e-01 0.0178 0.0806 0.263 B L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0439 0.0678 0.263 B L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0732 0.0888 0.263 B L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 3.59e-02 0.156 0.0738 0.263 CD4T L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0116 0.0586 0.263 CD4T L1
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0262 0.0594 0.263 CD4T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 5.50e-01 0.0326 0.0543 0.263 CD4T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 3.99e-01 0.0542 0.0642 0.263 CD4T L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.92e-01 0.052 0.0754 0.263 CD4T L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0269 0.0868 0.263 CD8T L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0852 0.0721 0.263 CD8T L1
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 2.28e-02 -0.16 0.0699 0.263 CD8T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0659 0.0682 0.263 CD8T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.39e-01 0.0936 0.0792 0.263 CD8T L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0811 0.263 CD8T L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00369 0.11 0.255 DC L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 5.97e-01 0.0389 0.0733 0.255 DC L1
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 1.67e-01 -0.131 0.0942 0.255 DC L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 6.80e-02 -0.182 0.0992 0.255 DC L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.52e-01 0.1 0.0873 0.255 DC L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0987 0.255 DC L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.94e-01 0.00071 0.0974 0.263 Mono L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 2.13e-02 0.129 0.0557 0.263 Mono L1
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0856 0.0771 0.263 Mono L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0912 0.0913 0.263 Mono L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0295 0.0793 0.263 Mono L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.11e-01 0.0697 0.0845 0.262 NK L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.28e-02 0.159 0.0739 0.262 NK L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 7.50e-01 0.0239 0.075 0.262 NK L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 3.87e-01 0.067 0.0772 0.262 NK L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0405 0.0942 0.262 NK L1
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 3.01e-01 0.103 0.0991 0.263 Other_T L1
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.11e-01 0.0289 0.078 0.263 Other_T L1
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 9.68e-01 0.00353 0.0888 0.263 Other_T L1
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 2.47e-01 0.109 0.0938 0.263 Other_T L1
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0832 0.0877 0.263 Other_T L1
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0412 0.0996 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00858 0.107 0.265 B_Activated L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 6.89e-01 0.0455 0.114 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.21e-01 0.114 0.114 0.265 B_Activated L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.30e-01 0.0102 0.116 0.265 B_Activated L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0483 0.0959 0.265 B_Activated L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.104 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.45e-01 0.129 0.0881 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0445 0.101 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0336 0.0999 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.52e-01 0.0795 0.105 0.264 B_Intermediate L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 2.62e-02 0.238 0.107 0.263 B_Memory L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 9.42e-02 0.159 0.0949 0.263 B_Memory L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0244 0.0885 0.263 B_Memory L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 4.76e-01 0.0735 0.103 0.263 B_Memory L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.61e-02 -0.202 0.1 0.263 B_Memory L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.65e-01 0.0296 0.0986 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.52e-01 0.112 0.078 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0203 0.0836 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0398 0.0844 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 7.83e-01 0.0264 0.0956 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0829 0.104 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 4.50e-01 0.0694 0.0916 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0614 0.107 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00265 0.0834 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0807 0.0984 0.262 B_Naive2 L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 1.01e-01 0.173 0.105 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0524 0.11 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00708 0.0919 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 1.39e-01 0.15 0.101 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.20e-01 0.134 0.109 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 3.53e-01 0.0953 0.102 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 1.28e-01 0.128 0.0837 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 9.70e-01 0.0023 0.0611 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0557 0.0646 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00556 0.0644 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 4.31e-01 0.0547 0.0694 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 2.99e-01 0.0838 0.0804 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 3.04e-01 0.101 0.0982 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.67e-01 0.0215 0.0727 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 4.28e-01 0.0632 0.0796 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 1.17e-01 0.118 0.0751 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.88e-02 0.135 0.0812 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 7.62e-01 -0.03 0.0989 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0349 0.0992 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 2.27e-02 0.196 0.0855 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 1.89e-01 0.116 0.0878 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 5.10e-02 0.17 0.0867 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 3.65e-01 0.0877 0.0966 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 7.81e-01 0.0277 0.0994 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 5.68e-01 0.054 0.0944 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0264 0.0895 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0384 0.0871 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 2.22e-02 -0.232 0.101 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.0972 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0703 0.102 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.64e-01 0.0311 0.103 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0256 0.0769 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 2.01e-01 -0.103 0.0801 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 4.35e-01 0.0588 0.0752 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.22e-01 0.0979 0.0799 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 7.33e-01 0.0294 0.0861 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.62e-01 0.0803 0.109 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.73e-01 0.0896 0.1 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 3.25e-01 0.0987 0.1 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0807 0.105 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00358 0.107 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000708 0.106 0.259 CD8_TCM L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0728 0.105 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 9.96e-01 0.000432 0.0981 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0714 0.0944 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 1.92e-01 -0.142 0.108 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 6.71e-01 0.048 0.113 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.01e-01 0.087 0.103 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 8.14e-01 0.0246 0.104 0.258 MAIT L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 9.55e-01 0.00582 0.102 0.258 MAIT L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 2.76e-01 0.0941 0.0862 0.258 MAIT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0108 0.0958 0.258 MAIT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 6.26e-01 0.0507 0.104 0.258 MAIT L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 1.51e-01 -0.133 0.0926 0.258 MAIT L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 2.96e-01 0.112 0.107 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.30e-02 0.2 0.0934 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 8.20e-01 0.0241 0.106 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.15e-01 0.12 0.0961 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 9.38e-01 0.008 0.102 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 2.50e-01 -0.103 0.0893 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.53e-01 0.124 0.0866 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.05e-01 0.0896 0.0871 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 1.08e-01 0.138 0.0852 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 9.82e-01 0.00234 0.103 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.78e-02 0.214 0.107 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.29e-01 0.0954 0.0975 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0895 0.111 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.32e-02 0.243 0.106 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0729 0.108 0.265 NK_HLA L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.80e-04 0.354 0.0998 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.46e-02 0.213 0.0866 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 1.92e-01 -0.129 0.0982 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0117 0.0913 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.56e-01 0.0428 0.0957 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 6.26e-01 0.0609 0.125 0.274 PB L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.61e-01 0.103 0.112 0.274 PB L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.51e-01 0.118 0.126 0.274 PB L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0544 0.0893 0.274 PB L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.19e-01 0.0972 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.70e-01 0.0299 0.102 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00496 0.0882 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 8.03e-01 0.0201 0.0804 0.265 Pro_T L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 2.54e-01 0.118 0.103 0.265 Pro_T L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.66e-01 0.00423 0.0996 0.265 Pro_T L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 3.12e-01 0.103 0.102 0.265 Pro_T L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 8.47e-01 0.0207 0.107 0.263 Treg L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 2.18e-01 0.11 0.0894 0.263 Treg L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0188 0.0717 0.263 Treg L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 7.66e-01 -0.028 0.0942 0.263 Treg L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0592 0.0973 0.263 Treg L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 1.87e-01 -0.137 0.104 0.263 Treg L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 5.36e-01 0.0669 0.108 0.251 cDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 2.81e-01 0.0872 0.0807 0.251 cDC L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0703 0.098 0.251 cDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 1.35e-01 -0.171 0.114 0.251 cDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 1.22e-01 0.174 0.112 0.251 cDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 4.80e-02 -0.206 0.104 0.251 cDC L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00865 0.0988 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.80e-01 0.0876 0.0651 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 1.85e-01 -0.108 0.081 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 6.26e-02 -0.179 0.0955 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 7.24e-01 0.0306 0.0867 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 8.82e-01 0.0159 0.107 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.33e-01 0.115 0.076 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0379 0.0928 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0939 0.109 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0588 0.0927 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 2.91e-01 0.137 0.13 0.261 gdT L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0974 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 2.77e-01 -0.13 0.119 0.261 gdT L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 4.96e-02 0.252 0.127 0.261 gdT L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 2.05e-01 0.159 0.125 0.261 gdT L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 1.16e-01 0.189 0.12 0.261 gdT L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 3.10e-01 0.107 0.105 0.258 intMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 5.76e-01 0.0517 0.0922 0.258 intMono L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0234 0.0825 0.258 intMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.76e-01 0.095 0.107 0.258 intMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 7.19e-02 -0.194 0.107 0.258 intMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 2.64e-01 -0.122 0.109 0.253 ncMono L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.75e-01 0.0241 0.0842 0.253 ncMono L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 1.87e-01 -0.111 0.0838 0.253 ncMono L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 3.50e-01 0.0886 0.0947 0.253 ncMono L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 1.84e-01 0.133 0.0998 0.253 ncMono L2
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 9.43e-01 0.00851 0.119 0.243 pDC L2
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 7.63e-01 0.0305 0.101 0.243 pDC L2
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 9.35e-01 0.00754 0.0919 0.243 pDC L2
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 7.38e-01 0.0407 0.121 0.243 pDC L2
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 1.94e-01 0.131 0.1 0.243 pDC L2
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0526 0.107 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 3.66e-01 0.0903 0.0997 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 4.58e-02 0.174 0.0868 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0406 0.0943 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0216 0.0953 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0409 0.103 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0518 0.0959 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 1.91e-01 0.107 0.0811 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 6.94e-01 0.0324 0.0823 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0211 0.0766 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0431 0.0924 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0308 0.0987 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 5.61e-02 0.113 0.0587 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0737 0.0778 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 8.77e-02 -0.169 0.0984 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.62e-01 0.00382 0.0802 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0495 0.103 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.02e-01 0.0819 0.0792 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116761 CTH 216184 sc-eQTL 1.46e-01 -0.113 0.0772 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 5.72e-02 0.182 0.0952 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 9.85e-01 0.0017 0.0918 0.263 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000066557 LRRC40 421823 sc-eQTL 4.22e-01 0.0712 0.0884 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116754 SRSF11 421720 sc-eQTL 3.23e-02 0.164 0.0762 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118454 ANKRD13C 272668 sc-eQTL 7.63e-01 0.0236 0.0782 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000132485 ZRANB2 -453887 sc-eQTL 3.41e-01 0.0757 0.0793 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197568 HHLA3 272597 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00426 0.0954 0.263 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116761 CTH 216184 eQTL 0.00114 -0.104 0.0319 0.0 0.0 0.297


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116761 CTH 216184 1.59e-06 1.91e-06 2.98e-07 1.27e-06 4.65e-07 6.94e-07 1.25e-06 4.25e-07 1.71e-06 7.23e-07 1.99e-06 1.25e-06 2.64e-06 5.06e-07 3.34e-07 1.04e-06 1.11e-06 1.27e-06 5.23e-07 6.49e-07 6.18e-07 1.92e-06 1.59e-06 8.95e-07 2.45e-06 9.28e-07 1.04e-06 1.05e-06 1.66e-06 1.51e-06 7.58e-07 2.86e-07 3.7e-07 6.49e-07 8.23e-07 5.92e-07 7.06e-07 3.36e-07 4.85e-07 2.28e-07 2.87e-07 2.14e-06 4.23e-07 1.25e-07 3.91e-07 3.28e-07 3.93e-07 2.54e-07 3.01e-07